FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1951, 508 aa 1>>>pF1KE1951 508 - 508 aa - 508 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0193+/-0.000922; mu= 2.8888+/- 0.055 mean_var=217.4627+/-43.972, 0's: 0 Z-trim(113.5): 66 B-trim: 137 in 1/53 Lambda= 0.086972 statistics sampled from 14073 (14139) to 14073 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.434), width: 16 Scan time: 3.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 3493 450.9 1.6e-126 CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 3469 447.9 1.3e-125 CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 1952 257.7 3.6e-68 CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 1384 186.2 6.5e-47 CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 542 80.8 6.6e-15 CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 310) 529 78.8 9.6e-15 CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 504 76.0 1.8e-13 CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 504 76.0 1.9e-13 CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 494 74.5 2.1e-13 CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 494 74.5 2.2e-13 CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 493 74.7 5.8e-13 CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 477 72.6 1.8e-12 CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 477 72.6 1.9e-12 CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 461 70.4 4.9e-12 CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 461 70.6 8.4e-12 CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 463 71.0 8.8e-12 CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 463 71.0 8.9e-12 CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 463 71.0 9e-12 CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 456 70.0 1.2e-11 CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 456 70.0 1.2e-11 CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 455 69.9 1.6e-11 CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 453 69.7 2e-11 CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 453 69.7 2e-11 CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 433 67.1 8.1e-11 >>CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 (508 aa) initn: 3493 init1: 3493 opt: 3493 Z-score: 2385.1 bits: 450.9 E(32554): 1.6e-126 Smith-Waterman score: 3493; 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CCDS10 EAPVAVVTVTPAPEPAENSQDLGSTSSLGPGISGPRGQAP-DTLSYLDSVSLMSGTLESL 230 240 250 260 270 280 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 TDELSSLGSDSEANGFAERRIDKFGFIVGSQGAEGALEE-VPLEVLRQRESKWLDMLNNW .:..::.::::: ::.: :. ::.::. ::: . :.:: .:..: :::: :::::..:: CCDS10 ADDVSSMGSDSEINGLALRKTDKYGFLGGSQYS-GSLESSIPVDVARQRELKWLDMFSNW 290 300 310 320 330 340 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 DKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDV :::.... .:..:::.:::: :::..::::::..: :.::::::.::. .::::::::: CCDS10 DKWLSRRFQKVKLRCRKGIPSSLRAKAWQYLSNSKELLEQNPGKFEELERAPGDPKWLDV 350 360 370 380 390 400 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 IERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAE ::.::::::::::::..:::::::::.:.:::::.:::.:::::::::.::::::::::: CCDS10 IEKDLHRQFPFHEMFAARGGHGQQDLYRILKAYTIYRPDEGYCQAQAPVAAVLLMHMPAE 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 QAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTE ::::::::::.:::::::: ::::::::::.:.::...::.::.:: ::.:::.::::: CCDS10 QAFWCLVQICDKYLPGYYSAGLEAIQLDGEIFFALLRRASPLAHRHLRRQRIDPVLYMTE 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 WFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIER :::: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::.:.::: ::...:::.:::.:. CCDS10 WFMCIFARTLPWASVLRVWDMFFCEGVKIIFRVALVLLRHTLGSVEKLRSCQGMYETMEQ 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 LRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQIEREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAI ::.: . ::: :::.::..::::: ::::. ::..:.::::::: : ::::..:: CCDS10 LRNLPQQCMQEDFLVHEVTNLPVTEALIERENAAQLKKWRETRGELQYRPSRRLHGSRAI 590 600 610 620 630 640 400 410 420 430 440 pF1KE1 LDAEPGPRPALQPSPSI-RLPLDAPLPGSKAK---PKPPKQAQKEQRKQMKGRGQLEKPP . . .: : :: :. :: ::.: :.:: . :. : : CCDS10 HEERRRQQPPLGPSSSLLSLP-GLKSRGSRAAGGAPSPPPPV----RRASAG-------P 650 660 670 680 690 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 APNQAMVVAAAGDACPPQHVPPKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL ::. ::.: : : : .:.: :. .. : . ...... .::.: CCDS10 APGP--VVTAEG-LHPSLPSPTGNSTPLGSS-KETRKQEKERQKQEKERQKQEKEREKER 700 710 720 730 740 CCDS10 QKQEKEREKQEKEREKQEKERQKQEKKAQGRKLSLRRKADGPPGPHDGGDRPSAEARQDA 750 760 770 780 790 800 >>CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (446 aa) initn: 1320 init1: 1291 opt: 1384 Z-score: 955.8 bits: 186.2 E(32554): 6.5e-47 Smith-Waterman score: 1384; 46.6% identity (74.1% similar) in 440 aa overlap (24-453:7-436) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAKSNGENGPRAPAAGESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAE-RRIDKFG :.:.: :. :. :::::::: .: . :. :..: CCDS81 MAQALGEDLVQPPE--LQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 FIVGSQGAEGALEEVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGR :: ::.. : . : ...:::: ::..: ..:.: :....::....:.:::: .::.: CCDS81 FIGGSSAEPGPGHP-PADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRAR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 AWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDL : : :..: ...:: ..:: .::::.:...: ::::::::.:::::: ::::: : CCDS81 CWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 FRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQ ..:::::::::::.::::::.:.:::::::.: :.:::::::::: ::::::. ..::.. CCDS81 LQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVR 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEG ::.:....::... : .::::.. . ::::. :::.: :.:.::. .:::::: :. :: CCDS81 LDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTER ....:::::.:.. :::. :. :: : ::. ::.. : .:: ....: . ..:: CCDS81 ARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSER 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 QIEREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAEP--GPRPALQPS-PSIRLPLDA ...:: :: . .. : :: ::.::..:. : : . .: : :. .. CCDS81 DLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVP--RIVVQP 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 PLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG-----RGQ-LEKPPAPNQAMVVAAAGDACPPQHVP : .:.::.. . . : ..: :: .: :: :.. CCDS81 P-----EEPRPPRRKPQTRGKTFHGLLTRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF 400 410 420 430 440 480 490 500 pF1KE1 PKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL >>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa) initn: 460 init1: 277 opt: 542 Z-score: 381.1 bits: 80.8 E(32554): 6.6e-15 Smith-Waterman score: 554; 29.8% identity (60.3% similar) in 393 aa overlap (1-384:439-806) 10 20 pF1KE1 MAKSNGENGPRA-PAAGESLSGTRESLAQG . .:.:.. : : : .: ::: . CCDS13 LLETVVRVYPANERFWYFSRKTFTETFFMRLKQSEGKGHTNAGDAIYEVVSLQRESDKEE 410 420 430 440 450 460 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 PDAATTDELSSLGSDSEANGFAERRIDKFGFIVGSQGAEGALEEVPLEVLRQRESKWLDM : . : :. : : . ::.. :. :.:. . .. : ..: .: .. CCDS13 PVTPT----SGGGPMSPQDDEAEEESDNEL----SSGTGDVSKDCPEKILY----SWGEL 470 480 490 500 510 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 LNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELD-MSPGDP :..: . .. . : . ..:.: .::...:: :.: ..: . .:. . : CCDS13 LGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAG----CHDNQAMLDRYRILITKDS 520 530 540 550 560 570 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 KWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLM .:: ::.:: :: :..: . :: ::..:... :::..: . ::::.:. .:::::. CCDS13 AQESVITRDIHRTFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLL 580 590 600 610 620 630 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 HMPAEQAFWCLVQICEKY-LPGYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDP ::: :::: ::.: : : : ...: .. : :.:. : :.:.: ... CCDS13 HMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEA 640 650 660 670 680 690 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 LLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQ .: ..::. :. .: :... :...:::..:::.:.:.::: . : :.. CCDS13 HMYASQWFLTLFTAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTS-----KEDLLQAD 700 710 720 730 740 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 YE-TIERLRSLSPKIMQEAF----LVQEVVELPVTERQIEREHLIQLRRWQETR-GELQC .: ... .: :: .. :.... .. : ..... . ...: : ..:: CCDS13 FEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYE----KEYQTMRESQLQQ 750 760 770 780 790 800 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 RSPPRLHGAKAILDAEPGPRPALQPSPSIRLPLDAPLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG ..: CCDS13 EDPMDRYKFVYL 810 >>CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (310 aa) initn: 504 init1: 483 opt: 529 Z-score: 378.2 bits: 78.8 E(32554): 9.6e-15 Smith-Waterman score: 529; 48.1% identity (77.3% similar) in 154 aa overlap (24-176:7-157) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAKSNGENGPRAPAAGESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAE-RRIDKFG :.:.: :. :. :::::::: .: . :. :..: CCDS58 MAQALGEDLVQPPE--LQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 FIVGSQGAEGALEEVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGR :: ::.. : . : ...:::: ::..: ..:.: :....::....:.:::: .::.: CCDS58 FIGGSSAEPGPGHP-PADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRAR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 AWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDL : : :..: ...:: ..:: .::::.:...: ::::::::.:::::: :::. 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CCDS53 HHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRT-PFTLNLRIWDIYIFEGERV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLR-SLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQI . .. ..:: : . . .: .. : .: .. .:. .. : .: : ... .:: . CCDS53 LTAMSYTILK--LHKKHLMKL--SMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKR 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE1 EREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAEPGPRPALQPSP--SIRLPLDAPLP . : . . .: . . ::.:. . .. : : . .::: : : :: CCDS53 AKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQ-SWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 GSKAKPKP------PKQAQ-------KEQRKQMKGRGQLEK--PPAPNQA---MVVAAAG . .:.: :..:: .:. :..: ...... : .:... . :::. CCDS53 RHEHSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQYNHAAAN 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 pF1KE1 DACPPQHVPPKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL . :. .:: . :.: ::: .:. CCDS53 QNSNATSNIRKEFVPKWNKPSD----VSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVR 480 490 500 510 520 CCDS53 VSNVRPKMKALDAEDGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYPPSP 530 540 550 560 570 580 >>CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 (845 aa) initn: 415 init1: 203 opt: 504 Z-score: 355.1 bits: 76.0 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 511; 28.8% identity (58.4% similar) in 483 aa overlap (46-494:53-516) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAERRIDKFGFIVGSQGAEG--ALE- .:. .. . :.:::. . . :.: CCDS44 DVALKLAQERAEIVAKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHNVAVER 30 40 50 60 70 80 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 EVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYL-SGGKVKL . ::. .: .::: ::..:.:. :. .:.. : :::: .:::..: : :.: CCDS44 QKHLEI--ERTTKWLKMLKGWEKY--KNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMK- 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 QQNPGKFDELDM-----SPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDLFRVLKAY ... ...: :: : . .:. :..: : : :: .: : ::.::.:: :: CCDS44 EETRDLYSKLKHRARGCSP-DIRQIDL---DVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAY 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 TLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAEQAFWCLVQIC---EKYLPGYYSEKLEAIQLDGE ..: : ::::... :.:.:::.: :.::: ::.. .. . :.. . . . : CCDS44 SIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQE 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 ILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFM-CAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKI ..:.: ..::. :.: .: .::. : ..:: :.. ::.::... :: .. CCDS44 HHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWFFQCFLDRT-PFTLNLRIWDIYIFEGERV 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLR-SLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQI . .. ..:: : . . .: .. : .: .. .:. .. : .: : ... .:: . CCDS44 LTAMSYTILK--LHKKHLMKL--SMEELVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKR 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAEPGPRPALQPSP--SIRLPLDAPLP . : . . .: . . ::.:. . .. : : . .::: : : :: CCDS44 AKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQ-SWGVHHLSNGQRSVGRPSPLASGRRESGAPHR 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KE1 GSKAKPKP------PKQAQ-------KEQRKQMKGRGQLEK--PPAPNQA---MVVAAAG . .:.: :..:: .:. :..: ...... : .:... . :::. CCDS44 RHEHSPHPQSRTGTPERAQPPRRKSVEEESKKLKDEADFQRKLPSGPQDSSRQYNHAAAN 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 pF1KE1 DACPPQHVPPKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL . :. .:: . :.: ::: .:. CCDS44 QNSNATSNIRKEFVPKWNKPSD----VSATERTAKYTMEGKGRAAHPALAVTVPGPAEVR 490 500 510 520 530 540 CCDS44 VSNVRPKMKALDAEDGKRGSTASQYDNVPGPELDSGASVEEALERAYSQSPRHALYPPSP 550 560 570 580 590 600 >>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (336 aa) initn: 458 init1: 252 opt: 494 Z-score: 354.0 bits: 74.5 E(32554): 2.1e-13 Smith-Waterman score: 494; 33.6% identity (60.0% similar) in 265 aa overlap (54-313:11-272) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 ESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAERRIDKFGFIVGSQGAEGALEEV---PLEVLR ::: .:: . ..: :. : .: CCDS95 MQPAERSRVPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLT 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 QRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDE .: :: .:.. . . . .. .::.: :.:.:. :::......:::: . . CCDS95 RRAIKWSRLLQGGG---VPRSRTVKRYVRKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQ 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 pF1KE1 LDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHG-QQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQ : .. .:. :.:. ::.: :: . : . :. :. :: :: . ::::.. CCDS95 LLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGM 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 APIAAVL-LMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHK ::. : :. :..:: : . . :: ::: . ... : :.: :.. :.. CCDS95 NFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGA 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 HLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSP . : . : ...::.: : :: .:::.:: .: :: ::::::.:.:.:. CCDS95 LMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELI 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 EKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQIEREHLIQLRRWQETRGE CCDS95 LEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQKIFSEPGSLSMATVAKLRESCRARLLAQG 280 290 300 310 320 330 >>CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (344 aa) initn: 467 init1: 261 opt: 494 Z-score: 353.8 bits: 74.5 E(32554): 2.2e-13 Smith-Waterman score: 494; 33.6% identity (60.0% similar) in 265 aa overlap (54-313:11-272) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 ESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAERRIDKFGFIVGSQGAEGALEEV---PLEVLR ::: .:: . ..: :. : .: CCDS66 MQPAERSRVPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLT 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 QRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDE .: :: .:.. . . . .. .::.: :.:.:. :::......:::: . . CCDS66 RRAIKWSRLLQGGG---VPRSRTVKRYVRKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQ 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 pF1KE1 LDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHG-QQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQ : .. .:. :.:. ::.: :: . : . :. :. :: :: . ::::.. CCDS66 LLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGM 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 APIAAVL-LMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHK ::. : :. :..:: : . . :: ::: . ... : :.: :.. :.. CCDS66 NFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGA 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 HLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSP . : . : ...::.: : :: .:::.:: .: :: ::::::.:.:.:. CCDS66 LMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELI 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 EKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQIEREHLIQLRRWQETRGE CCDS66 LEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQVCGAARGSVPSQGAPPHLQPGGCSDHPEGA 280 290 300 310 320 330 508 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:58:01 2016 done: Sun Nov 6 21:58:02 2016 Total Scan time: 3.880 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]