FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2108, 845 aa 1>>>pF1KE2108 845 - 845 aa - 845 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4713+/-0.00159; mu= 16.2611+/- 0.094 mean_var=211.0024+/-39.669, 0's: 0 Z-trim(105.6): 222 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.088294 statistics sampled from 8275 (8521) to 8275 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 3.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 845) 6114 793.4 0 CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 873) 5506 716.0 7.1e-206 CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 858) 2938 388.8 2.1e-107 CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 860) 2938 388.8 2.1e-107 CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 819) 2702 358.7 2.3e-98 CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 700) 2415 322.1 2.1e-87 CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 682) 2108 283.0 1.2e-75 CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 692) 2086 280.2 8.7e-75 CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 904) 2055 276.4 1.6e-73 CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 963) 2055 276.4 1.6e-73 CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 793) 2038 274.1 6.5e-73 CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2 (4599) 994 142.2 1.9e-32 CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2 (4655) 949 136.5 1e-30 CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11 (1615) 847 122.9 4.5e-27 CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12 (1613) 819 119.3 5.4e-26 CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1166) 787 115.0 7.5e-25 CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1207) 787 115.1 7.7e-25 CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1165) 758 111.3 9.8e-24 CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905) 758 111.6 1.3e-23 CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12 (4544) 717 107.0 7.9e-22 CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 534 83.2 5.5e-15 CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14 (1375) 525 81.8 9.2e-15 CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1 (1247) 521 81.2 1.2e-14 CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 484 77.3 6.7e-13 CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 471 75.3 1.7e-12 CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 441 71.1 1.5e-11 CCDS54345.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1342) 439 70.8 1.8e-11 CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 439 70.8 1.8e-11 CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22 ( 252) 427 68.2 2e-11 CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 439 70.9 2.1e-11 CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 431 69.6 3e-11 CCDS63958.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 734) 426 68.8 4e-11 >>CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 (845 aa) initn: 6114 init1: 6114 opt: 6114 Z-score: 4228.3 bits: 793.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6114; 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50.2% identity (73.3% similar) in 815 aa overlap (68-816:23-835) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 FQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVDGSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDC : : ...: :..:.:. .: :::. .: CCDS58 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAEC 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 EDGSDESPEQCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPD .:::::: : : ::. ..:::.. ..::: :::::. :::.: ::..: ::: : CCDS58 QDGSDESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQD 60 70 80 90 100 110 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 EFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDAD :: : .:.::::.:::... :: ::::: .: ::: :::..:.::: :.::.: : CCDS58 EFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPD 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 CSDQSDESLEQCGRQPVIH---TKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCP : : ::: ..: :.. . : : :..: ::::::..::::: ::::: ::: :: CCDS58 CEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCA 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDI :::::.:.: ::.::::::::. :: : ::::.: ::. : ::.::::.::::: . CCDS58 VATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITL 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 SKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTC .::::. .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: : ::.:. .. : CCDS58 DKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRC 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 GDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKI ::::::.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. :.::::...::. CCDS58 EDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKM 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 GLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN :.:.:: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: : :. :.: . CCDS58 TLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVIS 420 430 440 450 460 470 520 530 540 550 560 pF1KE2 -----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGF : ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. :: CCDS58 RDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGF 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDL .::.::: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::::.::::: .::.:. CCDS58 MYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDV 540 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 NGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQ :: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:::.. :..:: . . CCDS58 NGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPE 600 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 DIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRD :....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.::.::.:. . .. :. CCDS58 DMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRS 660 670 680 690 700 710 750 760 pF1KE2 CQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP----------------------- : :..:. ::: . :: CCDS58 CLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIVTMSHQ 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 pF1KE2 -------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK :... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.::::::: : CCDS58 ALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQK 780 790 800 810 820 830 820 830 840 pF1KE2 TTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA :::.. CCDS58 TTEDEVHICHNQDGYSYPSMVSLEDDVA 840 850 >>CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (860 aa) initn: 2755 init1: 1284 opt: 2938 Z-score: 2041.7 bits: 388.8 E(32554): 2.1e-107 Smith-Waterman score: 3018; 50.2% identity (73.3% similar) in 815 aa overlap (68-816:23-835) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 FQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVDGSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDC : : ...: :..:.:. .: :::. .: CCDS12 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAEC 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 EDGSDESPEQCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPD .:::::: : : ::. ..:::.. ..::: :::::. :::.: ::..: ::: : CCDS12 QDGSDESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQD 60 70 80 90 100 110 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 EFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDAD :: : .:.::::.:::... :: ::::: .: ::: :::..:.::: :.::.: : CCDS12 EFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPD 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 CSDQSDESLEQCGRQPVIH---TKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCP : : ::: ..: :.. . : : :..: ::::::..::::: ::::: ::: :: CCDS12 CEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCA 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDI :::::.:.: ::.::::::::. :: : ::::.: ::. : ::.::::.::::: . CCDS12 VATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITL 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 SKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTC .::::. .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: : ::.:. .. : CCDS12 DKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRC 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 GDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKI ::::::.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. :.::::...::. CCDS12 EDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKM 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 GLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN :.:.:: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: : :. :.: . CCDS12 TLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVIS 420 430 440 450 460 470 520 530 540 550 560 pF1KE2 -----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGF : ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. :: CCDS12 RDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGF 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDL .::.::: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::::.::::: .::.:. CCDS12 MYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDV 540 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 NGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQ :: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:::.. :..:: . . CCDS12 NGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPE 600 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 DIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRD :....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.::.::.:. . .. :. CCDS12 DMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRS 660 670 680 690 700 710 750 760 pF1KE2 CQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP----------------------- : :..:. ::: . :: CCDS12 CLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIVTMSHQ 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 pF1KE2 -------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK :... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.::::::: : CCDS12 ALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQK 780 790 800 810 820 830 820 830 840 pF1KE2 TTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA :::.. CCDS12 TTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA 840 850 860 >>CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (819 aa) initn: 2595 init1: 1284 opt: 2702 Z-score: 1879.5 bits: 358.7 E(32554): 2.3e-98 Smith-Waterman score: 2782; 49.9% identity (73.1% similar) in 772 aa overlap (113-816:27-794) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPEQCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDS :. .:..: .. .:: .: ::: .:.. CCDS56 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQC--QDGKCISYKWVCDGSAECQD 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 GEDE--ENCGNITCSPDEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQC : :: :.:. ::: ::: : .:.::::.:::... :: ::::: .: ::: ::: CCDS56 GSDESQETCSPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQC 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 pF1KE2 STSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIH---TKCPASEIQCGSGECIHKKWR ..:.::: :.::.: :: : ::: ..: :.. . : : :..: ::::::..:: CCDS56 NSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWR 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 CDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQ ::: ::::: ::: :: :::::.:.: ::.::::::::. :: : ::::.: ::. CCDS56 CDGGPDCKDKSDEENCAVATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTL 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 CLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIG : ::.::::.::::: ..::::. .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: :: CCDS56 CEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIG 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 YECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV ::: : ::.:. .. : ::::::.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::: CCDS56 YECLCPDGFQLVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAV 300 310 320 330 340 350 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 GKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSAS :. :.::::...::. :.:.:: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :.. CCDS56 GSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQ 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 IDDKVGRHVKMIDNVYN-----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFN .: : :. :.: . : ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: CCDS56 LDRAHG--VSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFR 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 SDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKS . .: .:.:::. ::.::.::: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::... CCDS56 ENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSG 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 RLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANK ::::.::::: .::.:.:: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::. CCDS56 RLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANR 540 550 560 570 580 590 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 FTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPK .:::.. :..:: . .:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: :::: CCDS56 LTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPK 600 610 620 630 640 650 740 750 760 pF1KE2 YTCSCPSGYNVEENGRDCQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP------ .::.::.:. . .. :.: :..:. ::: . :: CCDS56 FTCACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLP 660 670 680 690 700 710 770 780 790 pF1KE2 ------------------------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNW :... : .::..:::. .: .:.:.:: CCDS56 GATPGLTTVEIVTMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNW 720 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 pF1KE2 QHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA . ::..:.::::::: ::::.. CCDS56 RLKNINSINFDNPVYQKTTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA 780 790 800 810 >>CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 (700 aa) initn: 1635 init1: 859 opt: 2415 Z-score: 1682.6 bits: 322.1 E(32554): 2.1e-87 Smith-Waterman score: 2415; 49.8% identity (76.8% similar) in 664 aa overlap (193-843:47-697) 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQS : .::: . ::: : ::.: :: :.: CCDS57 LLLLLLLLQLQHLAAAAADPLLGGQGPAKDCEKDQFQCRNERCIPSVWRCDEDDDCLDHS 20 30 40 50 60 70 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 DESLEQCGRQPVIHTKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDE--VNCPSRTCRP :: ..: .. : :.. : .:.:::..:.:::. .: ::::: ..: ...: CCDS57 DE--DDCPKK-----TCADSDFTCDNGHCIHERWKCDGEEECPDGSDESEATCTKQVCPA 80 90 100 110 120 290 300 310 320 330 pF1KE2 DQFECEDGS--CIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCK-NVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKV ... : : :. .: .:.: .:: :.::..: ... : : .:.: .: :. : CCDS57 EKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATSLGTCRGD-EFQCGDGTCVLAIKH 130 140 150 160 170 180 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 CNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDI ::::::: : ::: .:::: ::::::::: :: ::.:: : :::.:.:.:::::: CCDS57 CNQEQDCPDGSDEAGCLQGLNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLLDQKTCGDI 190 200 210 220 230 240 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 DECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV-GKEPSLIFTNRRDIRKIGL :::..: :::::.: :: .:::: ::.::: : :::. :: ::::::::...:.: : CCDS57 DECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDL 250 260 270 280 290 300 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASID---DKVGRHVKMIDNVY ...: .:. .:.:.::::...:.....: ::: . :.:: .: : ..: . .... CCDS57 VKRNYSRLIPMLKNVVALDVEVATNRIYWCDLSYRKIYSAYMDKASDPKEQEVLIDEQLH 310 320 330 340 350 360 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 NPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWS .: ..:::::.: :::::...:::::::.:: .:. ::. .: :: .:::::: ::.::: CCDS57 SPEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRGFMYWS 370 380 390 400 410 420 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQD :::. :::::.:.:: ::. ::. .:.:::::::::...::::.:::::.:::.:..: . CCDS57 DWGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSIDFSGGN 430 440 450 460 470 480 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 RRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIV :. ...: .::.::.....:::.:.: : ::::...::...: :.. :..:::. .::.. CCDS57 RKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVI 490 500 510 520 530 540 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 YHELVQPSGKNWCEEDME-NGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRI .::: :: . . :: ... ::::::::::::::..:::::::.::. . . . . : : CCDS57 FHELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYR- 550 560 570 580 590 600 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 NVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAIL-PLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK : . .. :.:. .:. :...... ..:::.::::..:: :::::::::: : CCDS57 ---DANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKSMNFDNPVYRK 610 620 630 640 650 660 820 830 840 pF1KE2 TTEEDLS--IDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA ::::. . ::: .:..::.::: ..: .:: CCDS57 TTEEEDEDELHIGR-TAQIGHVYPARVALSLEDDGLP 670 680 690 700 >>CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (682 aa) initn: 2119 init1: 1209 opt: 2108 Z-score: 1471.4 bits: 283.0 E(32554): 1.2e-75 Smith-Waterman score: 2284; 47.5% identity (74.6% similar) in 669 aa overlap (193-845:27-682) 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQS : .::::. ..:: .:::: .:.:.: : CCDS56 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAECQDGS 10 20 30 40 50 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 DESLEQCGRQPVIHTKCPASEIQCGS--GECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRP ::: : : . . : .....::. ..:: . :::::. :: .:::: .:: :::: CCDS56 DESQETC-----LSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPVATCRP 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 DQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQ :.:.: ::.::::::::. :: : ::::.: ::. : ::.::::.::::: ..::::. CCDS56 DEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITLDKVCNM 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 EQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDEC .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: : ::.:. .. : ::::: CCDS56 ARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRCEDIDEC 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 QNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKE :.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. :.::::...::. :.:.: CCDS56 QDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSE 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 pF1KE2 YIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN-----P : .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: : :. :.: . : CCDS56 YTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVISRDIQAP 300 310 320 330 340 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 AAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDW ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. ::.::.:: CCDS56 DGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDW 350 360 370 380 390 400 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 GEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRR : ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::::.::::: .::.:.:: .:. CCDS56 GTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRK 410 420 430 440 450 460 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 IVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYH .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:::.. :..:: . .:....: CCDS56 TILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFH 470 480 490 500 510 520 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRINVT .:.:: . .:.. . . ..:. : :. . .... CCDS56 NLTQPREAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTT--TRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIV 530 540 550 560 570 580 760 770 780 790 800 pF1KE2 T----AVSEVS-----VPPKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDN : :...:. :... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.:::: CCDS56 TMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDN 590 600 610 620 630 640 810 820 830 840 pF1KE2 PVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA ::: ::::... : :. . :..::. ..:: .::.: CCDS56 PVYQKTTEDEVHIC---HNQD-GYSYPSRQMVSLEDDVA 650 660 670 680 >>CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (692 aa) initn: 2011 init1: 869 opt: 2086 Z-score: 1456.2 bits: 280.2 E(32554): 8.7e-75 Smith-Waterman score: 2166; 47.5% identity (71.8% similar) in 649 aa overlap (235-816:23-667) 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 CIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIHTKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDC . .: .:.:: .:.:: :: :::. .: CCDS56 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAEC 10 20 30 40 50 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 KDGSDEVN--CPSRTCRPDQFECED--GSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLG .::::: . : : ::. .: : . :: .:.: :: .:::: .: .. : : CCDS56 QDGSDESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGC--LTLCEG 60 70 80 90 100 110 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 PGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYEC :.::::.::::: ..::::. .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: CCDS56 PNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYEC 120 130 140 150 160 170 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKE : ::.:. .. : ::::::.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. CCDS56 LCPDGFQLVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSI 180 190 200 210 220 230 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 PSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDD :.::::...::. :.:.:: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: CCDS56 AYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDR 240 250 260 270 280 290 510 520 530 540 550 pF1KE2 KVGRHVKMIDNVYN-----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDL : :. :.: . : ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . CCDS56 AHG--VSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENG 300 310 320 330 340 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 REPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLY .: .:.:::. ::.::.::: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::: CCDS56 SKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLY 350 360 370 380 390 400 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 WLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTG :.::::: .::.:.:: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:: CCDS56 WVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTG 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 SELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTC :.. :..:: . .:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.:: CCDS56 SDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTC 470 480 490 500 510 520 740 750 760 pF1KE2 SCPSGYNVEENGRDCQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP--------- .::.:. . .. :.: :..:. ::: . :: CCDS56 ACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGAT 530 540 550 560 570 580 770 780 790 pF1KE2 ---------------------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHK :... : .::..:::. .: .:.:.::. : CCDS56 PGLTTVEIVTMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLK 590 600 610 620 630 640 800 810 820 830 840 pF1KE2 NMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA :..:.::::::: ::::.. CCDS56 NINSINFDNPVYQKTTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA 650 660 670 680 690 >>CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 (904 aa) initn: 2100 init1: 859 opt: 2055 Z-score: 1433.6 bits: 276.4 E(32554): 1.6e-73 Smith-Waterman score: 2879; 46.5% identity (68.8% similar) in 891 aa overlap (5-804:13-861) 10 20 30 40 pF1KE2 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGAT------GTGRKAKCEPSQFQCTNGRCI :: : ::: : . ..:. : : :: .:::: : ::: CCDS30 MGLPEPGPLRLLALLLLLLLLLLLQLQHLAAAAADPLLGGQGPAKDCEKDQFQCRNERCI 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 TLLWKCDGDEDCVDGSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPE .:.:: :.::.: ::: .: :::::.:::.:.::.:. ::::::. .: :::::: CCDS30 PSVWRCDEDDDCLDHSDEDDCPKKTCADSDFTCDNGHCIHERWKCDGEEECPDGSDESEA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRC : ..: ...::: : .:.:.:::::::.::..: :: .:... :.: :: :.. : CCDS30 TCTKQVCPAEKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATL-CAPHEFQCGNRSC 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTS---SCIPISWVCDDDADCSDQSD .. :::.:.:::.::::: :: :.:: .::.:. . .::: :::: . :: :.:: CCDS30 LAAVFVCDGDDDCGDGSDERGCADPACGPREFRCGGDGGGACIPERWVCDRQFDCEDRSD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE2 ESLEQCGRQPVIHTKCPA-----SEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTC :. : ::: :. :: :.. : ::::.: :::::: :::: :::..:: :: CCDS30 EAAELCGRPGPGATSAPAACATASQFACRSGECVHLGWRCDGDRDCKDKSDEADCPLGTC 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 RPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVC : :.:.: ::.:. . ..:: .:: :::::..: . : CCDS30 RGDEFQCGDGTCVLAIKHCNQEQDCPDGSDEAGCLQ--------------G--------- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDID .:::: ::::::::: :: ::.:: : :::.:.:.::::::: CCDS30 ------------------LNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLLDQKTCGDID 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 ECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV-GKEPSLIFTNRRDIRKIGLE ::..: :::::.: :: .:::: ::.::: : :::. :: ::::::::...:.: : CCDS30 ECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDLV 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 RKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASID---DKVGRHVKMIDNVYN ...: .:. .:.:.::::...:.....: ::: . :.:: .: : ..: . ..... CCDS30 KRNYSRLIPMLKNVVALDVEVATNRIYWCDLSYRKIYSAYMDKASDPKEQEVLIDEQLHS 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSD : ..:::::.: :::::...:::::::.:: .:. ::. .: :: .:::::: ::.:::: CCDS30 PEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRGFMYWSD 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 WGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDR ::. :::::.:.:: ::. ::. .:.:::::::::...::::.:::::.:::.:..: .: CCDS30 WGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSIDFSGGNR 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 RIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVY . ...: .::.::.....:::.:.: : ::::...::...: :.. :..:::. .::... CCDS30 KTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVIF 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 HELVQPSGKNWCEEDME-NGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRI- ::: :: . . :: ... ::::::::::::::..:::::::.::. . . . . : : CCDS30 HELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRAP 680 690 700 710 720 730 760 pF1KE2 ----------------------------------------NVTTAV-SEVSVP--PK--- ..:.:: : :::: :. CCDS30 QSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSISP 740 750 760 770 780 790 770 780 790 800 pF1KE2 ---------------------GTSAAWAIL----PLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKS :.... :.. :...... ..:::.::::..:: :: CCDS30 STLSPATSNHSQHYANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKS 800 810 820 830 840 850 810 820 830 840 pF1KE2 MNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA ::: CCDS30 MNFDNPVYRKTTEEEDEDELHIGRTAQIGHVYPARVALSLEDDGLP 860 870 880 890 900 >>CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 (963 aa) initn: 2100 init1: 859 opt: 2055 Z-score: 1433.4 bits: 276.4 E(32554): 1.6e-73 Smith-Waterman score: 2879; 46.5% identity (68.8% similar) in 891 aa overlap (5-804:13-861) 10 20 30 40 pF1KE2 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGAT------GTGRKAKCEPSQFQCTNGRCI :: : ::: : . ..:. : : :: .:::: : ::: CCDS57 MGLPEPGPLRLLALLLLLLLLLLLQLQHLAAAAADPLLGGQGPAKDCEKDQFQCRNERCI 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 TLLWKCDGDEDCVDGSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPE .:.:: :.::.: ::: .: :::::.:::.:.::.:. ::::::. .: :::::: CCDS57 PSVWRCDEDDDCLDHSDEDDCPKKTCADSDFTCDNGHCIHERWKCDGEEECPDGSDESEA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRC : ..: ...::: : .:.:.:::::::.::..: :: .:... :.: :: :.. : CCDS57 TCTKQVCPAEKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATL-CAPHEFQCGNRSC 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTS---SCIPISWVCDDDADCSDQSD .. :::.:.:::.::::: :: :.:: .::.:. . .::: :::: . :: :.:: CCDS57 LAAVFVCDGDDDCGDGSDERGCADPACGPREFRCGGDGGGACIPERWVCDRQFDCEDRSD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE2 ESLEQCGRQPVIHTKCPA-----SEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTC :. : ::: :. :: :.. : ::::.: :::::: :::: :::..:: :: CCDS57 EAAELCGRPGPGATSAPAACATASQFACRSGECVHLGWRCDGDRDCKDKSDEADCPLGTC 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 RPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVC : :.:.: ::.:. . ..:: .:: :::::..: . : CCDS57 RGDEFQCGDGTCVLAIKHCNQEQDCPDGSDEAGCLQ--------------G--------- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDID .:::: ::::::::: :: ::.:: : :::.:.:.::::::: CCDS57 ------------------LNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLLDQKTCGDID 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 ECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV-GKEPSLIFTNRRDIRKIGLE ::..: :::::.: :: .:::: ::.::: : :::. :: ::::::::...:.: : CCDS57 ECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDLV 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 RKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASID---DKVGRHVKMIDNVYN ...: .:. .:.:.::::...:.....: ::: . :.:: .: : ..: . ..... 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CCDS57 KTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVIF 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 HELVQPSGKNWCEEDME-NGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRI- ::: :: . . :: ... ::::::::::::::..:::::::.::. . . . . : : CCDS57 HELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRAP 680 690 700 710 720 730 760 pF1KE2 ----------------------------------------NVTTAV-SEVSVP--PK--- ..:.:: : :::: :. CCDS57 QSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSISP 740 750 760 770 780 790 770 780 790 800 pF1KE2 ---------------------GTSAAWAIL----PLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKS :.... :.. :...... ..:::.::::..:: :: CCDS57 STLSPATSNHSQHYANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKS 800 810 820 830 840 850 810 820 830 840 pF1KE2 MNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA ::: CCDS57 MNFDNPVYRKTTEEEDEDELHIGRTAQIGHVYPAAISSFDRPLWAEPCLGETREPEDPAP 860 870 880 890 900 910 845 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 20:39:00 2016 done: Sun Nov 6 20:39:01 2016 Total Scan time: 3.290 Total Display time: 0.260 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]