FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4203, 710 aa 1>>>pF1KE4203 710 - 710 aa - 710 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9018+/-0.000897; mu= -3.2420+/- 0.054 mean_var=323.0220+/-66.693, 0's: 0 Z-trim(116.9): 39 B-trim: 303 in 1/54 Lambda= 0.071361 statistics sampled from 17541 (17578) to 17541 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.54), width: 16 Scan time: 4.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 710) 4755 503.2 5.6e-142 CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 716) 4733 500.9 2.7e-141 CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 859) 985 115.1 4.5e-25 CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 885) 985 115.1 4.6e-25 CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 902) 985 115.1 4.6e-25 CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 913) 985 115.1 4.7e-25 CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 914) 985 115.1 4.7e-25 CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 ( 777) 719 87.7 7.2e-17 CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22 ( 473) 616 76.9 7.7e-14 CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 768) 598 75.2 4e-13 CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 803) 598 75.2 4.2e-13 >>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (710 aa) initn: 4755 init1: 4755 opt: 4755 Z-score: 2662.4 bits: 503.2 E(32554): 5.6e-142 Smith-Waterman score: 4755; 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CCDS43 TELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQE 630 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 pF1KE4 -----APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQ . . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: CCDS43 KKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQ 690 700 710 720 730 740 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 SSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGD .. .::::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: : CCDS43 VGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDD 750 760 770 780 790 800 680 690 700 710 pF1KE4 RVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS : : ::.::::::::. .: ::.:. CCDS43 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF 810 820 830 840 850 >>CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (885 aa) initn: 1566 init1: 617 opt: 985 Z-score: 563.5 bits: 115.1 E(32554): 4.6e-25 Smith-Waterman score: 1330; 37.7% identity (58.1% similar) in 769 aa overlap (61-696:91-852) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 LRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDP :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: CCDS65 SISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 SFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLPPMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGS :.. :: :::.:. : .: .:. . : . : . :: :: :. :.::. CCDS65 SYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGCILPYSDE--DGGPQDQL--KN--AISSILGT 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KE4 WLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ--- ::... .:: .:: : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: : CCDS65 WLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSP 180 190 200 210 220 230 210 pF1KE4 ----------------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV : :: :.. .: : : CCDS65 VPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAV 240 250 260 270 280 290 220 230 240 pF1KE4 --------------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLL : .:: :.. : :.:: . :.:: CCDS65 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLL 300 310 320 330 340 350 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 DFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGC : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..: CCDS65 VFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANC 360 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 VLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGA :. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: CCDS65 VITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWED 420 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 pF1KE4 VSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----G :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : CCDS65 VSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQG 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 PVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPP :::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: CCDS65 TVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQ 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 ILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSG . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : :: CCDS65 FGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSG 600 610 620 630 640 650 540 550 560 pF1KE4 S------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----AP : : :: .. : : :: : :: ... . CCDS65 SSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESA 660 670 680 690 700 710 570 580 590 600 610 pF1KE4 AGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVI . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. .: CCDS65 SQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCII 720 730 740 750 760 770 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 RVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPD :::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::. CCDS65 RVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPE 780 790 800 810 820 830 680 690 700 710 pF1KE4 NANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS ::::::::. .: ::.:. 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CCDS65 SYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGCILPYSDE--DGGPQDQL--KN--AISSILGT 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 pF1KE4 WLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ--- ::... .:: .:: : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: : CCDS65 WLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSP 200 210 220 230 240 250 210 pF1KE4 ----------------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV : :: :.. .: : : CCDS65 VPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAV 260 270 280 290 300 310 220 230 240 pF1KE4 --------------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLL : .:: :.. : :.:: . :.:: CCDS65 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLL 320 330 340 350 360 370 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 DFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGC : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..: CCDS65 VFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANC 380 390 400 410 420 430 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 VLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGA :. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: CCDS65 VITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWED 440 450 460 470 480 490 370 380 390 400 410 pF1KE4 VSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----G :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : CCDS65 VSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQG 500 510 520 530 540 550 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 PVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPP :::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: CCDS65 TVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQ 560 570 580 590 600 610 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 ILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSG . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : :: CCDS65 FGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSG 620 630 640 650 660 670 540 550 560 pF1KE4 S------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----AP : : :: .. : : :: : :: ... . CCDS65 SSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESA 680 690 700 710 720 730 570 580 590 600 610 pF1KE4 AGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVI . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. .: CCDS65 SQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCII 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 RVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPD :::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::. CCDS65 RVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPE 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 pF1KE4 NANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS ::::::::. .: ::.:. 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CCDS65 TELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQE 680 690 700 710 720 730 570 580 590 600 610 pF1KE4 -----APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQ . . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: CCDS65 KKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQ 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 SSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGD .. .::::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: : CCDS65 VGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDD 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 pF1KE4 RVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS : : ::.::::::::. .: ::.:. CCDS65 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF 860 870 880 890 900 910 >>CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (914 aa) initn: 1554 init1: 617 opt: 985 Z-score: 563.3 bits: 115.1 E(32554): 4.7e-25 Smith-Waterman score: 1320; 37.1% identity (57.9% similar) in 776 aa overlap (61-696:108-881) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 LRRQRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDP :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: CCDS69 SISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDL 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 pF1KE4 SFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-A :.. :: :::.:. : .: .:. . : : . .: . . .:. : CCDS69 SYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNA 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 pF1KE4 VVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EA . :.::.::... .:: .:: : .. ... ::: ..:. :: .. . :: CCDS69 ISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEA 200 210 220 230 240 250 200 210 pF1KE4 EREQ-------------------------------EEEP-----------------PQVW : : : :: :.. CCDS69 EPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQ 260 270 280 290 300 310 220 230 pF1KE4 TGP-PRV--------------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLM .: : : : .:: :.. : :.:: CCDS69 QAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLS 320 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PQGPQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQ . :.:: : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.: CCDS69 EEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQ 380 390 400 410 420 430 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FNTVTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYR ::.:..::. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.: CCDS69 FNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHR 440 450 460 470 480 490 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPP ::..: :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: CCDS69 LKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPK 500 510 520 530 540 550 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 P-----GPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSY : :::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..: CCDS69 ETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNY 560 570 580 590 600 610 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 TLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLARE ...: . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : CCDS69 SIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPS 620 630 640 650 660 670 540 550 560 pF1KE4 KSSSPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD : ::: : :: .. : : :: : :: ... CCDS69 TELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQE 680 690 700 710 720 730 570 580 590 600 610 pF1KE4 -----APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQ . . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: CCDS69 KKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQ 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 SSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGD .. .::::.: :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: : CCDS69 VGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDD 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 pF1KE4 RVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS : : ::.::::::::. .: ::.:. CCDS69 RKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF 860 870 880 890 900 910 >>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 (777 aa) initn: 1285 init1: 649 opt: 719 Z-score: 416.3 bits: 87.7 E(32554): 7.2e-17 Smith-Waterman score: 1331; 38.0% identity (60.8% similar) in 748 aa overlap (12-709:53-741) 10 20 30 40 pF1KE4 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSP ::.. : :: :::::..:. :. : CCDS47 FRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYR------ 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 pF1KE4 AEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQ--DPSFMPAFLAT : .: : :.: : :::. :: :: .:. : . : ::: ::::: CCDS47 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 YRTFVPTACLLGFLLPPMPP-PPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQD .:.:. : :::.. . : :...:. ....:::..:: .::.: CCDS47 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 FRDPPVHSDLGSVRTFL---GWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPP : ....: ...:: :.:: :.. . . :.... ... ::. : CCDS47 F-GSEAKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 RVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP-QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGS .: .:: : : ..: : .:..::::::.: ::: .. .:::. CCDS47 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 VWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLGA------PG------LAAPQRAQ .:..::::: . :.:::::.::: :.: :..::::: :: : ::::. CCDS47 LWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRAR 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 RLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSD ::::::.:..:: ::::::. :..:::::.::.::. .:: ..:. : .: .: ::::. CCDS47 LLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSE 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 ENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDML :.:. .:::.: :: .. : . . .. : :::::::: ::::::.: : : CCDS47 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 EGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVI :. :::.:::::. .:.....:: .:..:.:.: : :.. ::: ::.:.: . CCDS47 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 pF1KE4 EPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSP------SGSPGD--PSSPT---SSV :::..: : .::. : . .. . :. .: .. :: :..:. . . CCDS47 EPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRL 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 pF1KE4 SPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRPF-----ALPLGSPRIPL . : : :. : :. .: :: :: :::: . ::: CCDS47 AQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSH---LSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGG 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 pF1KE4 PAQQS--------------SEARVIRVSID-NDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKH . : :. :.:::... .. :..:.:::.:::::::::. :.:.:. CCDS47 AEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKN 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 NVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS : . : .:.: :.:::.: : :: .:::::::. : .::.::.. : . ...: CCDS47 NRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQR---RRSSTATPGV 690 700 710 720 730 740 CCDS47 TSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF 750 760 770 >>CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22 (473 aa) initn: 532 init1: 404 opt: 616 Z-score: 362.0 bits: 76.9 E(32554): 7.7e-14 Smith-Waterman score: 627; 35.0% identity (61.0% similar) in 346 aa overlap (162-504:144-470) 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 VQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKL ::. .::: . : : : CCDS13 VLPEPNEAKPDDPAPRPGQHALTMPALEPAPPLLADLGPA------LEPESPAALGPPGY 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 LEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGPQLLDFSVDEV :.. : : :: . : . ..: : . . . : : :.. : . CCDS13 LHSAPGPAPAPGEGPPPGTVLEPQSAPESSCPCRGSVKNQPSEEL----PDMTTFPPRLL 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 AEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLG ::::::.: :::.:: :.:::: .:.: : .::::::.:.:: .:.:. : :: CCDS13 AEQLTLMDAELFKKVVLHECLGCIWGQGHLKGNEHMAPTVRATIAHFNRLTNCITTSCLG 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 APGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLS .. : .::. .:.::..:..: : ::::...:.::: :::: .:...:..:: . .. CCDS13 DHSMRARDRARVVEHWIKVARECLSLNNFSSVHVIVSALCSNPIGQLHKTWAGVSSKSMK 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 pF1KE4 TFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLP---SKPPPGPVPYLGTFL ...: . .. .:..:.. . . . .: : : . . : ::.:: :: CCDS13 ELKELCK-----KDTAVKRDLLIKAGSFKVATQERN-PQRVQMRLRRQKKGVVPFLGDFL 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 TDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQN :.: ::.:.:: :.: : .:: :: ..: ..: :: ..: : : ... . .. CCDS13 TELQRLDSAIPDDLDG---NTNKRSKEVRVLQEMQLLQVAAMNYRLRPLEKFVTYFTRME 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 QLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGSPGDPSSPT ::....::.:: .:: CCDS13 QLSDKESYKLSCQLEPENP 460 470 >>CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 (768 aa) initn: 1504 init1: 596 opt: 598 Z-score: 349.0 bits: 75.2 E(32554): 4e-13 Smith-Waterman score: 1497; 40.4% identity (64.5% similar) in 736 aa overlap (11-686:9-721) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR----QRSQRRSPAEGPGGSQAPSPIAN .. .::::::.:.:::: :.:.: : ... . : :.: : : .. CCDS72 MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAANKGARWLGVEGDQLP-P-GH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 TFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELV--FGDREQDPSFMPAFLATYRTFVPTACLLGFLL : .:.: :.:...:. ::.:: .:. ::: .: ... ::.::: :. : .: .:: CCDS72 TVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGD--NDFTYISIFLSTYRGFASTKEVLELLL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PPMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNL--RAVVSVLGSWLQDHPQDFRDPPVHSDLGSVR . :. : . . :. : .: . :..:.: .::.. .:::.:: : .. CCDS72 DRYGNLTSPNCE--EDGSQSSSESKMVIRNAIASILRAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPPRVAQTSDPDSSEACAEE .: ::: ..:..:::.: ..:: : . : : . . : :: CCDS72 DYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQF-----QKQEVETDN---GLPNTISFS-------LEEE 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 EEGLMPQGPQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVR :: .. .. :: : :::::: .: .::.:: ..::: .::.::. .::.: CCDS72 EELEGGESAEFTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIR 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ATVAQFNTVTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQS ::..::::.: ::....::. : . :::. .:::: ::..:: :.::::::::.::::: CCDS72 ATISQFNTLTKCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQS 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KE4 NPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEAT-----EGSQEEDN : :::::..:.:: :. . :..::.::::.::::.:::.:..: .. ..: .:.. CCDS72 NSIYRLKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQ 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 --TPGSLPSKPP----PGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILAR : : . : :::::::::::.:::::: :..:: ::::::::.:.:..:. CCDS72 KRTQRRLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQ 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 IQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISL :. :: :.:: ..: .. .. :. ::::.:: :: :: : . .::. :. :. CCDS72 IKLLQSACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRK--SM 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 pF1KE4 TKRLSAK-LAREKSSSPSGSPGDPSSPTSSVSPGSPPSSPRSR------DAPAGSPPASP .:::: :. . .::. . .:.: .:. : : : : .: :: CCDS72 VKRLSLLFLGSDMITSPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPMD 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 GPQGPSTKLPLS---------LDLPSPRPFAL--PLGSP-------RI------------ :. :. :: : .: : .: ::.:: .: CCDS72 TPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNPKIHKRSVSVTSITS 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 ----PLPAQQSSEARVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACD :. ::. .. .::.:.....::.:.::.::::::.:.:..::. :::. . : . CCDS72 TVLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEE 640 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 pF1KE4 YQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS :.: ::. :. :.:::.:::::::. CCDS72 YELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAK 700 710 720 730 740 750 710 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 03:29:10 2016 done: Sun Nov 6 03:29:11 2016 Total Scan time: 4.790 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]