Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0068, 512 aa
1>>>pF1KE0068 512 - 512 aa - 512 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4748+/-0.000356; mu= 23.0912+/- 0.022
mean_var=65.9670+/-13.729, 0's: 0 Z-trim(113.3): 192 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.157910
statistics sampled from 22300 (22518) to 22300 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 7.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_997303 (OMIM: 610371) solute carrier family 2, ( 512) 3300 760.9 0
XP_011539126 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 517) 2844 657.0 3.7e-188
XP_011539127 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 383) 2390 553.5 4e-157
XP_016857626 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857625 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857624 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
NP_003030 (OMIM: 138230) solute carrier family 2, ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857622 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857629 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857623 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_005263548 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857630 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
NP_001315548 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
XP_016857627 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1991 462.7 1.1e-129
NP_001315549 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 457) 1798 418.7 1.8e-116
XP_016857631 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 442) 1647 384.3 4e-106
XP_006714031 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 563) 1467 343.4 1.1e-93
NP_001001290 (OMIM: 606142,612076) solute carrier ( 511) 1451 339.7 1.2e-92
NP_064425 (OMIM: 606142,612076) solute carrier fam ( 540) 1451 339.7 1.3e-92
XP_016863946 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 609) 1449 339.3 1.9e-92
XP_011512162 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 537) 1448 339.0 2e-92
XP_011512161 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 538) 1448 339.0 2e-92
NP_001315550 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 354) 1424 333.4 6.7e-91
NP_001033 (OMIM: 138190) solute carrier family 2, ( 509) 1300 305.3 2.8e-82
NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carr ( 492) 1296 304.4 5.1e-82
NP_110434 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, ( 503) 1279 300.5 7.6e-81
NP_001020109 (OMIM: 610367) solute carrier family ( 496) 1273 299.1 1.9e-80
NP_001020110 (OMIM: 610367) solute carrier family ( 499) 1273 299.1 2e-80
XP_016863947 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 487) 1265 297.3 6.8e-80
XP_011512163 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 486) 1257 295.5 2.4e-79
XP_011512160 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 586) 1257 295.6 2.7e-79
XP_011512159 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 586) 1257 295.6 2.7e-79
XP_011512158 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 615) 1257 295.6 2.8e-79
NP_008862 (OMIM: 138170) solute carrier family 2, ( 496) 1243 292.3 2.2e-78
XP_016874332 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1212 285.3 3.1e-76
XP_016874331 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1212 285.3 3.1e-76
XP_016874333 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1212 285.3 3.1e-76
XP_016874330 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1212 285.3 3.1e-76
XP_016874334 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1212 285.3 3.1e-76
XP_016874335 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
XP_005253374 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
XP_005253372 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
NP_001273163 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
NP_001273164 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
XP_011518864 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
XP_016874336 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
XP_011518865 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1203 283.2 1.2e-75
NP_001273162 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 520) 1203 283.2 1.3e-75
NP_703150 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, ( 520) 1203 283.2 1.3e-75
NP_001273166 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 535) 1203 283.2 1.3e-75
>>NP_997303 (OMIM: 610371) solute carrier family 2, faci (512 aa)
initn: 3300 init1: 3300 opt: 3300 Z-score: 4060.6 bits: 760.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3300; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQEAIGAYSFIIFAGICLLTAIYIYVVIPETKGKTFVEINRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQEAIGAYSFIIFAGICLLTAIYIYVVIPETKGKTFVEINRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE0 FAKRNRVKLPEEKEETIDAGPPTASPAKETSF
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FAKRNRVKLPEEKEETIDAGPPTASPAKETSF
490 500 510
>>XP_011539126 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carrier (517 aa)
initn: 2844 init1: 2844 opt: 2844 Z-score: 3499.1 bits: 657.0 E(85289): 3.7e-188
Smith-Waterman score: 2844; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQEAIGAYSFIIFAGICLLTAIYIYVVIPETKGKTFVEINRI
::::::::::::::::::::
XP_011 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQGPTSGRASLCQSSWVAGLQGWNPGASETHSGDWSPEGKAH
430 440 450 460 470 480
>>XP_011539127 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carrier (383 aa)
initn: 2414 init1: 2390 opt: 2390 Z-score: 2941.8 bits: 553.5 E(85289): 4e-157
Smith-Waterman score: 2390; 99.7% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
::::::::::::.
XP_011 ACLVLTVVLLFQSPQGPWRCPDI
370 380
>>XP_016857626 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carrier (501 aa)
initn: 2016 init1: 1988 opt: 1991 Z-score: 2449.1 bits: 462.7 E(85289): 1.1e-129
Smith-Waterman score: 1991; 59.9% identity (84.3% similar) in 491 aa overlap (15-505:9-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
.:::: .: :::: :::::.::::::...::.: ....::::::
XP_016 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
. : . ::. . :::: ::::::.::..:::::: ::.. ::::.::.::::.:.:::
XP_016 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
::: :.:: .::::..::...:.:::.: ...:::::::::::::: .:.. ..:. ::.
XP_016 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
..::::.:. .:.: :::.::.:::::: :::: :::::::::: :::: :::.:..::
XP_016 LVAQIFGLRNLLANVDGWPILLGLTGVPAALQLLLLPFFPESPRYLLIQKKDEAAAKKAL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
. ::: ... :. ..: : .::.: : .:::.: .::::::::::::::.::::::.:
XP_016 QTLRGWDSVDREVAEIRQEDEAEKAAGFISVLKLFRMRSLRWQLLSIIVLMGGQQLSGVN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AINYYADTIYTSAGVEAAHSQYVTVGSGVVNIVMTITSAVLVERLGRRHLLLAGYGICGS
:: :::: :: :::: : ::::.:.:.::.:::. .. .:: :::: ::: :..::
XP_016 AIYYYADQIYLSAGVPEEHVQYVTAGTGAVNVVMTFCAVFVVELLGRRLLLLLGFSICLI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ACLVLTVVLLFQNRVPELSYLGIICVFAYIAGHSIGPSPVPSVVRTEIFLQSSRRAAFMV
:: :::..: .:. : . :..:.::..:. ::..::::.:... ::::::::: .::::
XP_016 ACCVLTAALALQDTVSWMPYISIVCVISYVIGHALGPSPIPALLITEIFLQSSRPSAFMV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQEAIGAYSFIIFAGICLLTAIYIYVVIPETKGKTFVEINRI
:.::::.:: .:..:: :::..: ::::.:: :::::.:::....::::.:::.:::.:
XP_016 GGSVHWLSNFTVGLIFPFIQEGLGPYSFIVFAVICLLTTIYIFLIVPETKAKTFIEINQI
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KE0 FAKRNRVKLPEEKEETIDAGPPTASPAKETSF
:.: :.:. ..: . ::..:
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