Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0564
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0564, 448 aa
1>>>pF1KE0564 448 - 448 aa - 448 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1161+/-0.000479; mu= 0.0158+/- 0.029
mean_var=273.8983+/-54.827, 0's: 0 Z-trim(117.8): 150 B-trim: 502 in 2/53
Lambda= 0.077496
statistics sampled from 29909 (30073) to 29909 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 8.600
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 3005 349.7 9.2e-96
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1899 226.0 1.6e-58
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1899 226.0 1.6e-58
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1885 224.5 4.7e-58
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1819 217.1 7.2e-56
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1754 209.8 1.1e-53
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1752 209.6 1.3e-53
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1731 207.2 6.8e-53
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1718 205.8 1.8e-52
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1588 191.3 4.4e-48
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1588 191.3 4.8e-48
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1564 188.6 3.1e-47
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1552 187.3 7.5e-47
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1513 182.9 1.5e-45
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1227 150.9 6.6e-36
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1220 150.1 1.1e-35
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1208 148.7 2.6e-35
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1201 148.0 4.7e-35
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1190 146.8 1.2e-34
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1188 146.5 1.3e-34
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1188 146.6 1.3e-34
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1176 145.2 3.4e-34
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1165 144.0 7.4e-34
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1115 138.5 4.5e-32
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1115 138.5 4.7e-32
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1087 135.3 3.5e-31
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1027 128.5 3.3e-29
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 996 125.1 3.9e-28
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 984 123.8 9.9e-28
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 974 122.4 1.4e-27
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 980 123.3 1.4e-27
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 979 123.2 1.4e-27
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 979 123.2 1.4e-27
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 980 123.4 1.5e-27
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 961 121.2 5.6e-27
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 961 121.2 5.6e-27
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 909 115.5 4.1e-25
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 904 114.8 4.9e-25
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 892 113.4 1.2e-24
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 889 113.1 1.5e-24
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 857 109.5 1.7e-23
XP_011522641 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 289) 779 100.6 5.6e-21
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 701 91.9 2.3e-18
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 701 91.9 2.3e-18
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 701 91.9 2.3e-18
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 608 81.7 4.2e-15
NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 608 81.7 4.2e-15
NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438) 608 81.7 4.3e-15
XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472) 608 81.7 4.5e-15
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 595 80.6 2e-14
>>NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular Ha2 (448 aa)
initn: 3005 init1: 3005 opt: 3005 Z-score: 1840.2 bits: 349.7 E(85289): 9.2e-96
Smith-Waterman score: 3005; 100.0% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPSCTTC
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE0 VPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
430 440
>>XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, type I (455 aa)
initn: 1943 init1: 1798 opt: 1899 Z-score: 1171.8 bits: 226.0 E(85289): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1915; 67.0% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (1-448:1-455)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNC--RPELCLGYVCQPMACLPSVCLP----T
:.:.: .. ..:::: : :: :. :. : .:.: :.: .
XP_011 MASKCLKAGFSSGSLKS-PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSM-GPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTR
..: .::: : :.:.. :. : :.:..:: ..:::::::: ::::::.:: .
XP_011 SYRATSCLPAL-----CLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDN
::::::::: :::::.: ..:: : :::::.::::::::.: ::.::::::.::.:::
XP_011 VRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKN
:::::::::.:::.:...:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::
XP_011 AKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEE
:::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::..:: ::::.:.:.. : ::
XP_011 HEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQ
:::::..::::::. :..::.::::::.::::::::::.::.::.::.:.::::::::::
XP_011 LNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: :::::::.
XP_011 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCA
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE0 ---TPS--CTTCVPSP-CVP---RTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
.:: : :.:. : : :: : :: . : ::: ::.
XP_011 PDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPI---CVPCPGGRF
420 430 440 450
>>NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular Ha5 (455 aa)
initn: 1943 init1: 1798 opt: 1899 Z-score: 1171.8 bits: 226.0 E(85289): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1915; 67.0% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (1-448:1-455)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNC--RPELCLGYVCQPMACLPSVCLP----T
:.:.: .. ..:::: : :: :. :. : .:.: :.: .
NP_002 MASKCLKAGFSSGSLKS-PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSM-GPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTR
..: .::: : :.:.. :. : :.:..:: ..:::::::: ::::::.:: .
NP_002 SYRATSCLPAL-----CLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDN
::::::::: :::::.: ..:: : :::::.::::::::.: ::.::::::.::.:::
NP_002 VRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKN
:::::::::.:::.:...:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::
NP_002 AKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEE
:::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::..:: ::::.:.:.. : ::
NP_002 HEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQ
:::::..::::::. :..::.::::::.::::::::::.::.::.::.:.::::::::::
NP_002 LNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: :::::::.
NP_002 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCA
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE0 ---TPS--CTTCVPSP-CVP---RTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
.:: : :.:. : : :: : :: . : ::: ::.
NP_002 PDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPI---CVPCPGGRF
420 430 440 450
>>NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular Ha6 (467 aa)
initn: 1930 init1: 1765 opt: 1885 Z-score: 1163.2 bits: 224.5 E(85289): 4.7e-58
Smith-Waterman score: 1896; 66.4% identity (82.9% similar) in 455 aa overlap (1-445:1-438)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKS-C------PRPASVCSSGVNCR-PELC--LGYVCQPMACLPSV
:... :. . .:.:. : : .:. : : .:: : : ::. . . : ..
NP_003 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVG-SCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASY
.::: .:::: :.. :: .: :.:. ::.:::.:::::::::::::.:
NP_003 --------GSCLPGSYLSSECHT----SGFVGSGGWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLANY
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVN
: .:::::.::::::::::: . :. . :::::.:.:::..::::: ::.::::.:..
NP_003 LEKVRQLERENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCL
::::::::::::.:::.::..::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_003 IDNAKLAADDFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQ
::::::::. ::::::::::.::::::::::...::.:::::::.:: :::::: ::: :
NP_003 KKNHEEEVSVLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 MEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQ
:::::::..:::::: :..::.::::::.::::::::::.:.:::.::.:.:::::::
NP_003 TEELNQQVVSSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCN
::::::.:.::::::.::: :::::::::::::::.::::::: ::: :::.:::::: .
NP_003 LAQMQCLISNVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KE0 PCSTPSCTTCVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
::.: .: . : :: . ::: ..::.: ::
NP_003 PCAT-ACKPVIRVPSVPPVPCVP---SVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQ
410 420 430 440 450 460
NP_003 SRPL
>>NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular Ha1 (416 aa)
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20 30 40 50 60 70
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::::. :. :. . : . .:
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80 90 100 110 120 130
pF1KE0 GISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQ
.: .... .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. :.: :..:
NP_002 NIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERSQQQ
40 50 60 70 80 90
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. :.:::.:.:::::::::::::.::::.::.::::::::::::.::..::..::::
NP_002 EPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCTKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTELSLRQLV
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:.::::::::::.:::::.:::::::::::::.:::.:::.::..::::::::::.::::
NP_002 ESDINGLRRILDELTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKSNHEQEVNTLRCQLGDRLNVEVDA
160 170 180 190 200 210
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:: :::.:::.: : ::::.::.:::.::.::. : ::::.::..::::::.::..::.:
NP_002 APTVDLNRVLNETRSQYEALVETNRREVEQWFTTQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEIIEL
220 230 240 250 260 270
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:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.: .:::::.::::::.:::::
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::::::::::::::: ::::::::::.:::.:: :::.: . . .::. : : :::
NP_002 NQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCNLPSNPCATTNACSKPIGPCLSNPCTSCVP
340 350 360 370 380 390
440
pF1KE0 RTVGMPCSPC-PQGRY
. ::.:: :. :
NP_002 PA---PCTPCAPRPRCGPCNSFVR
400 410
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10 20 30 40 50 60
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..: : : ..: : : : :: .
NP_004 MSYSCGLPSLSCRTS-CSSRPCVPPSCHGC
10 20
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: : ..:. ...:. .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..::::
NP_004 T-LPGACNIPANVSNC----NWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAEL
30 40 50 60 70 80
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:. :.: :..: . .:::.:.:::::::::::.:.::::.::.:::::::.::::.:
NP_004 ENLIRERSQQQEPLVCASYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLASDDFRTK
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::.::..:::::.::::::::::.::::..:::::::::::::.:::.:::.::..::::
NP_004 YETELSLRQLVESDINGLRRILDELTLCRSDLEAQVESLKEELLCLKQNHEQEVNTLRCQ
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::::::.:::::: :::..::.: : ::::.::.:::.::.:: : ::::.::..::::
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pF1KE0 LQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQ
::.::..::.::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.: .:::::.:
NP_004 LQSYQAEIIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQRLITNVESQ
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pF1KE0 LAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTPS-CTT----
:::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::: :::.: . :
NP_004 LAEIRSDLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACDKSTGP
330 340 350 360 370 380
420 430 440
pF1KE0 CVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
:. .:: :. : :
NP_004 CISNPCGLRARCGPCNTFGY
390 400
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20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLP-SVCLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQA--
.: . :::. .:: :. . ::..
NP_002 MPYNFCLPSLSCRTSCSSRPCVPPSCHGYT
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 ---ASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQE
: .: .... .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. :.:
NP_002 LPGACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRE
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
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:..: . :.:::.:.:::::::::::.:.::::.::.::::::::::::.::..: .
NP_002 RSQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTEQS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
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.:::::.:::.::::::.::::..:::::.:::::::. ::.:::.::..::::::::::
NP_002 LRQLVESDINSLRRILDELTLCRSDLEAQMESLKEELLSLKQNHEQEVNTLRCQLGDRLN
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.:::::: :::..::.: : ::::.::.:::.::.:: : ::::.::..::::::.::.
NP_002 VEVDAAPAVDLNQVLNETRNQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSYQA
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.::.::::::.:::::::::.:: :::::::::::::::::.:.: .:::::.::::::.
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280 290 300 310 320 330
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:::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::: :::.: . : .:: .::
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::. : :
NP_002 GPRSRCGPCNTFGY
400
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.:: . . ..: : ..: : ::::.
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10 20 30 40 50
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: : :: . : : ..:. ...:. .:. ::.:::.::::::::::::::
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:: .:::::..:::::. ::: :..: . :.:::.:.:::::::::::.::::::.::
NP_066 YLEKVRQLERDNAELEKLIQERSQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCAKAENARLVV
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::::::::.::::.::..: ..: :::.:::..:::::.:::::.:::.:::::.:::.:
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:::::::::..:: :::::::.:::.:: :::..::.: : ::::.:: :::.::.::
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pF1KE0 QMEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSS
: ::::.::..::::::. :..::.::::::.:::::::::.::::::::::::::.:::
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::.:.: .:::::.:::::: :::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::
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:::.: . . .::
NP_066 NPCATTNASGNSCGPCGTSQKGCCN
420 430
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20 30 40 50 60 70
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: :::. .:: :. . ::..
XP_011 MDTKIPLSTLAPIFVSCTMSYSCCLPSLGCRTSCSSRPCVPPSCHGYTLPG
10 20 30 40 50
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: .: .... .:. ::.:::.:::::::::::::::: .:::::..:::::. ::: :.
XP_011 ACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELEKLIQERSQ
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.: . :.:::.:.:::::::::::.::::::.::::::::::.::::.::..: ..:
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:::.:::..:::::.:::::.:::.:::::.:::.::::::::::..:: :::::::.::
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:.:: :::..::.: : ::::.:: :::.::.:: : ::::.::..::::::. :..::
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.::::::.:::::::::.::::::::::::::.:::::.:.: .:::::.:::::: :::
XP_011 ELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRCDLE
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::::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::.: . . .::
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XP_011 N
>>NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskeletal (431 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPAS
:::.: :. : .:: :: :. . .: : .: : .: : : .: :
NP_872 MTSDCSSTH---CSPESCGT-ASGCAPASSCSVET----ACLPGTCATSRCQTPSFLSRS
10 20 30 40 50
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pF1KE0 -----CLSKTYLSSSCQAASGISGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVR
:: :...::.. . : .: .:.:..::::::::::::::::: .::
NP_872 RGLTGCLLPCYFTGSCNSPCLV----GNCAWCEDGVFTSNEKETMQFLNDRLASYLEKVR
60 70 80 90 100
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pF1KE0 QLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAK
.::. :::::::::: .... . :::: .: :::.::::::::::::.:..:..:: :
NP_872 SLEETNAELESRIQEQCEQDIPMVCPDYQRYFNTIEDLQQKILCTKAENSRLAVQLDNCK
110 120 130 140 150 160
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pF1KE0 LAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHE
::.:::..:::.::..:::.::::..:. ::..:::::.::::.::::::.:.:::::::
NP_872 LATDDFKSKYESELSLRQLLEADISSLHGILEELTLCKSDLEAHVESLKEDLLCLKKNHE
170 180 190 200 210 220
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:::. :: ::::::..:.:.:: .::.:::.::::: :... :::..:::. .: ::::
NP_872 EEVNLLREQLGDRLSVELDTAPTLDLNRVLDEMRCQCETVLANNRREAEEWLAVQTEELN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQ
:: .:.::::. : .:..:.::...::::::::.:: .::: :..:.::.:::::::.:
NP_872 QQQLSSAEQLQGCQMEILELKRTASALEIELQAQQSLTESLECTVAETEAQYSSQLAQIQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 CMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTP
:.: :.: :::::: :::::::::::::::.:::::::::: .::..:: .: :.::::
NP_872 CLIDNLENQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEINTYWGLLDSEDSRLSCSPCST-
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 SCT---TCVPSPCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
.:: :: :: ..:
NP_872 TCTSSNTC--EPCSAYVICTVENCCL
410 420 430
448 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:11:21 2016 done: Wed Nov 2 23:11:22 2016
Total Scan time: 8.600 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]