Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3952
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3952, 1711 aa
  1>>>pF1KE3952 1711 - 1711 aa - 1711 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.3085+/-0.00138; mu= -30.9299+/- 0.083
 mean_var=768.4439+/-161.660, 0's: 0 Z-trim(115.2): 100  B-trim: 480 in 1/52
 Lambda= 0.046267
 statistics sampled from 15692 (15773) to 15692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.485), width:  16
 Scan time:  6.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14616.1 BCORL1 gene_id:63035|Hs108|chrX        (1711) 11570 789.1       0
CCDS14250.1 BCOR gene_id:54880|Hs108|chrX          (1721) 1147 93.4 7.4e-18
CCDS48092.1 BCOR gene_id:54880|Hs108|chrX          (1703) 1123 91.8 2.2e-17
CCDS48093.1 BCOR gene_id:54880|Hs108|chrX          (1755) 1080 88.9 1.7e-16


>>CCDS14616.1 BCORL1 gene_id:63035|Hs108|chrX             (1711 aa)
 initn: 11570 init1: 11570 opt: 11570  Z-score: 4194.1  bits: 789.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11570; 100.0% identity (100.0% similar) in 1711 aa overlap (1-1711:1-1711)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MISTAPLYSGVHNWTSSDRIRMCGINEERRAPLSDEESTTGDCQHFGSQEFCVSSSFSKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MISTAPLYSGVHNWTSSDRIRMCGINEERRAPLSDEESTTGDCQHFGSQEFCVSSSFSKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ELTAVGSGSNARGADPDGSATEKLGHKSEDKPDDPQPKMDYAGNVAEAEGLLVPLSSPGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ELTAVGSGSNARGADPDGSATEKLGHKSEDKPDDPQPKMDYAGNVAEAEGLLVPLSSPGD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 GLKLPASDSAEASNSRADCSWTPLNTQMSKQVDCSPAGVKALDSRQGVGEKNTFILATLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLKLPASDSAEASNSRADCSWTPLNTQMSKQVDCSPAGVKALDSRQGVGEKNTFILATLG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 TGVPVEGTLPLVTTNFSPLPAPICPPAPGSASVPHSVPDAFQVPLSVPAPVPHSGLVPVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGVPVEGTLPLVTTNFSPLPAPICPPAPGSASVPHSVPDAFQVPLSVPAPVPHSGLVPVQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 VATSVPAPSPPLAPVPALAPAPPSVPTLISDSNPLSVSASVLVPVPASAPPSGPVPLSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VATSVPAPSPPLAPVPALAPAPPSVPTLISDSNPLSVSASVLVPVPASAPPSGPVPLSAP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 APAPLSVPVSAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVLAPMPASTPPAAPAPPSVPMPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APAPLSVPVSAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVLAPMPASTPPAAPAPPSVPMPTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TPSSGPPSTPTLIPAFAPTPVPAPTPAPIFTPAPTPMPAATPAAIPTSAPIPASFSLSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPSSGPPSTPTLIPAFAPTPVPAPTPAPIFTPAPTPMPAATPAAIPTSAPIPASFSLSRV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 CFPAAQAPAMQKVPLSFQPGTVLTPSQPLVYIPPPSCGQPLSVATLPTTLGVSSTLTLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CFPAAQAPAMQKVPLSFQPGTVLTPSQPLVYIPPPSCGQPLSVATLPTTLGVSSTLTLPV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LPSYLQDRCLPGVLASPELRSYPYAFSVARPLTSDSKLVSLEVNRLPCTSPSGSTTTQPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPSYLQDRCLPGVLASPELRSYPYAFSVARPLTSDSKLVSLEVNRLPCTSPSGSTTTQPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 PDGVPGPLADTSLVTASAKVLPTPQPLLPAPSGSSAPPHPAKMPSGTEQQTEGTSVTFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDGVPGPLADTSLVTASAKVLPTPQPLLPAPSGSSAPPHPAKMPSGTEQQTEGTSVTFSP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 LKSPPQLEREMASPPECSEMPLDLSSKSNRQKLPLPNQRKTPPMPVLTPVHTSSKALLST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKSPPQLEREMASPPECSEMPLDLSSKSNRQKLPLPNQRKTPPMPVLTPVHTSSKALLST
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 VLSRSQRTTQAAGGNVTSCLGSTSSPFVIFPEIVRNGDPSTWVKNSTALISTIPGTYVGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLSRSQRTTQAAGGNVTSCLGSTSSPFVIFPEIVRNGDPSTWVKNSTALISTIPGTYVGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 ANPVPASLLLNKDPNLGLNRDPRHLPKQEPISIIDQGEPKGTGATCGKKGSQAGAEGQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANPVPASLLLNKDPNLGLNRDPRHLPKQEPISIIDQGEPKGTGATCGKKGSQAGAEGQPS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 TVKRYTPARIAPGLPGCQTKELSLWKPTGPANIYPRCSVNGKPTSTQVLPVGWSPYHQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVKRYTPARIAPGLPGCQTKELSLWKPTGPANIYPRCSVNGKPTSTQVLPVGWSPYHQAS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LLSIGISSAGQLTPSQGAPIRPTSVVSEFSGVPSLSSSEAVHGLPEGQPRPGGSFVPEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLSIGISSAGQLTPSQGAPIRPTSVVSEFSGVPSLSSSEAVHGLPEGQPRPGGSFVPEQD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 PVTKNKTCRIAAKPYEEQVNPVLLTLSPQTGTLALSVQPSGGDIRMNQGPEESESHLCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PVTKNKTCRIAAKPYEEQVNPVLLTLSPQTGTLALSVQPSGGDIRMNQGPEESESHLCSD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 STPKMEGPQGACGLKLAGDTKPKNQVLATYMSHELVLATPQNLPKMPELPLLPHDSHPKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 STPKMEGPQGACGLKLAGDTKPKNQVLATYMSHELVLATPQNLPKMPELPLLPHDSHPKE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 LILDVVPSSRRGSSTERPQLGSQVDLGRVKMEKVDGDVVFNLATCFRADGLPVAPQRGQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LILDVVPSSRRGSSTERPQLGSQVDLGRVKMEKVDGDVVFNLATCFRADGLPVAPQRGQA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 EVRAKAGQARVKQESVGVFACKNKWQPDDVTESLPPKKMKCGKEKDSEEQQLQPQAKAVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVRAKAGQARVKQESVGVFACKNKWQPDDVTESLPPKKMKCGKEKDSEEQQLQPQAKAVV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 RSSHRPKCRKLPSDPQESTKKSPRGASDSGKEHNGVRGKHKHRKPTKPESQSPGKRADSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RSSHRPKCRKLPSDPQESTKKSPRGASDSGKEHNGVRGKHKHRKPTKPESQSPGKRADSH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 EEGSLEKKAKSSFRDFIPVVLSTRTRSQSGSICSSFAGMADSDMGSQEVFPTEEEEEVTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEGSLEKKAKSSFRDFIPVVLSTRTRSQSGSICSSFAGMADSDMGSQEVFPTEEEEEVTP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 TPAKRRKVRKTQRDTQYRSHHAQDKSLLSQGRRHLWRAREMPWRTEAARQMWDTNEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPAKRRKVRKTQRDTQYRSHHAQDKSLLSQGRRHLWRAREMPWRTEAARQMWDTNEEEEE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 EEEEGLLKRKKRRRQKSRKYQTGEYLTEQEDEQRRKGRADLKARKQKTSSSQSLEHRLRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEEEGLLKRKKRRRQKSRKYQTGEYLTEQEDEQRRKGRADLKARKQKTSSSQSLEHRLRN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 RNLLLPNKVQGISDSPNGFLPNNLEEPACLENSEKPSGKRKCKTKHMATVSEEAKDVVLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RNLLLPNKVQGISDSPNGFLPNNLEEPACLENSEKPSGKRKCKTKHMATVSEEAKDVVLY
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 CLQKDSEDVNHRDNAGYTALHEACSRGWTDILNILLEHGANVNCSAQDGTRPVHDAVVND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CLQKDSEDVNHRDNAGYTALHEACSRGWTDILNILLEHGANVNCSAQDGTRPVHDAVVND
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 NLETIWLLLSYGADPTLATYSGQTAMKLASSDTMKRFLSDHLSDLQGRAEGDPGVSWDFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLETIWLLLSYGADPTLATYSGQTAMKLASSDTMKRFLSDHLSDLQGRAEGDPGVSWDFY
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 SSSVLEEKDGFACDLLHNPPGSSDQEGDDPMEEDDFMFELSDKPLLPCYNLQVSVSRGPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSSVLEEKDGFACDLLHNPPGSSDQEGDDPMEEDDFMFELSDKPLLPCYNLQVSVSRGPC
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 NWFLFSDVLKRLKLSSRIFQARFPHFEITTMPKAEFYRQVASSQLLTPAERPGGLDDRSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NWFLFSDVLKRLKLSSRIFQARFPHFEITTMPKAEFYRQVASSQLLTPAERPGGLDDRSP
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710 
pF1KE3 PGSSETVELVRYEPDLLRLLGSEVEFQSCNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGSSETVELVRYEPDLLRLLGSEVEFQSCNS
             1690      1700      1710 

>>CCDS14250.1 BCOR gene_id:54880|Hs108|chrX               (1721 aa)
 initn: 1256 init1: 1014 opt: 1147  Z-score: 434.1  bits: 93.4 E(32554): 7.4e-18
Smith-Waterman score: 1298; 26.5% identity (50.7% similar) in 1833 aa overlap (1-1706:1-1709)

               10        20        30        40          50        
pF1KE3 MISTAPLYSGVHNWTSSDRIRMCGINEERRAPLSDEESTTG--DCQHFGSQEFCV--SSS
       :.:..:::..::.: .:.:.:::: .:.:.  ..: ... .  . .. .  .  :  .:.
CCDS14 MLSATPLYGNVHSWMNSERVRMCGASEDRKILVNDGDASKARLELREENPLNHNVVDAST
               10        20        30        40        50        60

         60                                 70        80        90 
pF1KE3 FSKVE-LTAV------------------------GSGSNARGADPDGSATEKLGHKSED-
         ... :.:.                        : ::. .: .   :.   :: .::  
CCDS14 AHRIDGLAALSMDRTGLIREGLRVPGNIVYSSLCGLGSE-KGREAATSTLGGLGFSSERN
               70        80        90        100       110         

                   100       110       120       130         140   
pF1KE3 -----KPDDPQPKMDYAGNVAEAEGLLVPLSSPGDGLKLPASDSAEAS--NSRADCSWTP
            ::. :.     : .    .:. .  ..:  :..  :  .:::   .  :. . .:
CCDS14 PEMQFKPNTPETVEASAVSGKPPNGFSAIYKTP-PGIQKSAVATAEALGLDRPASDKQSP
     120       130       140       150        160       170        

           150                 160       170       180       190   
pF1KE3 LNTQMSKQV----------DCSPAGVKALDSRQGVGEKNTFILATLGTGVPVEGTLPLVT
       :: . .. .            .::    :::       : . :    . .: . .  :. 
CCDS14 LNINGASYLRLPWVNPYMEGATPAIYPFLDS------PNKYSLNMYKALLP-QQSYSLA-
      180       190       200             210       220        230 

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE3 TNFSPLPAPICPPAPGSASVPHSVPDAFQVPLSVPAPVPHSGLVPVQVATSVPAPSPPLA
          .:: .:.:  .     .:   :     :  :   .: :   :....:  :. :: . 
CCDS14 ---QPLYSPVCTNGERFLYLP---P-----PHYVGPHIPSSLASPMRLST--PSASPAIP
                 240               250       260         270       

           260         270       280       290           300       
pF1KE3 PVPALAPAPPSVP--TLISDSNPLSVSASVLVPVPASAPPSGP----VPLSAPAPAPLSV
       :.  .  :  :.:    .: .::  :.. .   .  :  :  :    :  . :. . : .
CCDS14 PL--VHCADKSLPWKMGVSPGNP--VDSHAYPHIQNSKQPRVPSAKAVTSGLPGDTALLL
         280       290         300       310       320       330   

       310       320       330       340       350       360       
pF1KE3 PVSAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVLAPMPASTPPAAPAPPSVPMPTPTPSSGP-
       : :  :   .. :. :.: :          ..  :. .        :  .:.   :.:  
CCDS14 PPSPRPSPRVHLPTQPAADTYSEFHKHYARISTSPSVALSKPYMTVSSEFPAARLSNGKY
           340       350       360       370       380       390   

        370       380        390       400       410       420     
pF1KE3 PSTPTLIPAFAPTPVPA-PTPAPIFTPAPTPMPAATPAAIPTSAPIPASFSLSRVCFPAA
       :..:    .  :.:  :  : .     . .:      ..    .  : ..: . :   :.
CCDS14 PKAPEGGEGAQPVPGHARKTAVQDRKDGSSPPLLEKQTVTKDVTDKPLDLSSKVVDVDAS
           400       410       420       430       440       450   

         430             440        450       460       470        
pF1KE3 QAPAMQKV-PLSF-----QPGTVLTPSQ-PLVYIPPPSCGQPLSVATLPTTLGVSSTLTL
       .:  :.:. :  .       : ::. :. :   . ::. :  .  . . .:  . :. ..
CCDS14 KADHMKKMAPTVLVHSRAGSGLVLSGSEIPKETLSPPGNGCAIYRSEIIST--APSSWVV
           460       470       480       490       500         510 

      480       490        500        510       520       530      
pF1KE3 PVLPSYLQDRCLPGV-LASPELR-SYPYAFSVARPLTSDSKLVSLEVNRLPCTSPSGSTT
       :  ::  ..    .. : .  :  . :   : . :  . .  :  .:.    .: .  ..
CCDS14 PG-PSPNEENNGKSMSLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVITNVSG-SVSSAGRPAS
              520       530       540       550        560         

        540        550       560         570       580         590 
pF1KE3 TQPAPDG-VPGPLADTSLVTASAKVLPT--PQPLLPAPSGSSAPPHPAKM--PSGTEQQT
       ..:::.. . :  .. : : .. .:.      :  ::  .::.  . ::   :  . . .
CCDS14 ASPAPNANADGTKTSRSSVETTPSVIQHVGQPPATPAKHSSSTSSKGAKASNPEPSFKAN
     570       580       590       600       610       620         

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE3 EGTSVTFSPLKSPPQLEREMASPPECSEMPLDLSSKSNRQKLPLPNQRKTPPMPVLTPV-
       :.     : . :: .  :    :   : .:         . : : ..  . : ::: :  
CCDS14 ENGLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAVSPLSLHGKGPVYPHPVLLPNG
     630       640       650       660       670       680         

                   660           670       680       690           
pF1KE3 -----HTSSKALLSTVL--SRSQRTT--QAAGGNVTSCLGSTSSPFVIF----PEI----
            : . :  :   :  .: . .:  .: : ...  .    .:. :     ::     
CCDS14 SLFPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEITKEEKPERRSRS
     690       700       710       720       730       740         

              700       710       720        730       740         
pF1KE3 ---VRNGDPSTWVKNSTALISTIPGTYVGVANP-VPASLLLNKDPNLGLNRDPRHLPKQE
          .:  ::.  ..:  . :    .: .   .: ::..  :. .:: . ..    . :..
CCDS14 HERARYEDPT--LRNRFSEILETSSTKL---HPDVPTDKNLKPNPNWNQGKT---VVKSD
     750         760       770          780       790          800 

     750         760       770       780       790       800       
pF1KE3 PISIID--QGEPKGTGATCGKKGSQAGAEGQPSTVKRYTPARIAPGLPGCQTKE-LSLWK
        .  .:  . :: .   :  .: : : ::.  ....   :. . :.:   : .. ..: .
CCDS14 KLVYVDLLREEPDAKTDTNVSKPSFA-AESVGQSAEPPKPS-VEPALQ--QHRDFIALRE
             810       820        830       840          850       

        810       820       830       840       850       860      
pF1KE3 PTGPANIYPRCSVNGKPTSTQVLPVGWSPYHQASLLSIGISSAGQLTPSQGAPIRPTSVV
         :  . . .  .  .:. :           . :.:      ::    . : :.      
CCDS14 ELGRISDFHETYTFKQPVFT---------VSKDSVL------AGTNKENLGLPVS-----
       860       870                880             890            

        870       880        890         900       910       920   
pF1KE3 SEFSGVPSLSSSEAV-HGLPEGQPRPG--GSFVPEQDPVTKNKTCRIAAKPYEEQVNPVL
       . :   :  :.. ::  :  . .:.:   ::  :  : :: . : . .:   : . . : 
CCDS14 TPFLEPPLGSDGPAVTFGKTQEDPKPFCVGSAPPSVD-VTPTYT-KDGADEAESNDGKV-
       900       910       920       930        940        950     

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pF1KE3 LTLSPQTGTLALSVQPSGGDIRMNQGPEESESHLCSDSTPKMEGPQGACGLKLAGDTKPK
         :.:. . ::  .  :.: .  ..  .   ..: .::. ..   : :  :.. :    .
CCDS14 --LKPKPSKLAKRIANSAGYV--GDRFKCVTTELYADSS-QLSREQRA--LQMEG--LQE
            960       970         980        990        1000       

           990      1000      1010       1020         1030         
pF1KE3 NQVLATYMSHELVLATPQNLPKMPELPLLPHDS-HPKEL---ILDVVPSSR---RGSSTE
       ...:    ..       . . .. :: .  ... ::      .    :..    .:.. .
CCDS14 DSILCLPAAY-----CERAMMRFSELEMKEREGGHPATKDSEMCKFSPADWERLKGNQDK
        1010           1020      1030      1040      1050      1060

       1040      1050       1060      1070      1080      1090     
pF1KE3 RPQLGSQVDLGRVKMEKVDGDVV-FNLATCFRADGLPVAPQRGQAEVRAKAGQARVKQES
       .:.   .: : ..  :. ...   .....  : : .  ::.  .  :.    . .  .: 
CCDS14 KPK---SVTLEEAIAEQNESERCEYSVGNKHR-DPFE-APEDKDLPVEKYFVERQPVSEP
                1070      1080       1090       1100      1110     

        1100      1110      1120          1130          1140       
pF1KE3 VGVFACKNKWQPDDVTESLPPKKMKCGK----EKDSEEQQLQPQAKA----VVRSSHRPK
        .  . ..  .: . :  .  :.   :     :  .::   .:  ::    : .. :  :
CCDS14 PADQVASD--MPHSPTLRVDRKRKVSGDSSHTETTAEEVPEDPLLKAKRRRVSKGLHPKK
        1120        1130      1140      1150      1160      1170   

      1150      1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KE3 CRKLPSDPQESTKKSPRGASDSGKEHNGVRGKHKHRKPTKPESQSPGKRADSHEEGSLEK
        :.:    ..  ..   .:.: ::   : .....  . :.::.   :     .. :  . 
CCDS14 QRHLLHLRERWEQQV--SAAD-GKP--GRQSRKEVTQATQPEAIPQGTNITEEKPGRKRA
          1180        1190         1200      1210      1220        

      1210      1220      1230          1240      1250      1260   
pF1KE3 KAKSSFRDFIPVVLSTRTRSQSGSICSSFAGM----ADSDMGSQEVFPTEEEEEVTPTPA
       .::.. :..    :.     :.  . :.   :    . :  :.... :.     ..  ::
CCDS14 EAKGN-RSWSEESLKPSDNEQGLPVFSGSPPMKSLSSTSAGGKKQAQPSCAP--ASRPPA
     1230       1240      1250      1260      1270        1280     

          1270      1280      1290      1300      1310      1320   
pF1KE3 KRRKVRKTQRDTQYRSHHAQDKSLLSQGRRHLWRAREMPWRTEAARQMWDTNEEEEEEEE
       :..:....:.     . . .:                     .::  .   ... :.   
CCDS14 KQQKIKENQKTDVLCADEEED--------------------CQAASLLQKYTDNSEKPSG
        1290      1300                          1310      1320     

          1330      1340        1350      1360       1370      1380
pF1KE3 EGLLKRKKRRRQKSRKYQ--TGEYLTEQEDEQRRKGRADLKA-RKQKTSSSQSLEHRLRN
       . : : :.   :.::.    :::: .:. :     :.. ..  ::.   ::.      ..
CCDS14 KRLCKTKHLIPQESRRGLPLTGEYYVENAD-----GKVTVRRFRKRPEPSSDYDLSPAKQ
        1330      1340      1350           1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420        1430        
pF1KE3 RNLLLPNKVQGISDSPNGFLPNNLEEPACLENSEKPSGKRKCKTKHMA--TVSEEA----
       .   .    : .  : .  :: .       ..   :   :.  ... :  :. ..:    
CCDS14 EPKPFDRLQQLLPASQSTQLPCSSSPQETTQSRPMPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

          1440      1450      1460      1470      1480      1490   
pF1KE3 -KDVVLYCLQKDSEDVNHRDNAGYTALHEACSRGWTDILNILLEHGANVNCSAQDGTRPV
        ..::::::..   :::::::::: ::::::.::: .:.  :::.::.:::::::::::.
CCDS14 YEEVVLYCLENKICDVNHRDNAGYCALHEACARGWLNIVRHLLEYGADVNCSAQDGTRPL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

          1500      1510      1520      1530      1540      1550   
pF1KE3 HDAVVNDNLETIWLLLSYGADPTLATYSGQTAMKLASSDTMKRFLSDHLSDLQGRAEGDP
       :::: ::.:: . ::::::::::::::::.: ::.. :. :..::.:.:.::::: . : 
CCDS14 HDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSGRTIMKMTHSELMEKFLTDYLNDLQGRNDDDA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KE3 GVSWDFYSSSVLEEKDGFACDLLHNPPGSSDQEGDDPMEEDDFMFELSDKPLLPCYNLQV
       . .::::.::: :  :  . :.: ::::  ::. ::    : : ::.:. :::::::.::
CCDS14 SGTWDFYGSSVCEPDDESGYDVLANPPGPEDQDDDDDAYSDVFEFEFSETPLLPCYNIQV
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pF1KE3 SVSRGPCNWFLFSDVLKRLKLSSRIFQARFPHFEITTMPKAEFYRQVASSQLLTPAERPG
       ::..:: ::.:.:::::.::.:::::.  ::. ::.:. .:::::::..: :.. ..   
CCDS14 SVAQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCNFPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSK---
             1630      1640      1650      1660      1670          

          1680      1690      1700      1710        
pF1KE3 GLDDRSPPGSSETVELVRYEPDLLRLLGSEVEFQSCNS       
        :.  .:  :.: ..::..  ..  :::: ::.            
CCDS14 DLEAFNPE-SKELLDLVEFTNEIQTLLGSSVEWLHPSDLASDNYW
      1680       1690      1700      1710      1720 

>>CCDS48092.1 BCOR gene_id:54880|Hs108|chrX               (1703 aa)
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pF1KE3 MISTAPLYSGVHNWTSSDRIRMCGINEERRAPLSDEESTTG--DCQHFGSQEFCV--SSS
       :.:..:::..::.: .:.:.:::: .:.:.  ..: ... .  . .. .  .  :  .:.
CCDS48 MLSATPLYGNVHSWMNSERVRMCGASEDRKILVNDGDASKARLELREENPLNHNVVDAST
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pF1KE3 FSKVE-LTAV------------------------GSGSNARGADPDGSATEKLGHKSED-
         ... :.:.                        : ::. .: .   :.   :: .::  
CCDS48 AHRIDGLAALSMDRTGLIREGLRVPGNIVYSSLCGLGSE-KGREAATSTLGGLGFSSERN
               70        80        90        100       110         

                   100       110       120       130         140   
pF1KE3 -----KPDDPQPKMDYAGNVAEAEGLLVPLSSPGDGLKLPASDSAEAS--NSRADCSWTP
            ::. :.     : .    .:. .  ..:  :..  :  .:::   .  :. . .:
CCDS48 PEMQFKPNTPETVEASAVSGKPPNGFSAIYKTP-PGIQKSAVATAEALGLDRPASDKQSP
     120       130       140       150        160       170        

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pF1KE3 LNTQMSKQV----------DCSPAGVKALDSRQGVGEKNTFILATLGTGVPVEGTLPLVT
       :: . .. .            .::    :::       : . :    . .: . .  :. 
CCDS48 LNINGASYLRLPWVNPYMEGATPAIYPFLDS------PNKYSLNMYKALLP-QQSYSLA-
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pF1KE3 TNFSPLPAPICPPAPGSASVPHSVPDAFQVPLSVPAPVPHSGLVPVQVATSVPAPSPPLA
          .:: .:.:  .     .:   :     :  :   .: :   :....:  :. :: . 
CCDS48 ---QPLYSPVCTNGERFLYLP---P-----PHYVGPHIPSSLASPMRLST--PSASPAIP
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       :.  .  :  :.:    .: .::  :.. .   .  :  :  :    :  . :. . : .
CCDS48 PL--VHCADKSLPWKMGVSPGNP--VDSHAYPHIQNSKQPRVPSAKAVTSGLPGDTALLL
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pF1KE3 PVSAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVLAPMPASTPPAAPAPPSVPMPTPTPSSGP-
       : :  :   .. :. :.: :          ..  :. .        :  .:.   :.:  
CCDS48 PPSPRPSPRVHLPTQPAADTYSEFHKHYARISTSPSVALSKPYMTVSSEFPAARLSNGKY
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       :..:    .  :.:  :  : .     . .:      ..    .  : ..: . :   :.
CCDS48 PKAPEGGEGAQPVPGHARKTAVQDRKDGSSPPLLEKQTVTKDVTDKPLDLSSKVVDVDAS
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       .:  :.:. :  .       : ::. :. :   . ::. :  .  . . .:  . :. ..
CCDS48 KADHMKKMAPTVLVHSRAGSGLVLSGSEIPKETLSPPGNGCAIYRSEIIST--APSSWVV
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       :  ::  ..    .. : .  :  . :   : . :  . .  :  .:.    .: .  ..
CCDS48 PG-PSPNEENNGKSMSLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVITNVSG-SVSSAGRPAS
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       ..:::.. . :  .. : : .. .:.      :  ::  .::.  . ::   :  . . .
CCDS48 ASPAPNANADGTKTSRSSVETTPSVIQHVGQPPATPAKHSSSTSSKGAKASNPEPSFKAN
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       :.     : . :: .  :    :   : .:         . : : ..  . : ::: :  
CCDS48 ENGLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAVSPLSLHGKGPVYPHPVLLPNG
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            : . :  :   :  .: . .:  .: : ...  .    .:. :     ::     
CCDS48 SLFPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEITKEEKPERRSRS
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          .:  ::.  ..:  . :    .: .   .: ::..  :. .:: . ..    . :..
CCDS48 HERARYEDPT--LRNRFSEILETSSTKL---HPDVPTDKNLKPNPNWNQGKT---VVKSD
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        .  .:  . :: .   :  .: : : ::.  ....   :. . :.:   : .. ..: .
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         :  . . .  .  .:. :           . :.:      ::    . : :.      
CCDS48 ELGRISDFHETYTFKQPVFT---------VSKDSVL------AGTNKENLGLPVS-----
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       . :   :  :.. ::  :  . .:.:   ::  :  : :: . : . .:   : . . : 
CCDS48 TPFLEPPLGSDGPAVTFGKTQEDPKPFCVGSAPPSVD-VTPTYT-KDGADEAESNDGKV-
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         :.:. . ::  .  :.: .  ..  .   ..: .::. ..   : :    .      .
CCDS48 --LKPKPSKLAKRIANSAGYV--GDRFKCVTTELYADSS-QLSREQRALQRAMMRFSELE
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        : ..    .  . :.   .: .  ..       .:..:: . :. . . .  :   . .
CCDS48 MKEREGGHPATKDSEMCKFSPADWERLKG----NQDKKPKSVTLEEAIAEQNESERCEYS
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       .:..    :  .:  . :  . .   : ..  ::. :   : :    ..   :: .    
CCDS48 VGNK---HRDPFEAPE-DKDLPVEKYF-VERQPVSEPPADQVASDMPHSPTLRVDR----
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         ..   .:.: ::   : .....  . :.::.   :     .. :  . .::.. :.. 
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          :.     :.  . :.   :    . :  :.... :.     ..  :::..:....:.
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        :.::.    :::: .:. :     :.. ..  ::.   ::.      ...   .    :
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       .   :::::::::: ::::::.::: .:.  :::.::.:::::::::::.:::: ::.::
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        . ::::::::::::::::.: ::.. :. :..::.:.:.::::: . : . .::::.::
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CCDS48 VCEPDDESGYDVLANPPGPEDQDDDDDAYSDVFEFEFSETPLLPCYNIQVSVAQGPRNWL
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CCDS48 KELLDLVEFTNEIQTLLGSSVEWLHPSDLASDNYW
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CCDS48 PEMQFKPNTPETVEASAVSGKPPNGFSAIYKTP-PGIQKSAVATAEALGLDRPASDKQSP
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           150                 160       170       180       190   
pF1KE3 LNTQMSKQV----------DCSPAGVKALDSRQGVGEKNTFILATLGTGVPVEGTLPLVT
       :: . .. .            .::    :::       : . :    . .: . .  :. 
CCDS48 LNINGASYLRLPWVNPYMEGATPAIYPFLDS------PNKYSLNMYKALLP-QQSYSLA-
      180       190       200             210       220        230 

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE3 TNFSPLPAPICPPAPGSASVPHSVPDAFQVPLSVPAPVPHSGLVPVQVATSVPAPSPPLA
          .:: .:.:  .     .:   :     :  :   .: :   :....:  :. :: . 
CCDS48 ---QPLYSPVCTNGERFLYLP---P-----PHYVGPHIPSSLASPMRLST--PSASPAIP
                 240               250       260         270       

           260         270         280       290       300         
pF1KE3 PVPALAPAPPSVP--TLISDSNPLSVSA--SVLVPVPASAPPSGPVPLSAPAPAPLSVPV
       :.  .  :  :.:    .: .::..  :   .       .: .  :  . :. . : .: 
CCDS48 PL--VHCADKSLPWKMGVSPGNPVDSHAYPHIQNSKQPRVPSAKAVTSGLPGDTALLLPP
         280       290       300       310       320       330     

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE3 SAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVLAPMPASTPPAAPAPPSVPMPTPTPSSGP-PS
       :  :   .. :. :.: :          ..  :. .        :  .:.   :.:  :.
CCDS48 SPRPSPRVHLPTQPAADTYSEFHKHYARISTSPSVALSKPYMTVSSEFPAARLSNGKYPK
         340       350       360       370       380       390     

      370       380        390       400       410       420       
pF1KE3 TPTLIPAFAPTPVPA-PTPAPIFTPAPTPMPAATPAAIPTSAPIPASFSLSRVCFPAAQA
       .:    .  :.:  :  : .     . .:      ..    .  : ..: . :   :..:
CCDS48 APEGGEGAQPVPGHARKTAVQDRKDGSSPPLLEKQTVTKDVTDKPLDLSSKVVDVDASKA
         400       410       420       430       440       450     

       430             440        450       460       470       480
pF1KE3 PAMQKV-PLSF-----QPGTVLTPSQ-PLVYIPPPSCGQPLSVATLPTTLGVSSTLTLPV
         :.:. :  .       : ::. :. :   . ::. :  .  . . .:  . :. ..: 
CCDS48 DHMKKMAPTVLVHSRAGSGLVLSGSEIPKETLSPPGNGCAIYRSEIIST--APSSWVVPG
         460       470       480       490       500         510   

              490        500        510       520       530        
pF1KE3 LPSYLQDRCLPGV-LASPELR-SYPYAFSVARPLTSDSKLVSLEVNRLPCTSPSGSTTTQ
        ::  ..    .. : .  :  . :   : . :  . .  :  .:.    .: .  ....
CCDS48 -PSPNEENNGKSMSLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVITNVSG-SVSSAGRPASAS
            520       530       540       550        560       570 

      540        550       560         570       580         590   
pF1KE3 PAPDG-VPGPLADTSLVTASAKVLPT--PQPLLPAPSGSSAPPHPAKM--PSGTEQQTEG
       :::.. . :  .. : : .. .:.      :  ::  .::.  . ::   :  . . .:.
CCDS48 PAPNANADGTKTSRSSVETTPSVIQHVGQPPATPAKHSSSTSSKGAKASNPEPSFKANEN
             580       590       600       610       620       630 

           600       610       620       630       640       650   
pF1KE3 TSVTFSPLKSPPQLEREMASPPECSEMPLDLSSKSNRQKLPLPNQRKTPPMPVLTPV---
            : . :: .  :    :   : .:         . : : ..  . : ::: :    
CCDS48 GLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAVSPLSLHGKGPVYPHPVLLPNGSL
             640       650       660       670       680       690 

                 660           670       680       690             
pF1KE3 ---HTSSKALLSTVL--SRSQRTT--QAAGGNVTSCLGSTSSPFVIF----PEI------
          : . :  :   :  .: . .:  .: : ...  .    .:. :     ::       
CCDS48 FPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEITKEEKPERRSRSHE
             700       710       720       730       740       750 

            700       710       720        730       740       750 
pF1KE3 -VRNGDPSTWVKNSTALISTIPGTYVGVANP-VPASLLLNKDPNLGLNRDPRHLPKQEPI
        .:  ::.  ..:  . :    .: .   .: ::..  :. .:: . ..    . :.. .
CCDS48 RARYEDPT--LRNRFSEILETSSTKL---HPDVPTDKNLKPNPNWNQGKT---VVKSDKL
               760       770          780       790          800   

               760       770       780       790       800         
pF1KE3 SIID--QGEPKGTGATCGKKGSQAGAEGQPSTVKRYTPARIAPGLPGCQTKE-LSLWKPT
         .:  . :: .   :  .: : : ::.  ....   :. . :.:   : .. ..: .  
CCDS48 VYVDLLREEPDAKTDTNVSKPSFA-AESVGQSAEPPKPS-VEPALQ--QHRDFIALREEL
           810       820        830       840          850         

                   810        820       830       840       850    
pF1KE3 G-------------PANIYPRCSV-NGKPTSTQVLPVGWSPYHQASLLSIGISSAGQLTP
       :             :.    . ::  :    .  :::. .:. .  : : :   :  .  
CCDS48 GRISDFHETYTFKQPVFTVSKDSVLAGTNKENLGLPVS-TPFLEPPLGSDG--PAVTFGK
     860       870       880       890        900         910      

          860       870       880       890       900          910 
pF1KE3 SQGAPIRPTSVVSEFSGVPSLSSSEAVHGLPEGQPRPGGSFVPEQDPVTK---NKTCRIA
       .:  : .:  : :   .: ... . .  :  :..   :  . :. . ..:   :..  ..
CCDS48 TQEDP-KPFCVGSAPPSV-DVTPTYTKDGADEAESNDGKVLKPKPSKLAKRIANSAGYVG
        920        930        940       950       960       970    

             920       930       940                               
pF1KE3 AKPYEEQVNPVLLTLSPQTGTLALSVQPSG---------------------GDIRMNQ--
        .   . :.  : . : : .    ..:  :                     ....:..  
CCDS48 DR--FKCVTTELYADSSQLSREQRALQMEGLQEDSILCLPAAYCERAMMRFSELEMKERE
            980       990      1000      1010      1020      1030  

        950       960       970       980       990                
pF1KE3 G--PEESESHLCSDSTPKMEGPQGACGLKLAGDTKPKNQVLATYMSH-------ELVLAT
       :  :  ..:..:. :    :       ::   : :::. .:   ...       :  ...
CCDS48 GGHPATKDSEMCKFSPADWER------LKGNQDKKPKSVTLEEAIAEQNESERCEYSVGN
           1040      1050            1060      1070      1080      

    1000       1010      1020       1030       1040      1050      
pF1KE3 PQNLP-KMPELPLLPHDSHPKE-LILDVVPSSRRGSSTER-PQLGSQVDLGRVKMEKVDG
        .  : . ::   :: ...  :   ..  :... .:.  . : :  .::  :    ::.:
CCDS48 KHRDPFEAPEDKDLPVEKYFVERQPVSEPPADQVASDMPHSPTL--RVDRKR----KVSG
       1090      1100      1110      1120      1130            1140

       1060      1070      1080      1090      1100      1110      
pF1KE3 DVVFNLATCFRADGLPVAPQRGQAEVRAKAGQARVKQESVGVFACKNKWQPDDVTESLPP
       :   . .:   :. .:  :         :: . ::.         :. :   ..:.:   
CCDS48 DSSHTETT---AEEVPEDPL-------LKAKRRRVS---------KDDWPEREMTNS---
                1150             1160               1170           

       1120      1130      1140      1150      1160      1170      
pF1KE3 KKMKCGKEKDSEEQQLQPQAKAVVRSSHRPKCRKLPSDPQESTKKSPRGASDSGKEHNGV
          . .. .: . ..:      .  .. .:: ..     .:  ...  .:.: ::   : 
CCDS48 ---SSNHLEDPHYSELTNLKVCIELTGLHPKKQRHLLHLRERWEQQV-SAAD-GKP--GR
        1180      1190      1200      1210      1220          1230 

       1180      1190      1200      1210      1220      1230      
pF1KE3 RGKHKHRKPTKPESQSPGKRADSHEEGSLEKKAKSSFRDFIPVVLSTRTRSQSGSICSSF
       .....  . :.::.   :     .. :  . .::.. :..    :.     :.  . :. 
CCDS48 QSRKEVTQATQPEAIPQGTNITEEKPGRKRAEAKGN-RSWSEESLKPSDNEQGLPVFSGS
            1240      1250      1260       1270      1280      1290

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KE3 AGM----ADSDMGSQEVFPTEEEEEVTPTPAKRRKVRKTQRDTQYRSHHAQDKSLLSQGR
         :    . :  :.... :.     ..  :::..:....:.     . . .:        
CCDS48 PPMKSLSSTSAGGKKQAQPSCAP--ASRPPAKQQKIKENQKTDVLCADEEED--------
             1300      1310        1320      1330      1340        

           1300      1310      1320      1330      1340        1350
pF1KE3 RHLWRAREMPWRTEAARQMWDTNEEEEEEEEEGLLKRKKRRRQKSRKYQ--TGEYLTEQE
                    .::  .   ... :.   . : : :.   :.::.    :::: .:. 
CCDS48 ------------CQAASLLQKYTDNSEKPSGKRLCKTKHLIPQESRRGLPLTGEYYVENA
                         1350      1360      1370      1380        

             1360       1370      1380      1390      1400         
pF1KE3 DEQRRKGRADLKA-RKQKTSSSQSLEHRLRNRNLLLPNKVQGISDSPNGFLPNNLEEPAC
       :     :.. ..  ::.   ::.      ...   .    : .  : .  :: .      
CCDS48 D-----GKVTVRRFRKRPEPSSDYDLSPAKQEPKPFDRLQQLLPASQSTQLPCSSSPQET
          1390      1400      1410      1420      1430      1440   

    1410      1420        1430           1440      1450      1460  
pF1KE3 LENSEKPSGKRKCKTKHMA--TVSEEA-----KDVVLYCLQKDSEDVNHRDNAGYTALHE
        ..   :   :.  ... :  :. ..:     ..::::::..   :::::::::: ::::
CCDS48 TQSRPMPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLGYEEVVLYCLENKICDVNHRDNAGYCALHE
          1450      1460      1470      1480      1490      1500   

           1470      1480      1490      1500      1510      1520  
pF1KE3 ACSRGWTDILNILLEHGANVNCSAQDGTRPVHDAVVNDNLETIWLLLSYGADPTLATYSG
       ::.::: .:.  :::.::.:::::::::::.:::: ::.:: . ::::::::::::::::
CCDS48 ACARGWLNIVRHLLEYGADVNCSAQDGTRPLHDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSG
          1510      1520      1530      1540      1550      1560   

           1530      1540      1550      1560      1570      1580  
pF1KE3 QTAMKLASSDTMKRFLSDHLSDLQGRAEGDPGVSWDFYSSSVLEEKDGFACDLLHNPPGS
       .: ::.. :. :..::.:.:.::::: . : . .::::.::: :  :  . :.: :::: 
CCDS48 RTIMKMTHSELMEKFLTDYLNDLQGRNDDDASGTWDFYGSSVCEPDDESGYDVLANPPGP
          1570      1580      1590      1600      1610      1620   

           1590      1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KE3 SDQEGDDPMEEDDFMFELSDKPLLPCYNLQVSVSRGPCNWFLFSDVLKRLKLSSRIFQAR
        ::. ::    : : ::.:. :::::::.::::..:: ::.:.:::::.::.:::::.  
CCDS48 EDQDDDDDAYSDVFEFEFSETPLLPCYNIQVSVAQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCN
          1630      1640      1650      1660      1670      1680   

           1650      1660      1670      1680      1690      1700  
pF1KE3 FPHFEITTMPKAEFYRQVASSQLLTPAERPGGLDDRSPPGSSETVELVRYEPDLLRLLGS
       ::. ::.:. .:::::::..: :.. ..    :.  .:  :.: ..::..  ..  ::::
CCDS48 FPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSK---DLEAFNPE-SKELLDLVEFTNEIQTLLGS
          1690      1700      1710          1720      1730         

           1710        
pF1KE3 EVEFQSCNS       
        ::.            
CCDS48 SVEWLHPSDLASDNYW
    1740      1750     




1711 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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