Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2037
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2037, 634 aa
  1>>>pF1KE2037 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6543+/-0.000833; mu= 10.7881+/- 0.051
 mean_var=176.7497+/-35.437, 0's: 0 Z-trim(113.7): 20  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.096471
 statistics sampled from 14274 (14289) to 14274 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.439), width:  16
 Scan time:  3.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16         ( 637) 4266 606.0  5e-173
CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16         ( 636) 4249 603.6 2.6e-172
CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX         ( 628) 3674 523.6 3.1e-148
CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16         ( 499) 3362 480.1 3.1e-135
CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6         ( 642) 1162 174.0 5.6e-43
CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6          ( 684) 1162 174.0 5.8e-43
CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6          ( 462)  707 110.5   5e-24
CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20        ( 463)  704 110.1 6.8e-24


>>CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16              (637 aa)
 initn: 4252 init1: 4252 opt: 4266  Z-score: 3219.9  bits: 606.0 E(32554): 5e-173
Smith-Waterman score: 4266; 99.2% identity (99.4% similar) in 637 aa overlap (1-634:1-637)

               10           20        30        40        50       
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGG---SSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
       :::::::::::::   ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPGSGGGGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAAPPPPVGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
              370       380       390       400       410       420

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
              430       440       450       460       470       480

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
              490       500       510       520       530       540

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
              550       560       570       580       590       600

       600       610       620       630    
pF1KE2 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
              610       620       630       

>>CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16              (636 aa)
 initn: 3385 init1: 3385 opt: 4249  Z-score: 3207.1  bits: 603.6 E(32554): 2.6e-172
Smith-Waterman score: 4249; 99.1% identity (99.2% similar) in 637 aa overlap (1-634:1-636)

               10           20        30        40        50       
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGG---SSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
       :::::::::::::   ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPGSGGGGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAAPPPPVGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPI-ENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
              130       140        150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
     300       310       320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
     360       370       380       390       400       410         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
     540       550       560       570       580       590         

       600       610       620       630    
pF1KE2 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
     600       610       620       630      

>>CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX              (628 aa)
 initn: 3523 init1: 3198 opt: 3674  Z-score: 2774.7  bits: 523.6 E(32554): 3.1e-148
Smith-Waterman score: 3674; 88.5% identity (94.4% similar) in 627 aa overlap (16-634:3-628)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQRENLSA
                      :::::::::::::::.:::.:: .: : : : .:.:::::: ::.
CCDS14              MDSGSSSSDSAPDCWDQVDMESPGSAPSGDGVS-SAVAEAQREPLSS
                            10        20        30         40      

               70        80        90        100          110      
pF1KE2 AFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPP-PAGGAANNH---GAGSGAG---GR
       ::::.::::::::::::::::::::::: :. ::  :::...:..   :::   :   ::
CCDS14 AFSRKLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPTQPPTLPAGSGSNDETCTGAGYPQGKRMGR
         50        60        70        80        90       100      

           120        130       140       150       160       170  
pF1KE2 AAPVESSQEEQSLC-EGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSL
       .:::: :.::  .  :::::::.::::::.:::::.::. ::::::..:.::::::::: 
CCDS14 GAPVEPSREEPLVSLEGSNSAVTMELSEPVVENGEVEMALEESWEHSKEVSEAEPGGGSS
        110       120       130       140       150       160      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE2 GDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYL
       ::. :::::..:::::.::: : :::..: ::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS14 GDSGPPEESGQEMMEEKEEIRKSKSVIVPSGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMFL
        170       180       190       200       210       220      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 TGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 TGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETERKHFTIL
        230       240       250       260       270       280      

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 DAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIV
        290       300       310       320       330       340      

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 LINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCP
       ::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::
CCDS14 LINKMDDPTVNWSIERYEECKEKLVPFLKKVGFSPKKDIHFMPCSGLTGANIKEQSDFCP
        350       360       370       380       390       400      

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 WYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPN
       :: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS14 WYTGLPFIPYLDNLPNFNRSIDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSIFKGQQLVMMPN
        410       420       430       440       450       460      

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 KHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQI
       :::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::
CCDS14 KHNVEVLGILSDDTETDFVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPSNLCHSGRTFDVQI
        470       480       490       500       510       520      

            540       550       560       570       580       590  
pF1KE2 VIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARL
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALISLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARL
        530       540       550       560       570       580      

            600       610       620       630    
pF1KE2 RTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
        590       600       610       620        

>>CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16              (499 aa)
 initn: 3362 init1: 3362 opt: 3362  Z-score: 2541.4  bits: 480.1 E(32554): 3.1e-135
Smith-Waterman score: 3362; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (136-634:1-499)

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE2 AGSGAGGRAAPVESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                               MELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEA
                                             10        20        30

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE2 EPGGGSLGDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPGGGSLGDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTI
               40        50        60        70        80        90

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE2 GGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETE
              100       110       120       130       140       150

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 KKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTA
              160       170       180       190       200       210

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 GVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLK
              220       230       240       250       260       270

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE2 EQSDFCPWYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQSDFCPWYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQ
              280       290       300       310       320       330

         470       480       490       500       510       520     
pF1KE2 QLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSG
              340       350       360       370       380       390

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE2 RTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQD
              400       410       420       430       440       450

         590       600       610       620       630    
pF1KE2 QVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
              460       470       480       490         

>>CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6              (642 aa)
 initn: 926 init1: 637 opt: 1162  Z-score: 885.1  bits: 174.0 E(32554): 5.6e-43
Smith-Waterman score: 1170; 37.3% identity (66.5% similar) in 549 aa overlap (107-629:97-640)

         80        90       100       110       120             130
pF1KE2 VHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPVESSQEEQSLCEG------S
                                     :. : :. .  ..:. :. .         :
CCDS47 KFDVQKALSGVLEQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVS
         70        80        90       100       110       120      

              140          150       160       170       180       
pF1KE2 NSAVSMELSEPIV---ENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRPPEESAHEMME
       ..  .: .  : :   :::..  .:...   .. :. ..    .  .. ::.    .  :
CCDS47 GKKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTI--QASE
        130       140       150       160       170       180      

       190               200           210       220       230     
pF1KE2 EEEEIPKP--------KSVVAPPGAPK----KEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGM
       :.   : :        ... .     :    :. .:.: ::::::::::. :...:: : 
CCDS47 EQSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGN
          190       200       210       220       230       240    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP
       ..:::..:::.:.:. .. ..  .:.:: . :::..: :..:: . :::  : .:..:::
CCDS47 INKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAP
          250       260       270       280       290       300    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
       :::.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:... :: .: : .:
CCDS47 GHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVN
          310       320       330       340       350       360    

         360       370       380       390       400          410  
pF1KE2 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANL---KEQSDFCP
       :::.  :::..::..:   ::  :::..::. ..:. :.: :::.: ::   ...:..  
CCDS47 KMDQ--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTK
            370       380       390        400       410       420 

            420       430       440       450         460       470
pF1KE2 WYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGT--VVLGKLESGSICKGQQLVMM
       :: :: ..  .:..   .::.: :.:: . : .::.:.   . ::.:.: :  :..:. :
CCDS47 WYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAM
             430       440       450       460       470       480 

              480       490       500       510       520       530
pF1KE2 PNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDA
       : ...  : ::   :  .: .: :..... : :..  .:  : :.: :.   ..   : :
CCDS47 PPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRA
             490       500       510       520       530       540 

              540       550       560       570       580       590
pF1KE2 QIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIA
       .:.:.. .  :  :. ..:: .:  : . :  :: ...:..:: .: .:.:. . :  ..
CCDS47 RILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALV
             550       560       570       580       590       600 

              600       610       620       630    
pF1KE2 RLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       .:.:   : :: .::: ..::: ::  :.::: : : ..     
CCDS47 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE   
             610       620       630       640     

>>CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6               (684 aa)
 initn: 926 init1: 637 opt: 1162  Z-score: 884.8  bits: 174.0 E(32554): 5.8e-43
Smith-Waterman score: 1170; 37.3% identity (66.5% similar) in 549 aa overlap (107-629:139-682)

         80        90       100       110       120             130
pF1KE2 VHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPVESSQEEQSLCEG------S
                                     :. : :. .  ..:. :. .         :
CCDS51 KFDVQKALSGVLEQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVS
      110       120       130       140       150       160        

              140          150       160       170       180       
pF1KE2 NSAVSMELSEPIV---ENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRPPEESAHEMME
       ..  .: .  : :   :::..  .:...   .. :. ..    .  .. ::.    .  :
CCDS51 GKKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTI--QASE
      170       180       190       200       210       220        

       190               200           210       220       230     
pF1KE2 EEEEIPKP--------KSVVAPPGAPK----KEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGM
       :.   : :        ... .     :    :. .:.: ::::::::::. :...:: : 
CCDS51 EQSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGN
        230       240       250       260       270       280      

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP
       ..:::..:::.:.:. .. ..  .:.:: . :::..: :..:: . :::  : .:..:::
CCDS51 INKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAP
        290       300       310       320       330       340      

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
       :::.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:... :: .: : .:
CCDS51 GHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVN
        350       360       370       380       390       400      

         360       370       380       390       400          410  
pF1KE2 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANL---KEQSDFCP
       :::.  :::..::..:   ::  :::..::. ..:. :.: :::.: ::   ...:..  
CCDS51 KMDQ--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTK
        410         420       430        440       450       460   

            420       430       440       450         460       470
pF1KE2 WYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGT--VVLGKLESGSICKGQQLVMM
       :: :: ..  .:..   .::.: :.:: . : .::.:.   . ::.:.: :  :..:. :
CCDS51 WYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAM
           470       480       490       500       510       520   

              480       490       500       510       520       530
pF1KE2 PNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDA
       : ...  : ::   :  .: .: :..... : :..  .:  : :.: :.   ..   : :
CCDS51 PPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRA
           530       540       550       560       570       580   

              540       550       560       570       580       590
pF1KE2 QIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIA
       .:.:.. .  :  :. ..:: .:  : . :  :: ...:..:: .: .:.:. . :  ..
CCDS51 RILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALV
           590       600       610       620       630       640   

              600       610       620       630    
pF1KE2 RLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
       .:.:   : :: .::: ..::: ::  :.::: : : ..     
CCDS51 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE   
           650       660       670       680       

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CCDS49                            MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG
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       .::::.::.:.:: : .. ..  .:.::  . ::..: :....   ::: : . ::.:::
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pF1KE2 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
       ::..:. ::: :.:::: :::...:  ::::.:. :.:::::::.:: : :::.::: .:
CCDS49 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
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       :::.    .:..::::  ...  ..::.:.::   . :.: :: .: :. : :   ::. 
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pF1KE2 G------------LPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI
       :              ..  :: .   .: .: :.:::. : ::   .::: .:..:.: .
CCDS49 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVL
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         :. ... : . ..:: ..       . . ::.:. . .:..  ...  : .  : .: 
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pF1KE2 --LCHSGRTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTR
         .  .:  : ::..:..: . :  ::  ::  ::     ... :   .:..::.: .  
CCDS49 PPMEAAG--FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDG
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pF1KE2 PRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD    
       :.:.:. .. :. .  .  .:.:.:.:.: .:::..::  .:.:.: :.: : .:     
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CCDS49 KVTKSAQKAQKAK
     450       460  

>>CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20             (463 aa)
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CCDS13                            MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG
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pF1KE2 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP
       .::::.::.:.:: : .. ..  .:.::  . ::..: :....   ::: : ..::.:::
CCDS13 IDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAP
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pF1KE2 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
       ::..:. ::: :.:::: :::...:  ::::.:. :.:::::::.:: : :::.::: .:
CCDS13 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
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pF1KE2 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYI
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CCDS13 KMDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPAT-VPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFK
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pF1KE2 G------------LPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI
       :            . ..  ::..   .: .: :.:::. : ::   .::: .:..:.: .
CCDS13 GWKVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGIL
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pF1KE2 CKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDP-NN
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CCDS13 RPGMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNVCGDSKSD
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CCDS13 PPQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPK
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CCDS13 TKSAQKAQKAGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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