FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3408, 293 aa 1>>>pF1KE3408 293 - 293 aa - 293 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2993+/-0.000771; mu= 1.8113+/- 0.048 mean_var=387.0298+/-75.735, 0's: 0 Z-trim(112.6): 1876 B-trim: 123 in 1/52 Lambda= 0.065193 statistics sampled from 19447 (21633) to 19447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16 Scan time: 6.750 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 i ( 293) 2068 209.1 8.3e-54 NP_001258567 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 287) 2025 205.0 1.4e-52 NP_001258568 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 319) 1787 182.7 7.9e-46 NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 1543 160.4 1.1e-38 NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1531 159.0 1.9e-38 XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 1463 152.6 1.6e-36 NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1369 144.3 1.1e-33 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1311 138.6 4e-32 NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1308 138.1 4.1e-32 XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 1308 138.1 4.2e-32 XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1300 137.2 6.3e-32 NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1301 137.4 6.3e-32 NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1300 137.3 6.4e-32 XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1300 137.3 6.4e-32 XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 1293 136.9 1.2e-31 NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1287 136.1 1.6e-31 NP_001274462 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 134.2 5e-31 NP_001274463 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 134.2 5e-31 NP_009070 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 517) 1268 134.2 5e-31 NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 1260 133.4 8.2e-31 XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1260 133.5 8.4e-31 NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1260 133.5 8.7e-31 XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1260 133.5 8.8e-31 XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1260 133.5 8.8e-31 XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1260 133.5 8.8e-31 XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1260 133.5 8.8e-31 XP_016881606 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 486) 1251 132.6 1.5e-30 NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1242 131.8 2.8e-30 NP_001258578 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 172) 1231 130.0 3.1e-30 XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30 XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1223 130.1 1e-29 NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 1223 130.1 1e-29 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1219 129.7 1.4e-29 XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1199 127.8 4.6e-29 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1199 127.8 4.8e-29 NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 1196 127.5 5.6e-29 >>NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 isofo (293 aa) initn: 2068 init1: 2068 opt: 2068 Z-score: 1087.0 bits: 209.1 E(85289): 8.3e-54 Smith-Waterman score: 2068; 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NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE 360 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII :::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: : NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI 420 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE .:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.::: NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE 480 490 500 510 520 530 280 290 pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS .:::::::::::: : NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK 540 550 560 570 580 590 >-- initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 414.7 bits: 86.2 E(85289): 2.3e-16 Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:570-797) 50 60 70 80 90 pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY . . .:.... .. : : .:. : : NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV 540 550 560 570 580 590 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC .:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :. NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN 600 610 620 630 640 650 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI .: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. :: NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST 660 670 680 690 700 710 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH :: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. : NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH 720 730 740 750 760 770 280 290 pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS .::.:::.:::: . :.::::: NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT 780 790 800 810 820 >>NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 iso (554 aa) initn: 6050 init1: 1531 opt: 1531 Z-score: 811.3 bits: 159.0 E(85289): 1.9e-38 Smith-Waterman score: 1531; 75.2% identity (87.9% similar) in 290 aa overlap (1-290:1-290) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK :::::: :: :::::::::::::::::.:: ::::::::::::..::.::::.: :..:: NP_001 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLVMCSHFAQDVWPEHSIK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK :::::: : ::::::.:::::: :::: :: ..:::::::::: : ::::::.:::: NP_001 DSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW :.::: : ::.::::: .: :.::. ::.::::.::::::::::: ::::::::.::: NP_001 VFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL :..:.: : ::::::::::: :::::..:: :::::::.:::::::: .:::::..:: : NP_001 SSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :.:: :::::::::::.:::.:.: :.::. :. ..::::::::::: NP_001 TKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHK 250 260 270 280 290 300 NP_001 IIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHT 310 320 330 340 350 360 >-- initn: 1504 init1: 788 opt: 788 Z-score: 433.7 bits: 89.1 E(85289): 2e-17 Smith-Waterman score: 788; 65.7% identity (84.6% similar) in 169 aa overlap (125-293:293-461) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS :: ..::: :: .: ..:.:: :.. ..: NP_001 NQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFS 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK ::.:: ::: :. :::.::::.:: :..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::. NP_001 NLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTE 330 340 350 360 370 380 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII ::::.:::::::: .:::::. :: .:.:: : :.::::::.:::.:. :::::.:: NP_001 HKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKII 390 400 410 420 430 440 280 290 pF1KE3 YTGEEPYKCEECGKAFNLS .: :.:::::::::::: : NP_001 HTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGE 450 460 470 480 490 500 >-- initn: 838 init1: 302 opt: 339 Z-score: 205.4 bits: 46.9 E(85289): 0.00011 Smith-Waterman score: 339; 64.3% identity (82.1% similar) in 84 aa overlap (210-293:462-544) 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 WSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSH ::.::::::.: : ::: .::.::.:::. NP_001 VFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSN 440 450 460 470 480 490 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :: .:::.: ::::: :.: :.:.. :: ::::::::.: : .:::.::: : NP_001 LTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKE 500 510 520 530 540 550 NP_001 KLQT >>XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro (537 aa) initn: 5159 init1: 1463 opt: 1463 Z-score: 776.9 bits: 152.6 E(85289): 1.6e-36 Smith-Waterman score: 1463; 72.0% identity (85.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:34-326) 10 20 30 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYR :::::: ::::::::::::::::.:.:.:: XP_011 APRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQNLYR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 HVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDE .:::.::::::::..::.:::::: .:..::::::: : :::::::.::::::::::.:: XP_011 NVMLDNYRNLVFLVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 CKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSL : :. ::::::::: : ::::::.:::::.::::::: :: :.: .: :.:::: :: XP_011 HKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSC 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 CMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSS :.::.:::::: :: :::::. :::.:: .::.: : :: .::::: :::::.:: XP_011 CILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCGKAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 ILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTK ::::: :.: :::::: :::.:. : ::.:::::: :::.::.::: :. :::: XP_011 TLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFSVFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTK 250 260 270 280 290 300 280 290 pF1KE3 HQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :.::.:::.::::.::::::: : XP_011 HKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIV 310 320 330 340 350 360 >-- initn: 1936 init1: 725 opt: 730 Z-score: 404.3 bits: 83.7 E(85289): 8.8e-16 Smith-Waterman score: 730; 62.5% identity (81.5% similar) in 168 aa overlap (126-293:327-494) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 GGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSR :. ..:: :: .: ..:.:: :.. . : XP_011 IFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSST 300 310 320 330 340 350 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKH ::.:: .:: :. ::::::::.:. ::.:.: :.:.: ::::::: ::::: : :::: XP_011 LTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKHKRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKH 360 370 380 390 400 410 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 KIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIY :::.:: ::::: .::.::. : ::.:: .:: ::::::..:::.:. : :::::. :. XP_011 KIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIH 420 430 440 450 460 470 280 290 pF1KE3 TGEEPYKCEECGKAFNLS :::.:::::::::::: : XP_011 TGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEKPYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEK 480 490 500 510 520 530 >>NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 iso (1159 aa) initn: 7438 init1: 1369 opt: 1369 Z-score: 725.9 bits: 144.3 E(85289): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 1369; 66.9% identity (83.6% similar) in 293 aa overlap (1-293:10-302) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQ :: ::: ::::::: ::::::::::.:.::.:::::::::.::..: .: : NP_001 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGICPHFPQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSK :.: ::...:::::: : .: : ::.::::::::::::::: :. ::: ::::: . :: NP_001 DFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLTTAQSK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 IFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKC .:::.::.::..:: ::::: :::: .: :.::.: ::.:. . :::: .. :. :: NP_001 VFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 EECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCG .:: :::.::..:.. :.::: .:::::: :::::.: : :: :::: . :: ::: .:: NP_001 KECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 KAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFN ::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: ::.::. :.:::.:::::::::::. NP_001 KAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFS 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LS : NP_001 RSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLST 310 320 330 340 350 360 >-- initn: 6083 init1: 806 opt: 833 Z-score: 453.4 bits: 93.9 E(85289): 1.6e-18 Smith-Waterman score: 833; 63.4% identity (84.2% similar) in 183 aa overlap (111-293:820-1002) 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 LRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKH :...:.. :.... :: . ::: ::..: NP_001 GEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKP 790 800 810 820 830 840 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 FRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCE . .::::.. : ::.::.:::::. ::::::::.:. ..:. :..:::::::::: NP_001 SKSEECDKAFIWSSTLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCE 850 860 870 880 890 900 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 VCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGK ::::: ::: :: ::::.:::::::: .:::::..:: ::.:::::: :::::::.::: NP_001 ECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGK 910 920 930 940 950 960 270 280 290 pF1KE3 VFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS .:.:: :::.: ..:::.:::::::::::: : NP_001 AFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIS 970 980 990 1000 1010 1020 NP_001 SSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSAL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >-- initn: 4428 init1: 789 opt: 820 Z-score: 446.8 bits: 92.6 E(85289): 3.8e-18 Smith-Waterman score: 820; 56.6% identity (76.7% similar) in 219 aa overlap (76-293:588-806) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL :: .. . . .:: . ..: . NP_001 STHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHK 560 570 580 590 600 610 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KITTS-KIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHT .: :. : ..:.. :.. . :. ::: :::.: ..::::::.. :: ::.:: ::. NP_001 RIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHA 620 630 640 650 660 670 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 RENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKP :..::::::::.:: :.::. : ::::::::::: :::::. :: ::::: :.: ::: NP_001 GEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKP 680 690 700 710 720 730 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 YKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCE .:: .::::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: :::::. :.:::.::::. NP_001 FKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCK 740 750 760 770 780 790 290 pF1KE3 ECGKAFNLS ::::::. : NP_001 ECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDK 800 810 820 830 840 850 >-- initn: 2827 init1: 788 opt: 808 Z-score: 440.7 bits: 91.5 E(85289): 8.3e-18 Smith-Waterman score: 808; 64.0% identity (80.6% similar) in 186 aa overlap (108-293:313-498) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE : : ..:.. :.. . :. ::: ::: NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTE 290 300 310 320 330 340 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY .: ..::::::.. :: ::.:: ::. :..::::::::.:: :.::. : :::::::: NP_001 EKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPY 350 360 370 380 390 400 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ ::: :::::. :: ::::: ..: :::.:: .::::: :: ::::: ::: :::::::. NP_001 KCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEE 410 420 430 440 450 460 260 270 280 290 pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :::.:.:: :::::.::.:::.::: ::::::: : NP_001 CGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKA 470 480 490 500 510 520 NP_001 FKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWS 530 540 550 560 570 580 >-- initn: 579 init1: 579 opt: 587 Z-score: 328.4 bits: 70.7 E(85289): 1.5e-11 Smith-Waterman score: 587; 69.1% identity (85.4% similar) in 123 aa overlap (154-276:1003-1125) 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 KFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTN :.:: :: ::: :. ::::::::.: :.. NP_001 QSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSST 980 990 1000 1010 1020 1030 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 LSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRH :. :.::: ::::::: ::::: ::: ::.:: ..::::::::..::::::.:: ::.: NP_001 LNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKH 1040 1050 1060 1070 1080 1090 250 260 270 280 290 pF1KE3 KIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS ::::: :::::::.:::.:.:: ::.:. :.: NP_001 KIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHTITPVIPLLWEAEAGGSRGQEMETILAN 1100 1110 1120 1130 1140 1150 NP_001 TVKPLLY >-- initn: 886 init1: 387 opt: 387 Z-score: 226.7 bits: 51.9 E(85289): 6.9e-06 Smith-Waterman score: 387; 68.4% identity (87.3% similar) in 79 aa overlap (212-290:501-579) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT :.:::::.. :::::: .::::::: : :: NP_001 STLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLT 480 490 500 510 520 530 250 260 270 280 290 pF1KE3 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :::::. .: ::::.:::.:..: .:. :.::.:::. :::::::::: NP_001 THKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKR 540 550 560 570 580 590 NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTE 600 610 620 630 640 650 >>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa) initn: 4167 init1: 1293 opt: 1311 Z-score: 697.7 bits: 138.6 E(85289): 4e-32 Smith-Waterman score: 1472; 68.2% identity (80.2% similar) in 324 aa overlap (1-292:1-324) 10 20 30 40 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLAL---------CSR--- : :::: :::::::::::::::::::..::.:.::::::::::.. : . NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 pF1KE3 --------------------FAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSV :::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: : NP_001 EPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHV 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 DECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDK ::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.: NP_001 DECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSK 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 SLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQ :.:.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.: NP_001 SFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQ 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 SSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTL :: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: : NP_001 SSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHL 250 260 270 280 290 300 270 280 290 pF1KE3 TKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS : ..:..:::. :::.:::::::: NP_001 TTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQE 310 320 330 340 350 360 >-- initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 452.7 bits: 93.3 E(85289): 1.8e-18 Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (76-293:357-577) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL .:. ... : : ...:. . ..: . : NP_001 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL 330 340 350 360 370 380 110 120 130 140 150 pF1KE3 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ :.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::. NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE 390 400 410 420 430 440 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII :::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: : NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI 450 460 470 480 490 500 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE .:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.::: NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE 510 520 530 540 550 560 280 290 pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS .:::::::::::: : NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK 570 580 590 600 610 620 >-- initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 414.6 bits: 86.2 E(85289): 2.4e-16 Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:602-829) 50 60 70 80 90 pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY . . .:.... .. : : .:. : : NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV 580 590 600 610 620 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC .:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :. NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN 630 640 650 660 670 680 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI .: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. :: NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST 690 700 710 720 730 740 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH :: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. : NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH 750 760 770 780 790 800 280 290 pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS .::.:::.:::: . :.::::: NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT 810 820 830 840 850 >>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa) initn: 6547 init1: 1308 opt: 1308 Z-score: 697.5 bits: 138.1 E(85289): 4.1e-32 Smith-Waterman score: 1308; 69.0% identity (85.1% similar) in 268 aa overlap (26-293:89-356) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWL :.:: ..:.. .::.:::::: NP_001 GKEAWSMKRHEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWP 60 70 80 90 100 110 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 EQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQC :::::::::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : :::::: NP_001 EQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQC 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECG .::::: :::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: ::::::::: NP_001 DKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECG 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFK :.::::..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:. NP_001 KAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFN 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS . : :: :::::: ::::::..:::.:..: ::: :. :.:::.:::::::::::. : NP_001 RFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSN 300 310 320 330 340 350 NP_001 LTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTH 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 437.2 bits: 90.0 E(85289): 1.3e-17 Smith-Waterman score: 796; 60.8% identity (83.3% similar) in 186 aa overlap (108-293:423-608) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE : : ..:.. :.... :. ..::: :: NP_001 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG 400 410 420 430 440 450 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY .: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: :::: NP_001 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY 460 470 480 490 500 510 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ ::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::. NP_001 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE 520 530 540 550 560 570 260 270 280 290 pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS :::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. : NP_001 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 580 590 600 610 620 >-- initn: 329 init1: 329 opt: 329 Z-score: 199.9 bits: 46.0 E(85289): 0.00022 Smith-Waterman score: 329; 69.7% identity (86.4% similar) in 66 aa overlap (182-247:357-422) 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI .::. : ::::::::::. :::::.::. NP_001 RSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAH 330 340 350 360 370 380 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH :: :..:.:::::::: .:::::.. :::: ::::: NP_001 LTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH 390 400 410 420 430 440 280 290 pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS NP_001 KIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSH 450 460 470 480 490 500 >>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (640 aa) initn: 6540 init1: 1301 opt: 1308 Z-score: 697.4 bits: 138.1 E(85289): 4.2e-32 Smith-Waterman score: 1308; 69.0% identity (85.1% similar) in 268 aa overlap (26-293:104-371) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWL :.:: ..:.. .::.:::::: XP_011 KPTVSHYVAQADLQLLVSSCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWP 80 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 EQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQC :::::::::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : :::::: XP_011 EQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQC 140 150 160 170 180 190 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECG .::::: :::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: ::::::::: XP_011 DKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECG 200 210 220 230 240 250 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFK :.::::..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:. 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