Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0660
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0660, 389 aa
1>>>pF1KE0660 389 - 389 aa - 389 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9193+/-0.00191; mu= 16.6085+/- 0.115
mean_var=286.2303+/-52.259, 0's: 0 Z-trim(105.8): 956 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.075808
statistics sampled from 7532 (8598) to 7532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 ( 389) 2750 315.0 7.1e-86
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1630 193.0 6.7e-49
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1543 183.3 4.6e-46
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 1508 179.5 6.4e-45
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 1405 168.2 1.6e-41
CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 1343 161.3 1.6e-39
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 1340 160.8 1.8e-39
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 1327 159.8 6.5e-39
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 1324 159.5 7.8e-39
CCDS45985.1 ZNF844 gene_id:284391|Hs108|chr19 ( 666) 1321 159.2 1e-38
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 1317 158.7 1.4e-38
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 1311 158.1 2.1e-38
CCDS45982.1 ZNF763 gene_id:284390|Hs108|chr19 ( 397) 1287 155.1 1.1e-37
CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 1170 142.2 7.1e-34
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 1153 140.7 3.3e-33
CCDS12267.1 ZNF491 gene_id:126069|Hs108|chr19 ( 437) 1150 140.1 3.6e-33
CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 ( 461) 1147 139.9 4.6e-33
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1123 137.5 3.3e-32
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1120 137.2 4.1e-32
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1120 137.2 4.2e-32
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1119 137.0 4.2e-32
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 1118 136.8 4.5e-32
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1099 134.7 1.9e-31
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 1096 134.2 2.1e-31
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1075 132.1 1.2e-30
CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 ( 499) 1055 129.9 5.1e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1054 129.9 6e-30
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1054 130.0 6.2e-30
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1054 130.0 6.3e-30
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1054 130.0 6.3e-30
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1052 129.9 7.7e-30
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 1050 129.5 8.3e-30
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 1050 129.5 8.3e-30
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1050 129.6 8.7e-30
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 1048 129.3 9.5e-30
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 1044 128.7 1.2e-29
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1039 128.1 1.7e-29
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1039 128.1 1.7e-29
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1030 127.3 3.8e-29
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1030 127.7 4.8e-29
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1030 127.8 4.8e-29
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1024 126.4 5.2e-29
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 1023 126.3 5.5e-29
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1025 126.9 5.9e-29
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1025 126.9 5.9e-29
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1020 126.0 7e-29
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1020 126.2 7.8e-29
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1020 126.2 8.1e-29
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1019 126.1 8.6e-29
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1019 126.1 8.6e-29
>>CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 (389 aa)
initn: 2750 init1: 2750 opt: 2750 Z-score: 1655.2 bits: 315.0 E(32554): 7.1e-86
Smith-Waterman score: 2750; 100.0% identity (100.0% similar) in 389 aa overlap (1-389:1-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHT
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 GEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
370 380
>>CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 (641 aa)
initn: 11455 init1: 1376 opt: 1630 Z-score: 991.4 bits: 193.0 E(32554): 6.7e-49
Smith-Waterman score: 1630; 59.9% identity (77.5% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
:::: :::::: ::::::::: ::::.:::::::: : ::::.:.. :..::.: :: :
CCDS42 MDSVVFEDVAVNFTQEEWALLGPSQKKLYRDVMQETFVNLASIGENWEEKNIEDH-KNQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
:.: ::.:::: : :::::.:::.:: : . :::. : ::: ::::::: ..:::.:.:
CCDS42 RKLRSHMVERLCERKEGSQFGETISQTPNPKPNKKTFTRVKPYECSVCGKDYMCHSSLNR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
:. :: .. .: .. :: :.::.::: : .: : :::.. ::: : :..
CCDS42 HMRSHTEHRSYEYHKYGEKSYECKECGKRFSFRSSFRIHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
:: ::. . :.:::: :.::.: ::: : . .: : : ::::::: ::.:::.:. ::.
CCDS42 PSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFIYHTTFRGHMRMHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHE
:.:::.:.::::::::.::::: . ::::::::::::.: .::::. : .: ::
CCDS42 RNHERTHSGEKPYECKQCGKAFRYYQTFQIHERTHTGEKPYQCKQCGKALSCPTSFRSHE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHT
: :.:::::.::.:::::.. :.. .::: ::: ::: ::::::.: : . : : ::
CCDS42 RIHTGEKPYKCKKCGKAFSFPSSFRKHERIHTGEKPYDCKECGKAFISLPSYRRHMIMHT
300 310 320 330 340 350
370 380
pF1KE0 GEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:. ::.::.:::::.: ::.. :::..
CCDS42 GNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKP
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 3277 init1: 1176 opt: 1176 Z-score: 723.1 bits: 143.3 E(32554): 5.9e-34
Smith-Waterman score: 1176; 64.0% identity (81.2% similar) in 250 aa overlap (138-387:389-638)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CGKVFICHSALHRHILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNG
:: :.:::::::: .: : :::..
CCDS42 TGNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEK
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 PYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYAC
:.. : :. : .. . :.:::: :.::.: :::. :: .: ::: ::::::: :
CCDS42 PHECKQCGKAFSCSSSVRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERIHTGEKPYEC
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCG
:.:::.:.::::.:.:::.::::::::::.:::::: :. . .::::::::::::: .::
CCDS42 KQCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCG
480 490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 KAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFT
::: :: .:.:::::.::::::::::::::. ::.. ::::::::::: ::.: :.:.
CCDS42 KAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSVRMHERTHTGVKPYECKQCDKAFS
540 550 560 570 580 590
350 360 370 380
pF1KE0 SSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
: ..: ::::::::::: :..:::::.:: :.: :::..
CCDS42 CSRSFRIHERTHTGEKPYACQQCGKAFKCSRSFRIHERVHSGE
600 610 620 630 640
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 5495 init1: 1513 opt: 1543 Z-score: 940.5 bits: 183.3 E(32554): 4.6e-46
Smith-Waterman score: 1543; 58.9% identity (76.6% similar) in 384 aa overlap (1-383:1-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
::::. ::::: :: :::::::::::.::::::.: ::::: ::.: :::.:.: .:: :
CCDS42 MDSVASEDVAVNFTLEEWALLDPSQKKLYRDVMRETFRNLACVGKKWEDQSIEDWYKNQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
: : .:. : : : :: .: ::.::: :::::::. : :.:::::.:::::. ::.: :
CCDS42 RILRNHMEEGLSESKEYDQCGEAFSQILNLNLNKKIPTIVRPCECSLCGKVFMHHSSLSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPF-D
:: ::.:.: .. .: :: :.:::::::: : : :: :::.. :: : : : .
CCDS42 HIRSHLGHKPYDYQEYGEKPYKCKQCGKAFSSCQSFRRHERTHTGEKPYACPECGKAFIS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSS
.::: . . .::. :::..: :::. : .. ::::::::::: :..:.:.: :
CCDS42 LPSV-RRHMIKHTGDGPYKCQECGKAFDRPSLFQIHERTHTGEKPYECQECAKAFISLPS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVH
...: :::. ::.:.::::::.: . . :::::::::::.:: .::::: .. :
CCDS42 FQRHMIRHTGDGPYKCQECGKAFDRPSLFRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFISFTNFQSH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTH
:.:. ::.:: ::.:: . : . .::::::: ::: :..:::.:.::: .:.:::::
CCDS42 MIRHTGDGPYKCKVCGRAFIFPSYVRKHERTHTGEKPYECNKCGKTFSSSSNVRTHERTH
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE0 TGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:::::::::.::::: :.:.:
CCDS42 TGEKPYECKECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQVCGRAFDCPSSFQIHERTHTGEK
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 680 init1: 680 opt: 686 Z-score: 433.9 bits: 89.6 E(32554): 7.5e-18
Smith-Waterman score: 686; 59.1% identity (77.9% similar) in 154 aa overlap (219-372:387-539)
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHT
:::. :: :. ::..: ::.. :::.::
CCDS42 RTHTGEKPYECKECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQVCGRAFDCPSSFQIHERTHT
360 370 380 390 400 410
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKP
:::::::. ::::: . : :::. ::.: ::::: : .:.:::::.::::
CCDS42 GEKPYECQVCGKAFISLKRIRKHMILHTGDGPYKCQVCGKAFDCPSSVRTHERTHTGEKP
420 430 440 450 460 470
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECK
::::.:::::.:.:.. ::::::: ::: ::.:::.:. ::... :::.:.:.::: :
CCDS42 YECKECGKAFNYASSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKTFSYSSSFQRHERAHNGDKPY-VK
480 490 500 510 520 530
370 380
pF1KE0 KCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
. ::
CCDS42 NVGKLSFITQPSNTCENE
540 550
>>CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 (529 aa)
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10 20 30
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRD
::.:.::::: :: ::::::::.:.:.:::
CCDS12 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPGRNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLN
::. :.::: .:.: .::.:.:. :: :::: : .:: : : :: :.. :: .::
CCDS12 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHRHILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFI
: .. ::.:::.:::::.::. . .:.::. :: .: ::.: :: ..::.:::.:
CCDS12 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
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.:. : ::.. ::. : : : :. .::: :.::.: ::: : .
CCDS12 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIH
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CCDS12 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
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CCDS12 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSS-CEVHERT
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380
pF1KE0 HTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
: : ::: ::.:::.:.::: :. :::.::::: ::::.::::: :. .: :::..
CCDS12 HFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTRE
390 400 410 420 430 440
CCDS12 KPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQ
450 460 470 480 490 500
>>CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 (532 aa)
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10 20 30 40 50
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:::.::::::.::::::::::::::::::::::: :.::.:::. . :::.:..:
CCDS45 MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYK
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60 70 80 90 100 110
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CCDS45 NPRRNLSL-MREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSS
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KE0 LHRHILSHIGNKL----------FECEECP------------------EKLYHCKQCGKA
:. :: . :.: .. .:: :: : :.: ..
CCDS45 LNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTET
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 FISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYS
::: . ..:: : :...:::: : : : .. . . .:: : ::::.: :::. :
CCDS45 FISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLG
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CCDS45 TTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 IHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHER
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CCDS45 YHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEK
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330 340 350 360 370 380
pF1KE0 THTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::: ::::::.:::.: .: :. :::::.::::.:::.:::.:. :::: :::..
CCDS45 THTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTG
360 370 380 390 400 410
CCDS45 EKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPY
420 430 440 450 460 470
>>CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 (476 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
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CCDS12 MDAVAFEDVAVNFTQEEWALLGPSQKNLYRYVMQETIRNLDCIRMIWEEQNTEDQYKNPR
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
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CCDS12 RNLRCHMVERFSESKDSSQCGETFSLIRDSIVNNSICPGEDPCQSAECEEVIMGHLSLNS
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
:: :.: : .: :: . :: :::: : . . ::.. :. : :.
CCDS12 HIRVDSGHKPHEYQEYGEKPHTHKQRGKAFSYHHSFQSRGRPHTGKKRYECKECGKTFSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
.. . . :.. :::: : ::: . : :: ::::::::::: ::.:.:.: : ::
CCDS12 RRNLRRHMVVQGGNRPYKCKLCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSY
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 RQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHE
:.::: ::::::::::.:.::. :. ::::::::::: : .::::: : :: ::
CCDS12 RRHERMHTGEKPYECKQCSKALPDSSSYIRHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSSSLRRHE
250 260 270 280 290 300
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:::.:::::::::::.:.. ... : . ::: .:. :: :::.: : .: ::: ::
CCDS12 TTHSAEKPYECKQCGKTFHHLGSFQIHMKRHTGDRPHKCKICGKGFDRPSLVRYHERIHT
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 GEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::::::::.:::..: :::.:.:
CCDS12 GEKPYECKQCGKTLSHSSSFRRHMIMHTGGGPHKCKICGKAFVYPSVCQRHEKSHSGEKP
370 380 390 400 410 420
>>CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 (372 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
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CCDS12 MDSVVFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFRNLASVGKKWKDQKIEDEYKNPR
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
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CCDS12 RNLRGLMGERLLESKKDHQHGEILTQVPDDMLKKK-TPRVKSC-----GEVSVGHASLNR
70 80 90 100 110
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pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
: . :.: .: .: .: :.: : ::: :. ::
CCDS12 HHRADTGHKPYEYQEYGQKPYKCTYCKKAF--------------SDLPY-----------
120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
:. . ..:: : : :..: :.: : .:.:. :.:. :: :. :::.. :
CCDS12 ---FRTHEWAHTGGKPYDCEECGKSFISRSSIRRHRIMHSGDGPYKCNFCGKALMCLSLY
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 RQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHE
:.:.::::::::::.::::::.: : :::::::::::::: .:::::. : :..:.
CCDS12 LIHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSHSGSLRIHERTHTGEKPYECSECGKAFHSSTCLHAHK
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 RTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHT
::.:::::::::::::: ... ::::::: ::: ::.:::.: :.: ::.: ::::
CCDS12 ITHTGEKPYECKQCGKAFVSFNSVRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRTHGRTHT
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pF1KE0 GEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::::::::.:::::.:.::.. :::..
CCDS12 GEKPYECKQCGKAFGCASSVKIHERTHTGEKPCSSNTSKGQGEKIA
330 340 350 360 370
>>CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 (671 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
: ::..::::: ::.:::::: : :::::.::::: .::: : : .::::.:... :
CCDS32 MASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPR
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
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CCDS32 KNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNC
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEK-----------LYH-----------------CKQCGKAFIS
.: :.: : .:: :: :: ::.:::.: :
CCDS32 YIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFN-YSSY
: ...:::... ..:::: . : : .::...: . :.:::: :.::.:.:::. ::::
CCDS32 LGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIH
:: ::::::::::: ::.:.:.: : :: .:::.:::::::.::.:.::: :. ::
CCDS32 LR-HERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIH
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280 290 300 310 320 330
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:::::::::: : .::::: : :. :: :::.:::: :.::::::.. ... .: :
CCDS32 ERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE0 TGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:: :. :: :::.: :.:.:::::::::::::::.::::.: ::.:.:
CCDS32 TGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDG
360 370 380 390 400 410
CCDS32 PHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKC
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 1871 init1: 687 opt: 962 Z-score: 596.4 bits: 119.9 E(32554): 6.7e-27
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pF1KE0 LFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQS
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CCDS32 SHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHER
390 400 410 420 430 440
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pF1KE0 TYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTG
:.:.:: ::::.: ::. :: ::.:: :::::::: :: ::. :...:. .:::
CCDS32 THTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKACIDFCSFQNHKTTHTG
450 460 470 480 490 500
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pF1KE0 EKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPY
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CCDS32 EKPYECKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPY
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:::.:::::.. . . .::: : : : : .:::.:: : :..::.:::::.:::::.
CCDS32 ECKECGKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKE
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pF1KE0 CGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:::::. :::..:.... :
CCDS32 CGKAFASLSSLHRHKKTH-WKKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH
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>>CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 (615 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
::::.:::::: ::.:::::: :::::::::::.: .::: .: : :.:::.:. .:
CCDS45 MDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRDVMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLR
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pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
:: ::::. . :.::: :::.:: : .::.. . : : :: :.:.. ::.:.
CCDS45 RNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNC
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDF
.: :.: ::.: :: : :::::.. : . ::.. :: : :.
CCDS45 YIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSS
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 PSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSL
:. .. . . :. :::. : ::: . : :: ::::::::::: ::.:.:.: ::
CCDS45 PGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSY
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 RQHERSHTGEKPYECKECGKAF-SRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVH
.::. ::::::::::.:.::: . :.:: :::::::::::.: .::::: : ::::
CCDS45 LRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLR-HERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVH
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTH
:: :.::::: :::::::: . ... .: :.: :. :: :::.: .. : :: ::
CCDS45 ERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTH
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 TGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
: :::::::.::: .: ::.:.: :.
CCDS45 TLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEK
360 370 380 390 400 410
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initn: 1945 init1: 717 opt: 976 Z-score: 605.0 bits: 121.4 E(32554): 2.2e-27
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140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTG
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CCDS45 THTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTG
360 370 380 390 400 410
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