FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1939, 481 aa 1>>>pF1KE1939 481 - 481 aa - 481 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6129+/-0.00042; mu= 16.0139+/- 0.026 mean_var=65.2066+/-12.938, 0's: 0 Z-trim(110.6): 30 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.158829 statistics sampled from 19028 (19049) to 19028 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 9.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-bindin ( 481) 3090 717.2 2.4e-206 NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability ( 487) 1419 334.4 4.5e-91 XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34 XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34 XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34 NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing famil ( 507) 588 143.9 9.7e-34 NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 493) 532 131.1 6.9e-30 XP_016884229 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 450) 453 113.0 1.8e-24 NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 405) 410 103.1 1.5e-21 XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 455) 362 92.1 3.4e-18 NP_000069 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl ester ( 493) 343 87.8 7.5e-17 NP_872617 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 441) 313 80.9 8e-15 NP_001229849 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 398) 306 79.3 2.2e-14 XP_006721187 (OMIM: 118470,143470) PREDICTED: chol ( 266) 262 69.1 1.7e-11 NP_872599 (OMIM: 615717) BPI fold-containing famil ( 476) 264 69.7 2e-11 NP_777557 (OMIM: 614110) BPI fold-containing famil ( 453) 263 69.5 2.3e-11 XP_016883152 (OMIM: 614110) PREDICTED: BPI fold-co ( 469) 263 69.5 2.4e-11 NP_001273014 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl est ( 433) 262 69.2 2.6e-11 >>NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-binding pr (481 aa) initn: 3090 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3825.5 bits: 717.2 E(85289): 2.4e-206 Smith-Waterman score: 3090; 99.8% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 AELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 V : NP_004 V >>NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability-inc (487 aa) initn: 1328 init1: 920 opt: 1419 Z-score: 1756.1 bits: 334.4 E(85289): 4.5e-91 Smith-Waterman score: 1419; 44.8% identity (79.5% similar) in 469 aa overlap (12-478:18-486) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSEL :..:. .: . ..:::.:.::..:::.::.:.: :::.:: NP_001 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAVNPGVVVRISQKGLDYASQQGTAALQKEL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LRITLPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQG :: .::.. ...: :.:.:.: :.:..:. .: : . ::. ::..:::...:...: NP_001 KRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANIKISG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 RWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSE-SSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMS-G .::..: :.:..:.::.:..:.:::..: :::. .::.::.: ::::: : .:.: .: . 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XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK :::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. : XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL ::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::.. XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GANVQYMRV .....: XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 480 490 500 >>XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa) initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34 Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT :: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : . XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW :::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. : XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW .. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:. XP_011 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP : : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .: XP_011 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE . : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::... XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS : .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:.. XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK :::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. : XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL ::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::.. XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GANVQYMRV .....: XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 480 490 500 >>NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing family C (507 aa) initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34 Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT :: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : . NP_777 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW :::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. : NP_777 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW .. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:. NP_777 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP : : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .: NP_777 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE . : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::... NP_777 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS : .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:.. NP_777 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK :::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. : NP_777 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL ::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::.. NP_777 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GANVQYMRV .....: NP_777 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 480 490 500 >>NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer protein (493 aa) initn: 408 init1: 274 opt: 532 Z-score: 657.6 bits: 131.1 E(85289): 6.9e-30 Smith-Waterman score: 532; 24.6% identity (60.0% similar) in 467 aa overlap (14-480:6-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP ::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.: NP_006 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK :. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : .. NP_006 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :: : ...:..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . .. NP_006 WFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA . . : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :.. NP_006 LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN . :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :. NP_006 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP . .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... NP_006 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN . .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . NP_006 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR :.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... . NP_006 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 V NP_006 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 470 480 490 >>XP_016884229 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (450 aa) initn: 348 init1: 184 opt: 453 Z-score: 560.4 bits: 113.0 E(85289): 1.8e-24 Smith-Waterman score: 453; 27.8% identity (67.2% similar) in 299 aa overlap (12-308:14-309) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT :: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : . XP_016 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW :::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. : XP_016 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW .. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:. XP_016 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP : : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .: XP_016 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE . : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::... XP_016 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNL : .: ... . : XP_016 GVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES 300 310 320 330 340 350 >>NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer prot (405 aa) initn: 306 init1: 274 opt: 410 Z-score: 507.9 bits: 103.1 E(85289): 1.5e-21 Smith-Waterman score: 410; 22.5% identity (60.8% similar) in 378 aa overlap (103-480:2-378) 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 RGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVS :.:...:. .. : .. :: : ...: NP_001 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINAS 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 VKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKV ..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ... . : : .. . NP_001 AEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFL 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATAQMLEVMFKGEIF :...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .: NP_001 LNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFF 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 HRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDS ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: : NP_001 PLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDL 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 NIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPS .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... . .. :. NP_001 DMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 SSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYI . . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . :.: :. .. NP_001 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 pF1KE1 LNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... . NP_001 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA 340 350 360 370 380 390 NP_001 DVRASTAPTPSTAAV 400 >>XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (455 aa) initn: 348 init1: 184 opt: 362 Z-score: 447.6 bits: 92.1 E(85289): 3.4e-18 Smith-Waterman score: 401; 22.4% identity (58.1% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-426) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT :: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : . XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW :::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. : XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW .. .: : .:: ..: XP_011 GFESPLFVLYNSF--------------------AEP------------------------ 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .: XP_011 --------MEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE . : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::... XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS : .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:.. XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK :::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. : XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL ::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::.. XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI 370 380 390 400 410 420 480 pF1KE1 GANVQYMRV .....: XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 430 440 450 481 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:17:28 2016 done: Sun Nov 6 21:17:29 2016 Total Scan time: 9.550 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]