FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8543, 980 aa 1>>>pF1KB8543 980 - 980 aa - 980 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0844+/-0.000764; mu= 14.3206+/- 0.046 mean_var=133.8595+/-26.930, 0's: 0 Z-trim(112.9): 57 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.110854 statistics sampled from 13525 (13582) to 13525 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16 Scan time: 4.040 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 6513 1053.5 0 CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 1045 178.9 3.5e-44 CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 930 160.6 1.3e-38 CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 849 147.7 1.4e-34 CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 798 139.4 2.4e-32 CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 798 139.4 2.6e-32 CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 798 139.4 2.6e-32 CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 798 139.5 2.9e-32 CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 784 137.3 1.8e-31 CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 627 111.9 2.7e-24 CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 627 111.9 2.7e-24 CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 590 106.2 2.8e-22 CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 576 103.7 7.2e-22 CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 576 103.7 8.3e-22 CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 573 103.3 1.2e-21 CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 550 99.6 1.6e-20 CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 549 99.4 1.6e-20 CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 542 98.3 3.2e-20 CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 542 98.3 3.4e-20 CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 543 98.6 5.1e-20 CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 539 97.9 5.4e-20 CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 545 99.1 6.3e-20 CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 536 97.3 6.5e-20 CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 529 96.6 3.9e-19 CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 506 92.6 2e-18 CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 502 92.0 4.3e-18 CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 502 92.1 4.4e-18 CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 502 92.1 4.7e-18 CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 473 87.4 9.4e-17 CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 473 87.4 9.8e-17 CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 465 86.1 2.6e-16 CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 438 81.7 3.6e-15 CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 438 81.8 5.5e-15 CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 433 80.9 6.4e-15 CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 429 80.3 1.3e-14 CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 402 75.9 1.7e-13 CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 376 71.8 3.8e-12 CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 378 72.2 4.3e-12 CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 360 69.4 3.2e-11 >>CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 (980 aa) initn: 6513 init1: 6513 opt: 6513 Z-score: 5631.6 bits: 1053.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6513; 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CCDS65 LFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKY 60 70 80 90 100 110 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 ARELHIEIVSSPHYSTNGN-YDGVLYRHF-QIPRVVQEGDVLCVPTIGQVEILEGSPEKL ....:. ... . .:: .. : .: . : ...::.. : .:. CCDS65 GKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLV---------RGG---- 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB8 PRWREMFFKVKKTVGEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSP : . ::: .: : : : . : .. : :. ::: . . CCDS65 --MRAVEFKVVET------DP-SPYCIVAPDTVIHCEGE---PIKREDEEESLNEVGYDD 160 170 180 190 200 440 450 460 470 480 pF1KB8 PG----LEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTS---SVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLG : : ..:. . : .:. :.. ..:: :::: ::: .. :. .. : CCDS65 IGGCRKQLAQIKEMVEL--PLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETG 210 220 230 240 250 260 490 500 510 520 530 540 pF1KB8 LHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGL-GEDARV .. . . .. .: :..:. : .:.. ::.... .: .. :. :: : CCDS65 AFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVER- 270 280 290 300 310 320 550 560 570 580 590 600 pF1KB8 MAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDL-PADVQTA-FPHELEVPALSEGQRLSIL .. .:: : :.. ..:.:.:.: ... :: . . : .:... . :: :: CCDS65 -RIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEIL 330 340 350 360 370 380 610 620 630 640 650 660 pF1KB8 RALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEG . : .. :...:.: :.: . : : .:: :: :.:: :... : .: CCDS65 QIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAAL---CSEAALQAIRKKMDLIDLEDETID 390 400 410 420 430 670 680 690 700 710 720 pF1KB8 ELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQ-TAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLP .. . .:: :: : . .: ..: ..:.:.:.:.:::..::.:. : .: : CCDS65 AEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETV--VEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYP 440 450 460 470 480 490 730 740 750 760 770 780 pF1KB8 LEHPE-LLSLGLRRS-GLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSE .:::. .:..:. : :.:..:::: ::::::::.:.::. .:.:.:::::..:. :.:: CCDS65 VEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESE 500 510 520 530 540 550 790 800 810 820 830 840 pF1KB8 ENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRS-GDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQD ::::.: .:: ::::..:::::::.: .:: . ::.::. :::..:.:.:.::. . .. CCDS65 ANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKN 560 570 580 590 600 610 850 860 870 880 890 900 pF1KB8 VFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNV ::.::::::::..:::.:::::.:.:... :. :.. .:.: :: . .:.: . CCDS65 VFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPL-PDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDL-EF 620 630 640 650 660 670 910 920 930 940 950 pF1KB8 LDCCPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDL---EEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARL : ..:::: .:. : :... ... :. . . ::. . .: . : CCDS65 LAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRD 680 690 700 710 720 730 960 970 980 pF1KB8 QPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC . .: .:. : CCDS65 H----FEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGG 740 750 760 770 780 790 >>CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 (893 aa) initn: 884 init1: 536 opt: 930 Z-score: 806.7 bits: 160.6 E(32554): 1.3e-38 Smith-Waterman score: 936; 34.5% identity (65.9% similar) in 519 aa overlap (466-976:390-887) 440 450 460 470 480 490 pF1KB8 PGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVP ::: :::: ::: .. :. ...: .. . CCDS37 SQLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTMIARAVANEVGAYVSVIN 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 pF1KB8 CSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRH . .. : .:.::. ::..: .:..... .: : :.: ... ::.: : CCDS37 GPEIISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLT 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 pF1KB8 LLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDLPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAH :. . : ..:...:.: . : : .. : .:.:. . . .::.::. : . CCDS37 LMDGIGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAQDRLDILQKLLRR 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 pF1KB8 LP-LGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEGELCAA .: : :..: ::: :.: .:: .: .... : :: .. . . .. .: CCDS37 VPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRRILKK-------QPNLPDVKVA 540 550 560 570 580 590 680 690 700 710 720 pF1KB8 GF-PLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLPLEHPE :. . .:: ::..... . . . : .:.::: :.:::. .: .. .... ::.::: CCDS37 GLVKITLKDFLQAMNDIRPSAMREI-AIDVPNVSWSDIGGLESIKLKLEQAVEWPLKHPE 600 610 620 630 640 650 730 740 750 760 770 780 pF1KB8 -LLSLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVRE .. .:.. .:.::.:::: .::..:::.:.: .:.::..:::::.: :::.::. ::: CCDS37 SFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAIKGPELMNKYVGESERAVRE 660 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 pF1KB8 VFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVIGA .: .:::.:: ::::::::.:: :: : .:.: :::..:::.:.::... .:: ...: CCDS37 TFRKARAVAPSIIFFDELDALAVERGSSLGAGNVADRVLAQLLTEMDGIEQLKDVTILAA 720 730 740 750 760 770 850 860 870 880 890 900 pF1KB8 TNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNVLDCCPP ::::: .: ::.::::.:....: : :.. .... ... . :.: . : CCDS37 TNRPDRIDKALMRPGRIDRIIYVPL-PDAATRREIFKLQFHSMPVSNEVDL-DELILQTD 780 790 800 810 820 910 920 930 940 950 960 pF1KB8 QLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQEL .::.. ..: .: :: :: .. : .. . . :: . . : . :. CCDS37 AYSGAEIVAVCREAALLAL-------EEDIQ----ANLIMKRHFTQALSTVTPRIPESLR 830 840 850 860 870 970 980 pF1KB8 LRYKRIQRKFAAC :. :.: CCDS37 RFYEDYQEKSGLHTL 880 890 >>CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283 aa) initn: 642 init1: 353 opt: 849 Z-score: 734.4 bits: 147.7 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 902; 35.4% identity (65.2% similar) in 537 aa overlap (431-943:560-1074) 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 LADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALL .::. .:: .. : . .: . .:. CCDS56 VLLDPMVKEENSEEIDFILPFLKLSSLGGVNSLGVSSLEHITHSLLG--RPLSRQLMSLV 530 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 pF1KB8 TG--TSSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSH----LGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAI .: ....:: : : ::.:.. : :.. : :. .: :..: .. .. :.. CCDS56 AGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDKLDAHVERVDCKALRGKRLENIQKTLEVA 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 pF1KB8 FSRARRCRPAVLLLTAVDLLGR----DRDGLGEDARVMAVLRHLL--LNEDPLNSCPPLM ::.: .:.:.:: .::.. . . :: : : : . .. .. . CCDS56 FSEAVWMQPSVVLLDDLDLIAGLPAVPEHEHSPDAVQSQRLAHALNDMIKEFISMGSLVA 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 pF1KB8 VVATTSRAQDL-PADVQTAFPHELE----VPALSEGQRLSIL-----RALTAHLPLGQEV ..::.. :.: : :.. : .. . .. :: :: : . .. CCDS56 LIATSQSQQSLHPLLVSAQGVHIFQCVQHIQPPNQEQRCEILCNVIKNKLDCDINKFTDL 710 720 730 740 750 760 620 630 640 650 660 670 pF1KB8 NLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEGELCAAGFPLLAED .: ..:.. .:::. :. .:. .:: .:.. .... :.: . : . : CCDS56 DLQHVAKETGGFVARDFTVLV---DRAIHSRLSRQSIS---TREK--------LVLTTLD 770 780 790 800 810 680 690 700 710 720 730 pF1KB8 FGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLPLEHPELLS-LGLR- : .::. . : ..:. : ...: .:::.::.. ...::::: ..:::.. : .: CCDS56 FQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKIGGLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQ 820 830 840 850 860 870 740 750 760 770 780 790 pF1KB8 RSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVREVFARARAAA :.:.::.::::::::::: ..: : ..:.:::::::.. :.: ::. ::..: ::.:: CCDS56 RTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNFISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQAAK 880 890 900 910 920 930 800 810 820 830 840 850 pF1KB8 PCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVIGATNRPDLLDP :::.::::..:.:: ::. :. :: ::::.:::..:::... : :.:..::.::::.:: CCDS56 PCILFFDEFESIAPRRGH--DNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDP 940 950 960 970 980 990 860 870 880 890 900 910 pF1KB8 ALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNVLDCCPPQLTGADLYS :::::::.:: :. :..:.:..:.... .. : .:.: .: . ..::::: . CCDS56 ALLRPGRLDKCVYCPP-PDQVSRLEILNVLSDSLPLADDVDLQHVASVTD-SFTGADLKA 1000 1010 1020 1030 1040 920 930 940 950 960 970 pF1KB8 LCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRK : .:. ::. . : ::. :::. CCDS56 LLYNAQLEALHGML--LSSGLQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGLDQS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (667 aa) initn: 526 init1: 360 opt: 798 Z-score: 694.3 bits: 139.4 E(32554): 2.4e-32 Smith-Waterman score: 951; 34.1% identity (59.2% similar) in 625 aa overlap (437-978:53-666) 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT--- : . ..:.: .: .: :. CCDS58 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP 30 40 50 60 70 80 470 480 490 pF1KB8 SSVLLRGPPGCGKT----TVVAAACS-----H------------------LGLHLLKVPC .:::.:::::::: ....: :: : : : .::: CCDS58 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGAECSGMITAHCSFDFSGSNDPPASASQELDLPILKVAA 90 100 110 120 130 140 500 510 520 530 540 550 pF1KB8 SSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHL . . :: : ::. .: .: : .... .: . :. ..: :..: .: CCDS58 PEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QL 150 160 170 180 190 560 570 580 590 600 pF1KB8 LLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQDLPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALT : : ::. ..:...:.: ..: .. : : .:. . .:..: ::..: CCDS58 LTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLC 200 210 220 230 240 250 610 620 630 640 650 pF1KB8 AHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----A .: : : .. .::. ::: .::.:: ... : .:. :: . . CCDS58 RKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPS 260 270 280 290 300 310 660 670 680 690 pF1KB8 GGLTEE-----------DE--------------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHS :. :: :: .: :. . .:: :: ..: . . CCDS58 KGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-A 320 330 340 350 360 370 700 710 720 730 740 pF1KB8 QAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLPLEHPELL-SLGLRR-SGLLLHGPPGTG . : .:.:.: :.:.:.....:. .: :...:. . .::: .:.:: :::: : CCDS58 KREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCG 380 390 400 410 420 430 750 760 770 780 790 800 pF1KB8 KTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLA :::::::::.: .:.:.:::::::.:::::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: CCDS58 KTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALC 440 450 460 470 480 490 810 820 830 840 850 860 pF1KB8 PSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVF : : : :. :::.:::.:.:::.. :.::...::::::..:::.:::::.:: .: CCDS58 PRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLF 500 510 520 530 540 550 870 880 890 900 910 920 pF1KB8 VG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMT :: :: . :.... : :. .:.: . : : : ::::: .: .: CCDS58 VGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASI 560 570 580 590 600 610 930 940 950 960 970 980 pF1KB8 AALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC ::.... . : : : : .. . . .: ... :.:... . :.:.:.... CCDS58 CALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR 620 630 640 650 660 >>CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (750 aa) initn: 557 init1: 360 opt: 798 Z-score: 693.6 bits: 139.4 E(32554): 2.6e-32 Smith-Waterman score: 1000; 35.1% identity (61.4% similar) in 598 aa overlap (437-978:163-749) 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT--- : . ..:.: .: .: :. CCDS15 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP 140 150 160 170 180 190 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 SSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRP .:::.:::::::: .. : ..: : .::: . . :: : ::. .: .: : CCDS15 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP 200 210 220 230 240 250 530 540 550 560 570 pF1KB8 AVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHLLLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQD .... .: . :. ..: :..: .:: : ::. ..:...:.: .. CCDS15 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS 260 270 280 290 300 580 590 600 610 620 630 pF1KB8 LPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLY : .. : : .:. . .:..: ::..: .: : : .. .::. ::: .::. CCDS15 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM 310 320 330 340 350 360 640 650 660 pF1KB8 ALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----AGGLTEE-----------DE-------- :: ... : .:. :: . . :. :: :: CCDS15 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL 370 380 390 400 410 420 670 680 690 700 710 pF1KB8 ------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEIL .: :. . .:: :: ..: . .. : .:.:.: :.:.:.....:. CCDS15 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT 430 440 450 460 470 480 720 730 740 750 760 770 pF1KB8 ETIQLPLEHPELL-SLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM .: :...:. . .::: .:.:: :::: ::::::::::.: .:.:.:::::::.:: CCDS15 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM 490 500 510 520 530 540 780 790 800 810 820 830 pF1KB8 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL :::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: : : : :. :::.:::.:.::: CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL 550 560 570 580 590 600 840 850 860 870 880 890 pF1KB8 HSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEP .. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :. CCDS15 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA 610 620 630 640 650 660 900 910 920 930 940 950 pF1KB8 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED .:.: . : : : ::::: .: .: ::.... . : : : : .. . CCDS15 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH 670 680 690 700 710 720 960 970 980 pF1KB8 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC . .: ... :.:... . :.:.:.... CCDS15 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR 730 740 750 >>CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (765 aa) initn: 557 init1: 360 opt: 798 Z-score: 693.5 bits: 139.4 E(32554): 2.6e-32 Smith-Waterman score: 1000; 35.1% identity (61.4% similar) in 598 aa overlap (437-978:178-764) 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT--- : . ..:.: .: .: :. CCDS58 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP 150 160 170 180 190 200 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 SSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRP .:::.:::::::: .. : ..: : .::: . . :: : ::. .: .: : CCDS58 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP 210 220 230 240 250 260 530 540 550 560 570 pF1KB8 AVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHLLLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQD .... .: . :. ..: :..: .:: : ::. ..:...:.: .. CCDS58 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS 270 280 290 300 310 320 580 590 600 610 620 630 pF1KB8 LPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLY : .. : : .:. . .:..: ::..: .: : : .. .::. ::: .::. CCDS58 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM 330 340 350 360 370 380 640 650 660 pF1KB8 ALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----AGGLTEE-----------DE-------- :: ... : .:. :: . . :. :: :: CCDS58 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL 390 400 410 420 430 440 670 680 690 700 710 pF1KB8 ------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEIL .: :. . .:: :: ..: . .. : .:.:.: :.:.:.....:. CCDS58 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT 450 460 470 480 490 500 720 730 740 750 760 770 pF1KB8 ETIQLPLEHPELL-SLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM .: :...:. . .::: .:.:: :::: ::::::::::.: .:.:.:::::::.:: CCDS58 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM 510 520 530 540 550 560 780 790 800 810 820 830 pF1KB8 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL :::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: : : : :. :::.:::.:.::: CCDS58 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL 570 580 590 600 610 620 840 850 860 870 880 890 pF1KB8 HSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEP .. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :. CCDS58 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA 630 640 650 660 670 680 900 910 920 930 940 950 pF1KB8 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED .:.: . : : : ::::: .: .: ::.... . : : : : .. . CCDS58 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH 690 700 710 720 730 960 970 980 pF1KB8 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC . .: ... :.:... . :.:.:.... CCDS58 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR 740 750 760 >>CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (856 aa) initn: 557 init1: 360 opt: 798 Z-score: 692.8 bits: 139.5 E(32554): 2.9e-32 Smith-Waterman score: 1000; 35.1% identity (61.4% similar) in 598 aa overlap (437-978:269-855) 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT--- : . ..:.: .: .: :. CCDS15 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 SSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRP .:::.:::::::: .. : ..: : .::: . . :: : ::. .: .: : CCDS15 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 pF1KB8 AVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHLLLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQD .... .: . :. ..: :..: .:: : ::. ..:...:.: .. CCDS15 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS 360 370 380 390 400 410 580 590 600 610 620 630 pF1KB8 LPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLY : .. : : .:. . .:..: ::..: .: : : .. .::. ::: .::. CCDS15 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM 420 430 440 450 460 470 640 650 660 pF1KB8 ALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----AGGLTEE-----------DE-------- :: ... : .:. :: . . :. :: :: CCDS15 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL 480 490 500 510 520 530 670 680 690 700 710 pF1KB8 ------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEIL .: :. . .:: :: ..: . .. : .:.:.: :.:.:.....:. CCDS15 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT 540 550 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 pF1KB8 ETIQLPLEHPELL-SLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM .: :...:. . .::: .:.:: :::: ::::::::::.: .:.:.:::::::.:: CCDS15 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM 600 610 620 630 640 650 780 790 800 810 820 830 pF1KB8 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL :::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: : : : :. :::.:::.:.::: CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL 660 670 680 690 700 710 840 850 860 870 880 890 pF1KB8 HSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEP .. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :. CCDS15 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA 720 730 740 750 760 770 900 910 920 930 940 950 pF1KB8 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED .:.: . : : : ::::: .: .: ::.... . : : : : .. . 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CCDS15 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR 830 840 850 >>CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226 aa) initn: 642 init1: 353 opt: 784 Z-score: 678.5 bits: 137.3 E(32554): 1.8e-31 Smith-Waterman score: 804; 42.9% identity (73.9% similar) in 329 aa overlap (617-943:709-1017) 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAA ...: ..:.. .:::. :. .:. .:: CCDS64 HIQPPNQEQRCEILCNVIKNKLDCDINKFTDLDLQHVAKETGGFVARDFTVLV---DRAI 680 690 700 710 720 730 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 CTRIKNSGLAGGLTEEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHD .:.. .... :.: . : . :: .::. . : ..:. : ...: CCDS64 HSRLSRQSIS---TREK--------LVLTTLDFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDK 740 750 760 770 780 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 VGGLQEVKKEILETIQLPLEHPELLS-LGLR-RSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLT .:::.::.. ...::::: ..:::.. : .: :.:.::.::::::::::: ..: : .. 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