Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6306
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6306, 280 aa
1>>>pF1KB6306 280 - 280 aa - 280 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3518+/-0.00134; mu= 1.9378+/- 0.078
mean_var=317.2531+/-78.078, 0's: 0 Z-trim(110.4): 112 B-trim: 1053 in 2/49
Lambda= 0.072006
statistics sampled from 11461 (11579) to 11461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 2.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30678.1 FHL3 gene_id:2275|Hs108|chr1 ( 280) 2147 236.5 1.6e-62
CCDS2070.1 FHL2 gene_id:2274|Hs108|chr2 ( 279) 1301 148.6 4.6e-36
CCDS5035.1 FHL5 gene_id:9457|Hs108|chr6 ( 284) 1180 136.1 2.8e-32
CCDS14655.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 280) 1037 121.2 8.2e-28
CCDS55506.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 296) 1037 121.3 8.5e-28
CCDS55505.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 309) 1037 121.3 8.7e-28
CCDS55507.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 323) 892 106.2 3.1e-23
CCDS76036.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 194) 632 78.9 3.1e-15
CCDS83493.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 210) 632 79.0 3.2e-15
>>CCDS30678.1 FHL3 gene_id:2275|Hs108|chr1 (280 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 1235.9 bits: 236.5 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 2147; 100.0% identity (100.0% similar) in 280 aa overlap (1-280:1-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
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CCDS30 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
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CCDS30 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQP
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CCDS30 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQP
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190 200 210 220 230 240
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CCDS30 WHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLGGGKYVSFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB6 DRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
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CCDS30 DRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
250 260 270 280
>>CCDS2070.1 FHL2 gene_id:2274|Hs108|chr2 (279 aa)
initn: 1679 init1: 1287 opt: 1301 Z-score: 761.0 bits: 148.6 E(32554): 4.6e-36
Smith-Waterman score: 1301; 53.8% identity (82.7% similar) in 277 aa overlap (1-277:1-277)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
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CCDS20 MTERFDCHHCNESLFGKKYILREESPYCVVCFETLFANTCEECGKPIGCDCKDLSYKDRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
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CCDS20 WHEACFHCSQCRNSLVDKPFAAKEDQLLCTDCYSNEYSSKCQECKKTIMPGTRKMEYKGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQP
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CCDS20 SWHETCFICHRCQQPIGTKSFIPKDNQNFCVPCYEKQHAMQCVQCKKPITTGGVTYREQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLGGGKYVSFE
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CCDS20 WHKECFVCTACRKQLSGQRFTARDDFAYCLNCFCDLYAKKCAGCTNPISGLGGTKYISFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB6 DRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
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CCDS20 ERQWHNDCFNCKKCSLSLVGRGFLTERDDILCPDCGKDI
250 260 270
>>CCDS5035.1 FHL5 gene_id:9457|Hs108|chr6 (284 aa)
initn: 1562 init1: 1153 opt: 1180 Z-score: 693.0 bits: 136.1 E(32554): 2.8e-32
Smith-Waterman score: 1180; 48.7% identity (80.1% similar) in 271 aa overlap (5-275:6-276)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDR
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CCDS50 MTTAHFYCQYCTASLLGKKYVLKDDSPYCVTCYDRVFSNYCEECKKPIESDSKDLCYKDR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 HFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGG
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CCDS50 HWHEGCFKCTKCNHSLVEKPFAAKDERLLCTECYSNECSSKCFHCKRTIMPGSRKMEFKG
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120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QTWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQ
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CCDS50 NYWHETCFVCENCRQPIGTKPLISKESGNYCVPCFEKEFAHYCNFCKKVITSGGITFCDQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLGGGKYVSF
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CCDS50 LWHKECFLCSGCRKDLCEEQFMSRDDYPFCVDCYNHLYANKCVACSKPISGLTGAKFICF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB6 EDRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
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CCDS50 QDSQWHSECFNCGKCSVSLVGKGFLTQNKEIFCQKCGSGMDTDI
250 260 270 280
>>CCDS14655.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (280 aa)
initn: 1308 init1: 896 opt: 1037 Z-score: 612.8 bits: 121.2 E(32554): 8.2e-28
Smith-Waterman score: 1037; 44.2% identity (74.5% similar) in 278 aa overlap (1-277:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
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CCDS14 MAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKCFDKFCANTCVECRKPIGADSKEVHYKNRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
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CCDS14 WHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGCFKAIVAGDQNVEYKGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQP
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CCDS14 VWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCVTCHETKFAKHCVKCNKAITSGGITYQDQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB6 WHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLG-GGKYVSF
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CCDS14 WHADCFVCVTCSKKLAGQRFTAVEDQYYCVDCYKNFVAKKCAGCKNPITGFGKGSSVVAY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB6 EDRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
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CCDS14 EGQSWHDYCFHCKKCSVNLANKRFVFHQEQVYCPDCAKKL
250 260 270 280
>>CCDS55506.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (296 aa)
initn: 1308 init1: 896 opt: 1037 Z-score: 612.5 bits: 121.3 E(32554): 8.5e-28
Smith-Waterman score: 1037; 44.2% identity (74.5% similar) in 278 aa overlap (1-277:17-294)
10 20 30 40
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQ
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CCDS55 MASHRHSGPSSYKVGTMAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKCFDKFCANTCVECR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 QLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSAC
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CCDS55 KPIGADSKEVHYKNRFWHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCAR
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CCDS55 FKAIVAGDQNVEYKGTVWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCVTCHETKFAKHCVK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 CSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSC
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CCDS55 CNKAITSGGITYQDQPWHADCFVCVTCSKKLAGQRFTAVEDQYYCVDCYKNFVAKKCAGC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 KRPIVGLG-GGKYVSFEDRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
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CCDS55 KNPITGFGKGSSVVAYEGQSWHDYCFHCKKCSVNLANKRFVFHQEQVYCPDCAKKL
250 260 270 280 290
>>CCDS55505.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 1308 init1: 896 opt: 1037 Z-score: 612.3 bits: 121.3 E(32554): 8.7e-28
Smith-Waterman score: 1037; 44.2% identity (74.5% similar) in 278 aa overlap (1-277:30-307)
10 20 30
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPC
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CCDS55 MTFYVASLALELIWMLSSPAGPSSYKVGTMAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 YDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCND
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CCDS55 FDKFCANTCVECRKPIGADSKEVHYKNRFWHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNK
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 CYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCV
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CCDS55 CTTREDSPKCKGCFKAIVAGDQNVEYKGTVWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVA
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CCDS55 TCHETKFAKHCVKCNKAITSGGITYQDQPWHADCFVCVTCSKKLAGQRFTAVEDQYYCVD
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 CFGELFAPKCSSCKRPIVGLG-GGKYVSFEDRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQV
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CCDS55 CYKNFVAKKCAGCKNPITGFGKGSSVVAYEGQSWHDYCFHCKKCSVNLANKRFVFHQEQV
250 260 270 280 290 300
280
pF1KB6 LCQGCSQAGP
: :..
CCDS55 YCPDCAKKL
>>CCDS55507.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (323 aa)
initn: 892 init1: 892 opt: 892 Z-score: 530.7 bits: 106.2 E(32554): 3.1e-23
Smith-Waterman score: 892; 45.7% identity (75.7% similar) in 230 aa overlap (1-230:1-230)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
:.:.::: : . : :.::.: :. :. :.:. ::::.::.. :: ::.:. :..:
CCDS55 MAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKCFDKFCANTCVECRKPIGADSKEVHYKNRF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
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CCDS55 WHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGCFKAIVAGDQNVEYKGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQP
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CCDS55 VWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCVTCHETKFAKHCVKCNKAITSGGITYQDQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLGGGKYVSFE
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CCDS55 WHADCFVCVTCSKKLAGQRFTAVEDQYYCVDCYKNFVAKKCAGCKNPITGKRTVSRVSHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB6 DRHWHHNCFSCARCSTSLVGQGFVPDGDQVLCQGCSQAGP
CCDS55 VSKARKPPVCHGKRLPLTLFPSANLRGRHPGGERTCPSWVVVLYRKNRSLAAPRGPGLVK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS76036.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (194 aa)
initn: 612 init1: 612 opt: 632 Z-score: 387.1 bits: 78.9 E(32554): 3.1e-15
Smith-Waterman score: 632; 42.3% identity (72.5% similar) in 182 aa overlap (1-180:1-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRH
:.:.::: : . : :.::.: :. :. :.:. ::::.::.. :: ::.:. :..:
CCDS76 MAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKCFDKFCANTCVECRKPIGADSKEVHYKNRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQ
.:. :::: .: . ::.: :. .:...::: : : .:..: .... :....:: :
CCDS76 WHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGCFKAIVAGDQNVEYKGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB6 TWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTY--RD
.::. :: ::.:.: .:. :: : ::: :.:.::: .:..:.: :... : . .:
CCDS76 VWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCVTCHETKFAKHCVKCNKGLVKAPVWWPMKD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPIVGLGGGKYVS
.:
CCDS76 NPGTTTASTAKNAP
190
>>CCDS83493.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX (210 aa)
initn: 710 init1: 612 opt: 632 Z-score: 386.7 bits: 79.0 E(32554): 3.2e-15
Smith-Waterman score: 632; 42.3% identity (72.5% similar) in 182 aa overlap (1-180:17-198)
10 20 30 40
pF1KB6 MSESFDCAKCNESLYGRKYIQTDSGPYCVPCYDNTFANTCAECQ
:.:.::: : . : :.::.: :. :. :.:. ::::.::.
CCDS83 MASHRHSGPSSYKVGTMAEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHHCCLKCFDKFCANTCVECR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 QLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDSELLCNDCYCSAFSSQCSAC
. :: ::.:. :..: .:. :::: .: . ::.: :. .:...::: : : .:..:
CCDS83 KPIGADSKEVHYKNRFWHDTCFRCAKCLHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGC
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pF1KB6 GETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCSGCEQPLGSRSFVPDKGAHYCVPCYENKFAPRCAR
.... :....:: : .::. :: ::.:.: .:. :: : ::: :.:.::: .:..
CCDS83 FKAIVAGDQNVEYKGTVWHKDCFTCSNCKQVIGTGSFFPKGEDFYCVTCHETKFAKHCVK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 CSKTLTQGGVTY--RDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDEDPYCVACFGELFAPKCS
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CCDS83 CNKGLVKAPVWWPMKDNPGTTTASTAKNAP
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