FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1932, 470 aa 1>>>pF1KE1932 470 - 470 aa - 470 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4172+/-0.000395; mu= 16.9482+/- 0.024 mean_var=64.7113+/-13.400, 0's: 0 Z-trim(112.3): 76 B-trim: 1084 in 1/49 Lambda= 0.159435 statistics sampled from 21111 (21188) to 21111 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 8.610 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastas ( 470) 3235 753.1 3.6e-217 NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prep ( 477) 1690 397.8 3.5e-110 NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprote ( 476) 1633 384.6 3.1e-106 NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitia ( 469) 1567 369.5 1.1e-101 NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase is ( 467) 1526 360.0 7.8e-99 NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1497 353.4 7.6e-97 XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1497 353.4 7.6e-97 NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1497 353.4 7.6e-97 XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1497 353.4 7.6e-97 XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 476) 1497 353.4 8.1e-97 NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) intersti ( 403) 1472 347.6 3.8e-95 NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase ( 471) 1459 344.6 3.4e-94 NP_004762 (OMIM: 604629,612529) matrix metalloprot ( 483) 1380 326.5 1e-88 XP_011541138 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 377) 1108 263.8 5.7e-70 NP_002414 (OMIM: 178990) matrilysin preproprotein ( 267) 817 196.8 5.9e-50 NP_068573 (OMIM: 605470) matrix metalloproteinase- ( 261) 644 157.0 5.6e-38 XP_011518521 (OMIM: 605470) PREDICTED: matrix meta ( 191) 627 153.1 6.4e-37 NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 628 153.5 1.6e-36 NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 610) 625 152.8 2.4e-36 NP_002420 (OMIM: 601807,611543) matrix metalloprot ( 508) 607 148.7 3.6e-35 NP_002419 (OMIM: 602261) matrix metalloproteinase- ( 669) 606 148.5 5.4e-35 NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 599 146.9 1.5e-34 NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 599 146.9 1.5e-34 NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 599 146.9 1.5e-34 XP_016883086 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 591) 545 134.4 8.1e-31 NP_005931 (OMIM: 185261) stromelysin-3 preproprote ( 488) 538 132.8 2.1e-30 XP_016880550 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 409) 537 132.5 2.1e-30 XP_011523534 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 494) 537 132.6 2.5e-30 XP_016874796 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 434) 526 130.0 1.3e-29 NP_057239 (OMIM: 602285) matrix metalloproteinase- ( 603) 526 130.1 1.7e-29 NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 520 128.7 5.1e-29 XP_016874798 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 366) 510 126.3 1.4e-28 XP_016874797 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 387) 510 126.3 1.5e-28 XP_011536659 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 499 123.8 1.1e-27 XP_011536658 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 499 123.8 1.1e-27 XP_011536657 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 499 123.8 1.1e-27 XP_011526802 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 556) 481 119.7 2.1e-26 XP_016883087 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 614) 481 119.7 2.2e-26 NP_006681 (OMIM: 604871) matrix metalloproteinase- ( 645) 481 119.7 2.3e-26 NP_005932 (OMIM: 602262) matrix metalloproteinase- ( 607) 477 118.8 4.2e-26 XP_016880552 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 468 116.6 1.2e-25 XP_016880551 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 468 116.6 1.2e-25 XP_016880553 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 468 116.6 1.2e-25 XP_011523533 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 390) 468 116.6 1.2e-25 NP_116568 (OMIM: 608417) matrix metalloproteinase- ( 393) 468 116.6 1.2e-25 XP_011523532 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 418) 468 116.7 1.3e-25 XP_011523528 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 468 116.7 1.3e-25 XP_011523531 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 468 116.7 1.3e-25 XP_011523530 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 468 116.7 1.3e-25 XP_011523529 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 468 116.7 1.3e-25 >>NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastase pr (470 aa) initn: 3235 init1: 3235 opt: 3235 Z-score: 4019.8 bits: 753.1 E(85289): 3.6e-217 Smith-Waterman score: 3235; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 KEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 KEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 YTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 LAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 KYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 EPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 EPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 NFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 NFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC 430 440 450 460 470 >>NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prepropr (477 aa) initn: 1514 init1: 807 opt: 1690 Z-score: 2099.1 bits: 397.8 E(85289): 3.5e-110 Smith-Waterman score: 1690; 51.4% identity (77.7% similar) in 479 aa overlap (1-470:1-477) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATA-SGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNL :: : :::: .: .: ::.... : ... . ..:::..: :. . .. : :: . NP_002 MKSLPILLLLCVAVCSAYPLDGAARGEDTSMNLVQKYLENYYDLKKDVKQFVRRKDSGPV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 MKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRIN .: ::.:::.::::.:::.::..:::.:. :::::::: ::: .:: : ::: ..:::: NP_002 VK-KIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHFRTFPGIPKWRKTHLTYRIV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGG :::::. .. :: :..::..:: .:::: ::.. : :::.. :: ::::. ::: :. NP_002 NYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFDGPGN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 ILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPT .::::..:: ::.::::::.:: :: . ::::::.:.::::::::: ::.. .:.:.: NP_002 VLAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWTKDTTGTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANTEALMYPL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 YKYV-DINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLP-------NPDNSEPALCDPNLSFDAV :. . :.. :::: ::: ::::::: : .. . : :. . :: ::: :::::: NP_002 YHSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGPPPDSPETPLVPTEPVPPEPGTPANCDPALSFDAV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDK .:. ..:..:::: :: : .. . ..::::.::.::::..::::. ... ::.:: .. NP_002 STLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 YWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMD .: : . . . .::..::..::: :.:::::. . . .:::::...:::.::.:. :. NP_002 FWAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSME 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 PGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC ::.:: :...: :: :::::: . ..::: ::.:.:.: ...:.:::::::..: NP_002 PGFPKQIAEDFPGIDSKIDAVF-EEFGFFYFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC 420 430 440 450 460 470 >>NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprotein [ (476 aa) initn: 1672 init1: 794 opt: 1633 Z-score: 2028.3 bits: 384.6 E(85289): 3.1e-106 Smith-Waterman score: 1633; 49.3% identity (76.4% similar) in 479 aa overlap (1-470:2-476) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYS-GN :.. ...:: . .: ::..... : .: ....::::.:.:: . : ... . .: NP_002 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKD---VKQFRRKDSN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRI :. .::: ::.::::.:::.:::.:::.:. :::::::: :: .:: : ::: ..:::: NP_002 LIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKG :::::. :. :: ::.::..:: .:::: ::.. : :::.. :: ::::..::: : NP_002 VNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFP ::::. :: :. :: :::.:: :: ..::::::.:.::.:::::: ::.. .:.:.: NP_002 HSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 TYK-YVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLP------NPDNSE-PALCDPNLSFDA :. .... :::: ::. ::::::: : . . : :..:: :: ::: ::::: NP_002 LYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VTTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDD ..:. .. .:::::.:: . :. .:::..::.::: ..::::...:. ::.:: . NP_002 ISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 KYWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMM ..: : . . . .::..::..::: ..:::::: . . .::::. ..:::.:: : : NP_002 EFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSM 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DPGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC . :.:.::. .: :. ::.:::. . . ..:::.::.:::.: . .:. ::::::. : NP_002 EQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFG-FFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC 420 430 440 450 460 470 >>NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial co (469 aa) initn: 1389 init1: 738 opt: 1567 Z-score: 1946.3 bits: 369.5 E(85289): 1.1e-101 Smith-Waterman score: 1567; 49.1% identity (75.6% similar) in 468 aa overlap (4-470:7-466) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSG ::.::. ...: ..: .. ....: . ..::::.:.:. . : : . :: NP_002 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFP--ATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYR .. ::...::.:.::::::. :. ::..:. :::::::: .: :.: :.. ..::: NP_002 PVV-EKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 INNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGK :.:::::. : :::.::.::::.::::::: :.:.. :.:::.. :.:: : : ::: NP_002 IENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMF :: ::::: :: :::::::::::: ::.. :: .:.::.::::::.::.: :.:. NP_002 GGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNK :.: . . .:. ::: :::..:: .. . .:.. : :: .:.:::.::. .. NP_002 PSYTFS--GDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQT--PKACDSKLTFDAITTIRGE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 IFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISN ..::::::. :.. .:.:: .:: ::.:.:::::. :..: .:: .::: ... NP_002 VMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LRPEPNYPKSIHS-FGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPK .:::.:.: :::: ::.::::. . .::::: :.:::::: .. ::::::: NP_002 QNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC .:...: ::: :.::::. :. ..:::.:. :...: .:: :.::::.: NP_002 MIAHDFPGIGHKVDAVFM-KDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN 420 430 440 450 460 >>NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase isofor (467 aa) initn: 1411 init1: 797 opt: 1526 Z-score: 1895.4 bits: 360.0 E(85289): 7.8e-99 Smith-Waterman score: 1526; 47.6% identity (75.6% similar) in 468 aa overlap (5-470:9-464) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYS ..:::.. : :.:..:. :::. . :::::: : :. :. : . NP_002 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSSK---EKNTKTV-QDYLEKFYQLPSNQYQSTR-KNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITY :.. ::..:::.:.::.:::. . ::.::. ::::::: : ::.: :.. .:: NP_002 TNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 RINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDG :: ::::.... .:. ::. ::..:: ..:: :..:. : ::: ..: . ::: ::: NP_002 RIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVM .::::::: ::.::::::::: .: ::. :.. ::::.:.::.::::::.::::: :.: NP_002 PNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGN .:.: . . ... : ::: :::..:: .. . .:.. .: :::.:.:::.::. . 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XP_016 SNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKP--CDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRY 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRPEPNYP :: . . .. .:.:: .::.::.::.:::: :. .:::: ..:: .:. .:: XP_016 FWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYP 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 KSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITKNFQGI :.: ..:::. :. :::::: .:::::..:.::::..::.:.::::: :. : :: XP_016 KDISNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGI 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 pF1KE1 GPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC :.:::: ....... :.: . .:.. ::.:.. ..:.:..: XP_016 ESKVDAVF-QQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 400 410 420 430 440 >>XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (476 aa) initn: 1411 init1: 797 opt: 1497 Z-score: 1859.2 bits: 353.4 E(85289): 8.1e-97 Smith-Waterman score: 1497; 48.5% identity (76.6% similar) in 435 aa overlap (36-470:45-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 ILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLMKEKIQ :::::: : :. :. : . :.. ::.. XP_011 KIQKLFSTRPSQKPTRCSHLILDFPASRIDYLEKFYQLPSNQYQSTR-KNGTNVIVEKLK 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 EMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINNYTPDM :::.:.::.:::. . ::.::. ::::::: : ::.: :.. .:::: ::::.. XP_011 EMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQL 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 NREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGILAHAF .. .:. ::. ::..:: ..:: :..:. : ::: ..: . ::: ::: .::::::: XP_011 SEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAF 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 GPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTYKYVDI ::.::::::::: .: ::. :.. ::::.:.::.::::::.::::: :.:.:.: . . XP_011 QPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRET 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFFFKDRF ... : ::: :::..:: .. . .:.. .: :::.:.:::.::. ..:.:::::. 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