Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0636, 378 aa
1>>>pF1KE0636 378 - 378 aa - 378 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7503+/-0.00178; mu= 11.1793+/- 0.106
mean_var=265.4166+/-51.507, 0's: 0 Z-trim(105.4): 966 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.078725
statistics sampled from 7336 (8399) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS454.1 ZNF684 gene_id:127396|Hs108|chr1 ( 378) 2651 315.2 6.1e-86
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1153 145.2 1.1e-34
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 1135 143.1 4.6e-34
CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 ( 457) 1056 134.2 2.3e-31
CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 387) 1053 133.7 2.7e-31
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1051 133.7 3.7e-31
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1051 133.8 4.2e-31
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1051 133.8 4.2e-31
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1051 133.9 4.3e-31
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1051 133.9 4.3e-31
CCDS33131.1 ZNF547 gene_id:284306|Hs108|chr19 ( 402) 1043 132.6 6e-31
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1038 132.1 9.6e-31
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1040 132.6 1e-30
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1032 131.5 1.6e-30
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1032 131.5 1.6e-30
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1034 132.0 1.7e-30
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1029 131.2 2.2e-30
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1029 131.3 2.3e-30
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1029 131.3 2.3e-30
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 1024 130.7 3.3e-30
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1016 129.5 4.8e-30
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1016 129.6 5.4e-30
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1016 129.6 5.5e-30
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1016 129.7 5.7e-30
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1016 129.8 6.3e-30
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1016 129.8 6.5e-30
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1017 130.1 6.5e-30
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1016 129.9 6.8e-30
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1015 129.8 7.2e-30
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1012 129.3 8.5e-30
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1013 129.6 9.1e-30
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1013 129.6 9.2e-30
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 1007 128.5 9.9e-30
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1011 129.4 1.1e-29
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1008 128.8 1.1e-29
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1011 129.5 1.1e-29
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1011 129.5 1.1e-29
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 1007 128.7 1.2e-29
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1007 128.8 1.3e-29
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1008 129.0 1.3e-29
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 1005 128.5 1.4e-29
>>CCDS454.1 ZNF684 gene_id:127396|Hs108|chr1 (378 aa)
initn: 2651 init1: 2651 opt: 2651 Z-score: 1656.3 bits: 315.2 E(32554): 6.1e-86
Smith-Waterman score: 2651; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
::::::::::::::::::
CCDS45 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
370
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 1026 init1: 1026 opt: 1153 Z-score: 735.9 bits: 145.2 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1153; 44.0% identity (70.7% similar) in 389 aa overlap (1-378:7-385)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPI-TK
: . : :::.:.:. .: :::. :: :.: :: ::: ::: :..:. : ..
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 TKVILKVEQGQE-PWMVEGANPHESS---PESDYPLVDEPGKHRESK------DNFLKSV
..: : : ... . . . : :.. :::. . : : . : . .....
CCDS23 NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGF--ESGDRSERQWGDLTAEEWVSYP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSE
: . .:. ...: . .: . . : . :: ......: . :.: :
CCDS23 LQPVTDLLVHKEVH--------TGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKA
:::.:... :.:.:...:: ..:..::.:::...:..:: :: ::.::.: ::.:::.
CCDS23 CGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYS
: . ..:. ::: :.::::::: .:::.:. .: . :: ..:: :: .::.:::. :
CCDS23 FCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSER
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLL
:.: :: : ::::.::.: ::: :...: :: :.: ::::::: : :::. : . :::.
CCDS23 SDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLV
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE0 RHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
.:: ::::::::::: :::.::..:.::.::::::
CCDS23 QHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQR
360 370 380 390 400 410
CCDS23 THTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
420 430 440 450 460 470
>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 (446 aa)
initn: 998 init1: 998 opt: 1135 Z-score: 725.1 bits: 143.1 E(32554): 4.6e-34
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:48-419)
10 20 30
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYW
:: :::.:::: : .::. :. :.: ::
CCDS43 SALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYR
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE0 DVMLENYRNLISVGCPITKTK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPES
::::::: :..:. :.:. :.: : . .. . .:
CCDS43 DVMLENYGNVFSLDRE-TRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 DYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLP
:: . ::.. . : . :... . :.. . :...:..: . .
CCDS43 KRPLGNSPGERLNRK-------MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFT
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 PNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAH
: .:....: . . ..:.::.:.:.. .:.:.. :: .::.:::.::::.:...:
CCDS43 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 LATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQH
: ::.::.::.:. :.::::.: .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....:
CCDS43 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIH
. :: :: . :.::::.: ::.: .:.:.:::::::.: :::::...: : :::::
CCDS43 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KE0 TGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
:::::: :.::: : .: :..:: ::::.::::..::::: .: :. ::.:::
CCDS43 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
370 380 390 400 410 420
CCDS43 PLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
430 440
>>CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 (457 aa)
initn: 856 init1: 856 opt: 1056 Z-score: 676.5 bits: 134.2 E(32554): 2.3e-31
Smith-Waterman score: 1057; 43.1% identity (66.5% similar) in 394 aa overlap (5-378:3-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
: ::::.:::.::. :::. :. :.: :: :::::: .:.:.: :.: :. .
CCDS92 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLT-FNKILTMERIHHY
:::.:::. : . . : :.: . : :: :.:. .. : ::::
CCDS92 EQGKEPWL--G----KREVKRDLFSVSESSG--EIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERI---
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE0 NMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRS-------------------YTVENAYE
: .:. . :.:. :: . ..:. :.. ::: :
CCDS92 ---LSQGPVYS-SFKGGWKC-KDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
: ::::.: ..: .. :...:: .::. :..:::..:. ..:. :: ::.:..: :.::
CCDS92 CHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDC
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
.:.: . . :. ::: :::::::::..:::.:. :....: . : .:.. :..:::.:
CCDS92 NKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAF
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
.: : .:. :::::::.:: ::::: : :. :: ::: . :: : :: ::: .:
CCDS92 SSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHS
290 300 310 320 330 340
350 360 370
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
:..:: :.::: :::..:::.:. ...:: : : ::
CCDS92 FLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLIL
350 360 370 380 390 400
CCDS92 HQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
410 420 430 440 450
>>CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 (387 aa)
initn: 1635 init1: 878 opt: 1053 Z-score: 675.4 bits: 133.7 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 1053; 43.5% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (5-375:11-379)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKT
::::::.:::: :: :::. : .: :: .:::::: ...:. ::
CCDS62 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLDWE-TKP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEP----GKHRESKDNFLKSVLLTFNKI
.. .. .: . : . ..:: : : : ...: .. .. :. .:
CCDS62 EIHDASDKKSEGSLRECLG--RQSPLCPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKK
: . .. :. :.. .. : . . .: ...:..: :. :.: ::::::..
CCDS62 LRRRSALSREI---LTKERHQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQL
. . :: .:: ..:.::. :.::. .. :..::.::.::.:: ::.:::::. ...:
CCDS62 RSSLSRHLMSHTGESPYECSVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHS
. :::.::::.:::: ::::.:. .: ...: :: .: .::.::::.: ::: .:.
CCDS62 TRHQRIHTGESPYECHQCGKAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHT
. :.:. ::: ::::: . : :. ::.::::.::: : :::::: .. .: ::: .::
CCDS62 KAHAGDPRYQCNECGKAFFDRSSLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHT
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KE0 GEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
::::.::. :::.::.::..: ::.
CCDS62 GEKPFECTVCGKVFSSKSSVIQHQRRYAKQGID
360 370 380
>>CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 (527 aa)
initn: 1031 init1: 1031 opt: 1051 Z-score: 672.9 bits: 133.7 E(32554): 3.7e-31
Smith-Waterman score: 1051; 46.1% identity (73.5% similar) in 321 aa overlap (58-378:46-358)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 AERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVD
:... :..:. . : :.
CCDS82 GNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYK
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLL
.... : : .... ..... .::: :. .:. . : :: . . .:.
CCDS82 IHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIH-----TGEKPY---ACKECEKSFSQKSNLI
80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQK
... .: :. :::.::::::..: .: :.: :: .::. ::.::::. : : :: :..
CCDS82 DHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMR
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 IHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTL
:.::.:. :. ::::: . ..:..: :.:::::::::..:::.:. .:... :..:::
CCDS82 SHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTG
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 EKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPY
:: .::::: :.: ..... :...:: ::::.: ::::: . : :: :::::::::::
CCDS82 EKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370
pF1KE0 SCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
: :::::: .::.:. :. :.::::::::.::::::::.:.:.:::.::
CCDS82 ICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNE
310 320 330 340 350 360
CCDS82 CGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKA
370 380 390 400 410 420
>--
initn: 736 init1: 736 opt: 736 Z-score: 479.5 bits: 97.9 E(32554): 2.2e-20
Smith-Waterman score: 736; 59.5% identity (79.2% similar) in 168 aa overlap (211-378:359-526)
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
::.:. ::.::::: . :.:..: : ::::
CCDS82 HSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGE
330 340 350 360 370 380
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
:::::..:::.:. : .: :..::: :: . :.::::.: .:: : : :::::::.
CCDS82 KPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYE
390 400 410 420 430 440
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
: :::::...: :. : : ::::::..: .::::: . : : :. :::::::.: .:
CCDS82 CNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIEC
450 460 470 480 490 500
370
pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
::::::::.:. ::.:::
CCDS82 GKAFSQKSHLVRHQRIHTH
510 520
>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (665 aa)
initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051 Z-score: 671.9 bits: 133.8 E(32554): 4.2e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:370-629)
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
. : :. .:.: .. ::: . .
CCDS62 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
340 350 360 370 380 390
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
:. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS62 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
400 410 420 430 440 450
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:.. : ..
CCDS62 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
460 470 480 490 500 510
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
:: :: .::.::::.: :: : :.:.:::::::.: :::.:... :::.::: ::::
CCDS62 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370
pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::
CCDS62 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
580 590 600 610 620 630
CCDS62 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
640 650 660
>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (667 aa)
initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051 Z-score: 671.9 bits: 133.8 E(32554): 4.2e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:372-631)
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
. : :. .:.: .. ::: . .
CCDS62 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
350 360 370 380 390
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
:. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS62 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
400 410 420 430 440 450
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:.. : ..
CCDS62 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
460 470 480 490 500 510
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
:: :: .::.::::.: :: : :.:.:::::::.: :::.:... :::.::: ::::
CCDS62 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370
pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::
CCDS62 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
580 590 600 610 620 630
CCDS62 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
640 650 660
>>CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 (686 aa)
initn: 1031 init1: 1031 opt: 1051 Z-score: 671.8 bits: 133.9 E(32554): 4.3e-31
Smith-Waterman score: 1051; 46.1% identity (73.5% similar) in 321 aa overlap (58-378:205-517)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 AERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVD
:... :..:. . : :.
CCDS12 GNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYK
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLL
.... : : .... ..... .::: :. .:. . : :: . . .:.
CCDS12 IHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIH-----TGEKPY---ACKECEKSFSQKSNLI
240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQK
... .: :. :::.::::::..: .: :.: :: .::. ::.::::. : : :: :..
CCDS12 DHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMR
290 300 310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 IHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTL
:.::.:. :. ::::: . ..:..: :.:::::::::..:::.:. .:... :..:::
CCDS12 SHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTG
350 360 370 380 390 400
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 EKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPY
:: .::::: :.: ..... :...:: ::::.: ::::: . : :: :::::::::::
CCDS12 EKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPY
410 420 430 440 450 460
330 340 350 360 370
pF1KE0 SCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
: :::::: .::.:. :. :.::::::::.::::::::.:.:.:::.::
CCDS12 ICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNE
470 480 490 500 510 520
CCDS12 CGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKA
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 736 init1: 736 opt: 736 Z-score: 478.4 bits: 98.1 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 736; 59.5% identity (79.2% similar) in 168 aa overlap (211-378:518-685)
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
::.:. ::.::::: . :.:..: : ::::
CCDS12 HSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGE
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
:::::..:::.:. : .: :..::: :: . :.::::.: .:: : : :::::::.
CCDS12 KPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYE
550 560 570 580 590 600
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
: :::::...: :. : : ::::::..: .::::: . : : :. :::::::.: .:
CCDS12 CNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIEC
610 620 630 640 650 660
370
pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
::::::::.:. ::.:::
CCDS12 GKAFSQKSHLVRHQRIHTH
670 680
>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (692 aa)
initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051 Z-score: 671.7 bits: 133.9 E(32554): 4.3e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:397-656)
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
. : :. .:.: .. ::: . .
CCDS12 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
370 380 390 400 410 420
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
:. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS12 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
430 440 450 460 470 480
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:.. : ..
CCDS12 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
490 500 510 520 530 540
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
:: :: .::.::::.: :: : :.:.:::::::.: :::.:... :::.::: ::::
CCDS12 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
550 560 570 580 590 600
330 340 350 360 370
pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::
CCDS12 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
610 620 630 640 650 660
CCDS12 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
670 680 690
378 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:18:43 2016 done: Sat Nov 5 20:18:44 2016
Total Scan time: 2.640 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]