Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0323
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0323, 844 aa
1>>>pF1KE0323 844 - 844 aa - 844 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6095+/-0.000969; mu= 10.3872+/- 0.058
mean_var=143.9215+/-29.944, 0's: 0 Z-trim(109.3): 114 B-trim: 106 in 1/51
Lambda= 0.106908
statistics sampled from 10652 (10768) to 10652 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3 ( 844) 5886 920.2 0
CCDS8742.1 PRICKLE1 gene_id:144165|Hs108|chr12 ( 831) 2477 394.4 4.3e-109
CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX ( 615) 1874 301.3 3.3e-81
CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX ( 547) 1846 297.0 6.1e-80
CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6 ( 384) 746 127.2 5.4e-29
CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 ( 412) 710 121.7 2.7e-27
CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 ( 421) 710 121.7 2.7e-27
CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 253) 445 80.7 3.6e-15
CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 292) 445 80.7 4.1e-15
CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 365) 445 80.8 4.9e-15
CCDS30678.1 FHL3 gene_id:2275|Hs108|chr1 ( 280) 398 73.4 6e-13
CCDS14655.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 280) 355 66.8 5.9e-11
CCDS55506.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 296) 355 66.8 6.2e-11
CCDS55505.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 309) 355 66.8 6.4e-11
>>CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3 (844 aa)
initn: 5886 init1: 5886 opt: 5886 Z-score: 4913.6 bits: 920.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5886; 99.9% identity (99.9% similar) in 844 aa overlap (1-844:1-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS29 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVCTVCNELLVDLIYFYQDGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QCNIRTSYSPGGQGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QCNIRTSYSPGGQGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 RGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKLPGQEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKLPGQEGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 RIQPMSERTRRRATSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKDRPPLRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RIQPMSERTRRRATSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKDRPPLRAR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 EDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYDWCSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYDWCSTCSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 SSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKN
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 CIIS
::::
CCDS29 CIIS
>>CCDS8742.1 PRICKLE1 gene_id:144165|Hs108|chr12 (831 aa)
initn: 2419 init1: 1990 opt: 2477 Z-score: 2072.1 bits: 394.4 E(32554): 4.3e-109
Smith-Waterman score: 2684; 50.8% identity (73.7% similar) in 851 aa overlap (5-844:1-831)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
:::::: .::: : ::.:::::::::::::::::::::.:::.. :..::::::
CCDS87 MPLEMEPKMSKLAFGCQRSSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLRPEQIQLYFACLPEEK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
:::::::::: ::::::.::::::::::::.::.::::.::..::.:::.: ::::...
CCDS87 VPYVNSPGEKHRIKQLLYQLPPHDNEVRYCQSLSEEEKKELQVFSAQRKKEALGRGTIKL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
. .. :.::::: .::::..:::::::: :::::: ::: .::::::::::::::::
CCDS87 LSRAVMHAVCEQCGLKINGGEVAVFASRAGPGVCWHPSCFVCFTCNELLVDLIYFYQDGK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
:.::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::
CCDS87 IHCGRHHAELLKPRCSACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCLECETVLGGQRYIMKDGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
:.:: ::::::::::.::..:::.:..:::::::::::::.:: ::.:: :::: :::::
CCDS87 PFCCGCFESLYAEYCETCGEHIGVDHAQMTYDGQHWHATEACFSCAQCKASLLGCPFLPK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEE--PMLNQHSQL
::::.::..:: ::: ..:::::::::.::...::::...::.. .... : :
CCDS87 QGQIYCSKTCSLGEDVHASDSSDSAFQSARSRDSRRSVRMGKSSRSADQCRQSLLLSPAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVSSNRLSADVDP-LSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPL-
. . ::...: :: ..: :::: : :. . .:..: : . : . .. .
CCDS87 NYKFPGLSGNADDTLSRKLDDLSLSRQGTSFASEEFWKGRVEQETPEDPEEWADHEDYMT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 QLLSQCNIRTSYSPGGQGAGAQP-EMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFI-KECREDYYP
::: . . .. ..: . . : : .:. .:. . . :. :. . :.:
CCDS87 QLLLKFGDKSLFQPQPNEMDIRASEHW---ISDNMVKSKTELKQNNQSLASKKYQSDMYW
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEGGLSTQQCRTRHPISSLKYTEDMT
.. ::.. .: .... : . . .: : ..:. . .. .:. .::. :.
CCDS87 AQ--SQDGLGD---SAYGSHPGPASSRRLQELELDHGASGYNHDETQWYEDSLECLSDLK
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLN
: ::. : ::.:::::: :: :.:: : . : .:. .. .. . ::.:::::::
CCDS87 P-EQSVRDSMDSLALSNITGASVDGENKPRPSL--YSLQNF-EEMETEDCEKMSNMGTLN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SSMQFRSAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDGGMAGSKL
::: :::::..:: : ... . . . :. :. .:..: :. :. . .
CCDS87 SSMLHRSAESLKSLSSELCPEKILPEEKPVHLPVLRRS-KSQSR-PQQVKFSDDVIDNGN
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 PGQEGVRIQPMSERTRRRATSRDD-NRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKD
: .: :::::::::. . .. . : . :: ::::.:::::::.:..::. ::
CCDS87 YDIE-IRQPPMSERTRRRVYNFEERGSRSHHHRRRRSRKSRSDNALNLVTERKYSP--KD
650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 RPPLRAREDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYD
: : . ..:..:....: .: ... . ::::: ...:: .::: .:. ..: :
CCDS87 RLRLYTPDNYEKFIQNKSAREIQAYIQNADLYGQYAHATSDYGLQNPGMNRFLGLYGEDD
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE0 --WCSTCSSSSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVT-SDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQL
:::. ::::.:..::::::.::::: :.. .:.: :. :. .: :
CCDS87 DSWCSSSSSSSDSEEEGYFLGQPIPQPRPQRFAYYTDDLSSPPSALPTPQ---FGQRTTK
760 770 780 790 800 810
840
pF1KE0 HSRKR-QKSKNCIIS
..:. .:.::::::
CCDS87 SKKKKGHKGKNCIIS
820 830
>>CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX (615 aa)
initn: 1914 init1: 1841 opt: 1874 Z-score: 1571.3 bits: 301.3 E(32554): 3.3e-81
Smith-Waterman score: 1874; 50.6% identity (71.2% similar) in 559 aa overlap (2-543:58-599)
10 20 30
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSG
: ..:...:. . .:. ::::.: ::::::
CCDS14 NSCREQCPGFLLHGWRKICQHCKCPREEHAVHAVPVDLERIMCRLISDFQRHSISDDDSG
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 CALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCN
:: :::::::::::::::.:..:::::.::::::::::: :::::::::::::.:..::.
CCDS14 CASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDKVPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGH
.:.::::.::. ::.:::::::::: :: ::::.::::::.:: ::.::::::::::::
CCDS14 ALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRIFPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAE
:.:::: ::: :.:.::::::::::. ::.::::::::::.::: :::::::. ::::::
CCDS14 GACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGKVYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAE
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTY
:::::: ::::::::. ::::::.:...::.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.:
CCDS14 GRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSRPHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAY
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE0 DGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA--
.::::::.. ::::..: ..::::::::..: :::::::: : .:.. : ... .
CCDS14 EGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPRRGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPV
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQ
: . .:... :: .: . ..: .. .:. . : .: :.: :
CCDS14 TAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTELAPATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS-
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 TPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEM
.: .: .: .: ... ... : . ..: : :: . .: : .
CCDS14 VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSAFGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQ
450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 WGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVP
. : : :. : : . .. : .:.: : . : .: : ::. .:
CCDS14 RRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR---HPSRRRHYQ--CDAGSGSDSESCSSSPSS
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550
pF1KE0 KYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATG
. : :..: : : . :: : .. . .:. . :: :
CCDS14 SSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MPAQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDK
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 LSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFRSAESVRSLLSAQQY
CCDS14 NCIVA
>>CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX (547 aa)
initn: 1886 init1: 1813 opt: 1846 Z-score: 1548.7 bits: 297.0 E(32554): 6.1e-80
Smith-Waterman score: 1846; 51.1% identity (71.0% similar) in 548 aa overlap (13-543:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK
. .:. ::::.: :::::::: :::::::::::::::.:..:::::.:
CCDS78 MCRLISDFQRHSISDDDSGCASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP
:::::::::: :::::::::::::.:..::..:.::::.::. ::.:::::::::: ::
CCDS78 VPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCTALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK
::::.::::::.:: ::.:::::::::::: :.:::: ::: :.:.::::::::::. ::
CCDS78 FPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGLGACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR
.::::::::::.::: :::::::. :::::::::::: ::::::::. ::::::.:...:
CCDS78 VYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAEGRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK
:.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.:.::::::.. ::::..: ..::::::::.
CCDS78 PHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAYEGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA--RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQL
.: :::::::: : .:.. : ... . : . .:... :: .: . ..:
CCDS78 RGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPVTAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTEL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQ
.. .:. . : .: :.: : .: .: .: .: ... ...
CCDS78 APATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS-VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSA
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECRE
: . ..: : :: . .: : . . : : :. : : . .. :
CCDS78 FGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQRRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR-
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KE0 DYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHP
.:.: : . : .: : ::. .: . : :..: : : . :: :
CCDS78 --HPSRRRHYQC--DAGSGSDSESCSSSPSSSSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MP
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 ISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNV
.. . .:. . :: :
CCDS78 AQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDKNCIVA
520 530 540
>>CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6 (384 aa)
initn: 820 init1: 723 opt: 746 Z-score: 634.1 bits: 127.2 E(32554): 5.4e-29
Smith-Waterman score: 746; 44.3% identity (65.6% similar) in 253 aa overlap (24-268:24-259)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYS------
..::.::: :: ::..:
CCDS34 MSVQNSGWPHQEDSPKPQDPGPPANSDSDSGHL--------PGEDPEDTHAQGPAVLSLG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 --CLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKREN
:: ...: : : .. ::.::::.: . ::: .: :::. ::.:: ..::.:
CCDS34 SLCLDTNQAP--NWTG----LQTLLQQLPPQDIDERYCLALGEEERAELQLFCARRKQEA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDL
::.: .: . : ::.: .. :. .:::.:::. ::: :::. .:.. :..:
CCDS34 LGQGVARLVLPKLEGHTCEKCRELLKPGEYGVFAARAGEQRCWHQPCFACQACGQALINL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQ
::::.::..:::::::: :.::: :::..::. .::::::..:: .:::: .: :::
CCDS34 IYFYHDGQLYCGRHHAELLRPRCPACDQLIFSWRCTEAEGQRWHENHFCCQDCAGPLGGG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSL
:: . : : : :::. .: :. .. : .::
CCDS34 RYALPGGSPCCPSCFEN---RYSDAGSSWAGALEGQAFLGETGLDRTEGRDQTSVNSATL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPML
CCDS34 SRTLLAAAGGSSLQTQRGLPGSSPQQENRPGDKAEAPKGQEQCRLETIRDPKDTPFSTCS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 (412 aa)
initn: 950 init1: 694 opt: 710 Z-score: 603.6 bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:102-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
: :.:: . ..::.. ::.:: : ..:
CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM-
: . : ::: .::: ::.. :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .: :
CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD
140 150 160 170 180 190
130 140 150
pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV
.::. : : ... :: :..: :::.
CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR
::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. . :::::.:::.::..: :.::..
CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG
.::.::::::.:...:.:. :.: . .: : :. . .: :. : . : . ..::..
CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE
:::. :: :. :.: :.:. :.: .:..::: :
CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS
380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI
>>CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 950 init1: 694 opt: 710 Z-score: 603.5 bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27
Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:111-416)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
: :.:: . ..::.. ::.:: : ..:
CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM-
: . : ::: .::: ::.. :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .: :
CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD
150 160 170 180 190
130 140 150
pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV
.::. : : ... :: :..: :::.
CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR
::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. . :::::.:::.::..: :.::..
CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG
.::.::::::.:...:.:. :.: . .: : :. . .: :. : . : . ..::..
CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE
:::. :: :. :.: :.:. :.: .:..::: :
CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS
380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI
>>CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (253 aa)
initn: 613 init1: 423 opt: 445 Z-score: 385.8 bits: 80.7 E(32554): 3.6e-15
Smith-Waterman score: 548; 38.1% identity (59.3% similar) in 231 aa overlap (51-249:20-250)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 QRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQL
::. .:.:: : ... : : .::.:::
CCDS63 MFGMQGDVFGLRATFMEGLQYMELIPKEKQPVTGTEGAFYRRRQLMHQL
10 20 30 40
90 100 110 120
pF1KE0 PPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV-----------------RPFPV
: .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.: .: .
CCDS63 PIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGLPKEEGKQQEKPEGA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KE0 TMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNEL
:.: .:: : : . .:...:::.. ::: ::: . :.:
CCDS63 ETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQWHPTCFVCAKCSEP
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETV
:::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..: :: ::: : :: .
CCDS63 LVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLAWHRKHFVCEGCEQL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHC
:.:. ::. .:. : : .:
CCDS63 LSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS
230 240 250
>>CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (292 aa)
initn: 632 init1: 423 opt: 445 Z-score: 384.9 bits: 80.7 E(32554): 4.1e-15
Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:45-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
: :.:::. . ::. .:.:: : ...
CCDS63 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV--------
: : .::.:::: .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.:
CCDS63 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150
pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC
.: . :.: .:: : : . .:...:::..
CCDS63 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH
::: ::: . :.: :::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..:
CCDS63 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ
:: ::: : :: .:.:. ::. .:. : : .:
CCDS63 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS
260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES
>>CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 632 init1: 423 opt: 445 Z-score: 383.5 bits: 80.8 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:118-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS
: :.:::. . ::. .:.:: : ...
CCDS33 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110
pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV--------
: : .::.:::: .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.:
CCDS33 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150
pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC
.: . :.: .:: : : . .:...:::..
CCDS33 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH
::: ::: . :.: :::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..:
CCDS33 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ
:: ::: : :: .:.:. ::. .:. : : .:
CCDS33 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS
330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES
844 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 16:00:43 2016 done: Thu Nov 3 16:00:44 2016
Total Scan time: 4.270 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]