FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7277, 1288 aa 1>>>pF1KB7277 1288 - 1288 aa - 1288 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6327+/-0.000496; mu= -4.9804+/- 0.031 mean_var=552.2923+/-116.832, 0's: 0 Z-trim(121.4): 1767 B-trim: 32 in 1/58 Lambda= 0.054575 statistics sampled from 35497 (37881) to 35497 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16 Scan time: 17.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004663 (OMIM: 604468) mitogen-activated protein (1288) 8697 701.3 1.1e-200 NP_001284538 (OMIM: 604468) mitogen-activated prot (1280) 8619 695.1 7.9e-199 XP_016858260 (OMIM: 604468) PREDICTED: mitogen-act ( 869) 5880 479.2 5.1e-134 XP_016858261 (OMIM: 604468) PREDICTED: mitogen-act ( 801) 5265 430.8 1.8e-119 NP_001001671 (OMIM: 300820) mitogen-activated prot (1313) 3428 286.4 8.7e-76 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 PREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLPFGTLELGDTAALDAFYNADVVVLEV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 SSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALREDVFQKNSDCVGSYTLIPYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 SSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALREDVFQKNSDCVGSYTLIPYV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 VTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGTEALLTPLVGRLARLLEATPTDSCGYFRETIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 VTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGTEALLTPLVGRLARLLEATPTDSCGYFRETIR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVLLPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIY 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 QEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHTPNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB7 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB7 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB7 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB7 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP 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NP_001 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB7 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB7 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1270 1280 pF1KB7 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP :::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP 1260 1270 1280 >>XP_016858260 (OMIM: 604468) PREDICTED: mitogen-activat (869 aa) initn: 5880 init1: 5880 opt: 5880 Z-score: 2527.0 bits: 479.2 E(85289): 5.1e-134 Smith-Waterman score: 5880; 99.9% identity (100.0% similar) in 869 aa overlap (420-1288:1-869) 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 PSLHSGINAAVLLIAAGQHFEDSKELRLIGMKLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQI :::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MKLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQI 10 20 30 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 LANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMETFLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMETFLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLL 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 QSCQPFKTACAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAKLEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 QSCQPFKTACAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAKLEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWT 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 FPVASICGVSASKRDERCCFLYALPPAQDVQLCFPSVGHCQWFCGLIQAWVTKPDSTAPA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: XP_016 FPVASICGVSASKRDERCCFLYALPPAQDVQLCFPSVGHCQWFCGLIQAWVTNPDSTAPA 160 170 180 190 200 210 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 EEAEGAGEMLEFDYEYTETGERLVLGKGTYGVVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 EEAEGAGEMLEFDYEYTETGERLVLGKGTYGVVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQP 220 230 240 250 260 270 690 700 710 720 730 740 pF1KB7 LHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKIFMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKIFMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTIS 280 290 300 310 320 330 750 760 770 780 790 800 pF1KB7 FYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLINTFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 FYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLINTFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTG 340 350 360 370 380 390 810 820 830 840 850 860 pF1KB7 TLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVIEMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYKVHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 TLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVIEMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYKVHP 400 410 420 430 440 450 870 880 890 900 910 920 pF1KB7 PMPSSLSAEAQAFLLRTFEPDPRLRASAQTLLGDPFLQPGKRSRSPSSPRHAPRPSDAPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 PMPSSLSAEAQAFLLRTFEPDPRLRASAQTLLGDPFLQPGKRSRSPSSPRHAPRPSDAPS 460 470 480 490 500 510 930 940 950 960 970 980 pF1KB7 ASPTPSANSTTQSQTFPCPQAPSQHPPSPPKRCLSYGGTSQLRVPEEPAAEEPASPEESS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 ASPTPSANSTTQSQTFPCPQAPSQHPPSPPKRCLSYGGTSQLRVPEEPAAEEPASPEESS 520 530 540 550 560 570 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB7 GLSLLHQESKRRAMLAAVLEQELPALAENLHQEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 GLSLLHQESKRRAMLAAVLEQELPALAENLHQEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHT 580 590 600 610 620 630 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB7 PNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPLFAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 PNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPLFAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLS 640 650 660 670 680 690 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB7 RAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGDSQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 RAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGDSQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLL 700 710 720 730 740 750 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB7 RAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNEEARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 RAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNEEARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELN 760 770 780 790 800 810 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB7 VDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYTRIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 VDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYTRIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP 820 830 840 850 860 >>XP_016858261 (OMIM: 604468) PREDICTED: mitogen-activat (801 aa) initn: 5265 init1: 5265 opt: 5265 Z-score: 2265.7 bits: 430.8 E(85289): 1.8e-119 Smith-Waterman score: 5265; 99.9% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAGPCPRSGAERAGSCWQDPLAVALSRGRQLAAPPGRGCARSRPLSVVYVLTREPQPGLE 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVLLPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 QALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVLLPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIY 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 KDMFFSSGFQDAGHREQAYHWYRKAFDVEPSLHSGINAAVLLIAAGQHFEDSKELRLIGM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 KDMFFSSGFQDAGHREQAYHWYRKAFDVEPSLHSGINAAVLLIAAGQHFEDSKELRLIGM 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 KLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 KLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMET 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 FLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLLQSCQPFKTACAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAK 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NP_001 RALRAVYVRSESSQGGAAGGPEAGAR------QCLLRACEA-----EGAHLTSVPFGELD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LGDTAALDAFYNADVVVLEVSSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALR .:.::.:::::.:::.:...:. ::::::::::::::.:.:::.: ..: .:. NP_001 FGETAVLDAFYDADVAVVDMSDVSRQPSLFYHLGVRESFDMANNVILYHDTDADTALSLK 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 EDVFQKNSDCVGSYTLIPYVVTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGT--EALLTPLVG . : :::. :.: .:::.:: . .: .. : :. .: . . : ::: NP_001 DMVTQKNTASSGNYYFIPYIVTPCADYFCCESDAQRR-ASEYMQPNWDNILGPLCMPLVD 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 RLARLLEATPTDSCGYFRETIRRDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIM :. ::. . :: :..::. :::.:::...: .: .::::.. :.:..:.:. :::. NP_001 RFISLLKDIHVTSCVYYKETLLNDIRKAREKYQGEELAKELARIKLRMDNTEVLTSDIII 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 NLLLSYRDVQDYSAIIELVETLQALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVL ::::::::.:::.:...:::::. :::::.:.:::. :::.::::::: ::: :::... NP_001 NLLLSYRDIQDYDAMVKLVETLEMLPTCDLADQHNIKFHYAFALNRRNSTGDREKALQIM 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 LPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIYKDMFFSSGFQDAGHREQAYHWYRKAFDVEPSLHSGINA : ..: .::..:.:::::::.:..: .: :..: .::::.:... ::.:::: NP_001 LQVLQSCDHPGPDMFCLCGRIYKDIFLDSDCKDDTSRDSAIEWYRKGFELQSSLYSGINL 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 AVLLIAAGQHFEDSKELRLIGMKLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVV :::::.:::.:: : ::: ::..:. ::.::: .:::. ::::: ......::.: ..: NP_001 AVLLIVAGQQFETSLELRKIGVRLNSLLGRKGSLEKMNNYWDVGQFFSVSMLAHDVGKAV 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 LAAEQLYKLNAPIWYLVSVMETFLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLLQSCQPFKTA :::.:.::. :.::: :.....:: ..:. : . .: .::: ..... . NP_001 QAAERLFKLKPPVWYLRSLVQNLLLIRRFKKTIIEHSPRQERLNFWLDIIFEAT----NE 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 CAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAKLEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWTFPVASICGV ..: . :::.: .:: :. . . . ::.: . : . :.: ..:: :. NP_001 VTNGLRFPVLVIEPTKVYQPSYVSINNEAEERTVSLWHVSPTEMKQMHEWNFTASSIKGI 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 SASKRDERCCFLYALPPAQDVQLCFPSVGHCQWFCGLIQAWVTKPDSTAPAEEAEGAGEM : :: ::::::::. ..: :. : . .:. : .:.. .:. ... :.: :. NP_001 SLSKFDERCCFLYVHDNSDDFQIYFSTEEQCSRFFSLVKEMITNTAGSTVELEGETDGDT 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 LEFDYEYTETGERLVLGKGTYGVVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQPLHEEIALHR ::..:.. .:::.::::::::.:::::: ..::::::::::::::.:::::::::::. 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NP_001 RDFIRSPEHRVMATTISKLKVDLDFDSSSISQIHLVLFGFQDAVNKILRNHLIRPHWMFA 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB7 LDSLLSRAVRAALGVLGPEV--------EKEAVSPRSEELSNEGDSQQS-PGQQSPLPVE .:... :::.::. .: ::. : :.:. .: ..:: . :::.. . NP_001 MDNIIRRAVQAAVTILIPELRAHFEPTCETEGVDKDMDE-AEEGYPPATGPGQEA----Q 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB7 PEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNEEARTYVLA------ :.: : .::. :: ::.:: : :. :::::: :....:.. ..: : NP_001 PHQ--QHLSLQLGELRQETNRLLEHLVEKEREYQNLLRQTLEQKTQELYHLQLKLKSNCI 1180 1190 1200 1210 1220 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB7 ---PEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYTRIRGG : : . ::. :..::. ..:. ::. ......:: .:. :..:: : :.::: NP_001 TENPAGPYGQRTDKELIDWLRLQGADAKTIEKIVEEGYTLSDILNEITKEDLRYLRLRGG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1270 1280 pF1KB7 MVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP ..::.: :. : NP_001 LLCRLWSAVSQYRRAQEASETKDKA 1290 1300 1310 >>XP_011534141 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-activat (1286 aa) initn: 3255 init1: 1503 opt: 3191 Z-score: 1380.8 bits: 267.7 E(85289): 3.6e-70 Smith-Waterman score: 3505; 49.7% identity (75.2% similar) in 1143 aa overlap (14-1122:161-1283) 10 20 30 pF1KB7 MAGPCPRSGAERAGSCWQDPLAVALSRGRQLA-----APPGRG :: :. :.: . : : : ::: XP_011 CTIPEGGICRRGGAAAVGEGEEHQLPPPPPGSFWNVESAAAPGIGCPAATSSSSATRGRG 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 CAR---SRPLSVVYVLTREPQPGLEPREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLP . :: .:.::... : : . :: :. ::::: : :..: XP_011 SSVGGGSRRTTVAYVINEASQGQL-----VVAESEALQSLREACETVG-----ATLETLH 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 FGTLELGDTAALDAFYNADVVVLEVSSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPD :: :..:.:..:: :::::..:.:.:... ::::::::::::::::.::..: ... . 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