Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9645
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9645, 1032 aa
1>>>pF1KB9645 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4854+/-0.000993; mu= -1.1308+/- 0.060
mean_var=253.1159+/-55.584, 0's: 0 Z-trim(112.8): 21 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.080615
statistics sampled from 13509 (13518) to 13509 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.415), width: 16
Scan time: 5.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12009.1 TSHZ1 gene_id:10194|Hs108|chr18 (1032) 6790 803.5 0
CCDS77199.1 TSHZ1 gene_id:10194|Hs108|chr18 (1077) 6790 803.5 0
CCDS12421.2 TSHZ3 gene_id:57616|Hs108|chr19 (1081) 2201 269.8 2.2e-71
CCDS54474.1 TSHZ2 gene_id:128553|Hs108|chr20 (1031) 1972 243.1 2.2e-63
CCDS33490.1 TSHZ2 gene_id:128553|Hs108|chr20 (1034) 1972 243.1 2.2e-63
>>CCDS12009.1 TSHZ1 gene_id:10194|Hs108|chr18 (1032 aa)
initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4279.7 bits: 803.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6790; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB9 DHLIYVTELEKQ
::::::::::::
CCDS12 DHLIYVTELEKQ
1030
>>CCDS77199.1 TSHZ1 gene_id:10194|Hs108|chr18 (1077 aa)
initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4279.4 bits: 803.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6790; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:46-1077)
10 20 30
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VPEEELKAAEIDEEHVEDDGLSLDIQESEYMCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALD
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 DTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHS
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 FESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAITKLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAITKLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHM
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 MVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTT
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLEKFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLEKFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSL
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 ENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSA
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 EHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAK
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 ENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMD
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 HSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQA
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 DAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKS
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KB9 STPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 STPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGK
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 YIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDC
920 930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 ASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGS
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030
pF1KB9 TFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELEKQ
1040 1050 1060 1070
>>CCDS12421.2 TSHZ3 gene_id:57616|Hs108|chr19 (1081 aa)
initn: 3369 init1: 928 opt: 2201 Z-score: 1395.0 bits: 269.8 E(32554): 2.2e-71
Smith-Waterman score: 3645; 55.9% identity (75.6% similar) in 1076 aa overlap (1-1028:46-1077)
10 20 30
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYG
:: :. . ::::::.. . ..
CCDS12 VSEELKAAALVDEGLDPEEHTADGEPSAKYMCPEKELARACPSYQNSPAAEFSCHEMDSE
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB9 SPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQC--PDSVSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLA
: .::.::..: :...: ..:.: . : . .::: :.:::: :..:.: ::.:
CCDS12 SHISETSDRMADFESGSIKNEEETKEVTVPLEDTTVSDSLEQMKAVYNNFLSNSYWSNLN
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 LDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSS
:.:.. .:.:... ::.: ::..:. .
CCDS12 LNLHQP--------SSEKNNG--------------------------SSSSSSSSSSSCG
140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 SSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSA
:...::::.:.::::::.:. .:::::::::::::::..:::::.::::::::::::::
CCDS12 SGSFDWHQSAMAKTLQQVSQSRMLPEPSLFSTVQLYRQSSKLYGSIFTGASKFRCKDCSA
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 AYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCG
::::::::::::::::::::::.. :... :::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS12 AYDTLVELTVHMNETGHYRDDNHETDNNNPKRWSKPRKRSLLEMEGKEDAQKVLKCMYCG
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 HSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPV-PAITKLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAA
:::::::::::::::::::::::::::: :. .:..:.:.:.: .: : ::. .: .
CCDS12 HSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVTPVAAKIIPATRKKASLELELPSSPDSTGGTP
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 EVALSESAKD-QKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQL
....:.. :: .:::.:::::::.::::::.:.:::::.::::::::::::::::.:
CCDS12 KATISDTNDALQKNSNPYITPNNRYGHQNGASYAWHFEARKSQILKCMECGSSHDTLQEL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB9 TAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPV-------VEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIK
::::::::::.:::.:: :::: .: :: ..::.::.:: :: : :...
CCDS12 TAHMMVTGHFIKVTNSAMKKGKPIVETPVTPTITTLLDEKVQSVPLAATTFTS-PSNT--
410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 KQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLEKFEPSTLYPYLREEDLDDS
: : . . . : ::: .::: :. . : :.. . :: . :. : :: :.::..:
CCDS12 --PASISPKLNVEVKKEVDKEKA-VTDEKPKQKDKPGEEEEKCDISSKYHYLTENDLEES
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 PKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGTVK-PLPAAVQSVQVQP
:::::::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::. .: : .. .:. ..:
CCDS12 PKGGLDILKSLENTVTSAINKAQNGTPSWGGYPSIHAAYQLPNMMKLSLGSSGKSTPLKP
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 SYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKV-NIKKEERPPEKE
. :. . .: .....:. :.: : : :.: ::::::.::: :: ..... . :. .
CCDS12 MF-GNSEIVSPTKNQTLVSPPSSQTSPMPKTNFHAMEELVKKVTEKVAKVEEKMKEPDGK
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 KSSLAKAA-SPIAKENKDFPKTEEVSG---KPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEP
: .:. :: ..: . : : : . :...: : .:: . :: :
CCDS12 LSPPKRATPSPCSSEVGEPIKMEASSDGGFRSQENSPSPPRDGCKDGSPLAEPVENGKEL
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 LKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKIS
.: ... .. .:: :: :: :.::::::::.:: ::::..:: :.:::..::.:.:
CCDS12 VKPLASSLSGSTAIITDHPPEQPFVNPLSALQSVMNIHLGKAAKPSLPALDPMSMLFKMS
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770
pF1KB9 NSMLDKPVYPATP---VKQADAIDRYYYE-NSDQPIDLTKSKNK----------------
::. .: . . : :.:: .:::.:. :.::::::::.:.
CCDS12 NSLAEKAAVATPPPLQSKKADHLDRYFYHVNNDQPIDLTKGKSDKGCSLGSVLLSPTSTA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820
pF1KB9 PLVSSVADSVA-----------SPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDA
: .:: . ..: :::::.:: :::::.:::: : ::::::..:::::
CCDS12 PATSSSTVTTAKTSAVVSFMSNSPLRENALSDISDMLKNLTESHTSKSSTPSSISEKSDI
820 830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 DGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERV
::...::: .: .:..::::::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::::.
CCDS12 DGATLEEA-EESTPAQKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFAASLRQTSEGKYIMSDLSPQERM
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930 940
pF1KB9 HISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYIS
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::
CCDS12 HISRFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQIRTPSTYIS
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
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.::: . .:.: :::::::::..:.::::...:. ::: . ..:..:
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CCDS54 EE
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pF1KB9 YCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT-KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAG
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CCDS33 FCGDSFDSLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPTISSKMVTPAKKRVF-DVNRPCSPD---
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CCDS33 -STTGSFADSFSSQKNANLQLSSNNRYGYQNGASYTWQFEACKSQILKCMECGSSHDTLQ
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CCDS33 SFSHS------EGDSFRKSETPPEAKKTELGPLKEEEKLMKEGS-EKEKPQPLEPTSA-L
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CCDS33 TKFLKNMDKGHPIFYCSDCASQFRTPSTYISHLESHLGFQMKDMTRLSVDQQSKVEQEIS
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pF1KB9 KVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELE
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CCDS33 RVSSAQRSPETIAAEEDTDSKFKCKLCCRTFVSKHAVKLHLSKTHSKSPEHHSQFVTDVD
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pF1KB9 KQ
..
CCDS33 EE
1032 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:12:28 2016 done: Sun Nov 6 06:12:29 2016
Total Scan time: 5.470 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]