Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2067
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2067, 726 aa
1>>>pF1KE2067 726 - 726 aa - 726 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0504+/-0.000365; mu= 3.2717+/- 0.023
mean_var=220.2816+/-44.684, 0's: 0 Z-trim(120.7): 57 B-trim: 1488 in 1/56
Lambda= 0.086414
statistics sampled from 37594 (37652) to 37594 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 6.300
The best scores are: opt bits E(92320)
XP_011530804 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform X ( 726) 4748 605.2 3.1e-172
NP_001608 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform a [H ( 726) 4748 605.2 3.1e-172
NP_001171983 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform a ( 726) 4748 605.2 3.1e-172
NP_059522 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform e [H ( 643) 3859 494.4 6.6e-139
NP_059516 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform b [H ( 559) 3538 454.3 6.6e-127
NP_001171984 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform f ( 575) 3538 454.3 6.7e-127
XP_024303566 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
NP_058432 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin isof ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303563 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303562 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303564 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
NP_001307521 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
NP_001307522 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303570 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303565 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303567 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
NP_001307520 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303568 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
XP_024303569 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 706) 2317 302.1 5.3e-81
NP_001112 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin isof ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
XP_024303572 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
NP_063968 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin isof ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
XP_024303574 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
XP_024303575 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
XP_024303571 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
XP_024303573 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 674) 2288 298.5 6.2e-80
NP_001341684 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 737) 2122 277.8 1.1e-73
NP_001110 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin isof ( 737) 2122 277.8 1.1e-73
XP_016863195 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 737) 2122 277.8 1.1e-73
NP_001341683 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 737) 2122 277.8 1.1e-73
NP_001307523 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 628) 2006 263.3 2.3e-69
XP_024303576 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 628) 2006 263.3 2.3e-69
XP_024303578 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 596) 1977 259.7 2.6e-68
XP_024303577 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin i ( 596) 1977 259.7 2.6e-68
NP_054909 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin isof ( 631) 1973 259.2 3.9e-68
NP_001341687 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 631) 1973 259.2 3.9e-68
NP_001341686 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 631) 1973 259.2 3.9e-68
XP_016863198 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 631) 1973 259.2 3.9e-68
NP_001273574 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 662) 1849 243.8 1.8e-63
NP_001341688 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 662) 1849 243.8 1.8e-63
NP_001341685 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 768) 1849 243.8 2.1e-63
XP_016863194 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 768) 1849 243.8 2.1e-63
NP_789771 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin isof ( 662) 1620 215.2 7.2e-55
XP_024309655 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 662) 1620 215.2 7.2e-55
NP_001341691 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 693) 1620 215.2 7.5e-55
NP_054908 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin isof ( 768) 1620 215.3 8.1e-55
XP_016863193 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 768) 1620 215.3 8.1e-55
XP_016863192 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 799) 1620 215.3 8.3e-55
NP_001341690 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 799) 1620 215.3 8.3e-55
XP_005247991 (OMIM: 102680,145500) alpha-adducin i ( 799) 1620 215.3 8.3e-55
>>XP_011530804 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform X1 [H (726 aa)
initn: 4748 init1: 4748 opt: 4748 Z-score: 3213.7 bits: 605.2 E(92320): 3.1e-172
Smith-Waterman score: 4748; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (1-726:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KEKVES
::::::
XP_011 KEKVES
>>NP_001608 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform a [Homo (726 aa)
initn: 4748 init1: 4748 opt: 4748 Z-score: 3213.7 bits: 605.2 E(92320): 3.1e-172
Smith-Waterman score: 4748; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (1-726:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KEKVES
::::::
NP_001 KEKVES
>>NP_001171983 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform a [Ho (726 aa)
initn: 4748 init1: 4748 opt: 4748 Z-score: 3213.7 bits: 605.2 E(92320): 3.1e-172
Smith-Waterman score: 4748; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (1-726:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KEKVES
::::::
NP_001 KEKVES
>>NP_059522 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform e [Homo (643 aa)
initn: 3839 init1: 3839 opt: 3859 Z-score: 2615.4 bits: 494.4 E(92320): 6.6e-139
Smith-Waterman score: 3859; 98.8% identity (99.0% similar) in 596 aa overlap (1-594:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPE-EPGS-PAKSAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::. : :::: ::
NP_059 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELD---ETGQEREPGSGPAVCEF
550 560 570 580 590
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pF1KE2 ASPVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTA
NP_059 FSVALHIWSNILERKKLPQKSLAHLQSLHLLLQCRAQRRRQRQRAL
600 610 620 630 640
>>NP_059516 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform b [Homo (559 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3538 Z-score: 2400.0 bits: 454.3 E(92320): 6.6e-127
Smith-Waterman score: 3538; 97.3% identity (98.0% similar) in 554 aa overlap (1-554:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:..:
NP_059 NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSP-VEQRLPLT
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
: : : : .::
NP_059 GGE-TCLPSGSSVPGAGLQDP
540 550
>>NP_001171984 (OMIM: 102681) beta-adducin isoform f [Ho (575 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3538 Z-score: 2399.8 bits: 454.3 E(92320): 6.7e-127
Smith-Waterman score: 3538; 97.3% identity (98.0% similar) in 554 aa overlap (1-554:17-568)
10 20 30 40
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPRRRVPGANCKPTGKMSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 FNLMEQKKRVTMILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNLMEQKKRVTMILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 SSMNVSMMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSMNVSMMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QDHFLISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDHFLISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IIHLHTPATAAVSAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIHLHTPATAAVSAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 LVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 VQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 TAFVFEEDGAPVPALRQHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAFVFEEDGAPVPALRQHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ADEVEKSSSGMPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADEVEKSSSGMPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVI
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 AEKSRSPSTESQLMSKGDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKE
::::::: .:..: : : : : .::
NP_001 AEKSRSP-VEQRLPLTGGE-TCLPSGSSVPGAGLQDP
550 560 570
>>XP_024303566 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin isofo (706 aa)
initn: 2569 init1: 1386 opt: 2317 Z-score: 1575.9 bits: 302.1 E(92320): 5.3e-81
Smith-Waterman score: 2545; 54.4% identity (79.3% similar) in 734 aa overlap (1-726:1-706)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQP----YFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTM
:: .. . . ::: ..: ::::..:.::::.: :: . :::::::.:::.::::.
XP_024 MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINENDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPIN
:::::.:::.:: :::::::::.: ... ::.::::.. ..: . : . ....:.::::
XP_024 ILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPTGLLALQQIADYIMANSFSGFSSPPLSLGMVTPIN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVS
:: ::. . .:::.: :::..:.:::.::.:::.:..::...:.::::::..: :.:.:
XP_024 DLPGADTSSYVKGEKLTRCKLASLYRLVDLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPRGLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAV
::.:::.:.::::.::::..::. . .: ::: :.:::..::::.:.::.:: :::::
XP_024 FSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALG
:.:: :.::.:...::.::.::::..: .:.. .::.::: :::.::.::::::::::::
XP_024 SSMKCGILPISQESLLLGDVAYYDYQGSLEEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 DTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRP--HEVGSVQWAGSTFGP
.:.::::. ::..: ::::::.::..::::.:: .:. .:.. . :.. .: ..:
XP_024 ETLEEAFHYIFNVQLACEIQVQALAGAGGVDNLHVLDFQKYKAFTYTVAASGGGGVNMGS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 MQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGA
:: ..:: :::.::: ::::::::::.::::...:: .:::.:::::::::: ::.: .
XP_024 HQKWKVGEIEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRHPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PVPALRQHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSG
:. :. ::.::.:::::::.::::..::: .: . . ::: : :::::.. : :.:
XP_024 PLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMKVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSSKVSGG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 MPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTE
::.::.::::::: :.:.:::: ::::::::: :.:.:::::::::.....: :::
XP_024 TPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDK--PPST-
490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 SQLMSKGDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLEL-DGEKETAPEEPGSP
:. :.: . . :::::.::. ::::::. .:::. : :.:.: .. .:
XP_024 ---MQFEDDD---HGPPAPPNPFSHLTEGELEEYKRTIERKQQGLEDAEQELLSDDASS-
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 AKSAPASPVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGRE
.: .:: .:.:: : : :::. . : . : .::::..
XP_024 -----VSQIQS-----QTQSPQNVPEK-LEENHELFSKSFISMEVPV------MVVNGKD
600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 EEQTAEEILSKGLSQMTTSADTD-VDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTP
. . .:. :.: .:...::. . .. . . :.. .::::::::::::::::::::
XP_024 DMHDVEDELAKRVSRLSTSTTIENIEITIKSPEKIEE-VLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTP
640 650 660 670 680 690
720
pF1KE2 SFLKKSKKKEKVES
:::::.:::::::.
XP_024 SFLKKNKKKEKVEA
700
>>NP_058432 (OMIM: 601568,617008) gamma-adducin isoform (706 aa)
initn: 2569 init1: 1386 opt: 2317 Z-score: 1575.9 bits: 302.1 E(92320): 5.3e-81
Smith-Waterman score: 2545; 54.4% identity (79.3% similar) in 734 aa overlap (1-726:1-706)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSEETVPEAASPPPPQGQP----YFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTM
:: .. . . ::: ..: ::::..:.::::.: :: . :::::::.:::.::::.
NP_058 MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINENDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPIN
:::::.:::.:: :::::::::.: ... ::.::::.. ..: . : . ....:.::::
NP_058 ILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPTGLLALQQIADYIMANSFSGFSSPPLSLGMVTPIN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVS
:: ::. . .:::.: :::..:.:::.::.:::.:..::...:.::::::..: :.:.:
NP_058 DLPGADTSSYVKGEKLTRCKLASLYRLVDLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPRGLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAV
::.:::.:.::::.::::..::. . .: ::: :.:::..::::.:.::.:: :::::
NP_058 FSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALG
:.:: :.::.:...::.::.::::..: .:.. .::.::: :::.::.::::::::::::
NP_058 SSMKCGILPISQESLLLGDVAYYDYQGSLEEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]