FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9645, 1032 aa 1>>>pF1KB9645 1032 - 1032 aa - 1032 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0893+/-0.00037; mu= 1.0924+/- 0.023 mean_var=269.8450+/-58.644, 0's: 0 Z-trim(120.9): 9 B-trim: 72 in 2/56 Lambda= 0.078076 statistics sampled from 36795 (36804) to 36795 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16 Scan time: 17.900 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 (1032) 6790 778.9 0 XP_005266698 (OMIM: 607842,614427) PREDICTED: teas (1032) 6790 778.9 0 NP_001295139 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolo (1077) 6790 778.9 0 NP_065907 (OMIM: 614119) teashirt homolog 3 [Homo (1081) 2201 262.0 1.3e-68 NP_001180350 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 iso (1031) 1972 236.2 7.2e-61 XP_016883129 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho (1034) 1972 236.2 7.3e-61 NP_775756 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 isofor (1034) 1972 236.2 7.3e-61 XP_016883130 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho ( 995) 1782 214.8 1.9e-54 >>NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 iso (1032 aa) initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4146.7 bits: 778.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6790; 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