FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4590, 1094 aa 1>>>pF1KE4590 1094 - 1094 aa - 1094 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5697+/-0.000648; mu= -7.4312+/- 0.041 mean_var=405.6089+/-83.638, 0's: 0 Z-trim(115.1): 56 B-trim: 253 in 1/56 Lambda= 0.063683 statistics sampled from 25269 (25321) to 25269 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16 Scan time: 16.260 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003655 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subun (1094) 6942 653.8 1.6e-186 XP_005248675 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1053) 6653 627.2 1.5e-178 NP_001258698 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex su (1045) 6629 625.0 6.8e-178 XP_016865490 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1004) 6340 598.5 6.5e-170 XP_005248676 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 ( 871) 5416 513.5 2.1e-144 NP_001265441 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1101) 2944 286.5 5.8e-76 NP_001265440 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1050) 2189 217.1 4.3e-55 NP_004635 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta (1082) 2189 217.1 4.4e-55 XP_016878130 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple ( 629) 1736 175.3 9.9e-43 XP_016878129 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple (1058) 1632 165.9 1.1e-39 NP_001159491 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit b ( 919) 535 65.1 2.2e-09 NP_663782 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 939) 535 65.1 2.2e-09 NP_001118 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 949) 535 65.1 2.2e-09 XP_005257998 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 528 64.4 2.9e-09 XP_016879776 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 528 64.4 2.9e-09 XP_011522757 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 528 64.4 3.3e-09 XP_016879775 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 528 64.4 3.3e-09 XP_016879774 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 894) 528 64.5 3.3e-09 XP_011522756 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09 XP_011522755 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09 XP_011522754 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09 XP_016879773 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 937) 528 64.5 3.4e-09 NP_001273 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit beta ( 937) 528 64.5 3.4e-09 XP_005257995 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 528 64.5 3.5e-09 NP_001025177 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit b ( 951) 528 64.5 3.5e-09 XP_005257994 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 528 64.5 3.5e-09 XP_011522753 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 969) 528 64.5 3.5e-09 XP_011522750 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09 XP_011522752 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09 XP_011522751 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09 XP_016855582 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 405) 327 45.7 0.00067 XP_016855578 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 635) 327 45.9 0.00093 NP_006585 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex subun ( 739) 327 45.9 0.001 NP_001240781 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 739) 327 45.9 0.001 XP_016855579 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 571) 323 45.4 0.0011 NP_001295241 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 571) 323 45.4 0.0011 XP_016855577 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 700) 309 44.2 0.0031 >>NP_003655 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subunit b (1094 aa) initn: 6942 init1: 6942 opt: 6942 Z-score: 3469.9 bits: 653.8 E(85289): 1.6e-186 Smith-Waterman score: 6942; 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XP_016 DNIHRYEELNFEAL 1000 >>XP_005248676 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 com (871 aa) initn: 5416 init1: 5416 opt: 5416 Z-score: 2713.5 bits: 513.5 E(85289): 2.1e-144 Smith-Waterman score: 5416; 99.9% identity (99.9% similar) in 859 aa overlap (1-859:1-859) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: XP_005 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNVKSGALSKYAKKIFLA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE4 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV ::::::::::::::::::: XP_005 SLMADLEGLHLSTSSSVISERKALHLKLGKK 850 860 870 >>NP_001265441 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta- (1101 aa) initn: 4448 init1: 2052 opt: 2944 Z-score: 1484.7 bits: 286.5 E(85289): 5.8e-76 Smith-Waterman score: 4225; 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NP_001 SESESDSKSSSESGSGESSSESDNED--QDEDEEKGR--GSESEQ-----SEEDGKRKTK 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE4 DGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRT-PL :. . : ::.::.: ..:::.:::: ::: :. . .. ..: .... : NP_001 ---KKVPERKGEASSSDEGS--DSSSSSSESEMTSESEEEQLEPASWSRKTPPSSKSAPA 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE4 TKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHV ::..:::::.::.: :. . : .: :: :::::: :. :. : :. .:. . . NP_001 TKEISLLDLEDFTPPSVQPVSPPAIVSTSLAADLEGLTLTDSTLVPSLLSPV-SGVGRQE 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE4 LLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGD-KMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMH ::::..:.:::. : : ::: . :: .:::..: ..:..: :...:.: ::: :.... NP_001 LLHRVAGEGLAVDYTFSRQP-FSGDPHMVSVHIHFSNSSDTPIKGLHVGTPKLPAGISIQ 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 pF1KE4 VFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEK : :.:: : : :. :::.::::::.:.:::::. : :.::::::::. :: :::. NP_001 EFPEIESLAPGESATAVMGINFCDSTQAANFQLCTQTRQFYVSIQPPVGELMAPVFMSEN 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE4 DFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVH .:::::: : :::: . .. . .. :::. .::.: :: : .. .:::..:. NP_001 EFKKEQGKLMGMNEITEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLT 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE4 SGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG .:::.:.:.. . ...::: .:.:: :::..:.... .:.: NP_001 GGSLVLLTLDARPAGAAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ 1060 1070 1080 1090 1100 >>NP_001265440 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta- (1050 aa) initn: 3866 init1: 2097 opt: 2189 Z-score: 1110.1 bits: 217.1 E(85289): 4.3e-55 Smith-Waterman score: 3993; 60.4% identity (80.2% similar) in 1100 aa overlap (8-1093:7-1050) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL :.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: :: NP_001 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF .::::::.:::.:::::.:::::::::: :::: NP_001 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIE--------------------------- 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL :::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: ::::: NP_001 -----DPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG : .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::: NP_001 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP ::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..:: NP_001 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQ :.::::::::.::::::::::.:::::::::::.:..::.:.:.:.:.:::::::. ::: NP_001 YVMDPDHRLLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQ 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 YIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQ :.::::.:::::.:.:::::::::::.::::::.:: ::::.:::::::.:: :.::::: NP_001 YVVLQNVATMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQ 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 TYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQ ::..:.::.:.:::::.:::::::: .: :::::::: :::::::.:::::::::::::: NP_001 TYIRSMDKDFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQ 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 MQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDD ::::::::::::.::: :.: ::.::::::::::: ::.::.::::::::::::::.:.: NP_001 MQPAQHGEIIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEED 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 LVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGAL .::::..::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::.:: ::::::.:..::: NP_001 IVKLQVINLAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQNYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGAL 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN :..:::.::: ::::.::: ::::::::::.::: :: ::::: :: .::: :::::::: NP_001 SRHAKKLFLAPKPAPVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRN 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 pF1KE4 VEVIELAKEWTP-AGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSS-SDSESESGSESGEQGESGE ::: ::: ... :.... : :::.:: : ..:. :: :::: :.: ..::: NP_001 VEV----PEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGS 630 640 650 660 670 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 EGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSS .:.:...:: ...: :.:: : :... :. :: .. :. . : :: NP_001 GESSSESDNED--QDEDEEKGR--GSESEQ-----SEEDGKRKTK---KKVPERKGEASS 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 NDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRT-PLTKDVSLLDLDDFNPV .::.: ..:::.:::: ::: :. . .. ..: .... : ::..:::::.::.: NP_001 SDEGS--DSSSSSSESEMTSESEEEQLEPASWSRKTPPSSKSAPATKEISLLDLEDFTPP 730 740 750 760 770 780 830 840 850 860 870 880 pF1KE4 STPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYF :. . : .: :: :::::: :. :. : :. .:. . . ::::..:.:::. : NP_001 SVQPVSPPAIVSTSLAADLEGLTLTDSTLVPSLLSPV-SGVGRQELLHRVAGEGLAVDYT 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KE4 FPRQPCIFGD-KMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSIT : ::: . :: .:::..: ..:..: :...:.: ::: :.... : :.:: : : : NP_001 FSRQP-FSGDPHMVSVHIHFSNSSDTPIKGLHVGTPKLPAGISIQEFPEIESLAPGESAT 850 860 870 880 890 900 950 960 970 980 990 1000 pF1KE4 VSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNET . :::.::::::.:.:::::. : :.::::::::. :: :::..:::::: : :::: NP_001 AVMGINFCDSTQAANFQLCTQTRQFYVSIQPPVGELMAPVFMSENEFKKEQGKLMGMNEI 910 920 930 940 950 960 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE4 SAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGS . .. . .. :::. .::.: :: : .. .:::..:. .:::.:.:.. . .. 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NP_004 TEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLTGGSLVLLTLDARPAG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1070 1080 1090 pF1KE4 TAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG .::: .:.:: :::..:.... .:.: NP_004 AAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ 1060 1070 1080 >>XP_016878130 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 complex su (629 aa) initn: 2988 init1: 1732 opt: 1736 Z-score: 888.1 bits: 175.3 E(85289): 9.9e-43 Smith-Waterman score: 3000; 76.7% identity (92.0% similar) in 615 aa overlap (8-612:7-617) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL :.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: :: XP_016 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF .::::::.:::.:::::.:::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::::: XP_016 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: ::::: XP_016 QRGLKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG : .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::: XP_016 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP ::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..:: XP_016 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQ :.::::::::.::::::::::.:::::::::::.:..::.:.:.:.:.:::::::. ::: XP_016 YVMDPDHRLLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 YIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQ :.::::.:::::.:.:::::::::::.::::::.:: ::::.:::::::.:: :.::::: XP_016 YVVLQNVATMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 TYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQ ::..:.::.:.:::::.:::::::: .: :::::::: :::::::.:::::::::::::: XP_016 TYIRSMDKDFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 MQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDD ::::::::::::.::: :.: ::.::::::::::: ::.::.::::::::::::::.:.: XP_016 MQPAQHGEIIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEED 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 LVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGAL .::::..::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::.:: ::::::.:..::: XP_016 IVKLQVINLAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQNYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGAL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN :..:::.::: ::::.::: :: XP_016 SRHAKKLFLAPKPAPVLESSFKGLCCPPPAVPQL 600 610 620 >>XP_016878129 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 complex su (1058 aa) initn: 3785 init1: 1544 opt: 1632 Z-score: 833.5 bits: 165.9 E(85289): 1.1e-39 Smith-Waterman score: 4049; 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XP_016 TEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLTGGSLVLLTLDARPAG 980 990 1000 1010 1020 1030 1070 1080 1090 pF1KE4 TAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG .::: .:.:: :::..:.... .:.: XP_016 AAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ 1040 1050 1094 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 14:45:46 2016 done: Mon Nov 7 14:45:48 2016 Total Scan time: 16.260 Total Display time: 0.520 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]