Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3982
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3982, 329 aa
1>>>pF1KE3982 329 - 329 aa - 329 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6732+/-0.00127; mu= 8.1390+/- 0.075
mean_var=118.9933+/-24.481, 0's: 0 Z-trim(105.0): 204 B-trim: 21 in 1/47
Lambda= 0.117574
statistics sampled from 7946 (8196) to 7946 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 2190 383.1 1.7e-106
CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 1183 212.3 4.4e-55
CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 1004 181.9 5.7e-46
CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 906 165.2 5.7e-41
CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 806 148.3 6.6e-36
CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 798 146.9 1.9e-35
CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 696 129.6 2.9e-30
CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 443 86.7 2.2e-17
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 369 74.7 6.4e-13
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 369 74.7 6.4e-13
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 369 74.7 6.4e-13
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 347 71.0 8.4e-12
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 347 71.0 8.5e-12
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 347 71.2 1.5e-11
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 341 70.0 1.7e-11
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 341 70.0 1.7e-11
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 341 70.3 3.3e-11
>>CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 (329 aa)
initn: 2190 init1: 2190 opt: 2190 Z-score: 2025.5 bits: 383.1 E(32554): 1.7e-106
Smith-Waterman score: 2190; 100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSVLEENRPFAQQLSNVYFTILSLFCFKLFVKISLAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MSVLEENRPFAQQLSNVYFTILSLFCFKLFVKISLAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 VTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 HECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 AQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRLC
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE3 IRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 IRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
310 320
>>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa)
initn: 1522 init1: 902 opt: 1183 Z-score: 1102.4 bits: 212.3 E(32554): 4.4e-55
Smith-Waterman score: 1183; 53.8% identity (81.8% similar) in 325 aa overlap (6-329:2-323)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSVLEENRPFAQQLSNVYFTIL-SLFCFKLFVKISLAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFY
:. : ..:...:.. ..: :::..:. ::.:.:::::::::::::::: :.:
CCDS14 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACA
: . :::::::::::.:::::::.::..:: ::: ::...:. ::::::: :::::
CCDS14 GGIS--DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKG
..::: ::.::..:. :.::::::: .:: .:...:::.::::::: : :: :::...:
CCDS14 KALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHA
:.::..::.. ....:.:.:.::::::::: :. :. ::: ::.:..:.. ::::::
CCDS14 HRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRL
::.::..:...:: ..::... .:.. .:.:. .: ::. :: .:. :. : :::::
CCDS14 AARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPA-LSQLCRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE3 CIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
:.:. .:. . : .:.:: :. :: :.
CCDS14 CVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
300 310 320
>>CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (302 aa)
initn: 1353 init1: 902 opt: 1004 Z-score: 938.8 bits: 181.9 E(32554): 5.7e-46
Smith-Waterman score: 1004; 54.9% identity (83.1% similar) in 266 aa overlap (65-329:38-302)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 LAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGS-WADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQG
::. :::::::::::.:::::::.::..::
CCDS35 NEKNCEVSERIRRSGPWKEISFGDYICHTFQGDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 YNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAE
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CCDS35 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQ
.:::.::::::: : :: :::...::.::..::.. ....:.:.:.::::::::: :.
CCDS35 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 FHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVA
:. ::: ::.:..:.. ::::::::.::..:...:: ..::... .:.. .:.:
CCDS35 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320
pF1KE3 TSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
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CCDS35 APKSSVEQALLLREGPPA-LSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
250 260 270 280 290 300
>>CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (294 aa)
initn: 820 init1: 820 opt: 906 Z-score: 849.1 bits: 165.2 E(32554): 5.7e-41
Smith-Waterman score: 906; 53.1% identity (79.5% similar) in 258 aa overlap (69-326:35-291)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNA
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CCDS35 QGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGWAVNI
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEY
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CCDS35 ITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNLLLQH
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 GAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIW
::..: :: : :: :::: .:: ::.. ::..: ..:..: :::::::.:: .:: :.
CCDS35 GASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQRACVK
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 KLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSM
::: .::::..:: :.::::.:. .: :.. ::..:::: .:::.: ::.... :
CCDS35 KLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVPPESP
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320
pF1KE3 VERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
. ...:..:. : ::.::::: ::. .: . : : .: :: ::.::
CCDS35 LAQLFLEREG-PPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
250 260 270 280 290
>>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa)
initn: 1243 init1: 800 opt: 806 Z-score: 758.1 bits: 148.3 E(32554): 6.6e-36
Smith-Waterman score: 806; 53.4% identity (81.3% similar) in 219 aa overlap (69-287:35-253)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNA
.: ::.:::: .:. :.::.:.:::. ::
CCDS14 QGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGWAVNI
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEY
.: :::.:::::::: :..:.. ::. ::.::..: : ::::::: .:: .:..:::..
CCDS14 ITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNLLLQH
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 GAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIW
::..: :: : :: :::: .:: ::.. ::..: ..:..: :::::::.:: .:: :.
CCDS14 GASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQRACVK
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 KLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSM
::: .::::..:: :.::::.:. .: :.. ::..:::: .:::.: ::.... :
CCDS14 KLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVPPESP
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320
pF1KE3 VERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
. ...:..:
CCDS14 LAQLFLEREGASLPKPKP
250 260
>>CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (306 aa)
initn: 1339 init1: 690 opt: 798 Z-score: 749.8 bits: 146.9 E(32554): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 1074; 50.8% identity (77.5% similar) in 325 aa overlap (6-329:2-306)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSVLEENRPFAQQLSNVYFTIL-SLFCFKLFVKISLAILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFY
:. : ..:...:.. ..: :::..:. ::.:.:::::::::::::::: :.:
CCDS56 MEDGPVFYGFKNIFITMFATFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACA
: . :::::::::::.:::::::.::..: :::: :::::
CCDS56 GGIS--DCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQ-----------------ACLGGHVACA
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKG
..::: ::.::..:. :.::::::: .:: .:...:::.::::::: : :: :::...:
CCDS56 KALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRG
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHA
:.::..::.. ....:.:.:.::::::::: :. :. ::: ::.:..:.. ::::::
CCDS56 HRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSMVERILLQHEATPSSLYQLCRL
::.::..:...:: ..::... .:.. .:.:. .: ::. :: .:. :. : :::::
CCDS56 AARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPPA-LSQLCRL
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE3 CIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
:.:. .:. . : .:.:: :. :: :.
CCDS56 CVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
280 290 300
>>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 1006 init1: 621 opt: 696 Z-score: 656.9 bits: 129.6 E(32554): 2.9e-30
Smith-Waterman score: 696; 41.8% identity (70.7% similar) in 263 aa overlap (66-328:15-277)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 AILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYN
: :..:.:.::::..:. : :. :. .:
CCDS70 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGAC
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELL
:: ::.: .:::: : : .. :.. :: :::.:.: .::: ::: .::..:: :..::
CCDS70 VNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLL
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFH
: ::::.. :: ::: .: ::. .::. : ... . :.::::.::: ...
CCDS70 LSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLD
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 CIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATS
:. :: :::.:. .: .: :: ::. ........:.:::..: :.... .: : . :
CCDS70 CVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWS
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320
pF1KE3 SSMVERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
:: . . .: :: .: ::::. .:. : :. : .:..: : ..:.:
CCDS70 SSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
230 240 250 260 270
>>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa)
initn: 785 init1: 443 opt: 443 Z-score: 425.6 bits: 86.7 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 733; 50.7% identity (77.6% similar) in 219 aa overlap (69-287:35-243)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYNVNA
.: ::.:::: .:. :.::.:.:::. ::
CCDS55 QGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQGWAVNI
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELLLEY
.: :::.:::::::: :..:.. ::. ::.::..: : ::::::: .:: .:..:::..
CCDS55 ITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVNLLLQH
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 GAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFHCIW
::..: :: : :: :::: . ..: ..:..: :::::::.:: .:: :.
CCDS55 GASVQPESDLASPIHEAARR----------AYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQRACVK
130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 KLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATSSSM
::: .::::..:: :.::::.:. .: :.. ::..:::: .:::.: ::.... :
CCDS55 KLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELVPPESP
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 VERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
. ...:..:
CCDS55 LAQLFLEREGASLPKPKP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]