FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4087, 452 aa 1>>>pF1KE4087 452 - 452 aa - 452 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7384+/-0.000456; mu= 17.3837+/- 0.028 mean_var=147.9047+/-32.359, 0's: 0 Z-trim(114.7): 217 B-trim: 1050 in 2/52 Lambda= 0.105459 statistics sampled from 24283 (24627) to 24283 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 8.830 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 3018 471.5 2.1e-132 XP_016873516 (OMIM: 606124) PREDICTED: tripartite ( 375) 1410 226.7 8.2e-59 NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 836 139.5 1.9e-32 NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 799 133.9 9.1e-31 XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 788 132.2 2.9e-30 NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 706 119.7 1.7e-26 XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 674 114.9 4.9e-25 NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 674 114.9 4.9e-25 XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 674 114.9 4.9e-25 XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 674 114.9 4.9e-25 NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 674 114.9 4.9e-25 XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 593 102.5 2.4e-21 NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 524 92.1 3.7e-18 NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 524 92.1 3.7e-18 NP_001008275 (OMIM: 613288) tripartite motif-conta ( 477) 488 86.6 1.6e-16 NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 478 85.1 4.7e-16 NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 478 85.1 4.9e-16 XP_016873951 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 300) 465 82.8 1.4e-15 NP_149084 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 326) 465 82.8 1.4e-15 XP_005253241 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 326) 465 82.8 1.4e-15 NP_149083 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 347) 465 82.9 1.5e-15 NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 466 83.2 1.7e-15 XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 466 83.2 1.7e-15 NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 452 80.9 5.9e-15 NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 445 80.1 1.6e-14 XP_016873952 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 440 78.9 1.8e-14 XP_006718421 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 440 78.9 1.8e-14 XP_011518728 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 440 79.0 2e-14 XP_016873950 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 440 79.0 2e-14 XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 434 78.0 3.3e-14 XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 434 78.0 3.3e-14 NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 437 78.8 3.6e-14 XP_016873949 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 314) 432 77.8 4.6e-14 XP_011518729 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 271) 427 77.0 7.1e-14 NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 418 75.6 1.8e-13 NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 405 74.0 1e-12 NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487) 378 69.8 1.8e-11 NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487) 378 69.8 1.8e-11 NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 372 68.6 2.3e-11 XP_011512567 (OMIM: 609316) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 421) 371 68.7 3.4e-11 NP_008959 (OMIM: 609316) E3 ubiquitin-protein liga ( 425) 371 68.7 3.4e-11 XP_005249431 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 XP_005249433 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539) 372 69.0 3.6e-11 XP_005249434 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 NP_001229712 (OMIM: 600830) tripartite motif-conta ( 539) 372 69.0 3.6e-11 XP_005249432 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 XP_006715243 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 372 69.0 3.6e-11 NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486) 370 68.6 4.1e-11 >>NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containing p (452 aa) initn: 3018 init1: 3018 opt: 3018 Z-score: 2498.1 bits: 471.5 E(85289): 2.1e-132 Smith-Waterman score: 3018; 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78.8% identity (80.8% similar) in 452 aa overlap (1-452:1-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKSTG :::::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::.: ::::::::::::: XP_016 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 QINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQE :::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: XP_016 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR :: ::: ::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWK----------- 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCHKP XP_016 ------------------------------------------------------------ 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: XP_016 ------AFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 FLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM :: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: XP_016 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 YWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLMLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTV : :::::::::::. ::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::::: XP_016 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 290 300 310 320 330 340 430 440 450 pF1KE4 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF :::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 350 360 370 >>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa) initn: 677 init1: 336 opt: 836 Z-score: 703.7 bits: 139.5 E(85289): 1.9e-32 Smith-Waterman score: 836; 34.5% identity (62.9% similar) in 447 aa overlap (6-447:7-446) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKST : .. .:. ::::.. :..::.:.::::::. :. : . . : : . NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV--CPVCRQRF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 GQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQ ::. : .. .:.. ...: ... . :..: : ..::: : . :: .:..:. NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCAQSR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 EHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRC-WKDYVNLRLEA .:::: :.: ::.:.:::: . : .: : ..:.:: . : :: :. . NP_003 KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQ-ELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCH :.::. .. : :::...:. :.: .. .. : ..::.:.. . :. . ::.. :: NP_003 IHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPEL-SAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEAN . .:::: .:.:::: :. . .::: :. . ::. : ::::: . :: NP_003 SSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SDIFLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF-LAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFG ..: : :.. .: .:..: :. .. ::: : :::.:::: : . : .: NP_003 PWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAWDLG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 VCNMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCV-KNDIQRSLFTTSPLMLQYIPRPTSRVGLFLDC :: ..:.. .....:.. . :. . . . .:: :: : .::.::: NP_003 VCRDSVRRKGH-FLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQV---PPCQVGIFLDY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 EAKTVSFVDV-NQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF :: ::: .. ...::::.. .:.:. ::::.: NP_003 EAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGST 420 430 440 450 460 470 NP_003 DY >>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa) initn: 687 init1: 259 opt: 799 Z-score: 673.4 bits: 133.9 E(85289): 9.1e-31 Smith-Waterman score: 799; 34.0% identity (60.4% similar) in 450 aa overlap (9-447:10-442) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNW--KDSPFLVQCSECTK .:.: : ::..:: ::: ::::.::: :. : ..:. : :: . NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPY--ACPECRE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 STGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSS . : ::. : . ::: .::. : . .: .::: :: . ::: : NP_660 LSPQRNLRPNRPLAKMAEMARR--LHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 SQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRC--WKDYVNLR : :: :: :...:::. . :: .... : .: .. ..... .: : :. .:. . NP_660 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHL-RKQMQDALLFQAQADET-CVLWQKMVESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNE . . .:.... . :::.. :. :... ... ::. . :..... : . ::. NP_660 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 MCHKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPEL-SAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHE :. : . ::: . : :.: ..: :. :. . :: .. . :: . : .:: .:: . NP_660 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 EANSDIFLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF----LAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDS :: ...: : ::. : .: .: .:. : . : . ::::..::::.::: NP_660 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALP---DSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 WNWAFGVC--NMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLMLQYIPRPTSR .::.::: :. :::.. .: : .:: :. .:.: .:: : : NP_660 TSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERAL---APLR-----DPPRR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 VGLFLDCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF ::.::: :: .:: .....::.. .:. :: :::.: NP_660 VGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGD 410 420 430 440 450 460 NP_660 TLAPQ >>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa) initn: 706 init1: 239 opt: 788 Z-score: 664.3 bits: 132.2 E(85289): 2.9e-30 Smith-Waterman score: 788; 34.0% identity (60.4% similar) in 450 aa overlap (9-447:10-441) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNW--KDSPFLVQCSECTK .:.: : ::..:: ::: ::::.::: :. : ..:. : :: . XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPY--ACPECRE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 STGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSS . : ::. : . ::: .::. : . .: .::: :: . ::: : XP_016 LSPQRNLRPNRPLAKMAEMARR--LHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 SQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRC--WKDYVNLR : :: :: :...:::. . :: .... : .: .. ..... .: : :. .:. . XP_016 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHL-RKQMQDALLFQAQADET-CVLWQ-MVESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNE . . .:.... . :::.. :. :... ... ::. . :..... : . ::. XP_016 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 MCHKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPEL-SAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHE :. : . ::: . : :.: ..: :. :. . :: .. . :: . : .:: .:: . XP_016 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 EANSDIFLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF----LAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDS :: ...: : ::. : .: .: .:. : . : . ::::..::::.::: XP_016 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALP---DSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 WNWAFGVC--NMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLMLQYIPRPTSR .::.::: :. :::.. .: : .:: :. .:.: .:: : : XP_016 TSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERAL---APLR-----DPPRR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 VGLFLDCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF ::.::: :: .:: .....::.. .:. :: :::.: XP_016 VGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGD 410 420 430 440 450 460 XP_016 TLAPQ >>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa) initn: 656 init1: 444 opt: 706 Z-score: 596.7 bits: 119.7 E(85289): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 706; 30.0% identity (59.2% similar) in 453 aa overlap (6-447:20-465) 10 20 30 40 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDS :. .: : : .:..:. .:: :.:::.::. :. :.: NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 PFLVQCSECTKSTGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEV : : :.. .:. : .. .:. .:.... .:..: :.:. ..:: NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 DRSLLCLLCSSSQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTR :. .::.:. :. :: : :...:..:..::: . .. : .: : : . : . NP_742 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 CWKDYVNLRLEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREIL : :. : . : :.... ::.. : :... .::..::. . :... .:. : NP_742 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 RGMYEELNEMCHKPDVELLQAFGDILHRSESV----LLHMPQPLNPELSAGP--ITGLRD . :.. : . :.:. . :.. :.: . . :. ..: : .:: NP_742 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE4 RLNQFRVHITLHHEEANSDIFLCEILRSM-CIGCDHQDVPYFTATPRSFLAW----GAQT :.:. . .:: : :. .. : : .:. . .:.: ::: : . ... NP_742 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLP---DTPRRFTFYPCVLATEG 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 FTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTS ::::..::::.:::. .:: ::: ..:.. . : : . . ..: . ::. NP_742 FTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLP-ETGYWRVRLWNGD--KYAATTT 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 PLMLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF :. .: .:::.::: :: :.:: .:.. : :::. . .:. : :.: NP_742 PFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGR 420 430 440 450 460 470 NP_742 KNAAPLTIRPPTDWE 480 >>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 630 init1: 257 opt: 674 Z-score: 570.5 bits: 114.9 E(85289): 4.9e-25 Smith-Waterman score: 674; 29.9% identity (56.4% similar) in 461 aa overlap (9-448:10-457) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDS---------PFLV .:.: : ::..:: ::: :::.::: :. :.:. . XP_006 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 QCSECTKSTGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSL : :: . . : :: : . :.: .:.. .....: :.: :.::. :.: XP_006 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGL----QKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LCLLCSSSQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKD .:..: :.::: :: : : :.. .. :: . :. : :. .. : :. XP_006 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 YVNLRLEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMY :. : : : :..:: . :::.. :. :. . .. ::. : : . .. . :. . XP_006 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EELNEMCHKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQ---PLNPELSAGPITGLRDRLNQFRV .:.: . ...:: . . : :...: .. :. : :. .. . : . : : XP_006 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPR-TVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 HITLHHEEANSDIFLCEILRSMCIGCDHQDVPY-----FTATPRSFLAWGAQTFTSGKYY .. : ..: : . .: . . . :.: : : : .:.::..: XP_006 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYP---CAVGQTAFSSGRHY 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE4 WEVHV---GDSWNWAFGVCNMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTT-SPLM ::: . ::. ::.::: ..:.. : :.:.... :. : :.. .:.: XP_006 WEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCP-ENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVM 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF :. .: :..:.::: :: ::: .:...: ..: . .: ::.:.:: XP_006 LM---EPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV 420 430 440 450 460 XP_006 ISTVTMWVKG 470 >>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa) initn: 630 init1: 257 opt: 674 Z-score: 570.5 bits: 114.9 E(85289): 4.9e-25 Smith-Waterman score: 674; 29.9% identity (56.4% similar) in 461 aa overlap (9-448:10-457) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDS---------PFLV .:.: : ::..:: ::: :::.::: :. :.:. . NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 QCSECTKSTGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSL : :: . . : :: : . :.: .:.. .....: :.: :.::. :.: NP_057 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGL----QKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LCLLCSSSQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKD .:..: :.::: :: : : :.. .. :: . :. : :. .. : :. NP_057 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 YVNLRLEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMY :. : : : :..:: . :::.. :. :. . .. ::. : : . .. . :. . NP_057 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EELNEMCHKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQ---PLNPELSAGPITGLRDRLNQFRV .:.: . ...:: . . : :...: .. :. : :. .. . : . : : NP_057 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPR-TVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 HITLHHEEANSDIFLCEILRSMCIGCDHQDVPY-----FTATPRSFLAWGAQTFTSGKYY .. : ..: : . .: . . . :.: : : : .:.::..: NP_057 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYP---CAVGQTAFSSGRHY 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE4 WEVHV---GDSWNWAFGVCNMYWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTT-SPLM ::: . ::. ::.::: ..:.. : :.:.... :. : :.. .:.: NP_057 WEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCP-ENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVM 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF :. .: :..:.::: :: ::: .:...: ..: . .: ::.:.:: NP_057 LM---EPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV 420 430 440 450 460 NP_057 ISTVTMWVKG 470 >>XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 630 init1: 257 opt: 674 Z-score: 570.5 bits: 114.9 E(85289): 4.9e-25 Smith-Waterman score: 674; 29.9% identity (56.4% similar) in 461 aa overlap (9-448:10-457) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDS---------PFLV .:.: : ::..:: ::: :::.::: :. :.:. . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 QCSECTKSTGQINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSL : :: . . : :: : . :.: .:.. .....: :.: :.::. :.: XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGL----QKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LCLLCSSSQEHRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKD .:..: :.::: :: : : :.. .. :: . :. : :. .. : :. XP_011 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 YVNLRLEAIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMY :. : : : :..:: . :::.. :. :. . .. ::. : : . .. . :. . 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