FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9650, 2715 aa 1>>>pF1KE9650 2715 - 2715 aa - 2715 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4555+/-0.00121; mu= 13.1945+/- 0.073 mean_var=233.8681+/-45.978, 0's: 0 Z-trim(108.8): 80 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.083867 statistics sampled from 10411 (10481) to 10411 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 9.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 18235 2221.9 0 CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 6352 784.1 0 CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 6352 784.1 0 CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 5891 728.4 1.4e-208 CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 5503 681.4 1.9e-194 CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 5503 681.5 1.9e-194 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2670 2680 2690 2700 2710 pF1KE9 QAGEGALKDSNNDTN ::::::::::::::: CCDS13 QAGEGALKDSNNDTN 2710 >>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302 aa) initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352 Z-score: 4161.0 bits: 784.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6470; 59.8% identity (79.4% similar) in 1680 aa overlap (6-1660:82-1731) 10 20 30 pF1KE9 MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSP : . .: . . .. : ...:.. .:: CCDS45 QGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 S-----PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGT . : . . . :: : . .: : :: : . . :.: : : CCDS45 GQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKT 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 GVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDG :....:. .. :: :... : : : . :: .: . . . : ..: CCDS45 GMEENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEG 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESL :: :: . :: : :.: :..:..::.. :: . ::: :: :: .:. .. CCDS45 EKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKK---RKRNTSSDNS 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 pF1KE9 ELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAG ... . :. .::.:. ::. :::::.:::::.::.::::.:..::. : . : : CCDS45 DVE---VMPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 pF1KE9 RTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELF . . . .. . .:.: :.:: :..:.:. . :.. :. . : : CCDS45 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEF 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 YVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVD .:::.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. ::::::::: CCDS45 FVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVD 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 RILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKH :::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .: ::.:. 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CCDS45 DLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLFQDE 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE9 GYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDW .::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. : CCDS45 SYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTW 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE9 WDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPER ::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: : CCDS45 WDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEG 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE9 GNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSS . :: : . . :: ....: :: .. .. :. :: ..: . :: .: CCDS45 VDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGS 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE9 ALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTR :::::::::::.::: ..: . : :.. : :. .. .: :.:::: CCDS45 ALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQRWTR 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE9 REQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRL :::.::::.::.::: :: . : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.:::: CCDS45 REQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRL 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE9 PTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYL : ::: ....::::::::.::::::::::..::::: : :..:: ::.: . : CCDS45 PPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPEL 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE9 PVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCC : ::: .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: : :: :....:. ::. : CCDS45 PKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRC 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE9 LYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVI . : : : : . : . .:. :: CCDS45 STPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQD 1710 1720 1730 1740 1750 1760 >>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581 aa) initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352 Z-score: 4160.4 bits: 784.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6470; 59.8% identity (79.4% similar) in 1680 aa overlap (6-1660:361-2010) 10 20 30 pF1KE9 MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSP : . .: . . .. : ...:.. .:: CCDS53 QGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSP 340 350 360 370 380 390 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 S-----PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGT . : . . . :: : . .: : :: : . . :.: : : CCDS53 GQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKT 400 410 420 430 440 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 GVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDG :....:. .. :: :... : : : . :: .: . . . : ..: CCDS53 GMEENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEG 450 460 470 480 490 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESL :: :: . :: : :.: :..:..::.. :: . ::: :: :: .:. .. CCDS53 EKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKK---RKRNTSSDNS 500 510 520 530 540 550 220 230 240 250 260 pF1KE9 ELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAG ... . :. .::.:. ::. :::::.:::::.::.::::.:..::. : . : : CCDS53 DVE---VMPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI 560 570 580 590 600 270 280 290 300 310 pF1KE9 RTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELF . . . .. . .:.: :.:: :..:.:. . :.. :. . : : CCDS53 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEF 610 620 630 640 650 660 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 YVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVD .:::.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. ::::::::: CCDS53 FVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVD 670 680 690 700 710 720 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 RILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKH :::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .: ::.:. 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CCDS47 GYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDE-DPEYKPT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE9 QKQTESSSDGGDGVFSEKKDDS-------RAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVY . .. : . :: :..: . ...... . :: .:.::.:::::.:.: CCDS47 RTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAY 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE9 QRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRT-SEMDLINKEAQKRWTRREQADFYRTVSS :: ... : : : .. .: : .: . : .: ...:::::.:::::.::. CCDS47 QRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVST 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE9 FGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTT :::..: :. :::.::: ..:::::::::::.:: :::::: :::.:. : ::: . 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CCDS47 ---------PSVAQLLHERT-FAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQ 2300 2310 2320 2330 2340 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE9 GTLP--TPVLTSSAGSRTSLSEPEA---AEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKH : .: ::. ..: .. :..: : : :. . . :. ::. : ...... CCDS47 GLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRR 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE9 RRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIIL-NGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFPVS :: :.:.:: :: :.: .. : .. .. :: :...::: .:. . ..:: : CCDS47 RRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQ--EKVVDLSKASREATSSTSNFSSL 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KE9 ASTPKIGAISS-LQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVE .: . .:. .. :. .. .::::: . : ...:::: . .:::::::.:: CCDS47 SSKFILPNVSTPVSDAFKTQME-LLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVE 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE9 GGMDLIFL--KEQTLQAGILEVHE--DPGQATLSTTHPEGPG---PATSAPEPATAASSQ : .::.:. :. .:.: :: . . : : . .:: : : : ... CCDS47 G-LDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTR 2530 2540 2550 2560 2570 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KE9 --AEKSIPSKSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFSD-------KPKQRRPRCKEPGKLDVS .: . .:.:..::. . :....:.. . .: ::::.: ::..:.:::.. CCDS47 LVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDIN 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2400 2410 2420 pF1KE9 SLSGEERVPAIPKEPGLR-----------------------------------GFLPENK .:.::::::.. :. : . ::.::. CCDS47 TLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESM 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2430 2440 2450 2460 2470 2480 pF1KE9 FNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVAD--SPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQ :.. :. :..: : ::::::.::. .: . .: : ::..::..:.:.:::::..:: CCDS47 FDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQ 2700 2710 2720 2730 2740 2750 2490 2500 2510 2520 2530 2540 pF1KE9 NMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPT-GEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGLLSPP :..:. .. :.::.::: :.:: : : ..:. ..::.::::::..:..::.::::. : CCDS47 NLQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNP 2760 2770 2780 2790 2800 2810 2550 2560 2570 2580 2590 pF1KE9 MATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTA---EDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQSE .... .:. :: .. ...:. :. . ::. .. . .::... . : . . CCDS47 LSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATA 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2600 2610 2620 2630 2640 2650 pF1KE9 PAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMG-MALPAMQQ-ARHSEIVGLESQKRK :: :.:.::::::. ..:::.:::::: ::.: ..::.. : .. :: :... CCDS47 PAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVG-SSEEKA 2880 2890 2900 2910 2920 2930 2660 2670 2680 2690 2700 2710 pF1KE9 KKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGAQA----GEGALKDSNN :..: .: . : . . : : :.. :: :. : : .: . : .....: CCDS47 ADKAEG-GPFKDGETLEGSDAEESLDKT-AE-SSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNEN 2940 2950 2960 2970 2980 2990 pF1KE9 DTN : CCDS47 DE >>CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881 aa) initn: 3876 init1: 2853 opt: 5503 Z-score: 3604.6 bits: 681.4 E(32554): 1.9e-194 Smith-Waterman score: 6956; 45.4% identity (66.9% similar) in 2770 aa overlap (9-2690:437-2861) 10 20 30 pF1KE9 MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPF ..:... : : :...... . .: . CCDS45 EDLLQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQFTSHLVTRPSDMAQTQLQSQARS---W 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 DCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKK : .......: :: .. . . ... . . .... . ::.::: CCDS45 HSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTK-------LQNTQVRVMSEKKQRKK 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 KEP-GDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKP : . :: : . .. : :.. : . :. . : . : :: .: : . :: CCDS45 VESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTASVEGKE--EKKGRRMKSKP 520 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 REASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLT .. :..:. ..:. .:: : . :: :::.:.. : . .: CCDS45 KD----KDSKKTKTCSKLKEKTKI-------GKLIITLGKKQKRKNESSDEISDAEQ--- 580 590 600 610 620 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 NPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSAS :... .. :::::::.::.::.:: ::.. : ... :. . . ..:: . 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CCDS45 EEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGD 2050 2060 2070 2080 2090 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE9 LEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGF ..:: ... . : .. : . :...: ... . :.::. 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CCDS76 EEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGD 2050 2060 2070 2080 2090 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE9 LEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGF ..:: ... . : .. : . :...: ... . :.::. 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CCDS76 TDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEE 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 -GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSF :.. .. . ::..:.: . . . . .. ..: . :.:::... .. CCDS76 MGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDGS 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 EEDE---------LMEFS----ELDSDSDER------PTRSRRLNDKARRYLRAECFRVE .::. ..: : : : ::: :.:. ::: . : :: CCDS76 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKP-LPPLLARVG 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 KNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWE :. ..:.. : . . .. ... . .: . . : : :..:. .. :. . CCDS76 GNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRH 1410 1420 1430 1440 1450 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 LITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLH : : :: :.:. . . ::: CCDS76 LCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVE 1460 1470 1480 1490 1500 1510 >>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912 aa) initn: 1804 init1: 600 opt: 1615 Z-score: 1064.5 bits: 210.9 E(32554): 5.7e-53 Smith-Waterman score: 1795; 36.2% identity (63.2% similar) in 1013 aa overlap (279-1177:506-1488) 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP : :. .:: . . . . :. .. .: CCDS85 LNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPP-SPTPVPRPPDADPNTPSPKP 480 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 pF1KE9 --GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN------------- :.: . :.::....:: ::.:.. .:: .. . . .: CCDS85 LEGRPE---RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGD 540 550 560 570 580 590 360 370 380 390 400 pF1KE9 --KQAQMKHI---FTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCS :. . :. :.: .: .. .:... . :::. :. : . :. .:::.:: . CCDS85 EEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--HSVDKK-GH--VHYLIKWRD 600 610 620 630 640 410 420 430 440 pF1KE9 LPYEESTWELEE----DVDPAKVKEFESLQVL------P-------EIKHVERPAS---- :::....:: :. : : : . .. ... : .....::: CCDS85 LPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTV 650 660 670 680 690 700 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 DSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLS : : :.. :: ... :. ::.::.::: :.: . . :::::::::::.:. .:: CCDS85 DPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLY 710 720 730 740 750 760 510 520 530 540 550 pF1KE9 EIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDA .. .: .::::. :::::: ::::::. :. .: ...: :.. :: .:.. :. ..: CCDS85 SLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDN 770 780 790 800 810 820 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 Q---GNPLSGV-----FKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLL :. : . ::::..:..:.: : : .: :.:.:.:::::::: . :.. CCDS85 AIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFF 830 840 850 860 870 880 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 EGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKL . :. ..:.::.:::::::::..:::: ::::: : .: . .:::::.:. :.:.::: CCDS85 RVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKL 890 900 910 920 930 940 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 QSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLT-KGANQHN ...: : :::::: :: ::. : : :..:::. .:::::. :: .:: :. .:.. : CCDS85 HDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGG--N 950 960 970 980 990 1000 740 750 760 770 780 pF1KE9 MPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPD--FQLQAMIQAAGKLVLI . .:.:..:.:.::::::::. : .: .: :. .. .:.:.:.:::.:. CCDS85 QVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAA---ME------APKMPNGMYDGSALIRASGKLLLL 1010 1020 1030 1040 1050 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 DKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKP .:.: .: :::.:::::::.. ::.:::.: .. : :::::: . ::.:: ::::: : CCDS85 QKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 DSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: :::::.: : .::.. CCDS85 GAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFV 1120 1130 1140 1150 1160 1170 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEE :: : :... . :. :. : . :. : : . . ..::.:..:.:. :. . :: CCDS85 TRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----RPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 970 980 990 1000 pF1KE9 DEG---SKFCEEDI-----DQILQR---RTHTITIQSEGKG-----STFAKASFVAS--- .: .: :.. :. ..: :.. : ..: .: :.: :..:. CCDS85 TDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEE 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 -GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSF :.. .. . ::..:.: . . . . .. ..: . :.:::... .. CCDS85 MGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDGS 1300 1310 1320 1330 1340 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 EEDE---------LMEFS----ELDSDSDER------PTRSRRLNDKARRYLRAECFRVE .::. ..: : : : ::: :.:. ::: . : :: CCDS85 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKP-LPPLLARVG 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 KNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWE :. ..:.. : . . .. ... . .: . . : : :..:. .. :. . CCDS85 GNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRH 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 LITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLH : : :: :.:. . . ::: CCDS85 LCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVE 1470 1480 1490 1500 1510 1520 >>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966 aa) initn: 1750 init1: 581 opt: 1602 Z-score: 1055.8 bits: 209.3 E(32554): 1.7e-52 Smith-Waterman score: 1792; 36.5% identity (62.4% similar) in 985 aa overlap (279-1165:513-1470) 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP : :. ::: . .. .. : .: CCDS32 LNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVA-VPAPQQADGNPDVPPPRP 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 pF1KE9 GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN--------------- . . : :.::. ..:: ::.:: .:: . . . .: CCDS32 LQGRSERE-FFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED 550 560 570 580 590 600 360 370 380 390 400 pF1KE9 ------KQAQMKHIFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWC .... : ..: .: . .:... : :: . :. : . :. :::::: CCDS32 DGKSDKRKVKDPH-YAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRI--INHSVD-KKGNY--HYLVKWR 610 620 630 640 650 410 420 430 440 pF1KE9 SLPYEESTWELEE-DV--------------------DPAKVKEFESLQV-LPEIKHVERP .:::..:::: .: .. :::. ..... . : : CCDS32 DLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSP 660 670 680 690 700 710 450 460 470 480 490 pF1KE9 ASDSWQKLEKSREY--KNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITF ..: : : . .. ... :. :::::.::: :.: . . :::::::::::::.:.: CCDS32 TNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVF 720 730 740 750 760 770 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 LSEIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYR : .. .: .::::. :::::: ::::::. :. .. ...: :.. :: .:.. :. .. CCDS32 LYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFE 780 790 800 810 820 830 560 570 580 590 600 pF1KE9 DAQGNPLSGVFK--------FHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCK : . . .:: :::..:..:.: : : .:.:.:...:::::::: . : CCDS32 DNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSK 840 850 860 870 880 890 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 LLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVK ... :. . ..::.:::::::::..:::: ::::: : .: . .:::::.:.. :.:.: CCDS32 FFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIK 900 910 920 930 940 950 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 KLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFL-TKGANQ ::...: : :::::: :: ::. : : :..:::. .:::::. :: .:: : ..:.. CCDS32 KLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGG- 960 970 980 990 1000 1010 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 HNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPD--FQLQAMIQAAGKLV :. .:.: ::.:.::::::::. : . :: :. .. :.:...:::. CCDS32 -NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAME---------SPKLPSGAYEGGALIKSSGKLM 1020 1030 1040 1050 1060 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 LIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFC :..:.: :: ::.:::::::.. ::.:::.: . : :::::: . : ::: ::::: CCDS32 LLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFN 1070 1080 1090 1100 1110 1120 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 KPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYR : ...: ::: ::::::::::..::: :::::::::.::.:: .: :::::.. : .:: CCDS32 APGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 LITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMD ..:: : :... . :. :. : . :. : : . . ..::.:..:.:. :. . : CCDS32 FVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV----RPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKD 1190 1200 1210 1220 1230 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 E------EDEGS--KFCEEDIDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVASGN--- : :...: .. .: : ..:.: :. .:. .. :.: :..:. . CCDS32 ENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKI 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 ----RTDISLD---DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDE : :. . ::..:.: . . . . .. ..: . :::::... .. .::. CCDS32 EEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RVRKQVNYNDAAQEDQ 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE9 --LMEFS----ELDSDSDERPT----RSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWG-RWK :.: : : : :::: .:.: .. . : :: :. ..:.. : . 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