Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4254, 1009 aa
1>>>pF1KE4254 1009 - 1009 aa - 1009 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5282+/-0.00118; mu= -9.9215+/- 0.071
mean_var=481.6795+/-101.071, 0's: 0 Z-trim(114.4): 56 B-trim: 154 in 1/52
Lambda= 0.058438
statistics sampled from 14967 (15013) to 14967 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.461), width: 16
Scan time: 5.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009) 6822 590.6 5.4e-168
CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 ( 559) 3525 312.4 1.7e-84
CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 396) 1846 170.7 5.3e-42
CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 775) 1507 142.4 3.5e-33
CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 426) 1295 124.3 5.4e-28
CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 757) 1153 112.5 3.3e-24
CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 801) 1153 112.6 3.4e-24
>>CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009 aa)
initn: 6822 init1: 6822 opt: 6822 Z-score: 3129.4 bits: 590.6 E(32554): 5.4e-168
Smith-Waterman score: 6822; 100.0% identity (100.0% similar) in 1009 aa overlap (1-1009:1-1009)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEYAGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEYAGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGRRTSVPSPEQPQPYRTLRESDSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGRRTSVPSPEQPQPYRTLRESDSAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GDEAESPEQQVRKSTGPVPAPPDRAASIDLLEDVFSNLDMEAALQPLGQAKSLEDLRAPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GDEAESPEQQVRKSTGPVPAPPDRAASIDLLEDVFSNLDMEAALQPLGQAKSLEDLRAPK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DLREQPGTFDYQRLDLGGSERSRGVTVALKLTHPYNKLWSLGQDDMAIPSKPPAASPEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DLREQPGTFDYQRLDLGGSERSRGVTVALKLTHPYNKLWSLGQDDMAIPSKPPAASPEKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 SALLGNSLALPRRPQNRDSILNPSDKEEVPTPTLGSITIPRPQGRKTPELGIVPPPPIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SALLGNSLALPRRPQNRDSILNPSDKEEVPTPTLGSITIPRPQGRKTPELGIVPPPPIPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PAKLQAAGAALGDVSERLQTDRDRRAALSPGLLPGVVPQGPTELLQPLSPGPGAAGTSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PAKLQAAGAALGDVSERLQTDRDRRAALSPGLLPGVVPQGPTELLQPLSPGPGAAGTSSD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 ALLALLDPLSTAWSGSTLPSRPATPNVATPFTPQFSFPPAGTPTPFPQPPLNPFVPSMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ALLALLDPLSTAWSGSTLPSRPATPNVATPFTPQFSFPPAGTPTPFPQPPLNPFVPSMPA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 APPTLPLVSTPAGPFGAPPASLGPAFASGLLLSSAGFCAPHRSQPNLSALSMPNLFGQMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 APPTLPLVSTPAGPFGAPPASLGPAFASGLLLSSAGFCAPHRSQPNLSALSMPNLFGQMP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MGTHTSPLQPLGPPAVAPSRIRTLPLARSSARAAETKQGLALRPGDPPLLPPRPPQGLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGTHTSPLQPLGPPAVAPSRIRTLPLARSSARAAETKQGLALRPGDPPLLPPRPPQGLEP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE4 TLQPSAPQQARDPFEDLLQKTKQDVSPSPALAPAPDSVEQLRKQWETFE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TLQPSAPQQARDPFEDLLQKTKQDVSPSPALAPAPDSVEQLRKQWETFE
970 980 990 1000
>>CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (559 aa)
initn: 3525 init1: 3525 opt: 3525 Z-score: 1630.6 bits: 312.4 E(32554): 1.7e-84
Smith-Waterman score: 3525; 100.0% identity (100.0% similar) in 526 aa overlap (1-526:1-526)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEYAGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEYAGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGRRTSVPSPEQPQPYRTLRESDSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGRRTSVPSPEQNTIATPATLHILQK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GDEAESPEQQVRKSTGPVPAPPDRAASIDLLEDVFSNLDMEAALQPLGQAKSLEDLRAPK
CCDS35 SITHFAAKFPTRGWTSSSH
550
>>CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (396 aa)
initn: 1821 init1: 1613 opt: 1846 Z-score: 867.5 bits: 170.7 E(32554): 5.3e-42
Smith-Waterman score: 1846; 70.9% identity (90.7% similar) in 378 aa overlap (28-404:16-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
.:.: : .::::..:::.::.. :::::: :.
CCDS72 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
.. .::::.::::::::.::::::::::.::. :.:::::::::::.::::: ::::
CCDS72 RVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
.:. ::. :: :..:.. :.: .. :.::::::: .::. ::.:::.:::::::::::
CCDS72 AKELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
:::::.::::::.::::.:: :::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::
CCDS72 VNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
:::::::::: ::.:.:.: .:.:::.:::::::::.::.::..::.::.:.:::.:::
CCDS72 APMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALKNKLKKQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
::.::::::::::.::::.:::::.::. .: ::::::::.::.: ::..:.:::..: .
CCDS72 STATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEESFVKH-RSSVMKQFLETAIN
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE4 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEY-AGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTV
:::::::::::: ::.:.::::::::::. : . .:.::: ...
CCDS72 LQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAK
>>CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (775 aa)
initn: 1149 init1: 1089 opt: 1507 Z-score: 709.2 bits: 142.4 E(32554): 3.5e-33
Smith-Waterman score: 2112; 48.5% identity (73.0% similar) in 738 aa overlap (1-707:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
: : : ::. ::.. ..: . . :: : .::::..:::.::.. :::::: :.
CCDS72 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENE--DPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
.. .::::.::::::::.::::::::::.::. :.:::::::::::.::::: ::::
CCDS72 RVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSV--------------------HSYFTVPDT
.:. ::. :: :..:.. :.: .. :.::: :::: .::.
CCDS72 AKELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKDQPALVPHSYFIAPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 RELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYP
::.:::.::::::::::::::::.::::::.::::.:: :::::::::::::::.:::
CCDS72 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 MYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFD
:::::.:::::::::::::::::::::::: ::.:.:.: .:.:::.:::::::::.::.
CCDS72 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 DLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEE
::..::.::.:.:::.::: ::.::::::::::.::::.:::::.::. .: ::::::::
CCDS72 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE4 AFVSHYRSGAMRQFLQNATQLQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEYAGSD-K
.::.: ::..:.:::..: .:::::::::::: ::.:.::::::::::. : . :.. .
CCDS72 SFVKH-RSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGNPR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LYHQWLSTVRKGSGAILNTVKTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGC
:.::. ::.:: ::..::. :::.::..:.:::::.:::.:.::::..::.:. :.
CCDS72 SYQQWVHTVKKG-GALFNTAMTKATPAVRTAYKFAKNHAKLGLKEVKSKLKHKENEEDYG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 APTPEEQLPKTAPSPLVEAKDPKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGRRT
. . : .:. . .. : .... ...:.: .::: ... .:
CCDS72 TCSSSVQY-----TPVYKLHNEKGGNSEKR---KLAQAR------LKRPLKSL--DG---
480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 SVPSPEQPQPYRTLRESDSAEGDEAESPEQQVRKSTGPVPAPPDRAASIDLLEDVFSNLD
.. . :. . . . .: .:.:: . . :. : .. .::: .....:.
CCDS72 ALYDDEDDDDIERASKLSSEDGEEASAYLYESDDSVETRVKTP-YSGEMDLLGEILDTLS
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 MEAALQ-PLGQAKSLEDLRAPKDLREQPGTFDYQRLDLGGSERSRGVTVALKLTHPYNKL
... : :. ::::. .:. :. ::. . ... ... . .
CCDS72 THSSDQGKLAAAKSLDFFRSMDDI-------DYKPTNKSNAPSENNLAFLCGGSGDQAE-
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KE4 WSLGQDDMAIPSK--PPAASPEKPSALLGNSL-ALPRRPQNR----DSILNPSD--KEEV
:.::::: :. .: ::. . :. : .:: : .. .:. :.. .:.. ..
CCDS72 WNLGQDDSALHGKHLPPSPRKRVSSSGLTDSLFILKEENSNKHLGADNVSDPTSGLDFQL
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 PTPTLGSITIPRPQGRKTPELGIVPPPPIPRPAKLQAAGAALGDVSERLQTDRDRRAALS
.: ... . . :.:
CCDS72 TSPEVSQTDKGKTEKRETLSQISDDLLIPGLGRHSSTFVPWEKEGKEAKETSEDIGLLHE
690 700 710 720 730 740
>>CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 1285 init1: 1077 opt: 1295 Z-score: 616.0 bits: 124.3 E(32554): 5.4e-28
Smith-Waterman score: 1828; 64.9% identity (83.8% similar) in 425 aa overlap (1-404:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
: : : ::. ::.. ..: . . :: : .::::..:::.::.. :::::: :.
CCDS41 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASEN--EDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
.. .::::.::::::::.::::::::::.::. :.:::::::::::.::::: ::::
CCDS41 RVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSV--------------------HSYFTVPDT
.:. ::. :: :..:.. :.: .. :.::: :::: .::.
CCDS41 AKELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKDQPALVPHSYFIAPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 RELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYP
::.:::.::::::::::::::::.::::::.::::.:: :::::::::::::::.:::
CCDS41 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 MYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFD
:::::.:::::::::::::::::::::::: ::.:.:.: .:.:::.:::::::::.::.
CCDS41 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 DLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEE
::..::.::.:.:::.::: ::.::::::::::.::::.:::::.::. .: ::::::::
CCDS41 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE4 AFVSHYRSGAMRQFLQNATQLQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEY-AGSDK
.::.: ::..:.:::..: .:::::::::::: ::.:.::::::::::. : . .:.::
CCDS41 SFVKH-RSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LYHQWLSTVRKGSGAILNTVKTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGC
: ...
CCDS41 LQYDYPFSQ
420
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:. ...::::::: .:..::.::::.:::::::::::: ..: .. : .. .:::..:
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::: .:.. :.:..: :::.:. :::::::.:.:.: :.:::: :.:: ::.::::
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CCDS77 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
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CCDS77 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
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pF1KE4 AILNTVKTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPS
:.:..::.:..::.:..:. ::. :.: :.. : :: : . : . .
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: . ... .:.. : ::: :::. :: :: .: . . : ...: :::. :
CCDS77 PALPSRSDRLQQ-RLPITQHFGKNRPLRPSR-RRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCPW
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pF1KE4 PYRTLRESDSAEGDEAESPEQQVRK-STGPVPAPPDRAA-SIDLLEDVFSNLDMEAALQP
..: : . :.: . . . . : : : : . :.: . ..:: .:
CCDS77 AEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSMGAKSAGSLRPSQSLDCCHR--GDLDSCFSLPN
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. . . .: . :. . :: .. . .: .. :. : .. ... : .:.
CCDS77 IPRWQP-DDKKLPEP-EPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQS
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pF1KE4 DMAIPSKPPAASPEKPSALLGNSLALPRRPQNRDSILNPSDKEEVPTPTLGSI-TIPRPQ
. : . : . ::: : . : : :... . . : .: ::: :.. : : :
CCDS77 STA-SADPSIWGDPKPSPLT-EPLILHLTPSHKAA--EDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPP
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pF1KE4 GRKTPELGIVPPPP------IPRPAKLQAAGAALGDVSERL-QTDRDRRAALSPGLLPGV
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CCDS77 --ESPQI-LAPTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGA
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CCDS77 LNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVADLKKCFEG
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CCDS45 REPPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTV----------------------P
.. : .. .:::..: . . : .:: : . : :: :
CCDS45 AQDQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAP
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 DTRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAML
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CCDS45 DSGRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALL
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CCDS45 YPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETT
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280 290 300 310 320 330
pF1KE4 FDDLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFC
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CCDS45 FNDVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFS
300 310 320 330 340 350
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CCDS45 LRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKS----GLKGVQSLLMYKD----
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480 490 500 510 520
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1009 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 03:17:33 2016 done: Sun Nov 6 03:17:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]