Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2109
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2109, 930 aa
1>>>pF1KE2109 930 - 930 aa - 930 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5297+/-0.00105; mu= -4.7609+/- 0.063
mean_var=440.6053+/-94.302, 0's: 0 Z-trim(116.1): 702 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.061101
statistics sampled from 15874 (16662) to 15874 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.512), width: 16
Scan time: 5.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 6444 583.0 8.7e-166
CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 5357 487.1 5.3e-137
CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 1338 132.8 2e-30
CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 993 102.8 5.6e-21
CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 807 86.4 4.8e-16
CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 783 84.0 1.5e-15
CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 783 84.1 1.6e-15
CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 783 84.1 1.6e-15
CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 ( 524) 743 80.2 1.1e-14
CCDS9495.1 ZIC2 gene_id:7546|Hs108|chr13 ( 532) 644 71.5 4.7e-12
CCDS9494.2 ZIC5 gene_id:85416|Hs108|chr13 ( 663) 623 69.8 2e-11
CCDS43160.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 334) 607 68.1 3.3e-11
CCDS54653.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 372) 607 68.1 3.5e-11
CCDS54652.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 384) 607 68.1 3.6e-11
CCDS3136.1 ZIC1 gene_id:7545|Hs108|chr3 ( 447) 607 68.2 4e-11
>>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (930 aa)
initn: 6444 init1: 6444 opt: 6444 Z-score: 3089.9 bits: 583.0 E(32554): 8.7e-166
Smith-Waterman score: 6444; 99.8% identity (99.8% similar) in 930 aa overlap (1-930:1-930)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGRSCSMSLHRTSGTPQGPRMVSGHHIPAIRAHSGTPGPSPCGSTSSPTMASLANNLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNGRSCSMSLHRTSGTPQGPRMVSGHHIPAIRAHSGTPGPSPCGSTSSPTMASLANNLHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KMPSGGGMAPQNNVAESRIHLPALSPRRQMLTNGKPRFQVTQAGGMSGSHTLKPKQQEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMPSGGGMAPQNNVAESRIHLPALSPRRQMLTNGKPRFQVTQAGGMSGSHTLKPKQQEFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SPFPPNPGKGALGFGPQCKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGLISPPASQVSTACNQISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPFPPNPGKGALGFGPQCKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGLISPPASQVSTACNQISP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SLQRAMNAANLNIPPSDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLQRAMNAANLNIPPSDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GSQNGLDLGDLLSLPPGTSMSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSQNGLDLGDLLSLPPGTSMSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DSQPAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPLPPLPPPQGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQL
::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPLPPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 CPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 HPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SGTAAGAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGTAAGAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 RVPAPSSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RVPAPSSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 SQRIVPPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQRIVPPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGES
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KE2 LRSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
910 920 930
>>CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (775 aa)
initn: 5357 init1: 5357 opt: 5357 Z-score: 2573.0 bits: 487.1 E(32554): 5.3e-137
Smith-Waterman score: 5357; 99.7% identity (99.7% similar) in 775 aa overlap (156-930:1-775)
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NPGKGALGFGPQCKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGLISPPASQVSTACNQISPSLQRA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MMVQRLGLISPPASQVSTACNQISPSLQRA
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MNAANLNIPPSDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MNAANLNIPPSDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNG
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LDLGDLLSLPPGTSMSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LDLGDLLSLPPGTSMSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSL
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCIPQPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCIPQPRPV
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS64 PGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSA
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPLPPLPPPQGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPLPPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQA
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRY
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSS
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAA
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAP
580 590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPDSQRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPDSQRIV
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGA
700 710 720 730 740 750
910 920 930
pF1KE2 EDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
:::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
760 770
>>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 (620 aa)
initn: 1232 init1: 1184 opt: 1338 Z-score: 659.6 bits: 132.8 E(32554): 2e-30
Smith-Waterman score: 1401; 41.8% identity (62.8% similar) in 656 aa overlap (296-929:4-619)
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 SNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPT
::.. : .::. :. :.. :. :
CCDS58 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLAT
10 20 30
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SLVA-YINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCI-PQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPA
. :. ::. : ..:. :::.. ... :. : :.:.. : . ..
CCDS58 PAPSCYLLGSEPS-SGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSII
40 50 60 70 80 90
390 400 410 420 430
pF1KE2 YGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHM--VVQHGLPGPDSQPA--GLFKTERLEEFPGS
. . .: .: .: :.. . ... ::: : . : .. : .. .:
CCDS58 RSSQTSLV-----TCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK--AS
100 110 120 130 140
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 TVDLPPAPPLPPL--PPPQGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIG
. :: . : : :: :::: : . :: :.: : :.. ..
CCDS58 FLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYP----LSQLPPGPSLGGLGLGLA-----GRV--VA
150 160 170 180 190
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 GKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIH
:.. :::.:: : :.::::::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS58 GRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIH
200 210 220 230 240 250
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 MRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
:::::::::::: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
260 270 280 290 300 310
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 QRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCL
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.::::... . . :.::.::
CCDS58 QRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECL
320 330 340 350 360 370
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 TVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAAGAVPPPHPVSHP
..:.:. :: . ::..: : : : .: . .. .. . ..: :.: .:: : : :
CCDS58 VLQQLH--TSTQLAASDGKGG--CGLGQELLPG-VYPGSITPHNGLASGLLPPAHDV--P
380 390 400 410 420
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 SPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRV--PAPSSILQRTQPP
: : .... . .: :: ... . ..:. :: .:: . : : .... :
CCDS58 SRHHPLDATT-SSHHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPI-VSPLKGLGPPPLPPSSQSHSP
430 440 450 460 470 480
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 YTQQ-PSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKF--CPPHYPDSQRIVPPVSSCS
: :. :: : .: : .:. :..... : : : : :.. :...
CCDS58 GGQPFPTLPSKPSY-PPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFP-YGDCYRMAEPAAGG-
490 500 510 520 530 540
860 870 880 890 900
pF1KE2 VVPSFEDCLVPTSMGQASF--DVFHRAFSTHSGITVYDL------PSSSSSLFGESL-RS
: :: . : . . .: ..:: : :. :.. . .:.. :
CCDS58 ------DGLVGETHGFNPLRPNGYH-SLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSS
550 560 570 580 590
910 920 930
pF1KE2 GAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
: :: :. .. :.: ... :.::.
CCDS58 GPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
600 610 620
>>CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586 aa)
initn: 694 init1: 482 opt: 993 Z-score: 490.1 bits: 102.8 E(32554): 5.6e-21
Smith-Waterman score: 1024; 34.8% identity (57.5% similar) in 702 aa overlap (110-781:53-721)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 HLPALSPRRQMLTNGKPRFQVTQAGGMSGSHTLKPKQQEFGSPFPPN--PGKGALGFGPQ
: : : : .:.: . .: . :.
CCDS33 AGFPDPGKKASPLVVAAAAAAAVAAQGVPQHLLPP----FHAPLPIDMRHQEGRYHYEPH
30 40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 CKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGLI--SP-PASQVSTACNQISPSLQRAMNAANLNIP
:. .: . ....::. .. ..:: :: ::. . : : .. :. ..
CCDS33 --SV-HGVHGPPALSGSPV-ISDISLIRLSPHPAGPGESPFNAPHPYVNPHMEHYLRSVH
80 90 100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 PSDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALP----SLSNHGSQNGLDLGD
: : :.:: .. .:. .. :. .: .: .:: . :.. : : :
CCDS33 SSPTLSMIS------AARGLSPADVAQEHLKE--RGLFGLPAPGTTPSDYYHQMTLVAGH
140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 LLSLPPGTSMSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSD
: : . ... . : : .. .: : :: : :.:::::.:::::
CCDS33 --PAPYGDLLMQSGGAASAPHL----HDYLNPVDVSRFSSPRVTPRLSRKRALSISPLSD
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360
pF1KE2 GIGIDFNTIIRTSPTSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHF-LGVRGSCIPQPRPV-PGS
. ..:.. .:::::.:::::::.::.: : . :::. :. . . :.:. : .
CCDS33 A-SLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRSSSAASGS----YGHLSAGALSPAFTFPHPINPVA
250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QKGVLVAPGGLALPAYGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQPAGLF
. .: ::. :.:. : . : . . .: .: : . .. .
CCDS33 YQQILSQQRGLG-SAFGHTPPLIQPSPTFLAQQPMALTSINATPTQ--LSSSSNCLSDTN
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470
pF1KE2 KTERLEEFPGSTVDLPPA----PPLPPLPPPQGPPPPYH-AHAHLH-HPELG---PHAQ-
.... : :.. : : . : : : ..... : : : .:
CCDS33 QNKQSSESAVSSTVNPVAIHKRSKVKTEPEGLRPASPLALTQGQVSGHGSCGCALPLSQE
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480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QLALPQATLDDDG---EMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFT
::: . :: : : . . . :.: ::. :: ::.::.::.. :: .: : :.
CCDS33 QLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCTKEYDTQEQLVHHINNEHIHGEKKE-FV
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pF1KE2 CFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEK
: : .: :. :::.:.: :..::: :.::::.::::::: ::.::::::: :::::::::
CCDS33 CRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCSKAYSRLENLKTHLRSHTGEK
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 PYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSK
::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . ::: :.:::::::::::::::::::. .
CCDS33 PYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGP
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 EQQARKKLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFS
. .. :: :....:. :: . .. .:... : .: ... . . :
CCDS33 DAHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTEPGGPESTEASST-SQAVEDCLHVRAIKTES
600 610 620 630 640 650
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pF1KE2 SNYSSRS-GTAAGAVPPPHPV-SHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVD---AGAERFAP
:. . : :. .. : :. : :. .:. .:.: : :::.: ::. :
CCDS33 SGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGVEMPGTGPGS-LGDLTALDDTPPGADTSAL
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pF1KE2 SAPSPHHISPRRVPAPSSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQ
.::: .. :.
CCDS33 AAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKSLKDSCSWAGPTPHTRNTKLPPLPGSGSILE
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70 80 90 100 110 120
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.: :.:. : . : : : : . : . .: : . : ::
CCDS54 GTVFAMDPRNGYMEPHYHPPHLFPAFH------PPVPI-DARHHEGRYHYDP------SP
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130 140 150 160 170
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.:: .::. .: .. . : ... ::. ::: .. . :
CCDS54 IPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHRNPTAASESPF--------SPPHPYINPYMDYI
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:.... : . :.:: :. :: :.. :. :. :. . :.
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240 250 260 270 280 290
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.. : .:.. : ... ..... :: . .:.. . ::: : ::
CCDS54 GQRS----PYADII--PSAATAGTGAIHME---YLHAMDSTR--FSSPRLS------ARP
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:.::.::.::::: ..:..:.:::::.:::. .:.::.: : :::. ..
CCDS54 SRKRTLSISPLSDH-SFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSS----SSASGSYGHLSASAIS
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: . :: .. .: .:. :.:.. : : : :. : ..:
CCDS54 PALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLG-SAFGHSPPLIHPAPTFPTQRPIPGI-PTVLN
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. :. : :. .:: . : .:: : : . : . : : :... .
CCDS54 PVQVSSG-PSESSQ-----NKPTSESAVSSTGD-PMHNKRSKIKPDEDLPSP-GARGQQE
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.:: . :. .. :.. . . . :.: :. .: ::.::.::.. :: .
CCDS54 QPE----GTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHWEGCAREFDTQEQLVHHINNDHIHGE
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: : :.: : : :. :::.:.: :..::: :.::::.::::::: ::.::::::: :::
CCDS54 KKE-FVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCTKAYSRLENLKTHLR
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::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.:.::::::::::::::::::
CCDS54 SHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHV
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pF1KE2 KAHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPG-PGPDL
:. . : .. :: :. ..:: .: :::.... . .:::: :
CCDS54 KTVHGPEAHVTKKQRG--DIHP------------RPPP-PRDSGSH-SQSRSPGRPTQGA
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pF1KE2 YSAPIFSSNYSSRSGTA--AGAVPPPHPV-SHPSPGH----NVQGSP----HNPSSQLP-
. :: .:. . .: .:. :.:::: . : :: : . .::
CCDS54 LGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSNSGLELPL
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:.:.: . .: . .. :: :: .. ..... .: .:
CCDS54 TDGGSIGDLSAIDETPIMDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLERLKQVNGMF--
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:. : . :.. : . : : .. : : . ..: :. : :
CCDS54 ---PRLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGP--MTLLPGRSDLSGVDVTMLNMLN
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CCDS54 RRDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPISTDASRR
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::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.:..:::::::::::::::::
CCDS53 SHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHV
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:. . . .. :. :.. : : . . . . .: : .. ::.. .:.:
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: . . : : .. ::. ...: . .: . : . :. .
CCDS53 GAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLR
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.:: : . . . .. :: ::: : :. .:.. ... :... : .
CCDS53 LDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSS--SSSISSAYTVSRRS
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CCDS53 SLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMP
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300 310 320 330 340 350
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:::::.:::::. ..:..:.:::::.::::.::. .::.. :::. .:. .
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: : .:.: :. . :. . : . : : : . . .: . .
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CCDS53 EKREPESVYETD-----------CRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHW
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.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.:::::::.:..::::::: :::::::::::.
CCDS53 GGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYM
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:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.:..::::::::::::::::::. . . .
CCDS53 CEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAH
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pF1KE2 ARKKLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSP-----RDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPI
. :. :.. : : . . . . .: : .. ::.. .:.:: . .
CCDS53 VTKRHRGDGPL-PRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSD
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pF1KE2 FS---SNYSSRSGT--AAGAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTA
: : .. ::. ...: . .: . : . :. . .:: :
CCDS53 HSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRP
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. . . .. :: ::: : :. .:.. ... :... : . : : :.
CCDS53 IGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPG
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pF1KE2 GIHVHGFYGQLQKFCPP-HYPDSQRIVPPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAF
. .: ..: . : ::
CCDS53 SPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYP
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pF1KE2 LSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNGLDLG-DLLSLPPGTSMSSNSVSNSLP
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CCDS89 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPP-FCHQANLMSG--P
10 20 30 40 50
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pF1KE2 SYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAY
.. ..: .: :: :: .::::::.:::::. ..:..:.:::::.::::.
CCDS89 HSYGPARETNSCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDA-SLDLQTVIRTSPSSLVAF
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::. .::.. :::. .:. . . : . . ::: :. :..: .
CCDS89 INSRCTSPGG------SYGHLSIGTMSPSLGFPAQM-NHQKG----PS----PSFGVQPC
110 120 130 140 150
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pF1KE2 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQPAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPL
:. . ::. : : : : : : .:.: :. . :. . : .
CCDS89 GPHDSAR----GGMIP----HP--QSRGPFPTCQ----LKSE-LDMLVGKCREEPLEGDM
160 170 180 190
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pF1KE2 PPLPPPQGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSA
: : : . . .: . .. :... . : ::: ::
CCDS89 SS-PNSTGIQDPLLGMLD-GREDL--EREEKREPESVYETD-----------CRWDGCSQ
200 210 220 230 240
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pF1KE2 LYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKC
.:.::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.::
CCDS89 EFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC
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pF1KE2 TFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYA
:::::.:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.
CCDS89 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV
310 320 330 340 350 360
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:..::::::::::::::::::. . . .. :. :.. : : . . . . .:
CCDS89 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPL-PRAPSISTVEPKREREGGP
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 -----RDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFS---SNYSSRSGT--AAGAVPPPHPVSHPS
: .. ::.. .:.:: . . : : .. ::. ...: . .: .
CCDS89 IREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLD
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 PGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAPSSILQ
: . :. . .:: : . . . .. :: ::: : :. .
CCDS89 EGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSLER
490 500 510 520 530 540
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:.. ... :... : . : : :.. .: ..: . : ::
CCDS89 RSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASARG
550 560 570 580 590
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. .. :.... ::: . . . : : . . .. :.::. .. .:.:
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. . .:: : : : ..: . :::: :. . : . . .. . .:
CCDS94 GLPE-QHGPHGSQNVLNGQMRL--GLPGEVFGRSEQYRQVASPRTDPYSAAQLHNQYGPM
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CCDS94 NMNMGMNMAAAAAHHHHHHHHHPGAFFRYMRQQCIKQELI--------------CKWIDP
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:. .. ..::: :. :. . . .::: :::. :::.:.:::. :
CCDS94 EQLSNPKKSCNKTFSTMHELVTHVSVEHVGGPEQSNHVCFWEECPREGKPFKAKYKLVNH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]