Result of FASTA (ccds) for pFN21AE9650
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9650, 2715 aa
  1>>>pF1KE9650 2715 - 2715 aa - 2715 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4555+/-0.00121; mu= 13.1945+/- 0.073
 mean_var=233.8681+/-45.978, 0's: 0 Z-trim(108.8): 80  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.083867
 statistics sampled from 10411 (10481) to 10411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.322), width:  16
 Scan time:  9.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715) 18235 2221.9       0
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 6352 784.1       0
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 6352 784.1       0
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 5891 728.4 1.4e-208
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881) 5503 681.4 1.9e-194
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897) 5503 681.5 1.9e-194
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 1615 210.9 5.7e-53
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 1615 210.9 5.7e-53
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 1602 209.3 1.7e-52
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 1564 204.7 4.2e-51
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 1298 172.5 2.1e-41
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 1298 172.5 2.1e-41
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054) 1143 153.5 5.8e-36
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070) 1143 153.5 5.9e-36
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572) 1026 139.5 1.4e-31
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590) 1026 139.5 1.4e-31
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613) 1017 138.4   3e-31
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614) 1017 138.4   3e-31
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616) 1010 137.6 5.5e-31
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617) 1010 137.6 5.5e-31
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647)  999 136.3 1.4e-30
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  767 108.2 3.7e-22
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710)  757 107.0 9.4e-22
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828)  729 103.6   1e-20
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  722 102.7 1.6e-20
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052)  654 94.3 3.7e-18
CCDS83299.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          ( 948)  646 93.3 6.8e-18
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058)  632 91.7 2.4e-17
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  592 86.7 5.1e-16
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  592 86.7 5.1e-16
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  592 86.7 5.3e-16
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  592 86.7 5.8e-16
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  592 86.8   6e-16
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797)  585 85.9   1e-15
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  582 85.4 1.1e-15
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897)  585 85.9 1.1e-15
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  582 85.4 1.2e-15
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1           ( 747)  510 76.8 5.2e-13
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  511 77.2   8e-13
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  508 77.1 1.7e-12


>>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20              (2715 aa)
 initn: 18235 init1: 18235 opt: 18235  Z-score: 11930.4  bits: 2221.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 18235; 100.0% identity (100.0% similar) in 2715 aa overlap (1-2715:1-2715)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 LYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 KREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 SRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 QVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 KTVQEVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KTVQEVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 IFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 AKVKEFESLQVLPEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKVKEFESLQVLPEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 NCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 GSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 HRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 DLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 FLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 AAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 AIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 AVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 YGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 NFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 RSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVY
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 CVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 ADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPAREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPAREL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 DVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE9 SAEQGVTDGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAEQGVTDGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 SDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE9 LINKEAQKRWTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LINKEAQKRWTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFY
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KE9 SFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KE9 RLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKR
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pF1KE9 SGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCE
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pF1KE9 NFISKVQDVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NFISKVQDVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISIS
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pF1KE9 KDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSLEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSLEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPE
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE9 NIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFVDMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFVDMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE9 QNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGMGERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGMGERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVA
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE9 NQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHMERWMHGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHMERWMHGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGE
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE9 PTAIPSQPFKVKHELLKEPWKESAEGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PTAIPSQPFKVKHELLKEPWKESAEGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCH
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE9 SQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDIGDELQEARAPTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDIGDELQEARAPTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINR
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE9 LDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTLPTPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAALAAQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTLPTPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAALAAQI
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE9 HKESFLAPVFTKDEQKHRRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HKESFLAPVFTKDEQKHRRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLS
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE9 CSSEGSPGATSPFPVSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CSSEGSPGATSPFPVSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRD
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

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pF1KE9 DAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFLKEQTLQAGILEVHEDPGQATLSTTHPEGPGPATSAPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFLKEQTLQAGILEVHEDPGQATLSTTHPEGPGPATSAPE
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pF1KE9 PATAASSQAEKSIPSKSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFSDKPKQRRPRCKEPGKLDVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PATAASSQAEKSIPSKSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFSDKPKQRRPRCKEPGKLDVSS
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE9 LSGEERVPAIPKEPGLRGFLPENKFNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVADS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSGEERVPAIPKEPGLRGFLPENKFNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVADS
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             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KE9 PSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQNMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQNMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPM
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540      2550      2560      2570      2580
pF1KE9 MLPGMAAVPQMFGVGGLLSPPMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MLPGMAAVPQMFGVGGLLSPPMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKT
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pF1KE9 DTLAEDKPGPGPFSDQSEPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPAMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DTLAEDKPGPGPFSDQSEPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPAMQ
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pF1KE9 QARHSEIVGLESQKRKKKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QARHSEIVGLESQKRKKKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGA
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             2710     
pF1KE9 QAGEGALKDSNNDTN
       :::::::::::::::
CCDS13 QAGEGALKDSNNDTN
             2710     

>>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2302 aa)
 initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352  Z-score: 4161.0  bits: 784.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6470; 59.8% identity (79.4% similar) in 1680 aa overlap (6-1660:82-1731)

                                        10        20        30     
pF1KE9                          MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSP
                                     : . .:  . . .. : ...:..    .::
CCDS45 QGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSP
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pF1KE9 S-----PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGT
       .     :     . .    . ::  :    . .: : ::   : . . :.:      : :
CCDS45 GQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKT
             120       130       140       150       160           

              100       110       120       130       140       150
pF1KE9 GVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDG
       :....:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..:
CCDS45 GMEENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEG
         170       180          190       200       210            

              160       170       180       190       200       210
pF1KE9 AKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESL
        :: ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::   :: .:. .. 
CCDS45 EKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKK---RKRNTSSDNS
     220       230       240       250         260          270    

              220       230       240       250       260          
pF1KE9 ELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAG
       ...   . :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  
CCDS45 DVE---VMPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI
             280        290        300       310       320         

     270                  280       290       300       310        
pF1KE9 RTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELF
       .   .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :
CCDS45 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEF
     330       340       350       360       370       380         

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE9 YVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVD
       .:::.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. :::::::::
CCDS45 FVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVD
     390       400       410       420       430        440        

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE9 RILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKH
       :::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .:   ::.:.
CCDS45 RILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKR
      450       460       470       480       490       500        

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE9 VERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSI
       :.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS45 VNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSI
      510       520       530       540       550       560        

       500       510       520       530       540       550       
pF1KE9 TFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYR
       .::.:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .
CCDS45 AFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCK
      570       580       590       600       610       620        

       560       570       580       590       600       610       
pF1KE9 DAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLM
       :..:  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: ::::::::::::::::::..:: :
CCDS45 DSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHM
      630       640       650       660       670       680        

       620       630       640       650       660       670       
pF1KE9 ALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKP
        ::::::::::::::.::::::::.::::::::::. ::..::::::::::.:::.::::
CCDS45 DLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKP
      690       700       710       720       730       740        

       680       690       700       710       720       730       
pF1KE9 MMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINT
       :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.. :::::.::
CCDS45 MMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNT
      750       760       770       780       790       800        

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pF1KE9 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIA
       :::::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::: :
CCDS45 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKA
      810       820       830       840       850       860        

       800       810       820       830       840       850       
pF1KE9 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLL
       ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS45 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLL
      870       880       890       900       910       920        

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pF1KE9 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
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pF1KE9 FDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCE
       ::::::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.::::::::
CCDS45 FDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCE
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pF1KE9 EDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEA
       ::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.:: . 
CCDS45 EDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDL
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pF1KE9 KNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAE
        : :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : :..
CCDS45 LNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYGRTD
     1110      1120      1130      1140      1150        1160      

       1100      1110      1120      1130      1140      1150      
pF1KE9 CFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIW
       ::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.:::
CCDS45 CFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIW
       1170      1180      1190      1200      1210      1220      

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pF1KE9 ELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDD
       .::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::.....:.
CCDS45 DLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLFQDE
       1230      1240      1250      1260       1270      1280     

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pF1KE9 GYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDW
       .::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. :
CCDS45 SYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTW
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pF1KE9 WDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPER
       ::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: : 
CCDS45 WDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEG
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pF1KE9 GNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSS
        . :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  :: .:
CCDS45 VDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGS
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pF1KE9 ALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTR
       :::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.::::
CCDS45 ALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQRWTR
         1470      1480      1490      1500         1510      1520 

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pF1KE9 REQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRL
       :::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.::::
CCDS45 REQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRL
            1530      1540      1550      1560      1570      1580 

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pF1KE9 PTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYL
       :      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :
CCDS45 PPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPEL
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pF1KE9 PVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCC
       : :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :
CCDS45 PKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRC
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pF1KE9 LYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVI
             . : : : : .  : .  .:. ::                              
CCDS45 STPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQD
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>>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2581 aa)
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CCDS53 QGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSP
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pF1KE9 S-----PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGT
       .     :     . .    . ::  :    . .: : ::   : . . :.:      : :
CCDS53 GQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKT
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pF1KE9 GVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDG
       :....:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..:
CCDS53 GMEENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEG
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pF1KE9 AKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESL
        :: ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::   :: .:. .. 
CCDS53 EKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKK---RKRNTSSDNS
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pF1KE9 ELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAG
       ...   . :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  
CCDS53 DVE---VMPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI
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pF1KE9 RTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELF
       .   .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :
CCDS53 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEF
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pF1KE9 YVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVD
       .:::.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. :::::::::
CCDS53 FVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVD
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pF1KE9 RILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKH
       :::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .:   ::.:.
CCDS53 RILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKR
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pF1KE9 VERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSI
       :.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS53 VNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSI
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pF1KE9 TFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYR
       .::.:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .
CCDS53 AFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCK
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pF1KE9 DAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLM
       :..:  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: ::::::::::::::::::..:: :
CCDS53 DSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHM
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pF1KE9 ALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKP
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CCDS53 DLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKP
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pF1KE9 MMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINT
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CCDS53 MMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNT
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pF1KE9 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIA
       :::::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::: :
CCDS53 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKA
      1090      1100      1110      1120      1130      1140       

       800       810       820       830       840       850       
pF1KE9 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLL
       ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS53 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLL
      1150      1160      1170      1180      1190      1200       

       860       870       880       890       900       910       
pF1KE9 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
      1210      1220      1230      1240      1250      1260       

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pF1KE9 FDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCE
       ::::::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.::::::::
CCDS53 FDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCE
      1270      1280      1290      1300      1310      1320       

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pF1KE9 EDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEA
       ::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.:: . 
CCDS53 EDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDL
      1330      1340      1350      1360      1370      1380       

       1040      1050      1060      1070      1080      1090      
pF1KE9 KNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAE
        : :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : :..
CCDS53 LNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYGRTD
      1390      1400      1410      1420      1430        1440     

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pF1KE9 CFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIW
       ::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.:::
CCDS53 CFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIW
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pF1KE9 ELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDD
       .::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::.....:.
CCDS53 DLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLFQDE
        1510      1520      1530      1540       1550      1560    

       1220      1230      1240      1250      1260      1270      
pF1KE9 GYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDW
       .::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. :
CCDS53 SYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTW
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pF1KE9 WDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPER
       ::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: : 
CCDS53 WDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEG
         1630      1640      1650      1660      1670      1680    

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pF1KE9 GNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSS
        . :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  :: .:
CCDS53 VDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGS
          1690      1700      1710      1720      1730      1740   

           1400      1410      1420      1430      1440      1450  
pF1KE9 ALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTR
       :::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.::::
CCDS53 ALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQRWTR
          1750      1760      1770      1780         1790      1800

           1460      1470      1480      1490      1500      1510  
pF1KE9 REQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRL
       :::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.::::
CCDS53 REQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRL
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

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pF1KE9 PTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYL
       :      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :
CCDS53 PPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPEL
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

            1580      1590      1600      1610      1620      1630 
pF1KE9 PVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCC
       : :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :
CCDS53 PKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRC
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

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pF1KE9 LYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVI
             . : : : : .  : .  .:. ::                              
CCDS53 STPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQD
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (2997 aa)
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         ..    .. . . : : . :..      .: ..:   :: . :  :     :   :: 
CCDS47 MTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIVAEDPSKG-FG-----KDDFPGG
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pF1KE9 --DQE---GAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKP
         .::   ..  ::.... : ::..  :.::::   ::::. :: ::::   . :  ..:
CCDS47 VDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEP---KEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEP
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pF1KE9 REASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLT
       .:    :.::       :. .....: ..: .     ::: .: :.: . :. .::.  :
CCDS47 KE----KKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASAL---KKKVNKGKTEGS-ENSDLDK--T
                  690       700       710          720          730

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pF1KE9 NPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSAS
        :    :::. :.   :::::.:::::..:.:::.::. :....     .::: :  ..:
CCDS47 PPPSPPPEED-EDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDAD--AAGRDSPSNTS
              740        750       760       770         780       

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pF1KE9 TLAWQAEEPPEDDAN--IIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATM
           :.:.    ::.  ..:::..:..:.. . .    ..: :::::.:::::::.::..
CCDS47 ----QSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASI
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pF1KE9 EELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEV
       :.:::: :: ::::::. ::.: : . .: ...::::::::::::.. :.. : . :: :
CCDS47 EDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFL-SEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTD-DRGEPV
           850       860        870       880       890        900 

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pF1KE9 THYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVERPASDSWQKLEKSRE
       :::::::::::::.:::: ..:.: ::..:::.:.   :: ..:::: .:.:.: :.:::
CCDS47 THYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSRE
             910       920       930       940       950       960 

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pF1KE9 YKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLI
       :::.:.::::::::.::::::::: .:::::::::::::::::::: ::.:.:::::::.
CCDS47 YKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLV
             970       980       990      1000      1010      1020 

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pF1KE9 IAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVI
       ::::::: :::::::::::.:..:::::: ::. :: ::: ..: ::  ..: .:::..:
CCDS47 IAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAII
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pF1KE9 TTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSV
       :::::::.:::::..: : ::.:::::::::::::::::::.: ::::::::::::::.:
CCDS47 TTFEMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTV
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pF1KE9 EELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPK
       :::::::.:::::.:::::.:..:::::::::::.:::.:::::::::::.:::::::::
CCDS47 EELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPK
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pF1KE9 QETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGA
       .::::::::::::::::::::::::.::.::..: :.:::.:::::::::::::::::::
CCDS47 EETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGA
            1210      1220      1230      1240      1250      1260 

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pF1KE9 EEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDI
       ::::::.:..::. ..::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::
CCDS47 EEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDI
            1270      1280      1290      1300      1310      1320 

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pF1KE9 LEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTC
       :::::::::: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTC
            1330      1340      1350      1360      1370      1380 

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pF1KE9 IIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQD
       ::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 IIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQS
            1390      1400      1410      1420      1430      1440 

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pF1KE9 IN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQ
       .. :...::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS47 MSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIE
            1450      1460      1470      1480      1490      1500 

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pF1KE9 SEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .: : ...:::: ::::::
CCDS47 SEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQ
            1510      1520      1530      1540      1550      1560 

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pF1KE9 TKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERP-TRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRW
       :. :.. .::::::::.:.:::.:.: .. :: .::.. : :.::::::::::..:::::
CCDS47 TRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRW
            1570      1580      1590      1600      1610      1620 

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pF1KE9 KDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQN
        :::.:::.: .:.:.:.: :::..::::..::::::.::::::.::::: :::...: :
CCDS47 TDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVN
            1630      1640      1650      1660      1670      1680 

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       ::::::::::::::::.: :   : ..::::::.:::......:.::::::.::::::::
CCDS47 HSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLR
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       :::::::. :..:. :.: .::. . : :: .:.  . :.:.:::: :::::::::::::
CCDS47 VRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKH
            1750      1760      1770      1780      1790      1800 

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pF1KE9 GYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDGL
       :::.::.:::::::::::.::::: :...:::  ::  .:  . :. :.::. . .    
CCDS47 GYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDE-DPEYKPT
            1810      1820      1830      1840      1850       1860

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pF1KE9 QKQTESSSDGGDGVFSEKKDDS-------RAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVY
       .   ..  :   .  :: :..:       . ......  .  :: .:.::.:::::.:.:
CCDS47 RTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAY
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

        1410      1420      1430       1440      1450      1460    
pF1KE9 QRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRT-SEMDLINKEAQKRWTRREQADFYRTVSS
       ::  ...  : : :   ..     .:  :   .: . : .: ...:::::.:::::.::.
CCDS47 QRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVST
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

         1470      1480      1490      1500      1510      1520    
pF1KE9 FGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTT
       :::..:  :. :::.::: ..:::::::::::.::  :::::: :::.:.  :  ::: .
CCDS47 FGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLS
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

         1530      1540      1550      1560      1570      1580    
pF1KE9 IYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRDL
         .::::::::.:::::::::::.:::::. ::: :::.::.::: :: :::::.:::::
CCDS47 SIIEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDL
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

         1590      1600      1610      1620      1630      1640    
pF1KE9 LIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLT
       :.:.::::..::: .:.:::.::::::..:.::.. .:. .  :                
CCDS47 LVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLN----------------
             2110      2120      2130      2140                    

         1650      1660      1670      1680      1690      1700    
pF1KE9 YSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESLE
                     :  .  :..       : :     :          .:: .: :. :
CCDS47 --------------PLAVGFVQT-------PPVISSAHI----------QDERVL-EQAE
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pF1KE9 SMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSL
           ::    .::    :.:... .               :. :  : : ..:       
CCDS47 ----GK---VEEP----ENPAAKEK---------------CE-GKEEEEETDG-------
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         1770      1780      1790      1800      1810      1820    
pF1KE9 EAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFV
                  .::.     ::.   : .::..  ...  .:.          : ..:  
CCDS47 -----------SGKE-----SKQE--CEAEASSVKNELKGVEV----------GADTG--
                2200             2210      2220                    

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pF1KE9 DMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGM
                                .::.  :       ..::.:::. :... .     
CCDS47 -------------------------SKSISEK-------GSEEDEEEKLEDDDKSEE---
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         1890      1900      1910      1920      1930      1940    
pF1KE9 GERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHME
       . .::.         .:: ::  : :: ...:. .:                        
CCDS47 SSQPEA-------GAVSRGKN--F-DEESNASMSTAR-----------------------
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CCDS47 ------------------------------------------------------------
                                                                   

         2010      2020      2030      2040      2050      2060    
pF1KE9 EGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDI
                                  :  :::          : :.          :: 
CCDS47 ---------------------------DETRDGF---------YMED----------GD-
                                                 2290              

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                :..::::.:.: ..:: ::::::.::::::::..::::::: .  :... .
CCDS47 ---------PSVAQLLHERT-FAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQ
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pF1KE9 GTLP--TPVLTSSAGSRTSLSEPEA---AEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKH
       : .:  ::. ..:  .. :..:      :  : :.  . . :. ::. :     ......
CCDS47 GLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRR
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pF1KE9 RRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIIL-NGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFPVS
       ::  :.:.:: :: :.: .. :   .. ..  ::   :...::: .:. . ..:: :   
CCDS47 RRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQ--EKVVDLSKASREATSSTSNFSSL
          2410      2420      2430        2440      2450      2460 

       2240       2250      2260      2270      2280      2290     
pF1KE9 ASTPKIGAISS-LQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVE
       .:   .  .:. .. :.  ..  .::::: .  : ...::::   .   .:::::::.::
CCDS47 SSKFILPNVSTPVSDAFKTQME-LLQAGLSRTPTRHLLNGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVE
            2470      2480       2490      2500      2510      2520

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pF1KE9 GGMDLIFL--KEQTLQAGILEVHE--DPGQATLSTTHPEGPG---PATSAPEPATAASSQ
       : .::.:.  :. .:.:   :: .  .    :  : .  .::   : :  :      ...
CCDS47 G-LDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTR
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pF1KE9 --AEKSIPSKSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFSD-------KPKQRRPRCKEPGKLDVS
         .: .  .:.:..::. .  :....:..  . .:       ::::.: ::..:.:::..
CCDS47 LVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDIN
    2580      2590      2600      2610      2620      2630         

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pF1KE9 SLSGEERVPAIPKEPGLR-----------------------------------GFLPENK
       .:.::::::.. :. : .                                   ::.::. 
CCDS47 TLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESM
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pF1KE9 FNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVAD--SPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQ
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CCDS47 FDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQ
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pF1KE9 NMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPT-GEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGLLSPP
       :..:. .. :.::.::: :.::  : : ..:.  ..::.::::::..:..::.::::. :
CCDS47 NLQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNP
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pF1KE9 MATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTA---EDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQSE
       ....  .:. :: ..  ...:.  :. .   ::. .. . .::...    . :  .  . 
CCDS47 LSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATA
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pF1KE9 PAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMG-MALPAMQQ-ARHSEIVGLESQKRK
       ::   :.:.::::::.  ..:::.:::::: ::.: ..::..   :  .. ::  :... 
CCDS47 PAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVG-SSEEKA
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pF1KE9 KKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGAQA----GEGALKDSNN
         :..: .: .  :   . . : : :.. :: :. :  :  .: .     :   .....:
CCDS47 ADKAEG-GPFKDGETLEGSDAEESLDKT-AE-SSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNEN
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pF1KE9 DTN
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CCDS47 DE 
          

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CCDS45 EDLLQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQFTSHLVTRPSDMAQTQLQSQARS---W
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       40        50        60        70        80        90        
pF1KE9 DCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKK
         : .......:    :: ..   . . ...  . .       ....     . ::.:::
CCDS45 HSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTK-------LQNTQVRVMSEKKQRKK
           470       480       490              500       510      

      100        110       120       130       140       150       
pF1KE9 KEP-GDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKP
        :  . :: : .  ..   : :.. : . :.     . :  . : ::  .: : .   ::
CCDS45 VESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTASVEGKE--EKKGRRMKSKP
        520       530       540       550       560         570    

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE9 REASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLT
       ..    :..:. ..:.    .::        :   .   :: :::.:.. :  . .:   
CCDS45 KD----KDSKKTKTCSKLKEKTKI-------GKLIITLGKKQKRKNESSDEISDAEQ---
              580       590              600       610       620   

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE9 NPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSAS
             :... .. :::::::.::.::.:: ::.. :  ... :. . .   ..::   .
CCDS45 -----MPQHTLKDQDSQKRRSNRQIKRKKYAEDIEGK--QSEEEVKGSMKIKKNSAPLPG
                   630       640       650         660       670   

       280         290       300        310       320       330    
pF1KE9 TLAWQ--AEEPPEDDANIIEKILASKTVQ-EVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWAT
           :  .:.: :.:: :..:::.:.::. :. ::   .: : :.:::.:.:::::.:::
CCDS45 EQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSSRTVKKEISPGVM-IDTEEFFVKYKNYSYLHCEWAT
           680       690       700       710        720       730  

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE9 MEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEE
        :.: :: :: ::::::. .:::  :.:.. .:. ::::::::::.:::.  .: .::: 
CCDS45 EEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEP
            740       750       760       770       780       790  

          400       410       420       430        440       450   
pF1KE9 VTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVERPASDSWQKLEKSR
       : .:::::::::::.:::::.:::: ::..:::.::.  :. ....:: :. :.:...::
CCDS45 VIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNIWKKIDQSR
            800       810       820       830       840       850  

           460       470       480       490       500       510   
pF1KE9 EYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFL
       .:::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::: ::.: ::.::::
CCDS45 DYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFL
            860       870       880       890       900       910  

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE9 IIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVV
       ::::::::.::::::::::..:..::::: ::::::::::: .::.::  . :...:...
CCDS45 IIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAI
            920       930       940       950       960       970  

           580       590       600       610       620       630   
pF1KE9 ITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNS
       ::::::::. : ::. :.: ::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS45 ITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNT
            980       990      1000      1010      1020      1030  

           640       650       660       670       680       690   
pF1KE9 VEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAP
       ::::::::.:::: .::::..:..:::::::::::.:::.:::::::::::.::::.:::
CCDS45 VEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAP
           1040      1050      1060      1070      1080      1090  

           700       710       720       730       740       750   
pF1KE9 KQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLING
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::.: :.:::.::::::::::::::::.:
CCDS45 KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKG
           1100      1110      1120      1130      1140      1150  

           760       770       780       790       800       810   
pF1KE9 AEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLD
       :::::: .:: :..: : ::.::::::.:::::::::::::. :::::::::::::::::
CCDS45 AEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLD
           1160      1170      1180      1190      1200      1210  

           820       830       840       850       860       870   
pF1KE9 ILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
       :::::::..:: :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
           1220      1230      1240      1250      1260      1270  

           880       890       900       910       920       930   
pF1KE9 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS45 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQ
           1280      1290      1300      1310      1320      1330  

            940       950       960       970       980       990  
pF1KE9 DIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITI
       ... :.....:.::::: :.:::::.:::::.:.::::::::::::::::: :::.::::
CCDS45 SMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITI
           1340      1350      1360      1370      1380      1390  

           1000      1010      1020      1030      1040      1050  
pF1KE9 QSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRK
       .:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::.: :: . ..::::: ::.::
CCDS45 ESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRK
           1400      1410      1420      1430      1440      1450  

           1060      1070      1080      1090      1100      1110  
pF1KE9 QTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRW
       ::. . :  .::: :.:: .:..::.: . ::  :..  : :.::::::::::..:::::
CCDS45 QTRPF-SATKDELAELSEAESEGDEKP-KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRW
            1460      1470       1480      1490      1500      1510

           1120      1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KE9 KDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQN
       ..::.::::: .:::.:.:.::::::.::. ::.::::::.:::.:::::.:::.. :::
CCDS45 REILSHGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQN
             1520      1530      1540      1550      1560      1570

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KE9 HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLR
       : ::::::::::::::.:.:    ... :.::   ::: .:.:.:::::.:.::::::::
CCDS45 HLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLR
             1580      1590      1600      1610      1620      1630

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KE9 VRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKH
       :::::::: :..:.  .:.:.:  : ..:: .:. :. :.:..::: .::::::::::::
CCDS45 VRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKH
             1640      1650      1660      1670      1680      1690

           1300      1310      1320         1330      1340         
pF1KE9 GYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTD---GTSDIPERGNTDK--EDNAED
       :::.::..::::::::::.:: ::::...::: ..:   :  . ::   .    .:. ::
CCDS45 GYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIED
             1700      1710      1720      1730      1740      1750

      1350      1360      1370      1380      1390      1400       
pF1KE9 KVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQR
        :          :. :: :..   : .   ..:   ::  ::..::::.:::::.:.:::
CCDS45 DV----------SSPGDLVIA---DGDGQLMEG---DKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQR
                       1760         1770         1780      1790    

      1410         1420      1430      1440       1450      1460   
pF1KE9 CNRK---ELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINK-EAQKRWTRREQADFYRTVS
        :..   .  .: .  : .    . ::    : .  .  : : :.::::::.:::::.::
CCDS45 TNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQPIYEEA---TLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVS
         1800      1810      1820         1830      1840      1850 

          1470      1480      1490      1500      1510      1520   
pF1KE9 SFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDT
       .::::.: ..  ::::.:: ..:: ::.:.:::.:.:.:..::: :::::. ..   :. 
CCDS45 TFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPN-
            1860      1870      1880      1890      1900      1910 

          1530      1540      1550      1560      1570      1580   
pF1KE9 TIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRD
        :...:::::::.:::::::::::::::.:. ::: :::.::.:.  :::::::: ::::
CCDS45 -IFIQPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRD
              1920      1930      1940      1950      1960         

          1590      1600      1610      1620      1630      1640   
pF1KE9 LLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESL
       ::::.::::..::: .:. ::.:::. : :::.: : . ...   :   ::.      .:
CCDS45 LLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQV------AL
    1970      1980      1990      2000      2010      2020         

          1650      1660      1670      1680      1690      1700   
pF1KE9 TYSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESL
       . : ..                       :::         .. :. .:          :
CCDS45 SASPLT-----------------------SLP---------RLLDAKGII---------L
                                 2030               2040           

          1710      1720      1730      1740      1750      1760   
pF1KE9 ESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGS
       : :   .. :..::.: .:   ...:.:  . .  .:         :.  .   :   :.
CCDS45 EEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGD
           2050      2060      2070               2080        2090 

          1770      1780      1790      1800      1810      1820   
pF1KE9 LEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGF
        ..::  ... .      :  ..   :  . :...:    ... .         :.::. 
CCDS45 QKSGGKCETDRR------MVAARTEPLTPNPASKKP----RVHKR---------GSESS-
            2100            2110      2120                   2130  

          1830      1840      1850      1860      1870      1880   
pF1KE9 VDMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVG
           : :  ::.:.  :         ..:  :.   : .::                   
CCDS45 ----SDSDSDSERSSCS---------SRSSSSSSSSSCSHS-------------------
                2140               2150                            

          1890      1900      1910      1920      1930      1940   
pF1KE9 MGERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHM
                                    ..::               . .. .:     
CCDS45 -----------------------------RSGS--------------SSSSSSSC-----
                                 2160                    2170      

          1950      1960      1970      1980      1990      2000   
pF1KE9 ERWMHGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKES
                                 :.... .  .  ..  :                 
CCDS45 --------------------------SSASSSSSSSTSSSSSS-----------------
                                      2180                         

          2010      2020      2030      2040      2050      2060   
pF1KE9 AEGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGD
                     :  .::. : ....   :... : . :     .::: .: :    .
CCDS45 --------------SSSSSEESDSDEEEAQKRESTTHMKAY-----DEESVASLSTTQDE
                   2190      2200      2210           2220         

          2070       2080      2090      2100      2110      2120  
pF1KE9 IGDELQEARA-PTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPS
         : .:   . :  : .::   . . : ::::::.:::::.::..::::::::...   .
CCDS45 TQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDA
    2230      2240      2250      2260      2270      2280         

              2130      2140      2150            2160      2170   
pF1KE9 GTLP---TPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAAL------AAQIHKESFLAPVFTKD
       .:.    :  : .: :. :  :.: .       ::..      ..:. ::. :  .: :.
CCDS45 NTVASFYTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPP---GAGVKEEHDQSTQMSKEGGLKLTFQKQ
    2290      2300      2310         2320      2330      2340      

          2180      2190      2200      2210      2220      2230   
pF1KE9 EQKHRRPYEFEVERDAKARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPF
          ..::.. :   :. : : .:. .                  .:. .:: :      :
CCDS45 GLAQKRPFDGE---DG-ALGQQQYLTR---------------LRELQSASETS---LVNF
       2350          2360                     2370      2380       

          2240      2250      2260      2270      2280      2290   
pF1KE9 PVSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKH
       :   : :  :  .:.: .::                   .:: .  ..  ...::::::.
CCDS45 P--KSIPVSG--TSIQPTLG-------------------ANGVILDNQPIVKKRRGRRKN
           2390        2400                         2410      2420 

          2300          2310      2320       2330      2340        
pF1KE9 VEGGMDLIFLKEQT----LQAGILEVHEDPG-QATLSTTHPEGPGPATSAPEPATA---A
       ::: .:..:....     .. :.   . . : . .:: :.:.:  : : .: :.     .
CCDS45 VEG-VDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGI-PDTESPVPVINLKDG
             2430      2440      2450      2460       2470         

        2350       2360      2370      2380         2390      2400 
pF1KE9 SSQAEKSIPS-KSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFS---DKPKQRRPRCKEPGKLDVSSL
       .  :  . :. :.:  ::...  :  .. .:   ..    .:::.: ::..:.::::.::
CCDS45 TRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSL
    2480      2490      2500      2510      2520      2530         

            2410                                         2420      
pF1KE9 SGEERVPAIPKE----------PGLR-------------------------GFLPENKFN
       .:::::  : ..          : :.                         :::::. ..
CCDS45 TGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYE
    2540      2550      2560      2570      2580      2590         

       2430      2440      2450          2460      2470      2480  
pF1KE9 HTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVA----DSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQ
       . :. :..:.    ::::::.: . :: . .:     : :: .::. :::. :.::. ::
CCDS45 RILTGPVVREE-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG-NPLLANGLLPGVDLTTLQ
    2600      2610       2620      2630       2640      2650       

               2490       2500      2510      2520      2530       
pF1KE9 ----NMRNMPGIPLT-GLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGL
           :..:. .. .: ::.:.:.:   .:.: :.:.  .:.::.: :::..:...:.:::
CCDS45 ALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTG---LPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGL
      2660      2670      2680         2690      2700      2710    

      2540      2550      2560      2570      2580      2590       
pF1KE9 LSPPMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQS
       :. :   : ..:   . .: .: . . ::.:  .. ::..   .... .   :.  :  .
CCDS45 LTKP---TESGTEDKK-GSDSKESEGKTERT--ESQSSENGGENSVSSS---PSTSSTAA
            2720       2730      2740        2750         2760     

      2600      2610      2620      2630      2640             2650
pF1KE9 EPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPAMQQA-------RHSEIVGL
         . ....:.:.::.:. ..    .::.:.:.::... .:...:.       ..:.. . 
CCDS45 LNTAAAANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLGSS
        2770      2780          2790      2800      2810      2820 

             2660      2670      2680      2690      2700      2710
pF1KE9 ESQKRKKKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGAQAGEGALKDS
       .: . :.. ..  . ...    ::   : : ::.  . .:                    
CCDS45 KSVEVKEEDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSNED
            2830      2840      2850      2860      2870      2880 

            
pF1KE9 NNDTN

>>CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2897 aa)
 initn: 3876 init1: 2853 opt: 5503  Z-score: 3604.6  bits: 681.5 E(32554): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 6969; 45.3% identity (66.8% similar) in 2772 aa overlap (9-2690:437-2877)

                                     10        20        30        
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                                     ..:...  :   : :...... . .:   .
CCDS76 EDLLQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQFTSHLVTRPSDMAQTQLQSQARS---W
        410       420       430       440       450       460      

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE9 DCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKK
         : .......:    :: ..   . . ...  . .       ....     . ::.:::
CCDS76 HSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTK-------LQNTQVRVMSEKKQRKK
           470       480       490              500       510      

      100        110       120       130       140       150       
pF1KE9 KEP-GDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKKARKP
        :  . :: : .  ..   : :.. : . :.     . :  . : ::  .: : .   ::
CCDS76 VESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPTASVEGKE--EKKGRRMKSKP
        520       530       540       550       560         570    

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE9 REASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLT
       ..    :..:. ..:.    .::        :   .   :: :::.:.. :  . .:   
CCDS76 KD----KDSKKTKTCSKLKEKTKI-------GKLIITLGKKQKRKNESSDEISDAEQ---
              580       590              600       610       620   

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE9 NPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSAS
             :... .. :::::::.::.::.:: ::.. :  ... :. . .   ..::   .
CCDS76 -----MPQHTLKDQDSQKRRSNRQIKRKKYAEDIEGK--QSEEEVKGSMKIKKNSAPLPG
                   630       640       650         660       670   

       280         290       300        310       320       330    
pF1KE9 TLAWQ--AEEPPEDDANIIEKILASKTVQ-EVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWAT
           :  .:.: :.:: :..:::.:.::. :. ::   .: : :.:::.:.:::::.:::
CCDS76 EQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSSRTVKKEISPGVM-IDTEEFFVKYKNYSYLHCEWAT
           680       690       700       710        720       730  

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE9 MEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEE
        :.: :: :: ::::::. .:::  :.:.. .:. ::::::::::.:::.  .: .::: 
CCDS76 EEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEP
            740       750       760       770       780       790  

          400       410       420       430        440       450   
pF1KE9 VTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVERPASDSWQKLEKSR
       : .:::::::::::.:::::.:::: ::..:::.::.  :. ....:: :. :.:...::
CCDS76 VIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNIWKKIDQSR
            800       810       820       830       840       850  

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pF1KE9 EYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFL
       .:::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::: ::.: ::.::::
CCDS76 DYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFL
            860       870       880       890       900       910  

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE9 IIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVV
       ::::::::.::::::::::..:..::::: ::::::::::: .::.::  . :...:...
CCDS76 IIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAI
            920       930       940       950       960       970  

           580       590       600       610       620       630   
pF1KE9 ITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNS
       ::::::::. : ::. :.: ::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS76 ITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNT
            980       990      1000      1010      1020      1030  

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pF1KE9 VEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAP
       ::::::::.:::: .::::..:..:::::::::::.:::.:::::::::::.::::.:::
CCDS76 VEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAP
           1040      1050      1060      1070      1080      1090  

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pF1KE9 KQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLING
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::.: :.:::.::::::::::::::::.:
CCDS76 KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKG
           1100      1110      1120      1130      1140      1150  

           760       770       780       790       800       810   
pF1KE9 AEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLD
       :::::: .:: :..: : ::.::::::.:::::::::::::. :::::::::::::::::
CCDS76 AEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLD
           1160      1170      1180      1190      1200      1210  

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pF1KE9 ILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
       :::::::..:: :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADT
           1220      1230      1240      1250      1260      1270  

           880       890       900       910       920       930   
pF1KE9 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS76 CIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQ
           1280      1290      1300      1310      1320      1330  

            940       950       960       970       980       990  
pF1KE9 DIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITI
       ... :.....:.::::: :.:::::.:::::.:.::::::::::::::::: :::.::::
CCDS76 SMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITI
           1340      1350      1360      1370      1380      1390  

           1000      1010      1020      1030      1040      1050  
pF1KE9 QSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRK
       .:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::.: :: . ..::::: ::.::
CCDS76 ESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRK
           1400      1410      1420      1430      1440      1450  

           1060      1070      1080      1090      1100      1110  
pF1KE9 QTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRW
       ::. . :  .::: :.:: .:..::.: . ::  :..  : :.::::::::::..:::::
CCDS76 QTRPF-SATKDELAELSEAESEGDEKP-KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRW
            1460      1470       1480      1490      1500      1510

           1120      1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KE9 KDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQN
       ..::.::::: .:::.:.:.::::::.::. ::.::::::.:::.:::::.:::.. :::
CCDS76 REILSHGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQN
             1520      1530      1540      1550      1560      1570

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KE9 HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLR
       : ::::::::::::::.:.:    ... :.::   ::: .:.:.:::::.:.::::::::
CCDS76 HLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLR
             1580      1590      1600      1610      1620      1630

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KE9 VRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKH
       :::::::: :..:.  .:.:.:  : ..:: .:. :. :.:..::: .::::::::::::
CCDS76 VRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKH
             1640      1650      1660      1670      1680      1690

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pF1KE9 GYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTD---GTSDIPERGNTDK--EDNAED
       :::.::..::::::::::.:: ::::...::: ..:   :  . ::   .    .:. ::
CCDS76 GYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIED
             1700      1710      1720      1730      1740      1750

      1350      1360      1370      1380      1390      1400       
pF1KE9 KVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQR
        :          :. :: :..   : .   ..:   ::  ::..::::.:::::.:.:::
CCDS76 DV----------SSPGDLVIA---DGDGQLMEG---DKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQR
                       1760         1770         1780      1790    

      1410         1420      1430      1440       1450      1460   
pF1KE9 CNRK---ELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINK-EAQKRWTRREQADFYRTVS
        :..   .  .: .  : .    . ::    : .  .  : : :.::::::.:::::.::
CCDS76 TNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQPIYEEA---TLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVS
         1800      1810      1820         1830      1840      1850 

          1470      1480      1490      1500      1510      1520   
pF1KE9 SFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDT
       .::::.: ..  ::::.:: ..:: ::.:.:::.:.:.:..::: :::::. ..   :. 
CCDS76 TFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPN-
            1860      1870      1880      1890      1900      1910 

          1530      1540      1550      1560      1570      1580   
pF1KE9 TIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRD
        :...:::::::.:::::::::::::::.:. ::: :::.::.:.  :::::::: ::::
CCDS76 -IFIQPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRD
              1920      1930      1940      1950      1960         

          1590      1600      1610      1620      1630      1640   
pF1KE9 LLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESL
       ::::.::::..::: .:. ::.:::. : :::.: : . ...   :   ::.      .:
CCDS76 LLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQV------AL
    1970      1980      1990      2000      2010      2020         

          1650      1660      1670      1680      1690      1700   
pF1KE9 TYSQMSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESL
       . : ..                       :::         .. :. .:          :
CCDS76 SASPLT-----------------------SLP---------RLLDAKGII---------L
                                 2030               2040           

          1710      1720      1730      1740      1750      1760   
pF1KE9 ESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGS
       : :   .. :..::.: .:   ...:.:  . .  .:         :.  .   :   :.
CCDS76 EEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGD
           2050      2060      2070               2080        2090 

          1770      1780      1790      1800      1810      1820   
pF1KE9 LEAGGVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGF
        ..::  ... .      :  ..   :  . :...:    ... .         :.::. 
CCDS76 QKSGGKCETDRR------MVAARTEPLTPNPASKKP----RVHKR---------GSESS-
            2100            2110      2120                   2130  

          1830      1840      1850      1860      1870      1880   
pF1KE9 VDMCSLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVG
           : :  ::.:.  :         ..:  :.   : .::                   
CCDS76 ----SDSDSDSERSSCS---------SRSSSSSSSSSCSHS-------------------
                2140               2150                            

          1890      1900      1910      1920      1930      1940   
pF1KE9 MGERPEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHM
                                    ..::               . .. .:     
CCDS76 -----------------------------RSGS--------------SSSSSSSC-----
                                 2160                    2170      

          1950      1960      1970      1980      1990      2000   
pF1KE9 ERWMHGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKES
                                 :.... .  .  ..  :                 
CCDS76 --------------------------SSASSSSSSSTSSSSSS-----------------
                                      2180                         

          2010      2020      2030      2040      2050      2060   
pF1KE9 AEGQNVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDRDGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGD
                     :  .::. : ....   :... : . :     .::: .: :    .
CCDS76 --------------SSSSSEESDSDEEEAQKRESTTHMKAY-----DEESVASLSTTQDE
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pF1KE9 IGDELQEARA-PTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPS
         : .:   . :  : .::   . . : ::::::.:::::.::..::::::::...   .
CCDS76 TQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDA
    2230      2240      2250      2260      2270      2280         

              2130      2140      2150      2160      2170         
pF1KE9 GTLP---TPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKHRR
       .:.    :  : .: :. :  :.: .       ::..  .  . . .. :     .:: :
CCDS76 NTVASFYTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPP---GAGVKEEHDQSTQMSKV-----KKHVR
    2290      2300      2310         2320      2330           2340 

    2180              2190      2200      2210      2220      2230 
pF1KE9 PYEFEVE-RDA-------KARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLSCSSEGSPGATS
         :: :. .:        . .:: :     :.   . .  .     .:. .:: :     
CCDS76 EKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETS---LV
            2350      2360      2370      2380      2390           

            2240      2250      2260      2270      2280      2290 
pF1KE9 PFPVSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRR
        ::   : :  :  .:.: .::                   .:: .  ..  ...:::::
CCDS76 NFP--KSIPVSG--TSIQPTLG-------------------ANGVILDNQPIVKKRRGRR
     2400          2410                         2420      2430     

            2300          2310      2320       2330      2340      
pF1KE9 KHVEGGMDLIFLKEQT----LQAGILEVHEDPG-QATLSTTHPEGPGPATSAPEPATA--
       :.::: .:..:....     .. :.   . . : . .:: :.:.:  : : .: :.    
CCDS76 KNVEG-VDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGI-PDTESPVPVINLK
        2440       2450      2460      2470      2480       2490   

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pF1KE9 -ASSQAEKSIPS-KSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFS---DKPKQRRPRCKEPGKLDVS
        ..  :  . :. :.:  ::...  :  .. .:   ..    .:::.: ::..:.::::.
CCDS76 DGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVN
          2500      2510      2520      2530      2540      2550   

    2400      2410                                         2420    
pF1KE9 SLSGEERVPAIPKE----------PGLR-------------------------GFLPENK
       ::.:::::  : ..          : :.                         :::::. 
CCDS76 SLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESM
          2560      2570      2580      2590      2600      2610   

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pF1KE9 FNHTLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVA----DSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVG
       ... :. :..:.    ::::::.: . :: . .:     : :: .::. :::. :.::. 
CCDS76 YERILTGPVVREE-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG-NPLLANGLLPGVDLTT
          2620       2630      2640      2650       2660      2670 

                 2490       2500      2510      2520      2530     
pF1KE9 LQ----NMRNMPGIPLT-GLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVG
       ::    :..:. .. .: ::.:.:.:   .:.: :.:.  .:.::.: :::..:...:.:
CCDS76 LQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTG---LPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMG
            2680      2690         2700      2710      2720        

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pF1KE9 GLLSPPMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSD
       :::. :   : ..:   . .: .: . . ::.:  .. ::..   .... .   :.  : 
CCDS76 GLLTKP---TESGTEDKK-GSDSKESEGKTERT--ESQSSENGGENSVSSS---PSTSST
     2730         2740       2750        2760      2770            

        2600      2610      2620      2630      2640               
pF1KE9 QSEPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPAMQQA-------RHSEIV
        .  . ....:.:.::.:. ..    .::.:.:.::... .:...:.       ..:.. 
CCDS76 AALNTAAAANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLG
    2780      2790      2800          2810      2820      2830     

     2650      2660      2670      2680      2690      2700        
pF1KE9 GLESQKRKKKKTKGDNPNSHPEPAPSCEREPSGDENCAEPSAPLPAEREHGAQAGEGALK
       . .: . :.. ..  . ...    ::   : : ::.  . .:                  
CCDS76 SSKSVEVKEEDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSN
        2840      2850      2860      2870      2880      2890     

     2710     
pF1KE9 DSNNDTN
              
CCDS76 ED     
              

>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12               (1905 aa)
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      250       260       270       280       290       300        
pF1KE9 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
                                     : :.  .:: . . . .   :. ..   .:
CCDS76 LNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPP-SPTPVPRPPDADPNTPSPKP
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pF1KE9 --GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN-------------
         :.:    . :.::....:: ::.:..  .::   ..  .  . .:             
CCDS76 LEGRPE---RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGD
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pF1KE9 --KQAQMKHI---FTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCS
         :. . :.    :.: .: ..    .:... . :::.  :. : . :.  .:::.:: .
CCDS76 EEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--HSVDKK-GH--VHYLIKWRD
          590       600       610       620          630           

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pF1KE9 LPYEESTWELEE----DVDPAKVKEFESLQVL------P-------EIKHVERPAS----
       :::....:: :.    : :  : . ..  ...      :       .....:::      
CCDS76 LPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTV
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pF1KE9 DSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLS
       :   : :.. :: ...   :. ::.::.::: :.: .  . :::::::::::.:. .:: 
CCDS76 DPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLY
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pF1KE9 EIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDA
        .. .:  .::::. :::::: ::::::. :. .: ...: :.. :: .:.. :. ..: 
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           :.  : .      ::::..:..:.:  :   : .: :.:.:.:::::::: . :..
CCDS76 AIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFF
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       . :. ..:.::.:::::::::..:::: ::::: : .: .  .:::::.:.  :.:.:::
CCDS76 RVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKL
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pF1KE9 QSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLT-KGANQHN
       ...: : :::::: :: ::.  : : :..:::. .:::::. :: .::  :. .:..  :
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       . .:.:..:.:.::::::::.  :    .:      .:  :.  .. .:.:.:.:::.:.
CCDS76 QVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAA---ME------APKMPNGMYDGSALIRASGKLLLL
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       .:.: .:  :::.:::::::.. ::.:::.: .. : :::::: . ::.:: :::::  :
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pF1KE9 DSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI
        ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: :::::.: : .::..
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       :: : :... . :. :. : . :.    : :  . . ..::.:..:.:. :.   . :: 
CCDS76 TRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----RPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEA
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pF1KE9 DEG---SKFCEEDI-----DQILQR---RTHTITIQSEGKG-----STFAKASFVAS---
        .:   .:  :..      :. ..:   :..  : ..: .:     :.:  :..:.    
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pF1KE9 -GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSF
        :.. ..  .        ::..:.:  .  . . . ..  ..:   . :.:::... .. 
CCDS76 MGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDGS
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pF1KE9 EEDE---------LMEFS----ELDSDSDER------PTRSRRLNDKARRYLRAECFRVE
       .::.           ..:    : : : :::      :.:.   ::: .  :     :: 
CCDS76 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKP-LPPLLARVG
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        :. ..:.. : .  . .. ... .  .:    . . : :     :..:.   .. :. .
CCDS76 GNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRH
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pF1KE9 LITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLH
       :  :  :: :.:. .   . :::                                     
CCDS76 LCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVE
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>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12                (1912 aa)
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pF1KE9 --GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN-------------
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         :. . :.    :.: .: ..    .:... . :::.  :. : . :.  .:::.:: .
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pF1KE9 LPYEESTWELEE----DVDPAKVKEFESLQVL------P-------EIKHVERPAS----
       :::....:: :.    : :  : . ..  ...      :       .....:::      
CCDS85 LPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTV
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pF1KE9 DSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLS
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CCDS85 DPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLY
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pF1KE9 Q---GNPLSGV-----FKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLL
           :.  : .      ::::..:..:.:  :   : .: :.:.:.:::::::: . :..
CCDS85 AIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFF
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CCDS85 QVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAA---ME------APKMPNGMYDGSALIRASGKLLLL
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CCDS85 GAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFV
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CCDS85 TRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----RPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEA
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pF1KE9 DEG---SKFCEEDI-----DQILQR---RTHTITIQSEGKG-----STFAKASFVAS---
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pF1KE9 -GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSF
        :.. ..  .        ::..:.:  .  . . . ..  ..:   . :.:::... .. 
CCDS85 MGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDGS
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pF1KE9 EEDE---------LMEFS----ELDSDSDER------PTRSRRLNDKARRYLRAECFRVE
       .::.           ..:    : : : :::      :.:.   ::: .  :     :: 
CCDS85 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKP-LPPLLARVG
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pF1KE9 KNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWE
        :. ..:.. : .  . .. ... .  .:    . . : :     :..:.   .. :. .
CCDS85 GNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRH
     1410      1420      1430      1440      1450        1460      

      1160      1170         1180      1190      1200      1210    
pF1KE9 LITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLH
       :  :  :: :.:. .   . :::                                     
CCDS85 LCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVE
       1470       1480      1490      1500      1510      1520     

>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (1966 aa)
 initn: 1750 init1: 581 opt: 1602  Z-score: 1055.8  bits: 209.3 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 1792; 36.5% identity (62.4% similar) in 985 aa overlap (279-1165:513-1470)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE9 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
                                     : :.  :::   .   ..  ..  :   .:
CCDS32 LNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVA-VPAPQQADGNPDVPPPRP
            490       500       510       520        530       540 

      310       320       330       340       350                  
pF1KE9 GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN---------------
        .   . : :.::. ..:: ::.::   .::    .  .  . .:               
CCDS32 LQGRSERE-FFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE9 ------KQAQMKHIFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWC
             ....  : ..: .:  .    .:... : ::  . :. : . :.   :::::: 
CCDS32 DGKSDKRKVKDPH-YAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRI--INHSVD-KKGNY--HYLVKWR
              610        620       630         640          650    

           410                            420       430        440 
pF1KE9 SLPYEESTWELEE-DV--------------------DPAKVKEFESLQV-LPEIKHVERP
       .:::..:::: .: ..                    :::. ..... .  :        :
CCDS32 DLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSP
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             450         460       470       480       490         
pF1KE9 ASDSWQKLEKSREY--KNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITF
       ..:   : : . ..   ... :. :::::.::: :.: .  . :::::::::::::.:.:
CCDS32 TNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVF
          720       730       740       750       760       770    

     500        510       520       530        540       550       
pF1KE9 LSEIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYR
       :  .. .:  .::::. :::::: ::::::. :. .. ...: :.. :: .:.. :. ..
CCDS32 LYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFE
          780       790       800       810       820       830    

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pF1KE9 DAQGNPLSGVFK--------FHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCK
       :   .  . .::        :::..:..:.:  :   : .:.:.:...:::::::: . :
CCDS32 DNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSK
          840       850       860       870       880       890    

     610       620       630       640       650       660         
pF1KE9 LLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVK
       ... :. . ..::.:::::::::..:::: ::::: : .: .  .:::::.:.. :.:.:
CCDS32 FFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIK
          900       910       920       930       940       950    

     670       680       690       700       710       720         
pF1KE9 KLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFL-TKGANQ
       ::...: : :::::: :: ::.  : : :..:::. .:::::. :: .::  : ..:.. 
CCDS32 KLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGG-
          960       970       980       990      1000      1010    

      730       740       750       760       770         780      
pF1KE9 HNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPD--FQLQAMIQAAGKLV
        :. .:.: ::.:.::::::::.  :  .         ::  :.  ..  :.:...:::.
CCDS32 -NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAME---------SPKLPSGAYEGGALIKSSGKLM
           1020      1030      1040               1050      1060   

        790       800       810       820       830       840      
pF1KE9 LIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFC
       :..:.: ::   ::.:::::::.. ::.:::.:  . : :::::: . : ::: ::::: 
CCDS32 LLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFN
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

        850       860       870       880       890       900      
pF1KE9 KPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYR
        : ...: ::: ::::::::::..::: :::::::::.::.:: .: :::::.. : .::
CCDS32 APGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYR
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

        910       920       930       940       950       960      
pF1KE9 LITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMD
       ..:: : :... . :. :. : . :.    : :  . . ..::.:..:.:. :.   . :
CCDS32 FVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV----RPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKD
          1190      1200          1210      1220      1230         

              970         980          990       1000      1010    
pF1KE9 E------EDEGS--KFCEEDIDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVASGN---
       :      :...:  .. .: : ..:.:    :.   .:. ..  :.:  :..:.  .   
CCDS32 ENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKI
    1240      1250      1260      1270      1280      1290         

                   1020      1030      1040      1050      1060    
pF1KE9 ----RTDISLD---DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDE
           :  :. .   ::..:.:  .  . . . ..  ..:   . :::::... .. .::.
CCDS32 EEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RVRKQVNYNDAAQEDQ
    1300      1310      1320       1330      1340       1350       

               1070      1080          1090      1100      1110    
pF1KE9 --LMEFS----ELDSDSDERPT----RSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWG-RWK
           :.:    : : : ::::      .:.: ..  . :     ::  :. ..:.. : .
CCDS32 DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQR
      1360      1370      1380      1390      1400      1410       

          1120      1130         1140      1150      1160      1170
pF1KE9 DILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTL
         . .. ..: .  .:    . . : :     :..:.   .. :. .:  :  ::     
CCDS32 KAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGSETFA
      1420      1430      1440      1450        1460      1470     

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KE9 QNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVL
                                                                   
CCDS32 DGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPT
        1480      1490      1500      1510      1520      1530     

>>CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1                  (1954 aa)
 initn: 1672 init1: 578 opt: 1564  Z-score: 1031.0  bits: 204.7 E(32554): 4.2e-51
Smith-Waterman score: 1702; 33.2% identity (59.1% similar) in 1161 aa overlap (279-1282:473-1580)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE9 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
                                     : :.  :::         ....    .:.:
CCDS57 LNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAP-------FMVGLPGPDVEP
            450       460       470       480              490     

       310            320       330       340       350            
pF1KE9 G-EPPFDLE-----LFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN---------
       .  ::  ::      :.::. ..:: ::.:.   .::    .  .  . .:         
CCDS57 SLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFD
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                   360          370           380       390        
pF1KE9 --------KQAQMKH---IFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHY
               :. . :.   .... .: ..    .:... . :::.  :. : . :.  .::
CCDS57 YGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--HSFD-KKGD--VHY
         560       570       580       590         600          610

      400       410                                420        430  
pF1KE9 LVKWCSLPYEESTWELEEDVD-------------------------PAKV-KEFESLQVL
       :.:: .:::.. :::.. :.:                         : .. :. ..:.  
CCDS57 LIKWKDLPYDQCTWEID-DIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDD
              620        630       640       650       660         

            440       450         460       470       480       490
pF1KE9 PEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGL
        . :  . :  :   :..:.  : .:.   :. :::::.::: :.: .  . ::::::::
CCDS57 KQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGL
     670       680       690       700       710       720         

              500        510       520       530        540        
pF1KE9 GKTIQSITFLSEIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQM
       :::.:.:.::  .. .:  .::.:. :::::: ::::::. :. .. ...: :.. ::..
CCDS57 GKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSV
     730       740       750       760       770       780         

      550       560               570       580       590       600
pF1KE9 IQQYEMVYRDAQGNPLSGVF--------KFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEA
       :.. :. ..:      . ::        ::::..:..:.:  :   : .:.:.:...:::
CCDS57 IRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEA
     790       800       810       820       830       840         

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 HRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFG
       ::::: . :... :. . ...:.:::::::::..:::: ::::: : .: .  .:::::.
CCDS57 HRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFA
     850       860       870       880       890       900         

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 DLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFS
       :.. :.:.:::...: : :::::: :: ::.  : : :..:::...:::::. :: .:: 
CCDS57 DISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFE
     910       920       930       940       950       960         

               730       740       750         760       770       
pF1KE9 FL-TKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYL--INGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQA
        : .::..  :. .:.: ::.:.::::::::  . ..:  .:        :.. ... ..
CCDS57 ALNSKGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVL--------PNG-SYDGSS
     970         980       990      1000              1010         

       780       790       800       810       820       830       
pF1KE9 MIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNL
       .....:::.:..:.: ::   ::.:::::::.. ::.:::.:  . : :::::: . :.:
CCDS57 LVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGL
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       :: :::::  : ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: ::::
CCDS57 RQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIG
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CCDS57 QNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTE
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pF1KE9 QLSKMEVEDLLRKGAY-------------GALM-------------DEED-EGSKFCEED
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CCDS57 ELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYD
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pF1KE9 ---IDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVA---SG----NRTDISLD---DPN
          :...:.:    :    .:. ..  :.:  :..:.   .:    .:  :. .   ::.
CCDS57 DAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPD
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       .:.:  .  . . . ..  ..:   . :.:::... .. .::     ::     :.:   
CCDS57 YWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGS
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pF1KE9 -ELDSDSDERPT--RSRRLNDKARRYLRAE--------CFRVEKNLLIFGWG-RWKDILT
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CCDS57 EDEDEDFEERPEGQSGRR---QSRRQLKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFL
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       .. ..: .  .:    . . : :     :....   .. :. .:  :  :: :.:. .  
CCDS57 NAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLFMRHLCEPGADG-AETFADGV
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pF1KE9 -HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLL
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CCDS57 PREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYS-TPDLIPEGPEGKK-----------
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CCDS57 --------SGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMD-EKDPGAQKPRQP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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