Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0332
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0332, 626 aa
1>>>pF1KE0332 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7654+/-0.00107; mu= 16.4587+/- 0.065
mean_var=68.1893+/-13.555, 0's: 0 Z-trim(102.5): 20 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155316
statistics sampled from 6948 (6963) to 6948 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3805.1 TKTL2 gene_id:84076|Hs108|chr4 ( 626) 4128 934.6 0
CCDS2871.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 ( 623) 2832 644.2 1.5e-184
CCDS58834.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 ( 631) 2806 638.4 8.6e-183
CCDS55541.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX ( 540) 2683 610.8 1.5e-174
CCDS35448.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX ( 596) 2683 610.8 1.6e-174
>>CCDS3805.1 TKTL2 gene_id:84076|Hs108|chr4 (626 aa)
initn: 4128 init1: 4128 opt: 4128 Z-score: 4996.1 bits: 934.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4128; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
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CCDS38 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 AVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 AIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 CGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 TAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 IKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 IKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRG
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE0 KTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
610 620
>>CCDS2871.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 (623 aa)
initn: 1710 init1: 1710 opt: 2832 Z-score: 3426.7 bits: 644.2 E(32554): 1.5e-184
Smith-Waterman score: 2832; 66.7% identity (87.4% similar) in 625 aa overlap (2-626:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
: . ::: . .:.:.:::::::: ::.:: :.:::. ::::::::...:::::::.::
CCDS28 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
. ::..: ::::.::.:::::::::.:.:.: ..:..::::::. :::. ::.:. :.:
CCDS28 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLV
:::::::::::.::::::::::.:::::::.::.:::: ::::::::.:::: :.:::::
CCDS28 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFASIYKLDNLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPT
:..:.:::::: ::::.: ::::. ::::::.. .::::.:: ::.:: :: :..::
CCDS28 AILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA---KHQPT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQI
::.::::::::: ..:: :.:::::.::. :. :.. : ::::...... : ::.:..
CCDS28 AIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHP
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CCDS28 DIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSH
.::::: ::::::::.:.:::::.::. : ..:::::::::::.::.:::..:::: :::
CCDS28 DRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISESNINLCGSH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 CGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPE
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CCDS28 CGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 TAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFT
.:.::. .:.:..:::::: .. .:.:::::::::::::: ::. :... :..::.::::
CCDS28 NAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 IKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRG
::::: :..::.:: ::..:::::: :::::::: .:: :: : : .:::. ::. :
CCDS28 IKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSG
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KE0 KTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
: .::: ::::. : :: . :
CCDS28 KPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620
>>CCDS58834.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 (631 aa)
initn: 2391 init1: 1710 opt: 2806 Z-score: 3395.1 bits: 638.4 E(32554): 8.6e-183
Smith-Waterman score: 2806; 65.9% identity (86.3% similar) in 633 aa overlap (2-626:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYK
: . ::: . .:.:.:::::::: ::.:: :.:::. ::::::::...:::::::.::
CCDS58 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVD
. ::..: ::::.::.:::::::::.:.:.: ..:..::::::. :::. ::.:. :.:
CCDS58 SQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 VATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKAS--------YRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
:::::::::::.::::::::::.:::: :::.::.:::: ::::::::.::::
CCDS58 VATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
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CCDS58 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
:..::::.::::::::: ..:: :.:::::.::. :. :.. : ::::......
CCDS58 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
: ::.:...:..:.: : :.:::::::::.:.:: ::::::.:..:.:.:.::: :::::
CCDS58 PQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
:::.::::.::::: ::::::::.:.:::::.::. : ..:::::::::::.::.:::..
CCDS58 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
:::: ::::::: :::: :::::::::::::.:. :::::::...::.:. :::::::.:
CCDS58 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
:::::.::.:.::. .:.:..:::::: .. .:.:::::::::::::: ::. :... :.
CCDS58 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
.::.::::::::: :..::.:: ::..:::::: :::::::: .:: :: : : .::
CCDS58 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
:. ::. :: .::: ::::. : :: . :
CCDS58 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
600 610 620 630
>>CCDS55541.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX (540 aa)
initn: 2854 init1: 2683 opt: 2683 Z-score: 3247.3 bits: 610.8 E(32554): 1.5e-174
Smith-Waterman score: 2749; 71.2% identity (87.2% similar) in 577 aa overlap (49-625:1-539)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 TANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVLFFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGH
.:::::. :.:::.:::.::::::.:..
CCDS55 MSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK--
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 AAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHPTPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAY
:: ::::::: ::::::.::::::
CCDS55 ------------------------------------RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAY
30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 TGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFASHYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEH
::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::.:.::::::.:::::::.:: : ::
CCDS55 TGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEH
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 GADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDA
.::: :::::::::.:::.:::::::.::::::::.::::.::::::::: :.::::
CCDS55 CINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDA
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKSPVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDK
:.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :. :.::::...:::..::::: :.::::
CCDS55 ESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDK
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 IATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFSEIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVAL
:::.:. :::::::: ::.::.::.::: ::::::: ::.:::::::..::::::::::
CCDS55 IATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVAL
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 GCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQANINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDL
:::.::::::::..::::.:::::..:.:.....:::.::::::::.:.::.:::::::.
CCDS55 GCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDI
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMCFIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKV
::::.::.::.:::.::.:::::. ::::.::::::::..::: ::::::: ::::::::
CCDS55 AMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKV
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 VRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGISVRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGG
.:: :.:::::::::.:..::: :::.::.: : .:::: :::::::.:::.:::::: :
CCDS55 LRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEG
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 RVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLAVSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIA
:.::::::: .:::::::::::: .::: ::.:::::::: ::. :::::.:::.::::.
CCDS55 RIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIV
480 490 500 510 520 530
620
pF1KE0 AVTLTLMK
:: :.
CCDS55 AVKCMLLN
540
>>CCDS35448.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX (596 aa)
initn: 3040 init1: 2683 opt: 2683 Z-score: 3246.6 bits: 610.8 E(32554): 1.6e-174
Smith-Waterman score: 2935; 70.5% identity (87.3% similar) in 621 aa overlap (5-625:13-595)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVL
.:.:: :.:::.: :.:::::::::::...::. ::: :..:..:::
CCDS35 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHP
::. :.:::.:::.::::::.:..
CCDS35 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
:: ::::::: ::::::.::::::::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::
CCDS35 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
.:.::::::.:::::::.:: : :: .::: :::::::::.:::.:::::::.::::
CCDS35 YYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
::::.::::.::::::::: :.:::::.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :.
CCDS35 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
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CCDS35 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
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CCDS35 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
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CCDS35 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
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CCDS35 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
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CCDS35 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
510 520 530 540 550 560
600 610 620
pF1KE0 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
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CCDS35 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
570 580 590
626 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]