Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0394, 1120 aa
1>>>pF1KE0394 1120 - 1120 aa - 1120 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1919+/-0.000413; mu= 18.1638+/- 0.026
mean_var=89.6002+/-17.308, 0's: 0 Z-trim(112.1): 48 B-trim: 93 in 1/53
Lambda= 0.135494
statistics sampled from 20913 (20960) to 20913 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 12.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor ( 858) 440 97.0 5.1e-19
NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 937) 432 95.5 1.6e-18
NP_004238 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small n ( 972) 432 95.5 1.7e-18
NP_001245282 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 972) 432 95.5 1.7e-18
NP_001332797 (OMIM: 617064,617065) translation fac ( 629) 381 85.4 1.2e-15
NP_068746 (OMIM: 617064,617065) translation factor ( 669) 381 85.4 1.2e-15
NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 962) 383 85.9 1.3e-15
NP_733781 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 513) 328 75.0 1.3e-12
XP_011541993 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 564) 328 75.0 1.4e-12
NP_733792 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 732) 328 75.1 1.7e-12
XP_016865475 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 779) 328 75.1 1.8e-12
NP_115756 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 779) 328 75.1 1.8e-12
NP_001268231 (OMIM: 606544) ribosome-releasing fac ( 811) 328 75.1 1.9e-12
NP_001295095 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 591) 304 70.3 3.8e-11
NP_079272 (OMIM: 606639,609060) elongation factor ( 751) 304 70.4 4.6e-11
NP_001295093 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 770) 304 70.4 4.7e-11
XP_006713858 (OMIM: 606639,609060) PREDICTED: elon ( 712) 301 69.8 6.6e-11
XP_011544230 (OMIM: 602389,610678) PREDICTED: elon ( 427) 220 53.8 2.5e-06
NP_003312 (OMIM: 602389,610678) elongation factor ( 455) 220 53.9 2.7e-06
XP_016879108 (OMIM: 602389,610678) PREDICTED: elon ( 455) 220 53.9 2.7e-06
NP_056988 (OMIM: 606086) eukaryotic translation in (1220) 193 48.8 0.00024
>>NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor 2 [H (858 aa)
initn: 1670 init1: 432 opt: 440 Z-score: 462.4 bits: 97.0 E(85289): 5.1e-19
Smith-Waterman score: 1465; 30.5% identity (53.2% similar) in 1130 aa overlap (1-1100:1-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
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NP_001 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEE------------YLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVR
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NP_001 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKN
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NP_001 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPE
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NP_001 IVENVNVIISTY-------------GEGESGP---MGNIMID----------------PV
190 200
230 240 250 260 270
pF1KE0 QGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIK-----------KEV--LMKTLWGDYYINM
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NP_001 LGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDP
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KAKKIMKGDQA-KGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
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NP_001 ANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDS-ED
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
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NP_001 KDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCE-LLYEG-------PPDD
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 QALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEK
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NP_001 EA-AMGIKSC--DPKGPLMMYISKMV----------------------------------
380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
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NP_001 -----------PTSD--------KGR--------------------------FYAFGRVF
410
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
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NP_001 SGLVSTGLKVRIMGPNYTP------------GKKEDLYLKP------IQRTILMMGRYVE
420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 YLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQ
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NP_001 PIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPK
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 LVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPF
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NP_001 LVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSY
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 RETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLS
:::... .:. : .::: :
NP_001 RETVSE------------------------------------ESNVLCLSKSPNKHNRLY
580 590 600
760 770 780 790 800 810
pF1KE0 VRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLT
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NP_001 MKARPFPD-----------------GLAEDIDKGEVS--ARQELKQRARYLAEKYEWDVA
610 620 630 640
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 GRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSG
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NP_001 EAR------KIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQ----------------YLNEIKDSVVAG
650 660 670 680
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 FQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQD
:: :: : .::: . :: : .. : .: ..:
NP_001 FQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLH-------ADAIHRG------------------
690 700 710
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 GCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYA--LQVKPQRLMAAMYTCDIM
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NP_001 -------------------------GGQIIPTARR-CLYASVLTAQP-RLMEPIYLVEIQ
720 730 740 750
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 ATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASP
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NP_001 CPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFP
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE0 QLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHA
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NP_001 QCVFDHWQILPGDPF----------------DNSSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNF
820 830 840 850
1120
pF1KE0 EKQRTLSKNK
NP_001 LDKL
>>NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu (937 aa)
initn: 1251 init1: 299 opt: 432 Z-score: 453.4 bits: 95.5 E(85289): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 1012; 25.9% identity (51.1% similar) in 1102 aa overlap (6-1100:81-908)
10 20 30
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTL
.: . .:. :. :::. . .:. :::: .
NP_001 TQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCF
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ADCLI-SSNGIISSRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYA-TGNEEYLINLIDS
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NP_001 VDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDT
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIV
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NP_001 PGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLIL
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWST
:::. : .:: .:..:....:.: .....
NP_001 ELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST------------------------------
240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIG-IKKEVLMKTLWGDYY
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NP_001 ------DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIY
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 INMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
.: :..:. : ..... ::..::: .... :. .. . . ::... ..:
NP_001 FNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
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NP_001 LKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGG---VDS-----
380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 QALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEK
: :. : . .:.. ..::...:
NP_001 -DLGEAMSDC--DPDGPLMCHTTKMYSTD-------------------------------
430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
:: .: ::.::.
NP_001 --------------DGV----------------------------------QFHAFGRVL
460
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
::. . :. . ::: .:. :: :. :. :.. :.. ..:
NP_001 SGTIHAGQPVKVLGENYT-LE----------DEEDS--QI-----CTVGRLWISVARYHI
470 480 490 500
580 590 600 610 620
pF1KE0 YLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPS----CPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPS
...:: :: . : :... ..:.::. . : : ::.:..: ....:::: .::
NP_001 EVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATI-TEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPS
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 EMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEP
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NP_001 ELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADP
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 IIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKL
.. : ::... .. : .:..:...: . : .:. :
NP_001 VVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLE------KGLAED-------------
630 640 650 660
750 760 770 780 790 800
pF1KE0 ATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLE
. .::.:: . . : :: :. : .
NP_001 ---------IENEVVQITWNRKKL-------------GE--------------FFQTKYD
670 680
810 820 830 840 850 860
pF1KE0 QHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNS
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NP_001 WDLLAAR------SIWAFGPDATGPNILVDD---------TLPSEVDKALLGSVKD---S
690 700 710 720 730
870 880 890 900 910 920
pF1KE0 IVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQ
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NP_001 IVQGFQWGTREGPLCDELIRNV----------KFKILDAV-VAQEPLHR-----GG----
740 750 760 770
930 940 950 960 970 980
pF1KE0 ELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCD
::.: : ... :. . ::: .: .
NP_001 ------------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVE
780 790 800
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE0 IMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLA
..: .: .. ::.::..:.:.: :. :. .. ::: .:. .:::: ..: .:.: :
NP_001 VQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQA
810 820 830 840 850 860
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE0 SPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVE
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NP_001 FSLSVFHHWQIVPGDPL----DKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISK
870 880 890 900 910
1110 1120
pF1KE0 HAEKQRTLSKNK
NP_001 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
920 930
>>NP_004238 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nucle (972 aa)
initn: 1251 init1: 299 opt: 432 Z-score: 453.1 bits: 95.5 E(85289): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 1012; 25.9% identity (51.1% similar) in 1102 aa overlap (6-1100:116-943)
10 20 30
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTL
.: . .:. :. :::. . .:. :::: .
NP_004 TQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCF
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ADCLI-SSNGIISSRLAGKLRYMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYA-TGNEEYLINLIDS
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NP_004 VDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDT
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIV
::::.::.::....:: :: .. .::.::: .:. ....: : . .. ::::::::.
NP_004 PGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLIL
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWST
:::. : .:: .:..:....:.: .....
NP_004 ELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST------------------------------
270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIG-IKKEVLMKTLWGDYY
: .: .:: ::: :.:. . : . ::.::.. .: :. . . : :::: :
NP_004 ------DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIY
300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 INMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
.: :..:. : ..... ::..::: .... :. .. . . ::... ..:
NP_004 FNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEE
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
. . . . .:.... . . : :..::: . ..:. . : ::
NP_004 LKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGG---VDS-----
410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
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: :. : . .:.. ..::...:
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460 470 480 490 500 510
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...:: :: . : :... ..:.::. . : : ::.:..: ....:::: .::
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:.:... :.. .:.. : . ..:.::::.. .::..:. . ::.. ...: :.:..:
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.. : ::... .. : .:..:...: . : .:. :
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. .::.:: . . : :: :. : .
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. . . . .:.... . . : :..::: . ..:. . : ::
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220 230 240 250 260 270
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170 180 190 200 210
pF1KE0 KNILE-------QINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTD
..... .:.: :: : ::. :: .:. .. :.:
NP_068 EKVFDIPSDECIKISAKLGTNVES-VLQAIIERIPPPKVHRKNPLRALVFDSTFDQYRGV
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NP_068 IANVALFDGVVSKGDKIVSAHTQKTYEVNEVGVLNPNEQPTHKLYAGQVGYLIAGMKDVT
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>>NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu (962 aa)
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NP_001 LKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST-------------------------------
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NP_001 NPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEEL
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340 350 360 370 380 390
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. . . . .:.... . . : :..::: . ..:. . : ::
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NP_001 LPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPV
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NP_001 VTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLE------KGLAED--------------
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pF1KE0 VSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQE
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NP_001 -----------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEV
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NP_001 QAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAF
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NP_001 SLSVFHHWQIVPGDPL----DKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKF
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pF1KE0 AEKQRTLSKNK
NP_001 FDDPMLLELAKQDVVLNYPM
950 960
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NP_733 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
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pF1KE0 VSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEA
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pF1KE0 YSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSH
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pF1KE0 LYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMK
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NP_733 LKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTAVPVLC
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pF1KE0 GD--QAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQ
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NP_733 GSALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEERNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIY
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>>XP_011541993 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-releas (564 aa)
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Smith-Waterman score: 328; 29.0% identity (56.2% similar) in 283 aa overlap (17-293:68-342)
10 20 30 40
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGII
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XP_011 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
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XP_011 VERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESI
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290 300 310 320 330 340
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XP_011 GSALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEERNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIY
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>>NP_733792 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor 2, (732 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SSRLAGKLRYMDSRED----EQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSE
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NP_733 -TRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDW----KGYRVNLIDTPGHVDFTLE
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 VSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEA
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NP_733 VERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESI
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 YSHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSH
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NP_733 REKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKE-KLLWNCNSNDGKD-FERKPLLEMNDPEL
220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LYFSPEQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMK
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NP_733 LKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTAVPVLC
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
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330 340 350 360 370 380
1120 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:32:25 2016 done: Thu Nov 3 12:32:27 2016
Total Scan time: 12.570 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]