FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1862, 381 aa 1>>>pF1KE1862 381 - 381 aa - 381 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0373+/-0.000863; mu= 13.9216+/- 0.052 mean_var=91.2376+/-18.137, 0's: 0 Z-trim(108.4): 17 B-trim: 16 in 1/49 Lambda= 0.134273 statistics sampled from 10162 (10173) to 10162 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16 Scan time: 2.830 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3180.1 PTX3 gene_id:5806|Hs108|chr3 ( 381) 2572 508.2 4.8e-144 CCDS5657.1 NPTX2 gene_id:4885|Hs108|chr7 ( 431) 387 85.0 1.4e-16 CCDS32762.1 NPTX1 gene_id:4884|Hs108|chr17 ( 432) 361 80.0 4.5e-15 CCDS33647.1 NPTXR gene_id:23467|Hs108|chr22 ( 500) 347 77.3 3.3e-14 CCDS32362.1 PTX4 gene_id:390667|Hs108|chr16 ( 473) 304 69.0 1e-11 >>CCDS3180.1 PTX3 gene_id:5806|Hs108|chr3 (381 aa) initn: 2572 init1: 2572 opt: 2572 Z-score: 2699.6 bits: 508.2 E(32554): 4.8e-144 Smith-Waterman score: 2572; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MHLLAILFCALWSAVLAENSDDYDLMYVNLDNEIDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MHLLAILFCALWSAVLAENSDDYDLMYVNLDNEIDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 IMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDEL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 LQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 TAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 SYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 IVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHIR 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 GNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS ::::::::::::::::::::: CCDS31 GNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS 370 380 >>CCDS5657.1 NPTX2 gene_id:4885|Hs108|chr7 (431 aa) initn: 326 init1: 151 opt: 387 Z-score: 411.3 bits: 85.0 E(32554): 1.4e-16 Smith-Waterman score: 387; 29.7% identity (60.7% similar) in 300 aa overlap (85-377:131-416) 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 EWDKLFIMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESL-ARPCAPGAPAEAR- :: :...: : ..: : : :.. : CCDS56 KARGAGATGKDTMGDLPRDPGHVVEQLSRSLQTLKDRLESLEHQLRANVSNAGLPGDFRE 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 pF1KE1 -LTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAG---RALAAVLEELRQTRADLHAVQG : . : :: :. :..:..: .. .:.. . ..:. : : ..:. .: CCDS56 VLQQRLGEL---ERQLLRKVAELEDEKSLLHNETSAHRQKTESTLNALLQRVTELE--RG 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 WAARSWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYG .: . : . .... :.:.. ..:... . : .: .:. :.:.... . :::. CCDS56 NSAFK-SPDAFKVSL--PLRTNYLYGKIKKTLP-ELYAFTICLWLRSSASPGIGTPFSYA 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 TKRNPYEIQLY-LSYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNG . . :: : . . : .... . .: .:: :.: :.: ::....:. . .: CCDS56 VPGQANEIVLIEWGNNPIELLINDKVAQL--PLFVSDGKWHHICVTWTTRDGMWEAFQDG 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 ELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEE : .: ..: : . ::.: .:::.. ::: :: : :: :.:. ::::: :: .: CCDS56 EKLGTGENLAPWHPIKPGGVLILGQEQD--TVGGRFDATQAFVGELSQFNIWDRVLRAQE 330 340 350 360 370 380 350 360 370 380 pF1KE1 IRETGGAESCHIRGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS : . .. : .. :::. : .... ::: CCDS56 IVNIANC-STNMPGNIIPWVDNNVDVFGGASKWPVETCEERLLDL 390 400 410 420 430 >>CCDS32762.1 NPTX1 gene_id:4884|Hs108|chr17 (432 aa) initn: 222 init1: 172 opt: 361 Z-score: 384.1 bits: 80.0 E(32554): 4.5e-15 Smith-Waterman score: 376; 27.6% identity (61.0% similar) in 272 aa overlap (114-377:159-420) 90 100 110 120 130 pF1KE1 ELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDELLQATRDAGRR--LARM----EGA :..: .:::. : .: :.:. :: CCDS32 TLSQLGQTLQSLKTRLENLEQYSRLNSSSQTNSLKDLLQSKIDELERQVLSRVNTLEEGK 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 EAQRPEEAGRA-LAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSV . : . :. . ..: :.: ..:. : .. : : . . ::.:.. ....: CCDS32 GGPRNDTEERVKIETALTSLHQRISELEKGQ----KDNRP-GDKFQLTFPLRTNYMYAKV 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 HPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLY-LSYQSIVFVVGGEENK . : .. .:..:.:.:.. . . :::.. . :. : . . . .... . : CCDS32 KKSLP-EMYAFTVCMWLKSSATPGVGTPFSYAVPGQANELVLIEWGNNPMEILINDKVAK 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 LVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKN : ... :.: :.: ::....:. . .: ... ..: : . :.: .:::.. 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CCDS33 GRCESGLPRGLQGAGPRRDTMADGPWDSPALILELEDAVRALRDRIDRLEQELPARVNLS 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 ARPCAPGAPAEARLTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQ- : : :: . . . : : .:.: :. ::.. . : .: ::. .. :: CCDS33 AAP-APVSAVPTGLHSKMDQL------EGQLLAQVLALEKERV-----ALSHSSRRQRQE 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 TRADLHAVQGWAAR------SWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIW .. .: ..:: .:. .. : : .:.:.. ... :. . : .: .:.::.: CCDS33 VEKELDVLQGRVAELEHGSSAYSPPDA-FKISIPIRNNYMYARVRKALP-ELYAFTACMW 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 pF1KE1 VKA-TDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYLS-YQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSL--GRWT ... .. .. :::.. . :: : . .. . ... : ::. .:: . : CCDS33 LRSRSSGTGQGTPFSYSVPGQANEIVLLEAGHEPMELLI----NDKVAQLPLSLKDNGWH 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 HLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLA :.: .:....:: : . .::: .. ..:. : . ::: .:::.. .:: :: : : CCDS33 HICIAWTTRDGLWSAYQDGELQGSGENLAAWHPIKPHGILILGQEQD--TLGGRFDATQA 390 400 410 420 430 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 FSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCH--IRGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS : : .. ::.:: .:. .. : .: . ::.. : .. ::: CCDS33 FVGDIAQFNLWDHALTPAQVL---GIANCTAPLLGNVLPWEDKLVEAFGGATKAAFDVCK 440 450 460 470 480 490 CCDS33 GRAKA 500 >>CCDS32362.1 PTX4 gene_id:390667|Hs108|chr16 (473 aa) initn: 286 init1: 154 opt: 304 Z-score: 323.8 bits: 69.0 E(32554): 1e-11 Smith-Waterman score: 330; 31.3% identity (53.3% similar) in 319 aa overlap (64-348:126-434) 40 50 60 70 80 pF1KE1 IDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLFIMLENSQMR--ERMLLQATDDVLRGELQRLR-- : ::.: :: .: :.:. : ::. CCDS32 LAQLKAWVRKLQRRGRKVDTRLRALDLTLGERSQQRARERKAHKAQRDALQDSLARLEGL 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 --EELGRLAESLAR-PCA-PGA----PAEARLTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQR . .::: .: : : ::. :: . . .:: .. : ....: .: CCDS32 VHSQGARLAALEGRLPVAHPGTAALGPALVPTPTQPEELGPTSLKLQRDRQELRAASEHR 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 pF1KE1 --PEEAGRALAAVLEELRQTRAD-LHAV-QGWAAR-----SWLPA------GCETAILFP :... .: :. :. :. : : .: : . .: : : ...:: CCDS32 GPPQDS----SAPLQGRREPPASGSHRVLSGTAPKDPRQQAWSPQVPGEICGVGPTLVFP 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 pF1KE1 MRSKK--IFGSVHPVRPMRLESFSACIWVK-ATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLY---- : . .: : : .: :: : ::. :. :. :.::.:. : .. :. CCDS32 NASTRNVVFLSPGFVTALRALSF--CSWVRTASGRLG--TLLSYATEDNDNKLVLHGRDS 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LSYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATG : :: ::.: . . .. :.: :.: :.: .: : :. .:.:: .. : CCDS32 LLPGSIHFVIGDPAFRELPLQLLLDGQWHHICVIWTSTQGRYWLHVDRRLVATGSRFREG 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 HIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHI . .: :: : .:::... :::::: . :: : ..:. ::: .: :. CCDS32 YEIPPGGSLVLGQEQDS--VGGGFDSSEAFVGSMSGLAIWDRALVPGEVANLAIGKEFPT 390 400 410 420 430 440 360 370 380 pF1KE1 RGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS CCDS32 GAILTLANAALAGGFVQGANCTCLERCP 450 460 470 381 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:12:06 2016 done: Sun Nov 6 21:12:06 2016 Total Scan time: 2.830 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]