FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1467, 570 aa 1>>>pF1KE1467 570 - 570 aa - 570 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2598+/-0.00107; mu= 18.2796+/- 0.063 mean_var=59.4969+/-12.200, 0's: 0 Z-trim(102.3): 26 B-trim: 204 in 1/49 Lambda= 0.166275 statistics sampled from 6888 (6906) to 6888 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16 Scan time: 3.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14242.1 CYBB gene_id:1536|Hs108|chrX ( 570) 3911 947.2 0 CCDS5250.1 NOX3 gene_id:50508|Hs108|chr6 ( 568) 2392 582.8 3.9e-166 CCDS14474.1 NOX1 gene_id:27035|Hs108|chrX ( 564) 2259 550.9 1.5e-156 CCDS65298.1 NOX1 gene_id:27035|Hs108|chrX ( 527) 1898 464.3 1.7e-130 CCDS14475.1 NOX1 gene_id:27035|Hs108|chrX ( 515) 1727 423.2 3.7e-118 CCDS73362.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 ( 553) 805 202.1 1.5e-51 CCDS44696.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 ( 554) 805 202.1 1.5e-51 CCDS10117.1 DUOX2 gene_id:50506|Hs108|chr15 (1548) 604 154.1 1.2e-36 CCDS32221.1 DUOX1 gene_id:53905|Hs108|chr15 (1551) 582 148.8 4.7e-35 CCDS73361.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 ( 514) 383 100.8 4.2e-21 CCDS44695.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 ( 538) 373 98.5 2.3e-20 CCDS8285.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 ( 578) 373 98.5 2.4e-20 >>CCDS14242.1 CYBB gene_id:1536|Hs108|chrX (570 aa) initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 5065.5 bits: 947.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3911; 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CCDS52 DWTAALLEAFGAEGQALQEPWSLPRLAVDGPFGTALTDVFHYPVCVCVAAGIGVTPFAAL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LKSVWYKYCNNA-TNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNI :::.::: :..: : :::.:.::::.:::..::::::::: ::..:.:.... ::::.: CCDS52 LKSIWYK-CSEAQTPLKLSKVYFYWICRDARAFEWFADLLLSLETRMSEQGKTHFLSYHI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 YLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCG .::::::.:: :.:.: ::. ::::::::::.::::::.:::: :: .::.. ::::.:: CCDS52 FLTGWDENQALHIALHWDENTDVITGLKQKTFYGRPNWNNEFKQIAYNHPSSSIGVFFCG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 PEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF :.::..::.:. : . :::::: .:::.: CCDS52 PKALSRTLQKMCHLYSSADPRGVHFYYNKESF 540 550 560 >>CCDS14474.1 NOX1 gene_id:27035|Hs108|chrX (564 aa) initn: 1887 init1: 1078 opt: 2259 Z-score: 2923.9 bits: 550.9 E(32554): 1.5e-156 Smith-Waterman score: 2259; 58.2% identity (80.0% similar) in 574 aa overlap (1-570:1-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL ::::.::. .:.. ..::::::::::: . :. :..::::.:::.:: ::: : :: CCDS14 MGNWVVNHWFSVLFLVVWLGLNVFLFVDAFLKYEKADKYYYTRKILGSTLACARASALCL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL ::: ::::::::::::::::. . :: .:.:::.::::::.::.:: ::.::: :::: CCDS14 NFNSTLILLPVCRNLLSFLRGTCSFCSRTLRKQLDHNLTFHKLVAYMICLHTAIHIIAHL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSD-PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGI :: . : . . .: . :: :. .... :.:: ..: . : :.. : .::. CCDS14 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA :::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::. 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CCDS65 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA :::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::. CCDS65 TGVIMTIALILMVTSATEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMN 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VHNITVCEQKISEWG-KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVV . : ... : . ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.::::::: CCDS65 ESHPRKCAESFEMWDDRDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVV 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR ::::: :: :..::::.:.::.:::::::::.::..: :::::::::::::::::::::: CCDS65 ITKVVMHPSKVLELQMNKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 IVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPF .:::::.:. : .:... .:.: :::::::::::::.:::..::::::::::: CCDS65 AAGDWTENLIRAF---EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPF 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSY ::::::.:::. ::: :::::::.::.: :: :: .:: ::..:.: ...:::.: CCDS65 ASILKSIWYKFQCADHNLKTKKIYFYWICRETGAFSWFNNLLTSLEQEMEELGKVGFLNY 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 NIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFL ..::::: . ..: :.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .:::: CCDS65 RLFLTGWDSNIVGHAALNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFL 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 pF1KE1 CGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF :::..::..: : : :: :.: :::::: CCDS65 CGPRTLAKSLRKCCHRYSSLDPRKVQFYFNKENF 500 510 520 >>CCDS14475.1 NOX1 gene_id:27035|Hs108|chrX (515 aa) initn: 1667 init1: 1078 opt: 1727 Z-score: 2234.8 bits: 423.2 E(32554): 3.7e-118 Smith-Waterman score: 1944; 53.5% identity (73.0% similar) in 574 aa overlap (1-570:1-515) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL ::::.::. .:.. ..::::::::::: . :. :..::::.:::.:: ::: : :: CCDS14 MGNWVVNHWFSVLFLVVWLGLNVFLFVDAFLKYEKADKYYYTRKILGSTLACARASALCL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL ::: ::::::::::::::::. . :: .:.:::.::::::.::.:: ::.::: :::: CCDS14 NFNSTLILLPVCRNLLSFLRGTCSFCSRTLRKQLDHNLTFHKLVAYMICLHTAIHIIAHL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSD-PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGI :: . : . . .: . :: :. .... :.:: ..: . : :.. : .::. CCDS14 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA :::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::. CCDS14 TGVIMTIALILMVTSATEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VHNITVCEQKISEWG-KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVV . : ... : . ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.::::::: CCDS14 ESHPRKCAESFEMWDDRDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR ::::: :: :..::::.:.::.:::::::::.::..: :::::::::::::::::::::: CCDS14 ITKVVMHPSKVLELQMNKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 IVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPF .:::::.:. : .:... .:.: :::::::::::::.:::..::::::::::: CCDS14 AAGDWTENLIRAF---EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSY ::::::.:::. ::: ::. CCDS14 ASILKSIWYKFQCADHNLKTKKV------------------------------------- 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 NIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFL .: :.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .:::: CCDS14 ------------GHAALNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFL 440 450 460 470 480 540 550 560 570 pF1KE1 CGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF :::..::..: : : :: :.: :::::: CCDS14 CGPRTLAKSLRKCCHRYSSLDPRKVQFYFNKENF 490 500 510 >>CCDS73362.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 (553 aa) initn: 1209 init1: 319 opt: 805 Z-score: 1039.0 bits: 202.1 E(32554): 1.5e-51 Smith-Waterman score: 1161; 38.1% identity (62.7% similar) in 561 aa overlap (50-570:29-552) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFL : :.:: :. ::.:: :::::.::.::..: CCDS73 MLSAVTDLGSIESTVSKNLPVVSIHQLGLCLSRASASVLNLNCSLILLPMCRTLLAYL 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 RGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSV :::. : :.:: ::.. ::: . : . :..:. ::: :. .: :: :. . CCDS73 RGSQKVPSRRTRRLLDKSRTFHITCGVTICIFSGVHVAAHLVNA---LNFSVNYSEDFV- 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 ALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRR :: :: : ..:. :. : . :.::: ... :.:.::.:: .:: CCDS73 ------------ELNAARYRDEDPRKLLF---TTVPGLTGVCMVVVLFLMITASTYAIRV 120 130 140 150 200 210 220 230 240 pF1KE1 SYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTA-----------ESLAVHNITVCE--- : ...:::::.:: .:.. :..: . ... :: . . .::.. : CCDS73 SNYDIFWYTHNLFFVFYMLLTLHVSGGLLKYQTNLDTHPPGCISLNRTSSQNISLPEYFS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE1 -----------QKISEWGK---IKEC-PIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWR .: .:. . .: : :.: .: :.:: :: ::. :: ::: :. : CCDS73 EHFHEPFPEGFSKPAEFTQHKFVKICMEEPRFQANFPQTWLWISGPLCLYCAERLYRYIR 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE1 SQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEED- :.. :.: .:..:: ..:..: :..:: . :::: ..::.:: :: :::::: : : CCDS73 SNKPVTIISVMSHPSDVMEIRMVKENFKARPGQYITLHCPSVSALENHPFTLTMCPTETK 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 -FFSIHIRIVGDWTEG----LFNACGCDKQ--EFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYE :..:..::::::: :. . :.. : .. . ::. .:::::. :. ..:: CCDS73 ATFGVHLKIVGDWTERFRDLLLPPSSQDSEILPFIQSRNYPKLYIDGPFGSPFEESLNYE 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 pF1KE1 VVMLVGAGIGVTPFASILKSV---WYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQ : . :..:::::::::::... : : ::...:: :.::: ..:.:::::: CCDS73 VSLCVAGGIGVTPFASILNTLLDDWKPY-------KLRRLYFIWVCRDIQSFRWFADLLC 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 LLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNE .:.... ..: ... ..::. : : .: .:... . ::: : CCDS73 MLHNKFWQENRPDYVNIQLYLSQTDGIQKIIGEKYH--------ALNSRLFIGRPRWKLL 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 FKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF : ::. . . .::: :::..:..:: : : .:. : : : .:::.: CCDS73 FDEIAKYNRGKTVGVFCCGPNSLSKTLHKLSNQNNSYGTR---FEYNKESFS 510 520 530 540 550 >>CCDS44696.1 NOX4 gene_id:50507|Hs108|chr11 (554 aa) initn: 1273 init1: 319 opt: 805 Z-score: 1038.9 bits: 202.1 E(32554): 1.5e-51 Smith-Waterman score: 1225; 37.8% identity (63.1% similar) in 590 aa overlap (21-570:1-553) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL .::.:: . .:. :.. : ...:: .: :.:: :. : CCDS44 MNVLLFWKTFLLYNQGPEYHYLHQMLGLGLCLSRASASVL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL :.:: :::::.::.::..::::. : :.:: ::.. ::: . : . :..:. ::: CCDS44 NLNCSLILLPMCRTLLAYLRGSQKVPSRRTRRLLDKSRTFHITCGVTICIFSGVHVAAHL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGV :. .: :: :. . :: :: : ..:. :. : . :.::: CCDS44 VNA---LNFSVNYSEDFV-------------ELNAARYRDEDPRKLLF---TTVPGLTGV 110 120 130 140 190 200 210 220 230 pF1KE1 VITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTA------- ... :.:.::.:: .:: : ...:::::.:: .:.. :..: . ... :: CCDS44 CMVVVLFLMITASTYAIRVSNYDIFWYTHNLFFVFYMLLTLHVSGGLLKYQTNLDTHPPG 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 pF1KE1 ----ESLAVHNITVCE--------------QKISEWGK---IKEC-PIPQFAGNPPMTWK . . .::.. : .: .:. . .: : :.: .: :.:: CCDS44 CISLNRTSSQNISLPEYFSEHFHEPFPEGFSKPAEFTQHKFVKICMEEPRFQANFPQTWL 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 WIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPK :: ::. :: ::: :. ::.. :.: .:..:: ..:..: :..:: . :::: ..::. CCDS44 WISGPLCLYCAERLYRYIRSNKPVTIISVMSHPSDVMEIRMVKENFKARPGQYITLHCPS 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 pF1KE1 VSKLEWHPFTLTSAPEED--FFSIHIRIVGDWTEG----LFNACGCDKQ--EFQDAWKLP :: :: :::::: : : :..:..::::::: :. . :.. : .. . : CCDS44 VSALENHPFTLTMCPTETKATFGVHLKIVGDWTERFRDLLLPPSSQDSEILPFIQSRNYP 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 KIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSV---WYKYCNNATNLKLKKIY :. .:::::. :. ..::: . :..:::::::::::... : : ::...: CCDS44 KLYIDGPFGSPFEESLNYEVSLCVAGGIGVTPFASILNTLLDDWKPY-------KLRRLY 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 FYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKD : :.::: ..:.:::::: .:.... ..: ... ..::. : : .: CCDS44 FIWVCRDIQSFRWFADLLCMLHNKFWQENRPDYVNIQLYLSQTDGIQKIIGEKYH----- 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 VITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRG .:... . ::: : : ::. . . .::: :::..:..:: : : .:. : : CCDS44 ---ALNSRLFIGRPRWKLLFDEIAKYNRGKTVGVFCCGPNSLSKTLHKLSNQNNSYGTR- 490 500 510 520 530 540 570 pF1KE1 VHFIFNKENF : .:::.: CCDS44 --FEYNKESFS 550 >>CCDS10117.1 DUOX2 gene_id:50506|Hs108|chr15 (1548 aa) initn: 781 init1: 193 opt: 604 Z-score: 771.4 bits: 154.1 E(32554): 1.2e-36 Smith-Waterman score: 781; 29.3% identity (57.8% similar) in 564 aa overlap (21-570:1053-1548) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSAL ..:: :: . ::. . :.: . CCDS10 FLAQKLQQYKRFVENYRRHIVCVAIFSAICVGVFADRAYYYGFASPPSDIAQTTLVG--I 1030 1040 1050 1060 1070 1080 60 70 80 90 100 pF1KE1 ALARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQL--DRNLTFHKMVAWMI :.:. :: ..: ::: .::::..::: : . : . : . ::. .: CCDS10 ILSRGTAASVSFMFSYILLTMCRNLITFLR------ETFLNRYVPFDAAVDFHRWIAMAA 1090 1100 1110 1120 1130 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLY .. . .:. .: ::. . . .: :. . . :. : :. . CCDS10 VVLAILHSAGH------AVNVYIFSVSPLSLLACIFPNV-------FVNDGSKLPQKFYW 1140 1150 1160 1170 1180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 LAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIV . :.:::.. : : .. . ... .:: :. :: ::::..... : :::. .. CCDS10 WFFQTVPGMTGVLLLLVLAIMYVFASHHFRRRSFRGFWLTHHLYILLYALLIIHGSYALI 1190 1200 1210 1220 1230 1240 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 RGQTAESLAVHNITVCEQKISEWGKIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRF . .: : ... : ..: ..:: . CCDS10 Q-----------------------------LPTFH-------IYFLVPAIIYGGDKLVSL 1250 1260 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 WRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKK-KGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPE :.. .. ..:. : . ::... .::... ::.. . : .. :.:::::::::. CCDS10 SRKKVEISVVKAELLPSGVTYLQFQRPQGFEYKSGQWVRIACLALGTTEYHPFTLTSAPH 1270 1280 1290 1300 1310 1320 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 EDFFSIHIRIVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLV :: .:.::: :: :: : . . : . .. ::. .::::: . .. ..:: .:: CCDS10 EDTLSLHIRAVGPWTTRLREIYSSPKGNGCAGY--PKLYLDGPFGEGHQEWHKFEVSVLV 1330 1340 1350 1360 1370 1380 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 GAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQE :.::::::::::::.. .: . .... ::::: :. : . :::.::..: ...: CCDS10 GGGIGVTPFASILKDLVFK-SSLGSQMLCKKIYFIWVTRTQRQFEWLADIIQ----EVEE 1390 1400 1410 1420 1430 470 480 490 500 510 pF1KE1 RNNAGFLSYNIYLTGWDES---QANHFAV---HHDE--EKDVITGLKQKTLYGRPNWDNE .. ..: .::.: :. ... . . : .. .....:::.. : .::: .. CCDS10 NDHQDLVSVHIYVTQLAEKFDLRTTMLYICERHFQKVLNRSLFTGLRSITHFGRPPFEPF 1440 1450 1460 1470 1480 1490 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 FKTIASQHPNTR-IGVFLCGPEALAETLSK--QSISNSESGPRGVHFIFNKENF :... ::..: :::: ::: ...... : : .. .. . ::. . ::: CCDS10 FNSLQEVHPQVRKIGVFSCGPPGMTKNVEKACQLVNRQDRA----HFMHHYENF 1500 1510 1520 1530 1540 >>CCDS32221.1 DUOX1 gene_id:53905|Hs108|chr15 (1551 aa) initn: 777 init1: 188 opt: 582 Z-score: 742.8 bits: 148.8 E(32554): 4.7e-35 Smith-Waterman score: 752; 29.7% identity (58.7% similar) in 538 aa overlap (50-570:1083-1551) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFL . :.:. :: ..: ::: .::::..:: CCDS32 AIAGGLFLERAYYYAFAAHHTGITDTTRVGIILSRGTAASISFMFSYILLTMCRNLITFL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 RGSSACCSTRVRRQL--DRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPY : : . : . : . ::...: . ...:...:. ::. . . .: CCDS32 R------ETFLNRYVPFDAAVDFHRLIASTAIVLTVLHSVGHV------VNVYLFSISPL 1120 1130 1140 1150 1160 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 SVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTI :: :: : : . :. . . :.::::. : : .. . ... . CCDS32 SV-LSCLFPGL------FHDDGSELPQKYYWWFFQTVPGLTGVVLLLILAIMYVFASHHF 1170 1180 1190 1200 1210 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 RRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVHNITVCEQKISEWGKIKEC :: :. :: ::::...... : :::. ... CCDS32 RRRSFRGFWLTHHLYILLYVLLIIHGSFALIQ---------------------------- 1220 1230 1240 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 PIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKK-KG .:.: ... : ..: ..:: . :.. .. ..:. : . .:.... .: CCDS32 -LPRFH-------IFFLVPAIIYGGDKLVSLSRKKVEISVVKAELLPSGVTHLRFQRPQG 1250 1260 1270 1280 1290 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 FKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGL---FNACGCDK :... ::.. . : .. :.:::::::::.:: .:.::: .: :: : ..: :. CCDS32 FEYKSGQWVRIACLALGTTEYHPFTLTSAPHEDTLSLHIRAAGPWTTRLREIYSAPTGDR 1300 1310 1320 1330 1340 1350 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 QEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATN . ::. .::::: . .. ..:: .:::.::::::::::::.. .: . . . CCDS32 CA-----RYPKLYLDGPFGEGHQEWHKFEVSVLVGGGIGVTPFASILKDLVFK-SSVSCQ 1360 1370 1380 1390 1400 1410 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 LKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDES---QANH . ::::: :. : . :::.::... ...: .. ..: .::.: :. ... CCDS32 VFCKKIYFIWVTRTQRQFEWLADIIR----EVEENDHQDLVSVHIYITQLAEKFDLRTTM 1420 1430 1440 1450 1460 500 510 520 530 540 pF1KE1 FAV---HHDE--EKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTR-IGVFLCGPEALAE . . : .. .....:::.. : .::: .. :... ::..: :::: ::: .... 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CCDS73 WISGPLCLYCAERLYRYIRSNKPVTIISVMSHPSDVMEIRMVKENFKARPGQYITLHCPS 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 pF1KE1 VSKLEWHPFTLTSAPEED--FFSIHIRIVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDG :: :: :::::: : : :..:..::::::: .:.: :: CCDS73 VSALENHPFTLTMCPTETKATFGVHLKIVGDWTE-----------RFRDLL-LP------ 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 PFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTH : .:.: :.. .. . . :. : : ::...:: :.::: . CCDS73 P---SSQDS---EILPFIQS-------RNYPKDDWKPY-------KLRRLYFIWVCRDIQ 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 AFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKT .:.:::::: .:.... ..: ... ..::. : : .: .:... CCDS73 SFRWFADLLCMLHNKFWQENRPDYVNIQLYLSQTDGIQKIIGEKYH--------ALNSRL 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 LYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKEN . ::: : : ::. . . .::: :::..:..:: : : .:. : : : .:::. 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