FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2153, 613 aa 1>>>pF1KE2153 613 - 613 aa - 613 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5892+/-0.000788; mu= 14.3604+/- 0.048 mean_var=110.4935+/-22.297, 0's: 0 Z-trim(111.5): 18 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.122013 statistics sampled from 12441 (12454) to 12441 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16 Scan time: 3.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1195.1 IGSF8 gene_id:93185|Hs108|chr1 ( 613) 4127 737.2 1.4e-212 CCDS30814.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1214) 587 114.3 9.6e-25 CCDS30813.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1194) 530 104.2 9.9e-22 CCDS891.1 CD101 gene_id:9398|Hs108|chr1 (1021) 514 101.4 6.1e-21 CCDS890.1 PTGFRN gene_id:5738|Hs108|chr1 ( 879) 503 99.4 2.1e-20 >>CCDS1195.1 IGSF8 gene_id:93185|Hs108|chr1 (613 aa) initn: 4127 init1: 4127 opt: 4127 Z-score: 3929.7 bits: 737.2 E(32554): 1.4e-212 Smith-Waterman score: 4127; 100.0% identity (100.0% similar) in 613 aa overlap (1-613:1-613) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGALRPTLLPPSLPLLLLLMLGMGCWAREVLVPEGPLYRVAGTAVSISCNVTGYEGPAQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MGALRPTLLPPSLPLLLLLMLGMGCWAREVLVPEGPLYRVAGTAVSISCNVTGYEGPAQQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NFEWFLYRPEAPDTALGIVSTKDTQFSYAVFKSRVVAGEVQVQRLQGDAVVLKIARLQAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 NFEWFLYRPEAPDTALGIVSTKDTQFSYAVFKSRVVAGEVQVQRLQGDAVVLKIARLQAQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DAGIYECHTPSTDTRYLGSYSGKVELRVLPDVLQVSAAPPGPRGRQAPTSPPRMTVHEGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DAGIYECHTPSTDTRYLGSYSGKVELRVLPDVLQVSAAPPGPRGRQAPTSPPRMTVHEGQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 ELALGCLARTSTQKHTHLAVSFGRSVPEAPVGRSTLQEVVGIRSDLAVEAGAPYAERLAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ELALGCLARTSTQKHTHLAVSFGRSVPEAPVGRSTLQEVVGIRSDLAVEAGAPYAERLAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GELRLGKEGTDRYRMVVGGAQAGDAGTYHCTAAEWIQDPDGSWAQIAEKRAVLAHVDVQT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GELRLGKEGTDRYRMVVGGAQAGDAGTYHCTAAEWIQDPDGSWAQIAEKRAVLAHVDVQT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLCNVSGALPPAGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPGRLVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLCNVSGALPPAGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPGRLVA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 QLDTEGVGSLGPGYEGRHIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVRGSGTRLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QLDTEGVGSLGPGYEGRHIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVRGSGTRLR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 EAASARSRPLPVHVREEGVVLEAVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGPPGLRLAASWW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EAASARSRPLPVHVREEGVVLEAVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGPPGLRLAASWW 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 VERPEDGELSSVPAQLVGGVGQDGVAELGVRPGGGPVSVELVGPRSHRLRLHSLGPEDEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VERPEDGELSSVPAQLVGGVGQDGVAELGVRPGGGPVSVELVGPRSHRLRLHSLGPEDEG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 VYHCAPSAWVQHADYSWYQAGSARSGPVTVYPYMHALDTLFVPLLVGTGVALVTGATVLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VYHCAPSAWVQHADYSWYQAGSARSGPVTVYPYMHALDTLFVPLLVGTGVALVTGATVLG 550 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 TITCCFMKRLRKR ::::::::::::: CCDS11 TITCCFMKRLRKR 610 >>CCDS30814.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1214 aa) initn: 873 init1: 526 opt: 587 Z-score: 557.7 bits: 114.3 E(32554): 9.6e-25 Smith-Waterman score: 982; 33.2% identity (60.1% similar) in 584 aa overlap (13-570:5-558) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGALRPTLLPPSLPLL-LLLMLGMGCWAREVLVPEGPLYRVAGTAVSISCNVTGYEGPAQ .:.: : .::. :.: : ::::::. :. ..: :::.::.::.. 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CCDS30 EQDPLELTCEVASETIQHSHLSVAWLRQKVGEKPV------EVISLSRDFMLHSSSEYAQ 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 RLAAGELRLGKEGTDRYRMVVGGAQAGDAGTYHCTAAEWIQDPDGSWAQIAEKRAVLAHV : . ::.:: : : .:... : .: : ..: :::::::::::: ...::. : : CCDS30 RQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 DVQTLSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLCNVSGALPPAGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPG .:: .....: . .: :::.:. : . . : :. : : ... . .. ::. CCDS30 NVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEFRCILEAQNVP-DRYFAVSWAFNSSLIATMGPN 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 RLVAQLDTEGVGSLGPGYEGRHIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVRGSG : :..: . . : .. . : .. .. :.. : :.: : : . . 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CCDS30 MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QNFEWFLYRPEAPDTALGIVSTKDTQFSYAVFKSRVVAGEVQVQRLQGDAVVLKIARLQA :::.: .: : .:. . :::: :..: ::.. .:: .:.. ..:.::....:.:. ::: CCDS30 QNFQWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 QDAGIYECHTPSTDTRYLGSYSGKVELRVLPDVLQVSAAPPGPRGRQAPTSPPRMTVH-- .::: ::::::::: .:.::::.:..: :.:: ::..: : .:.: CCDS30 RDAGEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMP--------------QTLHRV 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 EGQELALGCLARTSTQKHTHLAVSFGRS-VPEAPVGRSTLQEVVGIRSDLAVEAGAPYAE : . : : : . . : .:.::.:.. :. : : :: ::... :. ..... ::. CCDS30 EQDPLELTCEVASETIQHSHLSVAWLRQKVGEKPV------EVISLSRDFMLHSSSEYAQ 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 RLAAGELRLGKEGTDRYRMVVGGAQAGDAGTYHCTAAEWIQDPDGSWAQIAEKRAVLAHV : . ::.:: : : .:... : .: : ..: :::::::::::: ...::. : : CCDS30 RQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 DVQTLSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLCNVSGALPPAGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPG .:: .....: . .: :::.:. : . . : :. : : ... . .. ::. CCDS30 NVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEFRCILEAQNVP-DRYFAVSWAFNSSLIATMGPN 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 RLVAQLDTEGVGSLGPGYEGRHIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVRGSG : :..: . . : .. . : .. .. :.. : :.: : : . . CCDS30 A-VPVLNSEFAHREARG----QLKVAKESDSVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVT 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 TRLREAASARSRPLPVHVREEGVVLEAVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGPPGLRLA .. . : : . .:. : . . . .... .:: . :.. . : : : :.. CCDS30 GEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEVASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQG-RFS 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 ASWW-VERPEDGELSSVPAQLVGGVGQDGVAELGVRPGGGPVSVELVGPRSHRLRLHSLG . : :.: ... :.. :. : : . : . : :..: : : : : . . CCDS30 VIWQLVDR--QNRRSNIMWLDRDGTVQPG-SSYWERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSR 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 PEDEGVYHCAPSAWVQHADYSWYQAGSAR-SGPVTVYPYMHALDTLFVPLLVGTGVALVT :::: :.: . ::. .: : .: : : :... CCDS30 KEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSF 510 520 530 540 550 560 600 610 pF1KE2 GATVLGTITCCFMKRLRKR CCDS30 DLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKA 570 580 590 600 610 620 >>CCDS891.1 CD101 gene_id:9398|Hs108|chr1 (1021 aa) initn: 865 init1: 510 opt: 514 Z-score: 489.4 bits: 101.4 E(32554): 6.1e-21 Smith-Waterman score: 987; 34.6% identity (61.9% similar) in 561 aa overlap (15-559:11-528) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGALRPTLLPPSLPLLLLLMLGMGCWAREVLVPEGPLYRVAGTAVSISCNVTGYEGPAQQ .::: :..: ::: : .:::.:. : :::.:::::..::..: CCDS89 MAGISYVASFFLLLTKLSIG--QREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NFEWFLYRPEAPDTALGIVSTKDTQFSYAVFKSRVVAGEVQVQRLQGDAVVLKIARLQAQ .:.: .: : : . :.::::. :::::. .:: .:.: :.:.::..:.:.:..:: . CCDS89 HFQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DAGIYECHTPSTDTRYLGSYSGKVELRVLPDVLQVSAAPPGPRGRQAPTSPPRMTVHEGQ ::: ::::::.:: .: ::::.:..: :.::.:. : : . .::. CCDS89 DAGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLS------------ATMSSQTLGKEEGE 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 ELALGCLARTSTQKHTHLAVSFGRSVPEAPVGRSTLQEVVGIRSDLAVEAGAPYAERLAA ::: : : .: .::::.:.. . : : :.... .:. . : :.::.:: CCDS89 PLALTCEASKATAQHTHLSVTWYLT---QDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAA 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GELRLGKEGTDRYRMVVGGAQAGDAGTYHCTAAEWIQDPDGSWAQIAEKRAVLAHVDVQT ....:.: : .:. . :..: : : :.::::::: .: :..:.. . . .: CCDS89 SDVQLNKLGPTTFRLSIERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQP 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLCNVSGALPPAGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPGRLVA ... :.. .. .. :.::::.: : .. :: . : . : .: CCDS89 AVKDFQVNI-TADSLFAEGKPLELVCLVVSS----GRDPQLQGIWFFN-------GTEIA 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 pF1KE2 QLDTEGVGSLGPGYEGR----HIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVR--- ..:. :: .: :. : .. . :.. ... :.. . : : :.:::.. .. CCDS89 HIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVSKLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRT 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 GSGTRLREAASARSRPLPVHVRE---EGVVLEAVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGP :: :.. : :. ::.:. ..::. . .:..::: ..::. :: CCDS89 GSWQVLQRKQSPDSH---VHLRKPAARSVVMSTKN--KQQVVWEGETLAFLCKA---GGA 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 pF1KE2 PGLRLAASWWVERPEDGELSSVPAQLVGGVGQDGVAELGVRPG----GGPVSVELVGPRS . :..::: . :.: .. : ..:.:.::::...::. : : . .: . . CCDS89 ES-PLSVSWW-HIPRD---QTQP-EFVAGMGQDGIVQLGASYGVPSYHGNTRLEKMDWAT 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 HRLRLHSLGPEDEGVYHCAPS--AWVQHADYSWYQAGSARSGPVTVYPYMHALDTLFVPL .:.. . : :.:.: : . : : :: : CCDS89 FQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWTQKISVTVKSLESSLQVSLMSRQPQVM 500 510 520 530 540 550 590 600 610 pF1KE2 LVGTGVALVTGATVLGTITCCFMKRLRKR CCDS89 LTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPASSHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKK 560 570 580 590 600 610 >>CCDS890.1 PTGFRN gene_id:5738|Hs108|chr1 (879 aa) initn: 925 init1: 292 opt: 503 Z-score: 479.9 bits: 99.4 E(32554): 2.1e-20 Smith-Waterman score: 585; 36.5% identity (62.8% similar) in 288 aa overlap (12-299:6-275) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGALRPTLLPPSLPLLLLLMLGMGCWAREVLVPEGPLYRVAGTAVSISCNVTGYEGPAQQ : :::: :. : .: : :: . : ::.:: . : :::. :.::..: CCDS89 MGRLASRPLLLALLSLALCRGRVVRVPTATLVRVVGTELVIPCNVSDYDGPSEQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NFEWFLYRPEAPDTALGIVSTKDTQFSYAVFKSRVVAGEVQVQRLQGDAVVLKIARLQAQ ::.: . .. . ..:: .. : ... :. ::. ..: .::: :.: .: . 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