FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1915, 452 aa 1>>>pF1KE1915 452 - 452 aa - 452 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3019+/-0.000874; mu= 12.2210+/- 0.052 mean_var=77.4190+/-15.361, 0's: 0 Z-trim(107.5): 43 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.145764 statistics sampled from 9589 (9632) to 9589 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 2.950 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 3090 659.4 2.2e-189 CCDS47733.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 108) 694 155.3 2.8e-38 CCDS158.1 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 416) 437 101.4 1.8e-21 CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 464) 421 98.1 2e-20 CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 479) 421 98.1 2.1e-20 CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 496) 421 98.1 2.1e-20 CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 538) 421 98.1 2.3e-20 CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 293) 391 91.7 1e-18 CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 368 86.9 4e-17 CCDS159.2 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 333) 365 86.3 5.2e-17 CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 363 85.9 6.6e-17 CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 363 85.9 7.9e-17 CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 327 78.3 1.9e-14 CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 327 78.3 1.9e-14 CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 321 77.1 4.8e-14 CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 321 77.1 4.8e-14 CCDS8331.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 263) 316 75.9 5.3e-14 CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 316 76.0 5.8e-14 CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 316 76.0 7.4e-14 CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 316 76.0 8.4e-14 CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 321) 314 75.5 8.5e-14 CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 316 76.0 8.6e-14 CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 377) 314 75.6 9.9e-14 CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 204) 284 69.2 4.5e-12 CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 ( 242) 278 67.9 1.3e-11 >>CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 (452 aa) initn: 3090 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3513.7 bits: 659.4 E(32554): 2.2e-189 Smith-Waterman score: 3090; 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CCDS42 SS----PQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRER-CPRGDDIL 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 pF1KE1 DMLVKVNALIKDREGYAPGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT .:..:: ..... . . :.: . :: ..: .:: CCDS42 TILTEVNYEVSNKD-----DKKNMGKQMPQPTFTLRKKL-VFPSD 460 470 480 490 >>CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (538 aa) initn: 321 init1: 227 opt: 421 Z-score: 479.0 bits: 98.1 E(32554): 2.3e-20 Smith-Waterman score: 423; 30.8% identity (63.2% similar) in 266 aa overlap (192-447:285-536) 170 180 190 200 210 pF1KE1 EHSLDNKDGPVCLQVKPCTPEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKE------ :...:.::: :...: .:. .: CCDS42 FSNGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 -LEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVAL .. :.: .: ..:.: :. : .... : :.... : :. . :: : : : . 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