FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3062, 217 aa 1>>>pF1KE3062 217 - 217 aa - 217 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0999+/-0.000909; mu= 15.0004+/- 0.055 mean_var=76.5637+/-15.282, 0's: 0 Z-trim(107.7): 195 B-trim: 255 in 1/50 Lambda= 0.146576 statistics sampled from 9535 (9760) to 9535 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 2.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11 ( 217) 1471 320.2 6.3e-88 CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX ( 213) 1144 251.0 4.1e-67 CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 603 136.6 1.1e-32 CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 600 136.0 1.8e-32 CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 ( 215) 581 132.0 2.8e-31 CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 562 127.9 4.5e-30 CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 547 124.8 4e-29 CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 533 121.8 3.1e-28 CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 ( 218) 518 118.7 2.9e-27 CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 509 116.7 1e-26 CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 ( 213) 509 116.7 1.1e-26 CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 506 116.1 1.7e-26 CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 ( 203) 505 115.9 1.9e-26 CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 503 115.5 2.6e-26 CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 498 114.4 5.5e-26 CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 212) 495 113.8 8.4e-26 CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 256) 492 113.2 1.5e-25 CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 486 111.9 3e-25 CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 188) 483 111.2 4.4e-25 CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 212) 483 111.2 4.9e-25 CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 190) 480 110.6 6.9e-25 CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 477 110.0 1.1e-24 CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 ( 217) 476 109.8 1.4e-24 CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 471 108.7 2.9e-24 CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4 ( 229) 469 108.3 4e-24 CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 462 106.8 9.9e-24 CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 462 106.8 1.1e-23 CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 462 106.8 1.1e-23 CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 455 105.3 3e-23 CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 ( 227) 454 105.1 3.6e-23 CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 453 105.0 4.4e-23 CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 444 103.0 1.4e-22 CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 438 101.7 3.6e-22 CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX ( 237) 438 101.8 3.9e-22 CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 435 101.1 5.5e-22 CCDS10153.1 RAB27A gene_id:5873|Hs108|chr15 ( 221) 431 100.3 1e-21 CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 419 97.7 5.7e-21 CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3 ( 208) 417 97.3 7.6e-21 CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 414 96.7 1.2e-20 CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 407 95.2 3.4e-20 CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 407 95.2 3.8e-20 CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 406 95.0 3.9e-20 CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 405 94.8 4.5e-20 CCDS54162.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 186) 403 94.3 5.4e-20 CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 206) 401 93.9 7.9e-20 CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX ( 201) 400 93.7 9e-20 CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX ( 201) 399 93.5 1e-19 CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 155) 395 92.5 1.5e-19 CCDS11958.1 RAB27B gene_id:5874|Hs108|chr18 ( 218) 394 92.4 2.3e-19 CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 392 92.0 2.8e-19 >>CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11 (217 aa) initn: 1471 init1: 1471 opt: 1471 Z-score: 1692.0 bits: 320.2 E(32554): 6.3e-88 Smith-Waterman score: 1471; 100.0% identity (100.0% similar) in 217 aa overlap (1-217:1-217) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC 190 200 210 >>CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX (213 aa) initn: 1156 init1: 963 opt: 1144 Z-score: 1318.4 bits: 251.0 E(32554): 4.1e-67 Smith-Waterman score: 1144; 77.0% identity (94.0% similar) in 217 aa overlap (1-217:1-213) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK ::.::.::::::::::::::::::..:::.::: . . ::::::::::::.:::::: CCDS14 MEAIWLYQFRLIVIGDSTVGKSCLIRRFTEGRF----AQVSDPTVGVDFFSRLVEIEPGK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI :::::.::::::::::::::.::::::::.:.:::::::::..:..::::.:..:::..: CCDS14 RIKLQIWDTAGQERFRSITRAYYRNSVGGLLLFDITNRRSFQNVHEWLEETKVHVQPYQI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK ::.:::::::: .::::::.:::::.: :::::::::.:: :::..:: ::::::::.: CCDS14 VFVLVGHKCDLDTQRQVTRHEAEKLAAAYGMKYIETSARDAINVEKAFTDLTRDIYELVK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC .::: ::.::::::::::::.::::::.:: ...:.: CCDS14 RGEITIQEGWEGVKSGFVPNVVHSSEEVVKSERRCLC 180 190 200 210 >>CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 (212 aa) initn: 513 init1: 261 opt: 603 Z-score: 700.2 bits: 136.6 E(32554): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 603; 49.0% identity (78.6% similar) in 192 aa overlap (5-196:3-188) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK . : :. :.:::. ::::::: .::. :: .:. : :.::.: .:.. :. :: CCDS61 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRF----QPVHDLTIGVEFGARMITID-GK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI .::::.::::::: ::::::::::...:..::.::: : .:.:. :::.:... . . CCDS61 QIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNS-NM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK :..:.:.: :: :.:.: .::.: .. . :. ..::::: :.::::.: ...::: :. CCDS61 VIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC .: . :.. .:.: : CCDS61 EGVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC 180 190 200 210 >>CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 (216 aa) initn: 510 init1: 264 opt: 600 Z-score: 696.6 bits: 136.0 E(32554): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 600; 48.4% identity (79.7% similar) in 192 aa overlap (5-196:3-188) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK . : :. :.:::. ::::::: .::. :: .:. : :.::.: .:...:. :: CCDS95 MTYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRF----QPVHDLTIGVEFGARMVNID-GK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI .::::.::::::: ::::::::::...:..::.::: :..:.:. .:::.:... . . CCDS95 QIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLTSWLEDARQHSSS-NM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK :..:.:.: :: :.:.: :::.: .. . :. ..::::: : ::::.: ...::. :. CCDS95 VIMLIGNKSDLESRRDVKREEGEAFAREHGLIFMETSAKTACNVEEAFINTAKEIYRKIQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC .: . ... .:.: : CCDS95 QGLFDVHNEANGIKIGPQQSISTSVGPSASQRNSRDIGSNSGCC 180 190 200 210 >>CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 (215 aa) initn: 558 init1: 244 opt: 581 Z-score: 674.9 bits: 132.0 E(32554): 2.8e-31 Smith-Waterman score: 581; 42.0% identity (73.1% similar) in 212 aa overlap (7-217:10-215) 10 20 30 40 50 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIE : :. :.::: ::::::::.::. .: : :.::.: .:..:. CCDS68 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKF----MADCPHTIGVEFGTRIIEVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PGKRIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQP :..::::.::::::::::..::::::...:...:.::: : ...:...:: .:. ..: CCDS68 -GQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 FRIVFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYE :..:.:.: :: .::.:: :::.... . :. ..:.::: . :::..: .. ::. CCDS68 -NTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LIKKGEICIQDGWEGVK-SGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC :. : . .. . ::. . .:. . . : :. : : CCDS68 NIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC 180 190 200 210 >>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 (207 aa) initn: 498 init1: 246 opt: 562 Z-score: 653.4 bits: 127.9 E(32554): 4.5e-30 Smith-Waterman score: 562; 45.9% identity (79.6% similar) in 181 aa overlap (1-181:1-175) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK : . : :.:..:::: :::.::: ::.. : . . :.:.:: : .:.. :: CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAF----NTTFISTIGIDFKIRTIELD-GK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI .::::.::::::::::.:: .:::...: .::.::::..::...:.:... . ... . CCDS10 KIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASS-DV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK ...:.:::. ..:::..:..:::. : :.:..:::::...::::.: :.:::. .. CCDS10 ERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC . CCDS10 RKMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL 180 190 200 >>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 (207 aa) initn: 495 init1: 247 opt: 547 Z-score: 636.3 bits: 124.8 E(32554): 4e-29 Smith-Waterman score: 547; 44.9% identity (75.5% similar) in 196 aa overlap (1-194:1-190) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK : . : :.:..:::: :::.:.: ::.. : . . :.:.:: : .:.. :: CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAF----NSTFISTIGIDFKIRTIELD-GK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI :::::.::::::::::.:: .:::...: .::.::::..::.....:... . ... . CCDS12 RIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASA-DV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIY-ELI ...:.:::. ..:::..:..:::. : :.:..::::: :::..: :.::: .. CCDS12 EKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KKGE-ICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC :: : : . .::: CCDS12 KKLEGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL 180 190 200 >>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 (203 aa) initn: 487 init1: 242 opt: 533 Z-score: 620.4 bits: 121.8 E(32554): 3.1e-28 Smith-Waterman score: 533; 45.1% identity (77.5% similar) in 182 aa overlap (1-182:1-174) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIEPGK : . . :.:..:::: :::.::. ::.. : . :.:.:: : ..:: :: CCDS10 MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYIS----TIGIDFKIRTVDIE-GK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQPFRI .::::.:::::::::..:: .:::...: .::.:::...:::....:.. : .. . CCDS10 KIKLQVWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENASA-GV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIK ::.:.:::. ..:.: .:.:.::. . :....:::::.. ::.:.:. :.::: :.: CCDS10 ERLLLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHGIRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDI--LLK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE3 KGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC .: CCDS10 SGGRRSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG 180 190 200 >>CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 (218 aa) initn: 460 init1: 254 opt: 518 Z-score: 602.9 bits: 118.7 E(32554): 2.9e-27 Smith-Waterman score: 518; 39.3% identity (71.2% similar) in 219 aa overlap (1-217:6-218) 10 20 30 40 50 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLE : . . :...:::.. .:::::::.: . .: . . :.::.: :.... CCDS31 MSQTAMSETYDFLFKFLVIGNAGTGKSCLLHQFIEKKF----KDDSNHTIGVEFGSKIIN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 IEPGKRIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYV . :: .:::.:::::::::::.::::::...:..::.:::.:.... . .:: .:.: . CCDS31 V-GGKYVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNALTNWLTDARMLA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QPFRIVFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDI . ::..: :.: :: ..:.:: :: ... . . ..:::: . ::::.:. .: : CCDS31 SQ-NIVIILCGNKKDLDADREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFVQCARKI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 YELIKKGEICIQDGWEGVKSGFVP-NTVHSSEEAVKPR-KECFC . :..::. . :.. : . ..: ..: : .:: : CCDS31 LNKIESGELDPERMGSGIQYGDAALRQLRSPRRAQAPNAQECGC 180 190 200 210 >>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 (205 aa) initn: 484 init1: 241 opt: 509 Z-score: 592.9 bits: 116.7 E(32554): 1e-26 Smith-Waterman score: 509; 46.6% identity (75.0% similar) in 176 aa overlap (7-182:10-179) 10 20 30 40 50 pF1KE3 METIWIYQFRLIVIGDSTVGKSCLLHRFTQGRFPGLRSPACDPTVGVDFFSRLLEIE : :.:..:::: ::::::: ::.. . . . :.:::: : .:.. CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTY----TESYISTIGVDFKIRTIELD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PGKRIKLQLWDTAGQERFRSITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVKDWLEEAKMYVQP :: ::::.::::::::::.:: ::::.. : ..:.:.:...::..::.::.: :.. CCDS46 -GKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 FRIVFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMKYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYE . ::::.::::.... : :.... . :. ..:::::.:::::.:: .. .: . CCDS46 -NVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LIKKGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC . : CCDS46 RMGPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC 180 190 200 217 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:53:27 2016 done: Sun Nov 6 04:53:28 2016 Total Scan time: 2.110 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]