FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3617, 469 aa 1>>>pF1KE3617 469 - 469 aa - 469 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6097+/-0.00098; mu= 16.0425+/- 0.059 mean_var=72.2747+/-14.449, 0's: 0 Z-trim(104.4): 20 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.150862 statistics sampled from 7880 (7896) to 7880 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16 Scan time: 2.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 469) 3151 695.4 3.2e-200 CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 462) 3086 681.3 5.8e-196 CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 471) 2399 531.8 6e-151 CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 514) 2236 496.3 3.1e-140 CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 520) 2236 496.3 3.1e-140 CCDS82769.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 434) 2209 490.4 1.6e-138 CCDS44353.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 500) 2177 483.5 2.2e-136 CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 534) 2173 482.6 4.3e-136 CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 471) 2151 477.8 1.1e-134 CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 505) 2147 476.9 2.1e-134 CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 406) 2124 471.9 5.5e-133 >>CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 (469 aa) initn: 3151 init1: 3151 opt: 3151 Z-score: 3708.0 bits: 695.4 E(32554): 3.2e-200 Smith-Waterman score: 3151; 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CCDS44 RYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAK 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIMQVKLGSPDYV :::..::::::::::::: :..:...: .:.::.::.: :: :.:.:::.::..:::: CCDS44 EGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE3 NRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDED-LDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRIV . .: :: .:::.:: ::: ::. :: : ::::: ::..:::. ..:::: :::::::: CCDS44 DCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIV 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 YYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIKDLKV :::::::: ::.::::::::.: ::.:::::: ::: ::..::..:..:. .::.:::.: CCDS44 YYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 WTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDKYRYR ::::.: :::::::: .::::::.:::::::::::.:::::.:.:: :.:::.:::: :: CCDS44 WTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYR 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 YPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKCPLHT :: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..::::::::: CCDS44 YPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHT 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KE3 VLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ :::::::::::.::::.::: .: :::.: . : .. : CCDS44 VLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSE--DAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKKP 400 410 420 430 440 450 CCDS44 RINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 460 470 480 490 500 >>CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (534 aa) initn: 2162 init1: 1335 opt: 2173 Z-score: 2556.8 bits: 482.6 E(32554): 4.3e-136 Smith-Waterman score: 2173; 72.5% identity (89.8% similar) in 432 aa overlap (28-458:40-467) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISK :: : .:: ::.:::::::::::::::: CCDS60 DSQQAGALPLLCQLDTFSPKATVFGVSINPAC--GPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 KLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVRRF :::::::::::::. ::::.:::..:: :.:..:: :::::..:.::::::::::::. . 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69.4% identity (87.8% similar) in 451 aa overlap (21-466:20-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLT : : . . :. . ::: ::::::.:::::::::.::::: CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVRRFLSE ::::::::::. ::.: :::..::.:::..:: ::::..::::::::.::.::. .:.: CCDS31 RYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIMQVKLGSPDYV :.:..::::::::::::: :.::.:::..:.:::::.: ::.::::::..::..:::: CCDS31 ENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 NRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDED-LDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRIV .:. ... :::..:::::. .:. :: : :.:::.::...::: ..:::: :.:::.:: CCDS31 ERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 YYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIKDLKV :::::::: ::.::::::::::.:: :.:::: ::: ::..::..: .:. .:.: :::: CCDS31 YYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 WTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDKYRYR ::::.::::::::.:::::::::.:::::::::::::: ::. :: :::::::.:: :: CCDS31 WTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 YPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKCPLHT :: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::.:..::::.::::: CCDS31 YPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 VLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVD----ISRPPEEALVTVPAHQ ..::::::::::::.: ::: :::::::.: .. . : : : . .: CCDS31 IFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTAAETTLAVRRRPSAASLMLPC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 (505 aa) initn: 2126 init1: 1302 opt: 2147 Z-score: 2526.6 bits: 476.9 E(32554): 2.1e-134 Smith-Waterman score: 2147; 71.8% identity (89.8% similar) in 432 aa overlap (21-451:20-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLT : : . . :. . ::: ::::::.:::::::::.::::: CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 RYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVRRFLSE ::::::::::. ::.: :::..::.:::..:: ::::..::::::::.::.::. .:.: CCDS31 RYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIMQVKLGSPDYV :.:..::::::::::::: :.::.:::..:.:::::.: ::.::::::..::..:::: CCDS31 ENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 NRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDED-LDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRIV .:. ... :::..:::::. .:. :: : :.:::.::...::: ..:::: :.:::.:: CCDS31 ERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 YYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIKDLKV :::::::: ::.::::::::::.:: :.:::: ::: ::..::..: .:. .:.: :::: CCDS31 YYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 WTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDKYRYR ::::.::::::::.:::::::::.:::::::::::::: ::. :: :::::::.:: :: CCDS31 WTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 YPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKCPLHT :: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::.:..::::.::::: CCDS31 YPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 VLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ ..::::::::::::.: ::: :::::::.: : CCDS31 IFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRP 420 430 440 450 460 470 CCDS31 RNYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD 480 490 500 469 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 20:24:37 2016 done: Sun Nov 6 20:24:37 2016 Total Scan time: 2.880 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]