FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1504, 1169 aa 1>>>pF1KE1504 1169 - 1169 aa - 1169 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5698+/-0.00106; mu= 20.9449+/- 0.064 mean_var=74.8293+/-14.781, 0's: 0 Z-trim(104.2): 66 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.148265 statistics sampled from 7735 (7802) to 7735 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 4.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 7755 1669.2 0 CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 7687 1654.6 0 CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 4979 1075.4 0 CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 4565 986.8 0 CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 4564 986.6 0 CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 1731 380.6 1.2e-104 CCDS45461.1 ITGAL 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CCDS67 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV 1150 1160 >>CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163 aa) initn: 7741 init1: 7687 opt: 7687 Z-score: 8877.8 bits: 1654.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7687; 99.7% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 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CCDS10 MEEANGQIAPENGTQTPSPPSEK 1150 1160 >>CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161 aa) initn: 4950 init1: 2496 opt: 4979 Z-score: 5747.3 bits: 1075.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4979; 65.3% identity (84.6% similar) in 1163 aa overlap (4-1165:2-1159) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA : ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...:: CCDS32 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM :::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.: CCDS32 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS : : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::.. CCDS32 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL ::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .: CCDS32 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK :: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. . CCDS32 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV ::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::.. CCDS32 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS .: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS32 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIG ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS32 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV ::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: :: CCDS32 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 VIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGL .::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: :::::::::::::::::::: CCDS32 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE1 VDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYID .::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :. CCDS32 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE1 KRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLL : : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...::: CCDS32 KSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE1 PSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQD :.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:. CCDS32 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE1 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQG .::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.:.. .:::::.: :. .::: CCDS32 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE1 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN . .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :. CCDS32 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE1 VSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNN .::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.::: CCDS32 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE1 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV :.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:. CCDS32 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE1 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: :::::::::::::: CCDS32 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE1 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE ::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.::: CCDS32 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE1 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV :.:. . : .: . : .:. : CCDS32 MLEDKPEDTATFSGDDF-SCVAPNVPLS 1140 1150 1160 >>CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152 aa) initn: 4533 init1: 2933 opt: 4565 Z-score: 5268.8 bits: 986.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4565; 61.5% identity (81.7% similar) in 1140 aa overlap (8-1143:5-1143) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA .::.:::. :::::::. .:. .. :::.:::: .: :::::::.:.:: CCDS45 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM :: :.:::: ::::.:::: :::: ::::::::::::.:::: ::::::::::. :..: CCDS45 NQRGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 YLTGLCFLLGPT--QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVI :. :::::.: . : :..: . . ::....::.::::::::: ..: : .:: .:. CCDS45 YVKGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHR :... .: :::::.:..:. ::::.::. . :: ::. . :: : :.:::.:..::.. CCDS45 EQLKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSW ::. . :::..: :::.:::::.: :: : :.:::: :: :.:::.:::: ::....: CCDS45 LFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSA .::: ::::: ..:.:.:..:.::: :::::.:::::::::.: :::::: ::.:::::: CCDS45 QELNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 VFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQ ..: .::.:..:::. :.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . :: CCDS45 AITSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 SLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLI ::::::::::: : ...: : . .:. .:.: :::::.:::::::::::::.:::::::: CCDS45 SLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTD :::::::::::::::::::::: :: ::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS45 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTD 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 VVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDG :.::::::..::::::::::. : .::::::::::::.:: :::::::.::::::::.:: CCDS45 VAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDG 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE1 LVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYI ::::.:::.:.:::::..::: : . :.: : :. :..::: .:::. . . .::.. CCDS45 LVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHV 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE1 DKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLL .: ... : ..:: :: ::::: :: ::.:.:::: . ...:::: ::...: CCDS45 QKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQ 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE1 LPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQ ::.:.:: :.::.:::::.::: :: :: ::::.:: :::: ::: .::::::: :.::: CCDS45 LPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQ 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE1 DNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQ :.:.:.::: .: :.::. :.:. : : ::::::: : ::: : :::: :. :.: CCDS45 DDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQ 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE1 GQLRSLHLTCDSAPVG--SQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLL . :: .:.:.:: : . :::: ::: :: ....:: ::::. :: ::..::: CCDS45 RSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLL 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE1 TANVSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQ :::.:::: :::.:: :::::::::::: ::.:: ::::::. ::. :.: .:.:: CCDS45 KANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENT-SRVMQHQYQ 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE1 VNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQK :.:::::.::.:. : :::.::: ..: .:. .: : : ... : :::::...: CCDS45 VSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRK 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE1 NPVLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDT ::..:::: : :..::.: :..:::.. :::::::: : . .... .::.::: :. CCDS45 APVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFND 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE1 SVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQ ::.. :::: ::.:.:: : .: ..: :: :::::::.:::::::::::.:::.:::::: CCDS45 SVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQ 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE1 YKEMMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV ::.:: : CCDS45 YKDMMSEGGPPGAEPQ 1140 1150 >>CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153 aa) initn: 3136 init1: 1487 opt: 4564 Z-score: 5267.6 bits: 986.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4564; 61.5% identity (81.7% similar) in 1141 aa overlap (8-1143:5-1144) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA .::.:::. :::::::. .:. .. :::.:::: .: :::::::.:.:: CCDS54 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM :: :.:::: ::::.:::: :::: ::::::::::::.:::: ::::::::::. :..: CCDS54 NQRGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 YLTGLCFLLGPT--QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVI :. :::::.: . : :..: . . ::....::.::::::::: ..: : .:: .:. CCDS54 YVKGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHR :... .: :::::.:..:. ::::.::. . :: ::. . :: : :.:::.:..::.. CCDS54 EQLKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSW ::. . :::..: :::.:::::.: :: : :.:::: :: :.:::.:::: ::....: CCDS54 LFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSA .::: ::::: ..:.:.:..:.::: :::::.:::::::::.: :::::: ::.:::::: CCDS54 QELNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 VFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQ ..: .::.:..:::. :.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . :: CCDS54 AITSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 SLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLI ::::::::::: : ...: : . .:. .:.: :::::.:::::::::::::.:::::::: CCDS54 SLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWR-RWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLT :::::::::::::::::::::: : :: ::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS54 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 DVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQD ::.::::::..::::::::::. : .::::::::::::.:: :::::::.::::::::.: CCDS54 DVAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMD 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE1 GLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLY :::::.:::.:.:::::..::: : . :.: : :. :..::: .:::. . . .::. CCDS54 GLVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLH 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE1 IDKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNL ..: ... : ..:: :: ::::: :: ::.:.:::: . ...:::: ::...: CCDS54 VQKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE1 LLPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHIC ::.:.:: :.::.:::::.::: :: :: ::::.:: :::: ::: .::::::: :.:: CCDS54 QLPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNIC 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE1 QDNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQK ::.:.:.::: .: :.::. :.:. : : ::::::: : ::: : :::: :. :. CCDS54 QDDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQN 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE1 QGQLRSLHLTCDSAPVG--SQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLL : . :: .:.:.:: : . :::: ::: :: ....:: ::::. :: ::..:: CCDS54 QRSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLL 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE1 LTANVSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRY : :::.:::: :::.:: :::::::::::: ::.:: ::::::. ::. :.: .:.: CCDS54 LKANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENT-SRVMQHQY 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE1 QVNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQ ::.:::::.::.:. : :::.::: ..: .:. .: : : ... : :::::... CCDS54 QVSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELR 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE1 KNPVLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFD : ::..:::: : :..::.: :..:::.. :::::::: : . .... .::.::: :. CCDS54 KAPVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE1 TSVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKR ::.. :::: ::.:.:: : .: ..: :: :::::::.:::::::::::.:::.::::: CCDS54 DSVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKR 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE1 QYKEMMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV :::.:: : CCDS54 QYKDMMSEGGPPGAEPQ 1140 1150 >>CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170 aa) initn: 1432 init1: 292 opt: 1731 Z-score: 1992.5 bits: 380.6 E(32554): 1.2e-104 Smith-Waterman score: 2030; 35.3% identity (62.9% similar) in 1180 aa overlap (9-1158:17-1145) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAG--FGDSVVQYANSWVV ..: : :.: .:::.. .: :: :: :.: .:. :. CCDS32 MKDSCITVMAMALLSGFFFFAPASS--YNLDVRGARSFSPPRAGRHFGYRVLQVGNG-VI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 VGAPQKITAANQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGP :::: . .:.::.:::: .:: : :. :. . .. ::..::. . ...::: : CCDS32 VGAPGE---GNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLR-GSNYTSKYLGMTLATDPTDGSILACDP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 TVHHECGRNMYLTGLCFLL-----GPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSR . . : .: ::.:::.:. :: . : : . ::: . . :.:::.::: :.. CCDS32 GLSRTCDQNTYLSGLCYLFRQNLQGP--MLQGRP-GFQECIKGNVDLVFLFDGSMSLQPD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 NFATMMNFVRAVISQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGF .: ...:.. :..... : ::. .:::....:.: : .. . ..: .:: :... . CCDS32 EFQKILDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKRKDPDALLKHVKHMLLL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 TYTATAIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAA-GIIRY : : ::. :. ..:. ::: ::.:.::.::: :.. : .. ::: :::: CCDS32 TNTFGAINYVATEVFREELGARPDATKVLIIITD----GEATDSGNI----DAAKDIIRY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 AIGVGLAFQNRNSWKELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSS ::.: ::...: . :. .::::..: . .. :. :::. ..:..::..:::: . CCDS32 IIGIGKHFQTKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSKQDL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 SSFELEMAQEGFSAVFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSP-TFINMSQENVDMRDS .::..:... :.:: .. :.::::. :.:: . ... :::. . ..: . CCDS32 TSFNMELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 YLGYS-TELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFT--QVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGA ::::. : : . .. :. ::::::: :....: : . .: . . :::::::::. CCDS32 YLGYTVTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGG 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 SLCSVDVDSDGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAV--LYGEQGHPW ::.::::.:: :.:.::::: .: . :::.: . : :. . : : :. :.: CCDS32 ELCGVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFI--YQR--RQLGFEEVSELQGDPGYPL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 GRFGAALTVLGDVNGDKLTDVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLS :::: :.:.: :.::: :.::..::: :.. ::::.:.: : ..::. :::: :.:. CCDS32 GRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQ--GAVYIFNGRHG-GLSPQPSQRIEGTQVL 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE1 SRLQYFGQALSGGQDLTQDGLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFE : .:.::... : .:: :::.:.::::..:...: .:::. . . :.: ::::: : CCDS32 SGIQWFGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGAESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVE 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE1 CREQVVSE-QTLVQSNICLYIDKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKN : .. .. . :. .::. : . .. : : ...: : :: : :. : .. CCDS32 CSYSTSNKMKEGVNITICFQIKSLIPQFQGR--LVANLTYTLQLDGHRTRRRGLFPGGRH 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE1 RSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLPSCVEDSVTPITLRLNFTLV---GKPL---LAFRNLRP . : : .. . : .:.. .: ::.: ..::.. :::.: : : ... : CCDS32 E-LRRNIAVTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAQGKDIPP 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KE1 MLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDG .: . . : .::::::: :. :. :: .::: ..: . . :..:. . : CCDS32 ILRPSLHSE-TWEIPFEKNCGEDKKCEANLRVSFSPARSRALRLTAFASLSVELSLSNLE 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 pF1KE1 EDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQLRSLHLTCDSAPVGSQG-TWSTSCRINHLIF ::.: . . . : :::.: : . ..: . ..:. : :. . . :: .. :: CCDS32 EDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQ---IPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIF 820 830 840 850 860 880 890 900 910 920 pF1KE1 RGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANVSSEN-NTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVS ..: .... :.. .. :: . : :::. .: .. .. .:. : . ... CCDS32 KAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQ 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 pF1KE1 SHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVS ..:. : :..:. . : : . : ::: : : . .:. ::: : : CCDS32 DQEDSTLYVSFTPKGPK-IHQVKHMYQV-----RIQPSIHDHNIPT---LEAV---VGVP 930 940 950 960 970 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE1 HP--QNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNP-VLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFT .: ..: . : .. ::. ... : . . . : : ::: : ..:. CCDS32 QPPSEGPITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERLPDAAEPCLPGAL-FRCPV---VFRQEILVQ 980 990 1000 1010 1020 1030 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE1 LKGNLSFGWVRQILQKKV-SVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNP . :.: . : .: ... :. : :.:..: . .: :..: . ::.. .. .. CCDS32 VIGTLEL--VGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQVVMKVDVVYEKQM 1040 1050 1060 1070 1080 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE1 TPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEMMEEANG---QIAPENGTQTPSPPTP : : :.::::::: :: ::::::::::. :: :: . : : :.. : : CCDS32 LYLYVLSGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE1 HYPQDNV CCDS32 GDPGCLKPLHEKDSESGGGKD 1150 1160 1170 >>CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086 aa) initn: 1353 init1: 271 opt: 1505 Z-score: 1731.7 bits: 332.3 E(32554): 3.9e-90 Smith-Waterman score: 1685; 33.2% identity (58.6% similar) in 1174 aa overlap (9-1158:17-1061) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAG--FGDSVVQYANSWVV ..: : :.: .:::.. .: :: :: :.: .:. :. CCDS45 MKDSCITVMAMALLSGFFFFAPASS--YNLDVRGARSFSPPRAGRHFGYRVLQVGNG-VI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 VGAPQKITAANQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGP :::: . .:.::.:::: .:: : :. :. . .. ::..:: :.:. CCDS45 VGAPGE---GNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLR-GSNYTSKYLGMTLA--TDPT------- 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 TVHHECGRNMYLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATM ::: CCDS45 ----------------------------------------------DGS----------- 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MNFVRAVISQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTAT :. .:::....:.: : .. . ..: .:: :... .: : CCDS45 ---------------ILFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKRKDPDALLKHVKHMLLLTNTFG 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 pF1KE1 AIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAA-GIIRYAIGVG ::. :. ..:. ::: ::.:.::.::: :.. : .. ::: :::: ::.: CCDS45 AINYVATEVFREELGARPDATKVLIIITD----GEATDSGNI----DAAKDIIRYIIGIG 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 LAFQNRNSWKELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFEL ::...: . :. .::::..: . .. :. :::. ..:..::..:::: . .::.. CCDS45 KHFQTKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSKQDLTSFNM 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 EMAQEGFSAVFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSP-TFINMSQENVDMRDSYLGYS :... :.:: .. :.::::. :.:: . ... :::. . ..: .::::. CCDS45 ELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAGYLGYT 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 -TELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFT--QVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSV : : . .. :. ::::::: :....: : . .: . . :::::::::. ::.: CCDS45 VTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELCGV 330 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 DVDSDGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAV--LYGEQGHPWGRFGA :::.:: :.:.::::: .: . :::.: . : :. . : : :. :.: :::: CCDS45 DVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFI--YQR--RQLGFEEVSELQGDPGYPLGRFGE 390 400 410 420 430 440 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 ALTVLGDVNGDKLTDVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQY :.:.: :.::: :.::..::: :.. ::::.:.: : ..::. :::: :.:. : .:. CCDS45 AITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQ--GAVYIFNGRHG-GLSPQPSQRIEGTQVLSGIQW 450 460 470 480 490 590 600 610 620 630 640 pF1KE1 FGQALSGGQDLTQDGLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQV ::... : .:: :::.:.::::..:...: .:::. . . :.: ::::: :: .. CCDS45 FGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGAESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSYST 500 510 520 530 540 550 650 660 670 680 690 700 pF1KE1 VSE-QTLVQSNICLYIDKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSR .. . :. .::. : . .. : : ...: : :: : :. : ... : : CCDS45 SNKMKEGVNITICFQIKSLIPQFQGR--LVANLTYTLQLDGHRTRRRGLFPGGRHE-LRR 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 pF1KE1 VRVLGLKAHCENFNLLLPSCVEDSVTPITLRLNFTLV---GKP--LLAFRNLRPMLAADA .. . : .:.. .: ::.: ..::.. :::.: : : : ... :.: . CCDS45 NIAVTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAGKDIPPILRPSL 620 630 640 650 660 670 760 770 780 790 800 810 pF1KE1 QRYFTASLPFEKNCGADHICQDNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGT . : .::::::: :. :. :: .::: ..: . . :..:. . : ::.: . CCDS45 HSE-TWEIPFEKNCGEDKKCEANLRVSFSPARSRALRLTAFASLSVELSLSNLEEDAYWV 680 690 700 710 720 730 820 830 840 850 860 870 pF1KE1 TVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQLRSLHLTCDSAPVGSQG-TWSTSCRINHLIFRGGAQI . . : :::.: : . ..: . ..:. : :. . . :: .. ::..: .. CCDS45 QLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQ---IPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIFKAGHSV 740 750 760 770 780 790 880 890 900 910 920 930 pF1KE1 TFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANVSSEN-NTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFT .. :.. .. :: . : :::. .: .. .. .:. : . .....:. : CCDS45 ALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQDQEDST 800 810 820 830 840 850 940 950 960 970 980 990 pF1KE1 KYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHP--QN :..:. . : : . : ::: : : . .:. ::: : : .: .. CCDS45 LYVSFTPKGPK-IHQVKHMYQV-----RIQPSIHDHNIPT---LEAV---VGVPQPPSEG 860 870 880 890 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE1 PSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNP-VLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLS : . : .. ::. ... : . . . : : ::: : ..:. . :.: CCDS45 PITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERLPDAAEPCLPGAL-FRCPV---VFRQEILVQVIGTLE 900 910 920 930 940 950 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE1 FGWVRQILQKKV-SVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVG . : .: ... :. : :.:..: . .: :..: . ::.. .. .. : : CCDS45 L--VGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQVVMKVDVVYEKQMLYLYVL 960 970 980 990 1000 1010 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE1 SSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEMMEEANG---QIAPENGTQTPSPPTPHYPQDN :.::::::: :: ::::::::::. :: :: . : : :.. : : CCDS45 SGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAGDPGCL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE1 V CCDS45 KPLHEKDSESGGGKD 1080 >>CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179 aa) initn: 1190 init1: 352 opt: 1193 Z-score: 1370.5 bits: 265.6 E(32554): 5.1e-70 Smith-Waterman score: 1409; 28.8% identity (60.4% similar) in 1110 aa overlap (73-1152:123-1173) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 QYANSWVVVGAPQKITAANQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEA-VNMSLGLSLASTTS ::.: .: .. :.: .:. ..: . . CCDS32 RGVTVVRSHHGVLICIQVLVRRPHSLSSELTGTCSLLGPDLRPQAQANF---FDLENLLD 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 pF1KE1 PSQLLACGPTVHHECGRNMYLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQ---DIVFLIDG :. . : .. : . .. . .. ..: ..:. .:....:: CCDS32 PDARVDTGDCYSNKEGGGEDDVNTARQRRALEKEEEEDKEEEEDEEEEEAGTEIAIILDG 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 SGSISSRNFATMMNFVRAVISQFQRPSTQ--FSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLL ::::. .: .:. .. .: . . :.:.:... .::.: ... . :. . CCDS32 SGSIDPPDFQRAKDFISNMMRNFYEKCFECNFALVQYGGVIQTEFDLRDSQDVMASLARV 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 ASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMA .. :. . : ::.:.:.:. .: .:.:.:: :.:...:.::: : :. :: CCDS32 QNITQVGSVTKTASAMQHVLDSIFTSSHGSRRKASKVMVVLTDGGIFEDPLNLTTVINSP 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 DAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAI :. :.::::: :.. . .::: ::: :.. : ::: .. :: . ..:. .:... CCDS32 KMQGVERFAIGVGEEFKSARTARELNLIASDPDETHAFKVTNYMALDGLLSKLRYNIISM 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 EGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVFTPDGPVL-GAVGSFTWSGGAFLYPP-NMSPTFINMS ::: ..... ..:: :::: . . :: ::::.: :::::.:: . :.:.. CCDS32 EGT---VGDALHYQLAQIGFSAQILDERQVLLGAVGAFDWSGGALLYDTRSRRGRFLNQT 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 QENV-DMRD---SYLGYSTELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVT . : . :::::.. . : . :::::.: : . . . .:. . . CCDS32 AAAAADAEAAQYSYLGYAVAVLHKTCSLSYIAGAPRYKHHGAVFELQKEGREASFLPVLE 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 GTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVL : :.:::::. :: ::.: :::::..:..:: :. . . :.: : : . . .: CCDS32 GEQMGSYFGSELCPVDIDMDGSTDFLLVAAPFYHVHGEEGRVYVYRLSEQDGSFSLARIL 510 520 530 540 550 560 520 530 540 550 560 pF1KE1 YGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVVIGAPGEK------ENRGAVYLFHGVL-GPS :. : .::: :....::.. ::::::.:::: : . :.::...: : : CCDS32 SGHPGFTNARFGFAMAAMGDLSQDKLTDVAIGAPLEGFGADDGASFGSVYIYNGHWDGLS 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 ISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGV ::: ::: .: .. :::::....:: :.. :::.:..::. ::....:.:::. . : CCDS32 ASPS--QRIRASTVAPGLQYFGMSMAGGFDISGDGLADITVGTLGQAVVFRSRPVVRLKV 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 SMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK-RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALD :: : :. .: .. . .:. .:. :.. . . : :. . :::. : CCDS32 SMAFTPSALP----------IGFNGVVNVRLCFEISSVTTASESGLREALLNFTLDV--D 690 700 710 720 730 690 700 710 720 730 pF1KE1 PGRLSPRATFQETKNRS-LSRVRVLGLKAH-CENFNLLLPS----CVEDSVTPITLRLNF :. : .: . :: :. .: . .. ::.. ::.:. : :: . ...... CCDS32 VGK--QRRRLQCSDVRSCLGCLREWSSGSQLCEDL-LLMPTEGELCEEDCFSNASVKVSY 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 790 pF1KE1 TLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDNLGISFSFPGLKSLLVG : : . .:.: .. . .::.:: : .: .: .. . . . :.:: CCDS32 QL-QTPEGQTDHPQPILDRYTEPFAIFQLPYEKACKNKLFCVAELQLATTV-SQQELVVG 790 800 810 820 830 840 800 810 820 830 840 850 pF1KE1 SNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQLRSLHLTCDSA-PVGS . ::. .. . :.::::: :......: .:. . . :: : .. ::. ::.: CCDS32 LTKELTLNINLTNSGEDSYMTSMALNYPRNLQLKRM---QKPP---SPNIQCDDPQPVAS 850 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 910 pF1KE1 QGTWSTSCRINHLIF-RGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANVSSENNTPRTSKTTF . .:::.: .. :..:... . ... .: . .:..:.. :. .. : CCDS32 --VLIMNCRIGHPVLKRSSAHVSVV--WQLEENAFPNRTADITVTVTNSNERRSLANETH 910 920 930 940 950 920 930 940 950 960 970 pF1KE1 QLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNLGQRDLPVSINFWVP :.. ... .:.:. . :.: ... .... .: . : .: . .... :: CCDS32 TLQF--RHGFVAVLSKPSIM--YVNTGQGLSHHKEFLFHVHGENLFGAE---YQLQICVP 960 970 980 990 1000 1010 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE1 VELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVLDCSIAGCLRFRCDV ..: : .... : .. :. . : . . :... ..: ::. CCDS32 TKLRGLQVVAVKKLTRTQASTV-CTWSQERACAYSSVQHVEEWHSVSCVIAS-------- 1020 1030 1040 1050 1060 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE1 PSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQTT .. . :. ...:. ...:. . . ..::.:. :.: : ... :.. : CCDS32 ------DKENVTVAAEISWDHSEELLKDVTELQILGEISFNKSLYEGLNAEN--HRTKIT 1070 1080 1090 1100 1110 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE1 TVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEMMEEA--NGQIAPEN .:. : . .. :.:. .:.::::.: .: ..:.: :::::.:... :. ..:. :: CCDS32 VVFLKDEKYHSLPIIIKGSVGGLLVLIVILVILFKCGFFKRKYQQLNLESIRKAQLKSEN 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1160 pF1KE1 GTQTPSPPTPHYPQDNV CCDS32 LLEEEN >>CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188 aa) initn: 1079 init1: 224 opt: 1084 Z-score: 1244.5 bits: 242.3 E(32554): 5.4e-63 Smith-Waterman score: 1498; 28.7% identity (61.2% similar) in 1198 aa overlap (20-1139:23-1177) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVD-SAGFGDSVVQY---ANSWVVVGA ::.::.. .. . .: :: .: :. .:.:.:::: CCDS45 MDLPRGLVVAWALSLWPGFTDTFNMDTRKPRVIPGSRTAFFGYTVQQHDISGNKWLVVGA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE1 PQKITAANQTGGLYQCGYSTGACEPIGL------QVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLA : . .. ..:: .:.: : : ..: .: . :: ::::::.. . ...:: CCDS45 PLETNGYQKTGDVYKCPVIHGNCTKLNLGRVTLSNVSERKDNMRLGLSLATNPKDNSFLA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 CGPTVHHECGRNMYLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRN :.: :::: ..: ::.: .. . .... . . :.: . .:::...:::.:: CCDS45 CSPLWSHECGSSYYTTGMCSRVNSNFRFSKTVAPALQRC-QTYMDIVIVLDGSNSIYP-- 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 FATMMNFVRAVISQFQ-RPST-QFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQG .. ...:. ....: :. : ...:... .: ....: .. . . ..: .: CCDS45 WVEVQHFLINILKKFYIGPGQIQVGVVQYGEDVVHEFHLNDYRSVKDVVEAASHIEQ-RG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 FTYTATAIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRY : : ::. : . :.:. : :..::::::... :: : . :: ... .. :: CCDS45 GTETRTAFGIEFARSEAFQKGGRKGAKKVMIVITDGESH-DSPDLEKVIQQSERDNVTRY 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE1 AIGVGLAFQNR---NSWKELNDI---ASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEG :..: :.. :: : ::.: :: :...:.:.: : ::::: . : ..::..:: CCDS45 AVAV-LGYYNRRGINPETFLNEIKYIASDPDDKHFFNVTDEAALKDIVDALGDRIFSLEG 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 TETTSSSSFELEMAQEGFSAVFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPN-----MSPTFINM :. . .:: :::.: :::. . :: .:::::.. :.:... . .... CCDS45 TNK-NETSFGLEMSQTGFSSHVVEDGVLLGAVGAYDWNGAVLKETSAGKVIPLRESYLKE 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 SQENVDMRDSYLGYS-TELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFT-QVSRQWRMKAEVTG :.. . .::::. : .. . . : ::::..::::...:: . .:. .. . : CCDS45 FPEELKNHGAYLGYTVTSVVSSRQGRVYVAGAPRFNHTGKVILFTMHNNRSLTIHQAMRG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 TQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGAPHYYEQTRG-GQVSVCPLPRGWRRWWCDAVL :::::::. . :::.:.:: ::..:.::: :... : :.: : : .. . ...: CCDS45 QQIGSYFGSEITSVDIDGDGVTDVLLVGAPMYFNEGRERGKVYVYELRQNLFVY--NGTL 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 YGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQ ... .:::.... . :.: :. .:::.::: : .. ::.:.::: : :: . .: CCDS45 KDSHSYQNARFGSSIASVRDLNQDSYNDVVVGAPLEDNHAGAIYIFHGFRG-SILKTPKQ 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE1 RIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPA ::..:.:.. ::::: .. : ::..:::.:::::: :....: .:::. ...:..: :. CCDS45 RITASELATGLQYFGCSIHGQLDLNEDGLIDLAVGALGNAVILWSRPVVQINASLHFEPS 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 pF1KE1 EIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDKRSKNLLGSRDLQSSVTL--DLALDPGRLSP .: .:... . : . . .:. . .:. . ..: . . ..: : .: CCDS45 KINIFHRDCKRSG-RDATCLAAFLCF-----TPIFLAPHFQTTTVGIRYNATMDERRYTP 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 RATFQETKNRSLSRVRVLGL-KAHCENFNLLLPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFR :: ..: .: .:. .:. . :: .:. . . . : : :.:. ....: : CCDS45 RAHLDEGGDRFTNRAVLLSSGQELCERINFHVLD-TADYVKPVTFSVEYSLED-P----- 710 720 730 740 750 750 760 770 780 pF1KE1 NLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHIC---------------------------QDN . ::: . .:.:: ..:. :. : :: CCDS45 DHGPMLDDGWPTTLRVSVPFWNGCNEDEHCVPDLVLDARSDLPTAMEYCQRVLRKPAQDC 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE1 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ . ..:: .. .. .. .:. . : ::..:.:....:. :.:.. . ::. . CCDS45 SAYTLSFDTTVFIIESTRQRVAVEATLENRGENAYSTVLNISQSANLQFASLI--QKEDS 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KE1 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV :.. . . . .: : ... .::. :...: :. : :... .: . . CCDS45 DGSIECVNEERRLQKQ-----VCNVSYPFFRAKAKVAFRLDFEFS-KSIFLHHLEIELAA 880 890 900 910 920 910 920 930 940 950 pF1KE1 SSENNTPRTSK--TTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKY-LNFSESEEKESHVAMHR--- .:..: ..: .. :.. .:: . .. . ....: .. . : :. . .. CCDS45 GSDSNERDSTKEDNVAPLRFHLKYEADVLFTRSSSLSHYEVKPNSSLERYDGIGPPFSCI 930 940 950 960 970 980 960 970 980 990 1000 pF1KE1 YQVNNLGQRDLPVS---INFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRC-----SSEKIAPP ....::: .:. ... .:. . . .. .. . : :.: : CCDS45 FRIQNLGL--FPIHGMMMKITIPIATRSGNRLLKLRDFLTDEANTSCNIWGNSTEYRPTP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE1 ASDFLAHIQKNPVLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSV . . ... : :. : . . . :.. . ..:..: : ::: :.:.. : .. 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