Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0750
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0750, 426 aa
1>>>pF1KE0750 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0404+/-0.00216; mu= 15.4474+/- 0.129
mean_var=283.1507+/-50.290, 0's: 0 Z-trim(104.3): 947 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.076219
statistics sampled from 6770 (7829) to 6770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45956.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 426) 2973 341.6 9e-94
CCDS74280.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 425) 2954 339.5 3.8e-93
CCDS12216.2 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 ( 486) 2490 288.5 9.3e-78
CCDS12217.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 354) 2432 281.9 6.7e-76
CCDS82286.1 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 ( 417) 2123 248.1 1.2e-65
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1053 130.8 4e-30
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1045 129.6 6.1e-30
CCDS45550.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 729) 1046 130.1 7e-30
CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 757) 1046 130.1 7.2e-30
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1045 129.9 7.2e-30
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 1042 129.4 8.3e-30
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1034 128.4 1.4e-29
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1034 128.6 1.6e-29
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1034 128.7 1.7e-29
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1031 128.4 2.1e-29
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1030 128.2 2.2e-29
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1024 127.5 3.4e-29
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 1021 127.1 4.1e-29
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1020 127.0 4.6e-29
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1022 127.7 5e-29
CCDS42485.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 430) 1017 126.5 5e-29
CCDS45945.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 423) 1014 126.1 6.3e-29
CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 412) 1013 126.0 6.7e-29
CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19 ( 549) 1011 126.0 8.9e-29
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1010 126.1 1.1e-28
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1007 125.6 1.2e-28
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1005 125.3 1.4e-28
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1006 125.7 1.5e-28
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1003 125.1 1.7e-28
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 1003 125.2 1.7e-28
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1001 124.9 1.9e-28
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1003 125.4 1.9e-28
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1003 125.4 2e-28
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1002 125.3 2.2e-28
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1002 125.3 2.2e-28
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 997 124.4 2.6e-28
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 995 124.1 2.8e-28
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 995 124.2 2.9e-28
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 996 124.7 3.5e-28
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 993 124.1 3.7e-28
CCDS55114.1 ZNF736 gene_id:728927|Hs108|chr7 ( 427) 990 123.5 3.9e-28
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 991 123.8 4.1e-28
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 990 123.8 4.7e-28
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 990 123.8 4.8e-28
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 990 123.8 4.8e-28
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 990 123.9 4.9e-28
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 992 124.6 5.6e-28
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 988 123.8 6e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 983 122.6 6.2e-28
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 986 123.5 6.9e-28
>>CCDS45956.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (426 aa)
initn: 2973 init1: 2973 opt: 2973 Z-score: 1797.0 bits: 341.6 E(32554): 9e-94
Smith-Waterman score: 2973; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLK
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 THSGER
::::::
CCDS45 THSGER
>>CCDS74280.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (425 aa)
initn: 2952 init1: 2175 opt: 2954 Z-score: 1785.7 bits: 339.5 E(32554): 3.8e-93
Smith-Waterman score: 2954; 99.8% identity (99.8% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS74 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQM-TRS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFNP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLK
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 THSGER
::::::
CCDS74 THSGER
420
>>CCDS12216.2 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 (486 aa)
initn: 4865 init1: 1848 opt: 2490 Z-score: 1509.5 bits: 288.5 E(32554): 9.3e-78
Smith-Waterman score: 2490; 83.9% identity (92.8% similar) in 428 aa overlap (1-426:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
:.:. .:.::: ::::::::::::. ::::. ...::::::::::::.:::::::::::
CCDS12 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
:.:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::: ::.
CCDS12 TEKYLYRDVMLENYMNLASV--------EWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQM-TRG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 YSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKF
:::::::. :::::: ::::::::::.:::::: ::::::::..::::::: :::::::
CCDS12 YSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTGQELSKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECE
::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS12 NPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFR
::.:.::::::::::::::::.:::.::::::::::: : .:::::::::::::::::::
CCDS12 RAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTG
::: .: :::::::::::::: :::::::::.::.::::::::::::::::::::.::.:
CCDS12 NSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKH
:.::::.:.:.::::::::::::. :..: :: ::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 LSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKH
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 LKTHSGER
:::::::.
CCDS12 LKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIH
420 430 440 450 460 470
>>CCDS12217.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (354 aa)
initn: 2432 init1: 2432 opt: 2432 Z-score: 1476.2 bits: 281.9 E(32554): 6.7e-76
Smith-Waterman score: 2432; 99.7% identity (99.7% similar) in 348 aa overlap (79-426:7-354)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 EFTPEEWALLDTTQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKN
: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSAFDMSHDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 QIFTGIQMQTRSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QIFTGIQMQTRSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKE
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSF
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKE
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKT
280 290 300 310 320 330
410 420
pF1KE0 FITSSHRSKHLKTHSGER
::::::::::::::::::
CCDS12 FITSSHRSKHLKTHSGER
340 350
>>CCDS82286.1 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 (417 aa)
initn: 3290 init1: 1848 opt: 2123 Z-score: 1291.9 bits: 248.1 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 2123; 85.2% identity (92.8% similar) in 359 aa overlap (70-426:1-350)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVTFDDVAVEFTPEEWALLDTTQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRS
::::::::::: :::::::::::
CCDS82 MLENYMNLASV--------EWEIQPRTKRS
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLQQGFLKNQIFTGIQMQTRSYSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNC
::::::::::::.:::: ::.:::::::. :::::: ::::::::::.:::::: ::::
CCDS82 SLQQGFLKNQIFSGIQM-TRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNC
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 YGKDSISVHKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFA
::::..::::::: :::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS82 YGKDTLSVHKEASTGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFA
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SLDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSA
::::::::: :::::::: ::.:.::::::::::::::::.:::.::::::::::: :
CCDS82 SLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYA
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 HAKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRT
.:::::::::::::::::::::: .: :::::::::::::: :::::::::.::.::::
CCDS82 PVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRT
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 HTGIKPYECKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGE
::::::::::::::::.::.::.::::.:.:.::::::::::::. :..: :: ::::::
CCDS82 HTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGE
270 280 290 300 310 320
400 410 420
pF1KE0 KPYECVECGKTFITSSHRSKHLKTHSGER
::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS82 KPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFV
330 340 350 360 370 380
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30 40 50 60 70 80
pF1KE0 EKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDTTQKYLYRDVMLENYMNLASV
. ::: ::..:. :::::::::: ::.:.
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSL
10 20 30 40
90 100
pF1KE0 DF-FFCLT--------------SEWEIQPRTKRSSLQ-----------------------
:. : . :.::.. : . .:.
CCDS12 DLPSRCASKDLSPEKNTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQENQKE
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE0 ---QGFL---KNQIF---TGIQMQTRSYSGWK--LCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGN
::.. : .:: : .....: .: : :..::..: . : :. ..: .
CCDS12 YFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEK
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200
pF1KE0 TFE----GNCYGKDS-ISVHKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKC
.: :. ...:: .:.:.. :.. . :::.:: . : .: .: .:..::::
CCDS12 PYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKC
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KE0 KECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHL---------------KQCV
.::::.: ..: :. .: ::: : .:: .:.: .:.: :.:
CCDS12 EECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECR
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290
pF1KE0 AV-------------HTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFR
: :::.: . :.:::.: :::: : : :.::: .:::::::.:
CCDS12 KVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFI
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTG
.: . : .:::: ::.:: :::::: :...:::: : ::. :::::::::. :.. .
CCDS12 RGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQ
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKH
:. : : ::::::::::::::::::.: ::.:.::::::::::: :::::: .:. ..:
CCDS12 LTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQH
410 420 430 440 450 460
420
pF1KE0 LKTHSGER
. :.::.
CCDS12 ERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLH
470 480 490 500 510 520
>--
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Smith-Waterman score: 806; 54.4% identity (74.4% similar) in 215 aa overlap (203-417:474-685)
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLC
::.::::::.: ..: .:. :: :::
CCDS12 EKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKE
: .::. :.: ::::.: .:::.: ..:::.:. : : . : ::: ..:::
CCDS12 ECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKE
510 520 530 540 550 560
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 CGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQA
::..: .:... : .:::: ::..: ::::::.....:: : : ::: :::::.:: .:
CCDS12 CGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKA
570 580 590 600 610 620
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITS
::: . :. : : ::::::::::::::::.:.: ::::.::: .:: .: ::: :
CCDS12 FTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDF---
630 640 650 660 670 680
420
pF1KE0 SHRSKHLKTHSGER
:: :.
CCDS12 SHGSQVYM
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10 20 30 40 50 60
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:..: ::. :: :::: ::: :: .:.
CCDS71 MNKFQGPVTLKDVIVEFTKEEWKLLTPAQRT
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 LYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSL------QQGFLKNQIFTGIQMQT
::.::::::: .:.:: . . . :. . ..:: ..... ....
CCDS71 LYKDVMLENYSHLVSVGYHVNKPNAVFKLKQGKEPWILEVEFPHRGF-PEDLWSIHDLEA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCY-GKDSISVHKEASIGQELSK
: . ::. ..: ::: . :. . :... ::... .
CCDS71 RYQESQAGNSRNGELTKHQ---KTHTTEKACECKECGKFFCQKSALIVHQHTHSKGKSYD
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQEC
. ::: :. . : : .: . . :.:::: : : ...::. :. : ::: : ..:
CCDS71 CDKCGKSFSKNEDLIRHQKIHTRDKTYECKECKKIFYHLSSLSRHLRTHAGEKPYECNQC
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSF
:... . :: . .:::.: . .::: : . : .: ::: ::: .::::::..:
CCDS71 EKSFYQKPHLTEHQKTHTGEKPFECTECGKFFYVKAYLMVHQKTHTGEKPYECKECGKAF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYT
..: ..:: ..::: ::.:: :::: :.:..:: : :.::: :::::::: . : : .
CCDS71 SQKSHLTVHQRMHTGEKPYKCKECGKFFSRNSHLKTHQRSHTGEKPYECKECRKCFYQKS
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 GLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSK
.:..: :.::::::..:..:::.: .: ::.:.: :::::::::.::::.: ..:
CCDS71 ALTVHQRTHTGEKPFECNKCGKTFYYKSDLTKHQRKHTGEKPYECTECGKSFAVNSVLRL
330 340 350 360 370 380
420
pF1KE0 HLKTHSGER
: .::.::.
CCDS71 HQRTHTGEKPYACKECGKSFSQKSHFIIHQRKHTGEKPYECQECGETFIQKSQLTAHQKT
390 400 410 420 430 440
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100 110 120 130 140 150
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: ::. : .. ::..:.: ..: . . .
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340 350 360 370 380 390
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pF1KE0 CYGKD-----SISVHKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGK
:: ... : .. :.. . :::.: . ::. :.. .:..::.::.:::
CCDS45 YCGKAFTVRCGLTRHVRTHTGEKPYTCKDCGKAFCTSSGLTEHVRTHTGEKPYECKDCGK
400 410 420 430 440 450
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pF1KE0 GFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTN
.: .:: .: :: ::: : ..: .:.: : : . . .:::.: . :.:::...
CCDS45 SFTVSSSLTEHARIHTGEKPYECKQCGKAFTGRSGLTKHMRTHTGEKPYECKDCGKAYNR
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHL
:. :.::: :: : : : .:::::: .: ::::::::::..: .:::.:: :. :
CCDS45 VYLLNEHVKTHTEEKPFICTVCRKSFRNSSCLNKHIQIHTGIKPYECKDCGKTFTVSSSL
520 530 540 550 560 570
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pF1KE0 TQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHR
:.:.::::: :::::: ::.::: . : .:::.::::::: :::::::: :: : .::
CCDS45 TEHIRTHTGEKPYECKVCGKAFTTSSHLIVHIRTHTGEKPYICKECGKAFASSSHLIEHR
580 590 600 610 620 630
400 410 420
pF1KE0 RIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLKTHSGER
: ::::::: : ::::.: .::: :: . :.:..
CCDS45 RTHTGEKPYICNECGKAFRASSHLHKHGRIHTGQKPYKCKECGKAYNRFYLLKEHLKTYT
640 650 660 670 680 690
CCDS45 EEQVFVCKDCGKSFKNSSCLNHHTQIHTDEKPF
700 710 720
>--
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MSAFDMSHG-FFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLD
:.: :..:: :. .: ::.:. . :: : :::.::::::::.:: :::.:::
CCDS45 MAAPDLAHGGHVSRDSVCLHEEQTQAAGMVAGWLINCYQDAVTFDDVAVDFTQEEWTLLD
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 TTQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQT-
.:. :::::::::: ::::: ::.. .:: .:.: .. . .. . ::
CCDS45 PSQRDLYRDVMLENYENLASV--------EWRL--KTKGPALRQD--RSWFRASNETQTA
70 80 90 100
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pF1KE0 RSYSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDS-ISVHKEA-SIGQE
::..: .::. .:::.:::. :.::.:.:: :.. .: : .: : .: .::..
CCDS45 RSHNGGQLCDRTQCGEAFSEHSGLSTHVRTQNTGDSCVSNHYERDFFIPCQKTLFKIGEQ
110 120 130 140 150 160
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pF1KE0 LSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEF
.: .. :::.:. ::... . . : . ::: .
CCDS45 FSVLGQCGKAFSSTPNVVSQ------------QACTRD----RSLD-------------Y
170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECG
. : ... ..:.:. .. :.:... : : :::..:. .. .. : .. :.:::
CCDS45 SSCGEVFLNQSYLQARAGSHNGEETWKWKPCGKALTHSMGCATPVEMHAVRNPHVCRECG
200 210 220 230 240 250
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pF1KE0 RSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFT
..:: .. .. ..:.: : :: . ::::: :. :::::: :.. :: ::::::.:::
CCDS45 KAFRYTAYLTGRVQVHPGEKPCELEECGKASPVSSSLTQHVRIHAAEKPCECKECGKAFT
260 270 280 290 300 310
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pF1KE0 QYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSH
.::. :... :.:::.::.:::: . :..: . :: :::.
CCDS45 GLSGLSKHVQTDPGQKPYECKDCGKACGGFYLLNEHGKTHTREKPFACVVCGKYFRNSSC
320 330 340 350 360 370
420
pF1KE0 RSKHLKTHSGER
CCDS45 LNNHVRIHTGIKPYTCSYCGKAFTVRCGLTRHVRTHTGEKPYTCKDCGKAFCTSSGLTEH
380 390 400 410 420 430
>>CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 (757 aa)
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Smith-Waterman score: 1046; 48.9% identity (70.8% similar) in 305 aa overlap (127-426:395-699)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 KRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGN
: ::. : .. ::..:.: ..: . . .
CCDS73 YECKDCGKACGGFYLLNEHGKTHTREKPFACVVCGKYFRNSSCLNNHVRIHTGIKPYTCS
370 380 390 400 410 420
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 CYGKD-----SISVHKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGK
:: ... : .. :.. . :::.: . ::. :.. .:..::.::.:::
CCDS73 YCGKAFTVRCGLTRHVRTHTGEKPYTCKDCGKAFCTSSGLTEHVRTHTGEKPYECKDCGK
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTN
.: .:: .: :: ::: : ..: .:.: : : . . .:::.: . :.:::...
CCDS73 SFTVSSSLTEHARIHTGEKPYECKQCGKAFTGRSGLTKHMRTHTGEKPYECKDCGKAYNR
490 500 510 520 530 540
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pF1KE0 FSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHL
:. :.::: :: : : : .:::::: .: ::::::::::..: .:::.:: :. :
CCDS73 VYLLNEHVKTHTEEKPFICTVCRKSFRNSSCLNKHIQIHTGIKPYECKDCGKTFTVSSSL
550 560 570 580 590 600
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 TQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHR
:.:.::::: :::::: ::.::: . : .:::.::::::: :::::::: :: : .::
CCDS73 TEHIRTHTGEKPYECKVCGKAFTTSSHLIVHIRTHTGEKPYICKECGKAFASSSHLIEHR
610 620 630 640 650 660
400 410 420
pF1KE0 RIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLKTHSGER
: ::::::: : ::::.: .::: :: . :.:..
CCDS73 RTHTGEKPYICNECGKAFRASSHLHKHGRIHTGQKPYKCKECGKAYNRFYLLKEHLKTYT
670 680 690 700 710 720
CCDS73 EEQVFVCKDCGKSFKNSSCLNHHTQIHTDEKPF
730 740 750
>--
initn: 1412 init1: 485 opt: 552 Z-score: 356.2 bits: 75.8 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 888; 38.4% identity (63.5% similar) in 422 aa overlap (1-400:1-393)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSAFDMSHG-FFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLD
:.: :..:: :. .: ::.:. . :: : :::.::::::::.:: :::.:::
CCDS73 MAAPDLAHGGHVSRDSVCLHEEQTQAAGMVAGWLINCYQDAVTFDDVAVDFTQEEWTLLD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 TTQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTS-----EWEIQPRT-KRSSLQQGFLKNQ----
.:. :::::::::: ::::: . : : : . :. .:. ::. ::..
CCDS73 PSQRDLYRDVMLENYENLASVGHHLFQPSVIYWLEQEEELRAGRRAVLQEWRLKTKGPAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ------IFTGIQMQT-RSYSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGK
. .. . :: ::..: .::. .:::.:::. :.::.:.:: :.. .: : .
CCDS73 RQDRSWFRASNETQTARSHNGGQLCDRTQCGEAFSEHSGLSTHVRTQNTGDSCVSNHYER
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE0 DS-ISVHKEA-SIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFAS
: : .: .::...: .. :::.:. ::... . . : . :
CCDS73 DFFIPCQKTLFKIGEQFSVLGQCGKAFSSTPNVVSQ------------QACTRD----RS
190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAH
:: .. : ... ..:.:. .. :.:... : : :::..:. ..
CCDS73 LD-------------YSSCGEVFLNQSYLQARAGSHNGEETWKWKPCGKALTHSMGCATP
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
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