FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3954, 616 aa 1>>>pF1KE3954 616 - 616 aa - 616 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2644+/-0.000443; mu= 19.6519+/- 0.027 mean_var=94.8038+/-21.626, 0's: 0 Z-trim(110.3): 367 B-trim: 912 in 1/48 Lambda= 0.131723 statistics sampled from 18207 (18635) to 18207 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 10.390 The best scores are: opt bits E(85289) NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1483 293.2 1.7e-78 NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1462 289.2 2.8e-77 NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1462 289.2 2.8e-77 NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1462 289.2 2.8e-77 XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1462 289.2 2.8e-77 NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1462 289.3 2.9e-77 XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1462 289.3 2.9e-77 NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1462 289.3 2.9e-77 NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1462 289.3 2.9e-77 XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1462 289.3 2.9e-77 XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1462 289.3 2.9e-77 XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1089 218.4 6.2e-56 XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1089 218.4 6.2e-56 NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 1089 218.4 6.2e-56 NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 813 165.9 3.8e-40 NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 787 160.9 1.1e-38 NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 787 160.9 1.1e-38 XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 779 159.4 3e-38 XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 761 156.0 3.6e-37 NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 742 152.4 4.1e-36 NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 735 151.0 1e-35 NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 717 147.6 1e-34 XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 717 147.6 1e-34 XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 713 146.9 1.9e-34 NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 713 146.9 1.9e-34 NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 710 146.3 2.8e-34 XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 695 143.3 1.6e-33 NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 694 143.3 2.3e-33 NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 671 138.8 4.3e-32 NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 670 138.6 4.8e-32 XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 670 138.6 4.8e-32 NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 654 135.7 4.6e-31 NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 654 135.7 4.6e-31 XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531) 645 133.9 1.4e-30 NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 623 129.8 2.6e-29 NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 623 129.8 2.7e-29 XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 623 129.8 2.8e-29 NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 592 123.7 1.3e-27 XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 576 120.7 1.1e-26 XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 576 120.8 1.2e-26 NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 576 120.9 1.3e-26 NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 576 120.9 1.3e-26 XP_006710686 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 440) 545 114.8 6.3e-25 XP_005270896 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 545 114.8 6.5e-25 XP_011539696 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 545 114.8 6.5e-25 NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 540 114.0 1.5e-24 NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 540 114.0 1.5e-24 XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 540 114.0 1.5e-24 XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 540 114.0 1.5e-24 NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 540 114.0 1.5e-24 >>NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Homo sa (617 aa) initn: 1417 init1: 411 opt: 1483 Z-score: 1530.0 bits: 293.2 E(85289): 1.7e-78 Smith-Waterman score: 1483; 38.6% identity (71.5% similar) in 594 aa overlap (12-601:17-599) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLV-ADE .: : . ... . :::.::: ... :..::.:::.:: .: NP_061 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAG-TTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 QRV-PAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDG ... :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.. .::: ..::.: ..: :. NP_061 DEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 GNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILN :.. .::.: .::: :.::: .: . :: :: . . ..:. :.: ..: ....:::. NP_061 DNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 HFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLE .: .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:: .:: . : .: .... NP_061 NFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTN ::.:::. .::.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. :::.:.. NP_061 NIRFPLMTPQDLINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 QERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGS . .:. .:: : .. : .: . . : ....: . .:. : : .: .::.:.:....::. NP_061 STHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 FSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSS . :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... : :.:::. : :.. NP_061 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELAT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 VETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTD :: :.:. . ::::: . . ::::::.: ..::::: :: ....:.:.: :: NP_061 VECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHD----TFQNELMCFDPDTD 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 VWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAP : .. ::::.:: : ::..::..: :::. : . :::. : ::: .::: .: NP_061 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 LLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSAC .:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: : :.: . :::....: :: NP_061 MLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRAC 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 VCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ . .. : ::. NP_061 TLTVFP-PEENPGSPSRESPLSAPSDHS 600 610 >>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa) initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1508.5 bits: 289.2 E(85289): 2.8e-77 Smith-Waterman score: 1462; 38.1% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (20-601:24-599) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADE-- .... :::.::: ... ::.::.:::.:. . NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 QRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGG . :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.: .::. ..::.: ..: :. NP_001 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMD 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNH :.. .::.: .::: :.::: .: . :. :: . . ..:. :.: ..: ....:.:.. NP_001 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 FGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLEN : .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:. .:: . : : ....: NP_001 FPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQ :.:::. ..:.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. :::.:.. NP_001 IRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSF .:. .:: : .. : .: . . : :...: . .:. : : .: .::.:.:....::. NP_001 THLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 SRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSV . :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... .: :.:::: : : .: NP_001 NYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 ETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTDV : :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:.: :: NP_001 ECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMCFDPDTDK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 WEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPL : .. ::::.:: : ::..:. .: :::. : . :::. : ::: .::: .: . NP_001 WIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAM 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 LHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACV :...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: . :.: . :::....: ::. NP_001 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACT 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 CALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ .. : ::. NP_001 LTVFP-PEETTPSPSRESPLSAP 600 610 >>NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa) initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1508.3 bits: 289.2 E(85289): 2.8e-77 Smith-Waterman score: 1462; 38.1% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (20-601:50-625) 10 20 30 40 pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVV .... :::.::: ... ::.::.:::. NP_001 VEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVT 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 LVADE--QRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGG :. . . :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.: .::. ..::.: . NP_001 LMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTA 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 ELVLDGGNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFI .: :. :.. .::.: .::: :.::: .: . :. :: . . ..:. :.: ..: .. NP_001 KLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYV 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 DGFILNHFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAH ..:.:..: .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:. .:: . : NP_001 NSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDF 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 ARQVLENIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKR : ....::.:::. ..:.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. : NP_001 AAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDR 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 TALRTNQERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFI ::.:.. .:. .:: : .. : .: . . : :...: . .:. : : .: .::.:.:. NP_001 TAIRSDTTHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFL 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 FIAGGSFSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNE ...::. . :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... .: :.:::: NP_001 YVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNA 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 NGALSSVETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLC : : .:: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.: NP_001 AGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMC 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 YDHRTDVWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQ .: :: : .. ::::.:: : ::..:. .: :::. : . :::. : ::: .: NP_001 FDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPILDQ 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 WTRVAPLLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAI :: .: .:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: . :.: . :::... 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