FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8287, 422 aa 1>>>pF1KB8287 422 - 422 aa - 422 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5455+/-0.000686; mu= 12.3689+/- 0.042 mean_var=308.2982+/-62.365, 0's: 0 Z-trim(113.2): 2013 B-trim: 84 in 1/54 Lambda= 0.073045 statistics sampled from 20154 (22464) to 20154 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16 Scan time: 8.810 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003408 (OMIM: 604668) zinc finger protein 264 [ ( 627) 1684 192.5 2.6e-48 XP_011525824 (OMIM: 604668) PREDICTED: zinc finger ( 595) 1336 155.8 2.7e-37 NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [ ( 600) 1234 145.0 4.7e-34 NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1158 136.9 1.1e-31 NP_003432 (OMIM: 194648,615226) zinc finger protei ( 474) 1145 135.5 2.8e-31 XP_016864080 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc ( 534) 1145 135.6 3e-31 NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 i ( 457) 1128 133.7 9.6e-31 XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 457) 1128 133.7 9.6e-31 NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 is ( 533) 1120 132.9 1.9e-30 XP_016875410 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 546) 1120 132.9 1.9e-30 NP_001243208 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 566) 1120 133.0 1.9e-30 XP_016875409 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 575) 1120 133.0 1.9e-30 XP_011533136 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1116 132.4 2.3e-30 XP_011533135 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1116 132.4 2.3e-30 XP_011515622 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1104 131.2 5.8e-30 XP_016869365 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1104 131.2 5.8e-30 NP_001273699 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 520) 1104 131.2 5.9e-30 XP_011515620 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1104 131.3 6e-30 XP_011515617 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1104 131.3 6e-30 XP_011515618 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1104 131.3 6e-30 NP_001273698 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 539) 1104 131.3 6e-30 XP_016869364 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1104 131.3 6e-30 XP_016869361 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1104 131.3 6.1e-30 XP_016869363 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1104 131.3 6.1e-30 XP_016869362 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1104 131.3 6.1e-30 NP_085057 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 is ( 560) 1104 131.3 6.1e-30 XP_011515616 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1104 131.3 6.1e-30 NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1091 129.8 1.5e-29 NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1091 129.8 1.5e-29 XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1091 129.8 1.5e-29 NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1091 129.8 1.5e-29 NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1091 129.8 1.5e-29 NP_001317551 (OMIM: 604755) zinc finger protein 46 ( 521) 1087 129.4 2e-29 XP_016881665 (OMIM: 604755) PREDICTED: zinc finger ( 555) 1087 129.5 2.1e-29 NP_006626 (OMIM: 604755) zinc finger protein 460 i ( 562) 1087 129.5 2.1e-29 NP_001317442 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1085 129.2 2.3e-29 NP_001317443 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1085 129.2 2.3e-29 XP_016875411 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1085 129.2 2.3e-29 XP_016875412 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1085 129.2 2.3e-29 XP_005266240 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1085 129.2 2.3e-29 NP_001128650 (OMIM: 609601) zinc finger protein 39 ( 534) 1079 128.6 3.7e-29 XP_016881531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 534) 1079 128.6 3.7e-29 XP_011524533 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 534) 1079 128.6 3.7e-29 XP_011524531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1079 128.6 3.8e-29 XP_006722621 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1079 128.6 3.8e-29 XP_011524532 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1079 128.6 3.8e-29 NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1078 128.6 4.1e-29 NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1078 128.6 4.2e-29 XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1078 128.6 4.2e-29 NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1078 128.6 4.3e-29 >>NP_003408 (OMIM: 604668) zinc finger protein 264 [Homo (627 aa) initn: 1163 init1: 1163 opt: 1684 Z-score: 988.4 bits: 192.5 E(85289): 2.6e-48 Smith-Waterman score: 1684; 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70.7% identity (84.3% similar) in 140 aa overlap (283-422:391-530) 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 HTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGE ::::. ::.: ::::: :::: :.:.:::: XP_011 HTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGE 370 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 KPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYE :::::::: :::::: ::.:. ::::::::.:. ::::: : : .:.:::.:::::: XP_011 KPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYE 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 pF1KB8 CTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT :..:::.: :: ::.:..::::: :::: ::::::.: : : ::::.:: XP_011 CVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDV 490 500 510 520 530 540 XP_011 GRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL 550 560 570 580 590 >>NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [Homo (600 aa) initn: 1224 init1: 1224 opt: 1234 Z-score: 732.3 bits: 145.0 E(85289): 4.7e-34 Smith-Waterman score: 1325; 58.5% identity (81.4% similar) in 311 aa overlap (113-422:108-418) 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 AGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSDSRLGRARDEEGLLEMQKGKVTP : ...:..:.::...:..: :::. .. NP_998 SYPGDNTKPKTTEPTFSHLALPEEVLLQEQLTQGASKNSQLGQSKDQDGPSEMQEVHLKI 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 ETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSADV-LHECDSQQPGKDALIHAGTN .. : :.: : .:::.:::. .. :. .:.. :.::::. : ::::. : NP_998 GIGPQRGKLLEKMSSERDGLGSDDGVCTKITQKQVSTEGDLYECDSHGPVTDALIREEKN 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 PYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYECNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKC :::..::: :... ::.:.:.:: .:::::. :::.::.:. :..: .:::::::::: NP_998 SYKCEECGKVFKKNALLVQHERIHTQVKPYECTECGKTFSKSTHLLQHLIIHTGEKPYKC 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KB8 LECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECE .::::::.:::.: .:. ::.:::::.::.: :::::::::. :.:.::::::: :::: NP_998 MECGKAFNRRSHLTRHQRIHSGEKPYKCSECGKAFTHRSTFVLHHRSHTGEKPFVCKECG 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KB8 KAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFH ::: .: .:.:::::::::::.:. ::::: : : ::.:::: ::.::..::::: NP_998 KAFRDRPGFIRHYIIHTGEKPYECIECGKAFNRRSYLTWHQQIHTGVKPFECNECGKAFC 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 pF1KB8 RSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT .:. :::: .::::: ::::.::::::.::::: ::::.:: NP_998 ESADLIQHYIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLKQHQRIHTGEKPYECSECGKAFTHCST 380 390 400 410 420 430 NP_998 FVLHKRTHTGEKPYECKECGKAFSDRADLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFNRSSHLTRH 440 450 460 470 480 490 >-- initn: 1920 init1: 758 opt: 758 Z-score: 461.2 bits: 94.9 E(85289): 6e-19 Smith-Waterman score: 758; 73.6% identity (87.1% similar) in 140 aa overlap (283-422:419-558) 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 HTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGE ::::::::.: ::::: :::. :.:::::: NP_998 HTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLKQHQRIHTGEKPYECSECGKAFTHCSTFVLHKRTHTGE 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 KPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYE ::.::::: ::::.:: ::.:. ::::::::.:. ::::: ::.: .::.::::::::: NP_998 KPYECKECGKAFSDRADLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFNRSSHLTRHQQIHTGEKPYE 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 pF1KB8 CTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT : :::::: ::. ::.::.::::: ::.: ::::::.: : : .:::.:: NP_998 CIQCGKAFCRSANLIRHSIIHTGEKPYECSECGKAFNRGSSLTHHQRIHTGRNPTIVTDV 510 520 530 540 550 560 NP_998 GRPFMTAQTSVNIQELLLGKEFLNITTEENLW 570 580 590 600 >-- initn: 368 init1: 357 opt: 364 Z-score: 236.8 bits: 53.4 E(85289): 1.9e-06 Smith-Waterman score: 364; 56.9% identity (80.4% similar) in 102 aa overlap (7-108:4-105) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL .::. :::.:::::::.::: ::: ::::::.::::::::::.::: . :::: NP_998 MAASAQVSVTFEDVAVTFTQEEWGQLDAAQRTLYQEVMLETCGLLMSLGCPLFKPEL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSD .. :.: ::::.. . ::... :: .. .: ::: .: :...:. NP_998 IYQLDHRQELWMATKDLSQSSYPGDNTKPKTTEPTFSHLALPEEVLLQEQLTQGASKNSQ 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 SRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSAD NP_998 LGQSKDQDGPSEMQEVHLKIGIGPQRGKLLEKMSSERDGLGSDDGVCTKITQKQVSTEGD 120 130 140 150 160 170 >>NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [Homo (506 aa) initn: 1107 init1: 1107 opt: 1158 Z-score: 689.7 bits: 136.9 E(85289): 1.1e-31 Smith-Waterman score: 1158; 43.2% identity (68.0% similar) in 419 aa overlap (12-422:27-437) 10 20 30 40 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETC :.:.:::: :::.::..:: ::::....::::: NP_003 MPANGTSPQRFPALIPGEPGRSFEGSVSFEDVAVDFTRQEWHRLDPAQRTMHKDVMLETY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 GLLVSLGHRVPKPELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERA . :.:.: : :::.. ::.:.::::... : .:. . . . . . NP_003 SNLASVGLCVAKPEMIFKLERGEELWILEEESSGHGYSGSLSLLCGNGSVGDNALRHDND 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 FLRGS--LTLESSTSSDSRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETH-LGKVSLEGEGL .:. . ::.... .. ... :.. . : ::. : . : : ::. . .: NP_003 LLHHQKIQTLDQNVEYNGCRKAFHEKTGFV---RRKRTPRGDKNFECHECGKAYCRKSNL 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB8 GTDDGLHSRALQEWLSADVLHECDSQQPGKDALI-----HAGTNPYKCKQCGKGFNRKWY .:. . . . . :: . ... :: :.: :..:..:::.:.:: NP_003 VEHLRIHT-GERPYECG----ECAKTFSARSYLIAHQKTHTGERPFECNECGKSFGRKSQ 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 LVRHQRVHTGMKPYECNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQH :. : :.::: .::::. :::.::...:: : :::::::.: ::::.:. . : :: NP_003 LILHTRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECSECGKTFRVKISLTQH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB8 HPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIH : :::::::::..: : : .... .:.: ::::::.:: :: : : . : .: : NP_003 HRTHTGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPYECGECGKFFRMKMTLNNHQRTH 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB8 TGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEM ::::::.: :::.:: : : :::::::::::::..::.::. .. ::.:. .:.:: NP_003 TGEKPYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNECGNAFYVKARLIEHQRMHSGEK 360 370 380 390 400 410 400 410 420 pF1KB8 PYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT ::.: :::: :. .. : ::.:.:: NP_003 PYECSECGKIFSMKKSLCQHRRTHTGEKPYECSECGNAFYVKVRLIEHQRIHTGERPFEC 420 430 440 450 460 470 >>NP_003432 (OMIM: 194648,615226) zinc finger protein 14 (474 aa) initn: 1001 init1: 1001 opt: 1145 Z-score: 682.5 bits: 135.5 E(85289): 2.8e-31 Smith-Waterman score: 1145; 43.4% identity (65.2% similar) in 422 aa overlap (11-422:3-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL :.::.:::. :. :::. :: :..:::.::::. ::::: . .:.: NP_003 MELLTFRDVAIEFSPEEWKCLDPDQQNLYRDVMLENYRNLVSLGVAISNPDL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSD : ::. .: . :: : : :. .: : .: . : . . : NP_003 VTCLEQRKEPYNVK---IHKIVARPPAMCSHFTQDHWPVQGIEDSFHKLILRRYEKCGHD 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB8 S-RLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSA . .: .. . ..::: . .. . :. .:. .. . . . . .. . NP_003 NLQLRKGCKSLNECKLQKGGYNEFNECLSTTQ-SKILQCKASVKVVSKFSNSNKRKTRHT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 DVLH--ECD-SQQP----GKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLV--RHQRVHTGMKP : :: : : . .:::: .:: :..:::.: :: :. .:.:.::: :: NP_003 GEKHFKECGKSFQKFSHLTQHKVIHAGEKPYTCEECGKAF--KWSLIFNEHKRIHTGEKP 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 YECNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECS . :. ::. :. :: . .: .:::::::::: ::::::.: . : .:. ::.:::: : NP_003 FTCEECGSIFTTSSHFAKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRFTTLTKHKRIHAGEKPITCE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 QCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGK .::: :: :.: .:.: ::::::..:.:: :::. . : .: :::::::: : ::: NP_003 ECRKIFTSSSNFAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 AFRCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKR ::: ::.: .:...::::.::.: .::::: :: : .:. ::::: :::: ::::::.: NP_003 AFRQSSKLNEHKKVHTGERPYKCDECGKAFGRSRVLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFRR 350 360 370 380 390 400 420 pF1KB8 RSHLLQHQRVHT . ::...:. NP_003 STDRSQHKKIHSADKPYKCKECDKAFKQFSLLSQHKKIHTVDKPYKCKDCDKAFKRFSHL 410 420 430 440 450 460 >>XP_016864080 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc fin (534 aa) initn: 1001 init1: 1001 opt: 1145 Z-score: 682.1 bits: 135.6 E(85289): 3e-31 Smith-Waterman score: 1145; 43.4% identity (65.2% similar) in 422 aa overlap (11-422:63-478) 10 20 30 40 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREV :.::.:::. :. :::. :: :..:::.: XP_016 IGSAENAMFEDDDWWSWDEKYLCCDNGVGELLTFRDVAIEFSPEEWKCLDPDQQNLYRDV 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 MLETCGLLVSLGHRVPKPELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPV :::. ::::: . .:.:: ::. .: . :: : : :. .: XP_016 MLENYRNLVSLGVAISNPDLVTCLEQRKEPYNVK---IHKIVARPPAMCSHFTQDHWPVQ 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 pF1KB8 LSERAFLRGSLTLESSTSSDS-RLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEG : .: . : . . :. .: .. . ..::: . .. . :. .:. XP_016 GIEDSFHKLILRRYEKCGHDNLQLRKGCKSLNECKLQKGGYNEFNECLSTTQ-SKILQCK 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 EGLGTDDGLHSRALQEWLSADVLH--ECD-SQQP----GKDALIHAGTNPYKCKQCGKGF .. . . . . .. . : :: : : . .:::: .:: :..:::.: XP_016 ASVKVVSKFSNSNKRKTRHTGEKHFKECGKSFQKFSHLTQHKVIHAGEKPYTCEECGKAF 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 NRKWYLV--RHQRVHTGMKPYECNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKR :: :. .:.:.::: ::. :. ::. :. :: . .: .:::::::::: ::::::.: XP_016 --KWSLIFNEHKRIHTGEKPFTCEECGSIFTTSSHFAKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNR 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KB8 RSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHL . : .:. ::.:::: : .::: :: :.: .:.: ::::::..:.:: :::. . : XP_016 FTTLTKHKRIHAGEKPITCEECRKIFTSSSNFAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTTL 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KB8 IQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHS .: :::::::: : :::::: ::.: .:...::::.::.: .::::: :: : .:. XP_016 TKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFRQSSKLNEHKKVHTGERPYKCDECGKAFGRSRVLNEHK 390 400 410 420 430 440 400 410 420 pF1KB8 VIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT ::::: :::: ::::::.: . ::...:. XP_016 KIHTGEKPYKCEECGKAFRRSTDRSQHKKIHSADKPYKCKECDKAFKQFSLLSQHKKIHT 450 460 470 480 490 500 XP_016 VDKPYKCKDCDKAFKRFSHLNKHKKIHT 510 520 530 >>NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 isofo (457 aa) initn: 948 init1: 948 opt: 1128 Z-score: 673.0 bits: 133.7 E(85289): 9.6e-31 Smith-Waterman score: 1163; 44.4% identity (65.7% similar) in 423 aa overlap (8-422:2-408) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL .: :::.:::. :..:::. :. ::: ::: ::::. : ::::: . ::.. NP_003 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHA--TCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTS : :::.:.: :. :: ... . . . .... : . : . .. . .. . NP_003 VSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 SDSRLG-RARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKET---HLGKVSLEGEGLGTDDGLH--SRA :. . : . .:. .:. ..: . : :.:. :.. ..: : : ... NP_003 SSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVE-----RPYGCHECGKT 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 LQEWLSADVLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYE . . .: :::. :.: .:: ::.::: :.. ::.:: .::: ::.: NP_003 FGRRFSL-VLHQ----------RTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHE 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQC :. :.:.:: : ::.: :::::::.: ::::::.: : : .:. :: :.: : : .: NP_003 CKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKC 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAF :::. : .:::. :::::::.:: :: ::: .:: .: ::: . ::.: : ::: NP_003 GKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAF 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 RCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRS :: : ::.:::::.::: ::: .:::.: . ::::. :::: :: : :: :::.: NP_003 RCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSF 340 350 360 370 380 390 420 pF1KB8 HLLQHQRVHT :. :::.:: NP_003 SLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ 400 410 420 430 440 450 >>XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger pro (457 aa) initn: 948 init1: 948 opt: 1128 Z-score: 673.0 bits: 133.7 E(85289): 9.6e-31 Smith-Waterman score: 1163; 44.4% identity (65.7% similar) in 423 aa overlap (8-422:2-408) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL .: :::.:::. :..:::. :. ::: ::: ::::. : ::::: . ::.. XP_011 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHA--TCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTS : :::.:.: :. :: ... . . . .... : . : . .. . .. . XP_011 VSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 SDSRLG-RARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKET---HLGKVSLEGEGLGTDDGLH--SRA :. . : . .:. .:. ..: . : :.:. :.. ..: : : ... XP_011 SSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVE-----RPYGCHECGKT 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 LQEWLSADVLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYE . . .: :::. :.: .:: ::.::: :.. ::.:: .::: ::.: XP_011 FGRRFSL-VLHQ----------RTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHE 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQC :. :.:.:: : ::.: :::::::.: ::::::.: : : .:. :: :.: : : .: XP_011 CKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKC 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAF :::. : .:::. :::::::.:: :: ::: .:: .: ::: . ::.: : ::: XP_011 GKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAF 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 RCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRS :: : ::.:::::.::: ::: .:::.: . ::::. :::: :: : :: :::.: XP_011 RCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSF 340 350 360 370 380 390 420 pF1KB8 HLLQHQRVHT :. :::.:: XP_011 SLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ 400 410 420 430 440 450 >>NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 isofor (533 aa) initn: 2603 init1: 925 opt: 1120 Z-score: 667.8 bits: 132.9 E(85289): 1.9e-30 Smith-Waterman score: 1120; 42.7% identity (65.4% similar) in 419 aa overlap (11-422:13-421) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKP :..:::... :: .::. :: .:. :::.:.::. :.:.:.. :: NP_062 MATSFRTASCWGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDSTQKYLYRDVILENYHNLISVGYHGTKP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 ELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSL-TLESST .:. ::.:.. ::.. .:. .: . . . . ::.. . : :. : NP_062 DLIFKLEQGEDPWIINAKISRQSCPDGWEEWYQNNQDELESI--ERSYACSVLGRLNLSK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 SSDSRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGL-HSRALQEW . :: .: : : .:: ... ....: : . .: : :.:: . 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XP_016 KPYECNECEKAYPRKASLQIHQKTHSGEKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGEKPWK 470 480 490 500 510 520 380 390 400 410 420 pF1KB8 CTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT :..:::.: .. : : : XP_016 CSECGKSFCWNSGLRIHRKTHK 530 540 422 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:09:45 2016 done: Sun Nov 6 22:09:47 2016 Total Scan time: 8.810 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]