FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1939, 481 aa 1>>>pF1KE1939 481 - 481 aa - 481 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5809+/-0.000978; mu= 15.9266+/- 0.059 mean_var=60.9596+/-12.059, 0's: 0 Z-trim(103.5): 25 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.164268 statistics sampled from 7443 (7454) to 7443 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16 Scan time: 3.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 ( 481) 3090 741.1 5.9e-214 CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 ( 487) 1419 345.1 9.8e-95 CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 ( 507) 588 148.2 1.9e-35 CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 493) 532 134.9 1.9e-31 CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 405) 410 106.0 7.9e-23 CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 493) 343 90.1 5.7e-18 CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 441) 313 83.0 7.1e-16 CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 398) 306 81.3 2e-15 CCDS13212.1 BPIFB3 gene_id:359710|Hs108|chr20 ( 476) 264 71.4 2.4e-12 CCDS13211.1 BPIFB6 gene_id:128859|Hs108|chr20 ( 453) 263 71.2 2.7e-12 CCDS67032.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 433) 262 70.9 3e-12 >>CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 (481 aa) initn: 3090 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3954.6 bits: 741.1 E(32554): 5.9e-214 Smith-Waterman score: 3090; 99.8% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 AELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 V : CCDS13 V >>CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 (487 aa) initn: 1328 init1: 920 opt: 1419 Z-score: 1814.3 bits: 345.1 E(32554): 9.8e-95 Smith-Waterman score: 1419; 44.8% identity (79.5% similar) in 469 aa overlap (12-478:18-486) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSEL :..:. .: . ..:::.:.::..:::.::.:.: :::.:: CCDS13 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAVNPGVVVRISQKGLDYASQQGTAALQKEL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LRITLPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQG :: .::.. ...: :.:.:.: :.:..:. .: : . ::. ::..:::...:...: CCDS13 KRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANIKISG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 RWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSE-SSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMS-G .::..: :.:..:.::.:..:.:::..: :::. .::.::.: ::::: : .:.: .: . CCDS13 KWKAQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPTSGKPTITCSSCSSHINSVHVHISKS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DLGWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL .:::..:::..::: ... ..:..:: . .::::.::::.::::: :.::: : :.:.: CCDS13 KVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKIDSVAGINYGL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV : : .::. :.:..:::.. .::..: . :: .: :..:::...::: ::::.:: CCDS13 VAPPATTAETLDVQMKGEFYSENHHNPPPFAPPVMEFPAAHDRMVYLGLSDYFFNTAGLV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS :.: : :.... ::::: .:..::::: : :.:..:. .:::..... :. . : :. . CCDS13 YQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGTFLPEVAKKFPNMKIQIHVSASTPPHLSVQ 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK : .:. : ....::..::.:: .: ... :. : .. ......: :: .. .::: CCDS13 PTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESNRLVGELKLDRLLLELK 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL .:..: : .:::. ..:: . . :. :.:: .::::: :::::.. :: :..::.. CCDS13 HSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFPLPTPARVQLYNVVLQPHQNFLLF 430 440 450 460 470 480 480 pF1KE1 GANVQYMRV ::.: : CCDS13 GADVVYK >>CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 (507 aa) initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 749.7 bits: 148.2 E(32554): 1.9e-35 Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT :: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : . CCDS13 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW :::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. : CCDS13 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW .. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:. CCDS13 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP : : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .: CCDS13 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE . : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::... CCDS13 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS : .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:.. CCDS13 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK :::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. : CCDS13 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL ::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::.. CCDS13 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GANVQYMRV .....: CCDS13 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP 480 490 500 >>CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (493 aa) initn: 408 init1: 274 opt: 532 Z-score: 678.2 bits: 134.9 E(32554): 1.9e-31 Smith-Waterman score: 532; 24.6% identity (60.0% similar) in 467 aa overlap (14-480:6-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP ::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.: CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK :. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : .. CCDS13 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :: : ...:..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . .. CCDS13 WFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA . . : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :.. CCDS13 LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN . :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :. CCDS13 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP . .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... CCDS13 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN . .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . CCDS13 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR :.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... . CCDS13 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 V CCDS13 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 470 480 490 >>CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (405 aa) initn: 306 init1: 274 opt: 410 Z-score: 523.3 bits: 106.0 E(32554): 7.9e-23 Smith-Waterman score: 410; 22.5% identity (60.8% similar) in 378 aa overlap (103-480:2-378) 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 RGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVS :.:...:. .. : .. :: : ...: CCDS56 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINAS 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 VKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKV ..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ... . : : .. . CCDS56 AEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFL 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATAQMLEVMFKGEIF :...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .: CCDS56 LNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFF 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 HRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDS ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: : CCDS56 PLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDL 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 NIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPS .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... . .. :. CCDS56 DMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 SSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYI . . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . :.: :. .. CCDS56 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 pF1KE1 LNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... . CCDS56 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA 340 350 360 370 380 390 CCDS56 DVRASTAPTPSTAAV 400 >>CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 (493 aa) initn: 174 init1: 70 opt: 343 Z-score: 436.1 bits: 90.1 E(32554): 5.7e-18 Smith-Waterman score: 343; 23.2% identity (55.5% similar) in 461 aa overlap (11-461:7-460) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGAN--PGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT . :::: .. . :.. :.: ::: .: .: ..:. . : . CCDS10 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRAS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKV ::.::. . .:. .: .:...: . : .. : ......::.. :. .: : CCDS10 YPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 RKS---FFKLQGSFDVSV-KGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDL . .. .. :.: . ..:....: : . .::: . : .: .. . . ..:. CCDS10 GYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQL-TCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGER 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 --GWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL ::. .:: : : .. ::...::. :. .:. . ..:: .. :. .: :: CCDS10 EPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEIN-VISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV . : ::..:: ::.....: . : . .: . ..:.:: .:. ::.. . : CCDS10 TGDPVITASYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGD-SRMLYFWFSERVFHSLAKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS ..: : .:. : . . : : .: . .. .. . : .: . ..: CCDS10 AFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKIS 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK : .: . . :.: ... . .. .:. . :: ::. .. : CCDS10 CQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPK 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 E-SKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFP-LPLLKRVQLYDLGLQIHKDFL :.. ..: ....:. .: . :. ..: : : : :.:.:. CCDS10 TVSNLTESSSESVQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNSKGVSLFDIINPEIITRD 410 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 FLGANVQYMRV CCDS10 GFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS 470 480 490 >>CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (441 aa) initn: 308 init1: 174 opt: 313 Z-score: 398.5 bits: 83.0 E(32554): 7.1e-16 Smith-Waterman score: 351; 22.5% identity (52.9% similar) in 467 aa overlap (14-480:6-414) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP ::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.: CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK :. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : .. CCDS13 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :.:. .: .:. CCDS13 WFLKV---YD----------------------------------------------FLST 110 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA : : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :.. CCDS13 F---ITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN . :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :. CCDS13 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP . .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... CCDS13 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN . .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . CCDS13 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR :.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... . CCDS13 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 V CCDS13 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 420 430 440 >>CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (398 aa) initn: 308 init1: 174 opt: 306 Z-score: 390.2 bits: 81.3 E(32554): 2e-15 Smith-Waterman score: 306; 22.3% identity (58.8% similar) in 296 aa overlap (185-480:77-371) 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 TASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQ : : .. .:...:: .. .. . :. :. CCDS56 ETITIPDLRGKEGHFYYNISEKVYDFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLD 50 60 70 80 90 100 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 TLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHN :.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .: ..:. :: .:.. CCDS56 TVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEE 110 120 130 140 150 160 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 KMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPN .::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: : .. : . : .: :. . CCDS56 RMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVID 170 180 190 200 210 220 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 MNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFN :.:. : . : ...:.. ... . .. :.. . . ... . .:: ... CCDS56 SPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALR 230 240 250 260 270 280 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 TSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLK . . : . .. ..: . . :.: :. .. ..: .:.. .: .:: . CCDS56 GKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPE 290 300 310 320 330 340 460 470 480 pF1KE1 RVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV ... . : :: .::.... . CCDS56 GINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV 350 360 370 380 390 >>CCDS13212.1 BPIFB3 gene_id:359710|Hs108|chr20 (476 aa) initn: 116 init1: 69 opt: 264 Z-score: 335.2 bits: 71.4 E(32554): 2.4e-12 Smith-Waterman score: 293; 23.5% identity (55.9% similar) in 497 aa overlap (1-472:1-472) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLA---LQSELLRI : . :: :.:: :.. . : . : .::: : : :..:.. ::. : . CCDS13 MQPVMLALWSLLLLWGLATPCQELLETVGTLARIDKDELGKAIQNSLVGEPILQNVLGSV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE1 TLPD---------FTGDLRIPHVGR-GRYE-FHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSI- : . . : . : : : : . .:.:. : . :. .:: :..::. CCDS13 TAVNRGLLGSGGLLGGGGLLGHGGVFGVVEELSGLKIEELTLPKVLLKLLPGFGVQLSLH 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 SDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIAD . ... .: : : ...... .... . :. : : : . . ::. .. CCDS13 TKVGMHCSG---------PLGGLLQLAAE-VNVTSRVALAVSSRGTPILILKRCSTLLGH 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSF . . .:: : :: . .:. . ::: . .: ... :: . .. : .. . . .. CCDS13 ISL-FSGLLP--TPLF-GVVEQMLFKVLPGLLCPVVD-SVLGVVNELLGAVLGLVSLGAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 ADIDYSLVEAPRATAQMLEV----MFK---GEI--FHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKM .....::. : . :..:. . : :.: : .. :.:. ..: .... CCDS13 GSVEFSLATLPLISNQYIELDINPIVKSVAGDIIDFPKS-RAPA-------KVPPKKDHT 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 VYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPR-LARLYPNM . :.:::. . . .: :...:: ...: :.. ::: .. ..:. :..: .. CCDS13 SQVMVPLYLFNTTFGLLQTNGALDMDITPELVP--SDVPLTTTDLAALLPEALGKLPLHQ 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 NLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNT .: : : :: ... . :. .: .. .:... : .:.:. . .: : :. .. CCDS13 QLLLFLRVREAPTVTLHNKKALVSLPANIHVLFYVPKGTPESLFELNSVMTVRAQLAPSA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 SKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKR .:. :. ...:.. : . :.. :: :.. . . ::.: : :.::: . CCDS13 TKLHISLSLERLSVKVASSFTHAFDGSRLEEWLSHVVGAVYAPKLNVALDVGIPLPKVLN 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 VQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV ... . :.: .. . : CCDS13 INFSNSVLEIVENAVVLTVAS 460 470 >>CCDS13211.1 BPIFB6 gene_id:128859|Hs108|chr20 (453 aa) initn: 133 init1: 92 opt: 263 Z-score: 334.2 bits: 71.2 E(32554): 2.7e-12 Smith-Waterman score: 287; 22.7% identity (55.5% similar) in 449 aa overlap (12-451:4-427) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP .: : : : . :.:: . :. :.. : .:..:. . CCDS13 MLRILCLALCSLLTGTRADPGALLRL---GMDIMNQVQSAMDESHILE-KMA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK .: . : . . . .:.... .: .: ::: :. .: ... : : : CCDS13 AEAGK-KQPGM-KPIKGITNLKVKDVQLPVITLNFVPGVGIFQCVS-TGMTVTG-----K 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL :: . :.... : ..: :: .: .: :. . .: ...:.... ... : .. CCDS13 SF--MGGNMEIIVALNITATNRLLRDEETGLPVFKSEGCEVILVNVKTNLPSNM--LPKM 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA .. ..: ..::: . .: :. .: .. .: . ... . : :. :: .:: CCDS13 VNKFLDSTLHKVLPGLMCPAID-AVLVYVNRKWTNLSDPMPVGQMGTVKYVLMSAPATTA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAA--VMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGY ..... :. . ... .. . : : ....:: . : . .: .: :. .... CCDS13 SYIQLDFSPVVQQQKGKT-IKLADAGEALTFPEGYAKGSSQLLLPATFLSAELALLQKSF 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 LNFSITDDMI---PPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMN-LELQGSVPSAPLLNFSPG . .: : :: ::. :::.. :.:..: ::. . : : .. . : .... : CCDS13 -HVNIQDTMIGELPPQ-----TTKTLARFIPEVAVAYPKSKPLTTQIKIKKPPKVTMKTG 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 NLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPV--FRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKV-KVEL . . . .. :. : : :. : : : :... . . ... . .. .. CCDS13 KSLLHLHSTLEMFAARWRS-KAPMSLFLLEVHFNLKVQYSVHENQLQMATSLDRLLSLSR 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 KESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLF : :..: :: . : .... :. .. : :: : :.::: CCDS13 KSSSIGNFNERELTGFITSYLEEAYIPVVNDVLQVGLPLPDFLAMNYNLAELDIVENALM 390 400 410 420 430 440 480 pF1KE1 LGANVQYMRV CCDS13 LDLKLG 450 481 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:17:27 2016 done: Sun Nov 6 21:17:28 2016 Total Scan time: 3.050 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]