Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0577, 309 aa
1>>>pF1KE0577 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1782+/-0.000549; mu= 22.3312+/- 0.034
mean_var=104.9801+/-31.583, 0's: 0 Z-trim(106.7): 260 B-trim: 1001 in 1/49
Lambda= 0.125176
statistics sampled from 14434 (14832) to 14434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1022 196.1 7.6e-50
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 964 185.6 1.1e-46
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 890 172.3 1.1e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 851 165.2 1.5e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 847 164.5 2.5e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 845 164.1 3.2e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 845 164.1 3.2e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 845 164.2 3.2e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 837 162.7 8.6e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 828 161.1 2.7e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 823 160.2 4.9e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 816 158.9 1.2e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 807 157.3 3.6e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 792 154.6 2.4e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 784 153.1 6.6e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 768 150.3 4.9e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 768 150.3 4.9e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 768 150.3 4.9e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 756 148.1 2.2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 715 140.7 3.7e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 487 99.5 9.3e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 463 95.2 1.9e-19
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 213 50.2 8.5e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 199 47.6 4.6e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 199 47.6 4.6e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 189 45.7 0.00015
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 186 45.3 0.00024
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 186 45.3 0.00024
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 178 43.8 0.00061
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 177 43.5 0.00065
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 178 43.9 0.0007
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 177 43.6 0.0007
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 178 44.0 0.00071
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 172 42.8 0.0014
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 172 42.8 0.0014
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 172 42.8 0.0014
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 172 42.8 0.0014
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 168 41.9 0.0021
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 168 41.9 0.0021
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 168 42.0 0.0022
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 168 42.0 0.0022
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 168 42.0 0.0022
NP_110387 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphate r ( 398) 163 41.2 0.0043
NP_001159687 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphat ( 398) 163 41.2 0.0043
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 163 41.2 0.0043
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 163 41.2 0.0043
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 161 40.7 0.005
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 160 40.5 0.0058
XP_016864712 (OMIM: 600933) PREDICTED: proteinase- ( 383) 160 40.6 0.0061
NP_005233 (OMIM: 600933) proteinase-activated rece ( 397) 160 40.6 0.0062
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1039 init1: 1007 opt: 1022 Z-score: 1015.9 bits: 196.1 E(85289): 7.6e-50
Smith-Waterman score: 1022; 48.4% identity (76.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 HALRRVIRK
: ..:.:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1012 init1: 954 opt: 964 Z-score: 959.3 bits: 185.6 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 964; 46.6% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (3-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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NP_003 MYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLM
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_003 CDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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pF1KE0 HALRRVIRK
.:: :: .
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 911 init1: 890 opt: 890 Z-score: 887.1 bits: 172.3 E(85289): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 890; 43.1% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (6-309:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTP
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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pF1KE0 HALRRVIRK
::.:. ..
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 851; 43.1% identity (70.5% similar) in 295 aa overlap (14-307:15-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHM
:.:.:... : :.:..::: :. ::.:..::: .:.: . : :::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE0 PMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVM
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE0 MAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE0 YCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGA-FIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSK
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIP-LILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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pF1KE0 AFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKK
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
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300
pF1KE0 VMHALRRVIRK
: :..:..
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 847; 43.9% identity (72.6% similar) in 303 aa overlap (7-309:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
:.: ::::.: ::.: : . :.:.:.: :::.:..::: :: :. : .:: :
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTP
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
::.:: .:...: : ::.:.:. ::..:.. .:... : ... :: . :.: ::..:
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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NP_003 SYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFF
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
:: :. .. . . . ::..:. : . .. :..:: :.. ..: :: : :::
NP_003 CEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
::::.::. : :.::. :. :. : : ...:.: :.::.:. :.:::.::::::: :
NP_003 STCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
:::.: .
NP_003 AALRKVATRNFP
300
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 847 init1: 828 opt: 845 Z-score: 843.1 bits: 164.1 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
::.::..:.: : : : . .:.::.: . .: ::. :.::.:: . . :::..:
XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
:.. :.:.::. .: ..:. ::...: .. :. :: .. .:: : ::: :::
XP_011 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
::..:.
XP_011 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 847 init1: 828 opt: 845 Z-score: 843.1 bits: 164.1 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
10 20 30 40 50
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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NP_036 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_036 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
::..:.
NP_036 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 847 init1: 828 opt: 845 Z-score: 843.0 bits: 164.2 E(85289): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 845; 41.6% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (3-307:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIW
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NDPHLHMPMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ECFLLVMMAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCR
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 FNIIHYFYCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKS
: : .:.:.. :.:.::. .: ..:. ::...: .. :. :: .. .:: :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EKGRSKAFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300
pF1KE0 SLRNKKVMHALRRVIRK
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 798 init1: 798 opt: 837 Z-score: 835.3 bits: 162.7 E(85289): 8.6e-40
Smith-Waterman score: 837; 41.3% identity (73.3% similar) in 303 aa overlap (7-309:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
:.. . :.: :....: :. .::: :. ::.:.::: .:.: ::.:: :
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSP
10 20 30 40 50
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pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
::.::..:.: : : .:: .:.::::. ::. .: .:...: : .::::.::..:
NP_009 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
:.:::::.:.:: : ... .: :: :...:::... .:.. :.: :: . :
NP_009 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
.::..:: :.:.:...: .:..: . :... : ..:::.. : :::.::.::::.:
NP_009 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVT
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
.:.::.. :
NP_009 RAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 787 init1: 715 opt: 828 Z-score: 826.5 bits: 161.1 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 828; 41.8% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (6-309:4-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
::.. .::.: :... : . ..: .:: .::.:.:::. .:. : .: .:: :
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
.:.::..:.:.: :. :.::::. ... :: : :.::.::..: .. . ..:..:
NP_002 VYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
::::::::: :: : . :: :: :::. .:.. :. :.:. :. :.::: :::..
NP_002 AYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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NP_002 CEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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NP_002 STCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMH
240 250 260 270 280 290
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NP_002 GALGRLLDKHFKRLT
300 310
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]