FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1183, 703 aa 1>>>pF1KE1183 703 - 703 aa - 703 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6165+/-0.000754; mu= 15.4883+/- 0.046 mean_var=111.0946+/-21.932, 0's: 0 Z-trim(112.2): 29 B-trim: 15 in 1/53 Lambda= 0.121682 statistics sampled from 12972 (13001) to 12972 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16 Scan time: 3.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 715) 4034 718.9 6.3e-207 CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 430) 2625 471.4 1.2e-132 CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 668) 2163 390.4 4.5e-108 CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 515) 1968 356.1 7.3e-98 CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 594) 1968 356.2 8.2e-98 CCDS62900.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 537) 1955 353.9 3.7e-97 CCDS81576.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 495) 1665 302.9 7.3e-82 CCDS95.1 RERE gene_id:473|Hs108|chr1 (1566) 416 84.0 1.9e-15 >>CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (715 aa) initn: 3996 init1: 3996 opt: 4034 Z-score: 3828.5 bits: 718.9 E(32554): 6.3e-207 Smith-Waterman score: 4706; 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CCDS55 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYMSSLRILLDILEEIWWLENANPV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPHGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTR CCDS55 RWREARTKPQ 430 >>CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 (668 aa) initn: 2315 init1: 1511 opt: 2163 Z-score: 2053.8 bits: 390.4 E(32554): 4.5e-108 Smith-Waterman score: 2663; 59.7% identity (77.1% similar) in 717 aa overlap (1-703:1-668) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::.: .::: CCDS80 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT ..: :.::: ..: . :. .:::.:::::::::.:::::: CCDS80 SNAR-----------------EFEEESKQP---GVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPAT 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL ::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.: : CCDS80 HIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM : ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::: CCDS80 LVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHM 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL ::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: :::::: CCDS80 SAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEAL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN :::::::.::.:::::::::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::.:. 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CCDS80 LPLATIVKDLVAQA-PLKP---KTPRGTKTPINRNQLSQ--NRGLGGIMVKRAYETMAGA 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE1 DGLANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATE :. : . ::. . ::..: : .::...: :::. : ..::. 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CCDS82 HIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEM 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM : ::: : :.::.::..::. ..::::.::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS82 LLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHM 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL ::::::::::::::::::... ::.:.:::.::: ::::::::::::::::::.:::::: CCDS82 SAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEAL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN :::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. 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CCDS81 TTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSI 270 280 290 300 310 320 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 RLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINN :::.:...:: .. :: :: .... : .. : :: :. .. . .. ... : CCDS81 RLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQA-PLKP---KTPRGTKTPINRNQLSQ--NR 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 pF1KE1 GSPTILGKRSYEQHNGVDGLANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRR : :. ::.:: :. :. .. : : : .: ::..: : .::. CCDS81 GLGGIMVKRAYETMAGA-GVPFSANGR---P----LASG---------IRSSSQPAAKRQ 380 390 400 410 420 640 650 660 670 680 690 pF1KE1 RMNWIDAPDDVFYMATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQ-ALPPRPPPPAP ..: :::. : ..::..:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : : ::: CCDS81 KLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAP 430 440 450 460 470 480 700 pF1KE1 VN----DEPIVIED . .::::.:: CCDS81 SHPASTNEPIVLED 490 >>CCDS95.1 RERE gene_id:473|Hs108|chr1 (1566 aa) initn: 515 init1: 225 opt: 416 Z-score: 391.0 bits: 84.0 E(32554): 1.9e-15 Smith-Waterman score: 565; 25.4% identity (53.7% similar) in 630 aa overlap (103-699:222-826) 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 PGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPATHIRGKCSVTLLN ...::::.: ... :. .::::... .. CCDS95 EVPDSVYQHLVQDRHNENDSGRELVITDPVIKNRELFISDYVDTYHAAALRGKCNISHFS 200 210 220 230 240 250 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 ETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDLLKEGEEDGRDQS . . . . : : ::: : :.:. . : . .:::::: .:: . :: :: . CCDS95 DIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNSTQGEIRVGPSHQAKLPDLQPFPSPDGDTVT 260 270 280 290 300 310 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 RLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLF . : :: ..: .. ..: .:::...:: : .:. . . .::::: : . CCDS95 QHEELVWMP--GVNDCDLLMYLRAARSMAAFAGMCDGGST------EDGCVAASRDDTTL 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 HAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEALEKYGKDFTDIQQ .:..:::.. :: .::.. :: . : : . . :. .:.. : ..:..:::.: :.. CCDS95 NALNTLHESGYDAGKALQRLVKKPVPKLIE---KCWTEDEVKRFVKGLRQYGKNFFRIRK 370 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 pF1KE1 DFLPWKSLTSIIEYYYMWKTT-----DRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYNKPN--PN ..:: : .: .::.:: : .: ...: .:. . : . . : : :. :. CCDS95 ELLPNKETGELITFYYYWKKTPEAASSRAHRRHRRQAVFRRIKTRTASTP-VNTPSRPPS 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 QISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASCWTYWK . .. .:. . . ... : ::. :.:: : .:. : :. ::..: ..: CCDS95 SEFLDLSSASEDDFDSEDSEQELKGYACRHCFTTTSKDWHHGGRENIL--LCTDCRIHFK 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 KYGGLKMPTRLDGERP-GPNRSNMSPHGLPARSSG-SPKFAMKTRQAFYLHTTKLTRIAR ::: : : :.: : ..: . ...: : : .:.::.. .: : .: CCDS95 KYGELP-PI----EKPVDPPPFMFKP--VKEEDDGLSGKHSMRTRRSRGSMST--LRSGR 540 550 560 570 580 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 RLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLET . .. : . : :.. .. .: ... ..:....: : . :.. 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CCDS95 TPSATAVPPQGSPTASQAPNQPQAPTAPVPHTHIQQAPALHPQRPPSPHPPPHPSPHPPL 770 780 790 800 810 820 700 pF1KE1 VIED CCDS95 QPLTGSAGQPSAPSHAQPPLHGQGPPGPHSLQAGPLLQHPGPPQPFGLPPQASQGQAPLG 830 840 850 860 870 880 703 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:02:40 2016 done: Sun Nov 6 22:02:41 2016 Total Scan time: 3.870 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]