FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3610, 364 aa 1>>>pF1KE3610 364 - 364 aa - 364 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1711+/-0.000804; mu= 16.8400+/- 0.048 mean_var=60.0870+/-11.877, 0's: 0 Z-trim(107.0): 35 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.165457 statistics sampled from 9301 (9336) to 9301 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16 Scan time: 2.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 2512 608.0 4.1e-174 CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 524 133.4 3e-31 CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 522 133.0 4.4e-31 CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 460 118.2 1.3e-26 CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 444 114.4 2.2e-25 CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 423 109.4 6.1e-24 CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 422 109.1 6.8e-24 CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 421 108.9 8.1e-24 CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 421 108.9 8.9e-24 CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 410 106.3 6e-23 CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 384 100.1 4.1e-21 CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 380 99.1 7.5e-21 CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 367 96.0 6.7e-20 CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 351 92.2 8.7e-19 CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 350 92.0 1.2e-18 CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 338 89.1 8.6e-18 CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 334 88.1 1.3e-17 CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 333 87.9 1.8e-17 CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 325 86.0 6.7e-17 CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 316 83.8 2.8e-16 CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 305 81.1 1.5e-15 CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 298 79.5 5e-15 CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 289 77.3 2.3e-14 CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 273 73.5 3.2e-13 CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 273 73.6 3.9e-13 CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 270 72.8 5.8e-13 CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 242 66.1 6e-11 CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 241 65.9 6.7e-11 >>CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 (364 aa) initn: 2512 init1: 2512 opt: 2512 Z-score: 3239.3 bits: 608.0 E(32554): 4.1e-174 Smith-Waterman score: 2512; 99.7% identity (99.7% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 AATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKERE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 AATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKERE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 QLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 FNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNP :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 FNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSGVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DQCHPSRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 DQCHPSRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 LTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDE 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 CGCG :::: CCDS85 CGCG >>CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 (372 aa) initn: 595 init1: 222 opt: 524 Z-score: 674.5 bits: 133.4 E(32554): 3e-31 Smith-Waterman score: 701; 36.8% identity (62.6% similar) in 356 aa overlap (29-363:39-371) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGL-DKAPSPQKFQPVPYILKKIFQD .:: ::: :. . ...::: .. ..:. CCDS42 CGHHLLLLLALLLPSLPLTRAPVPPGPAAALLQALGLRDEPQGAPRLRPVPPVMWRLFRR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE3 REAAATT--------GVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASS----CL :. : ::. . :.:.:::: ::..: .::.: : . :. .: : CCDS42 RDPQETRSGSRRTSPGVTLQPCHVEELGVAGNIVRHIPDRG---APTRASEPASAAGHCP 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 QKLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGK . . :.:::.. :. . :.: : .. . .:: : ..: . : :: CCDS42 EWTVVFDLSAVEPAERPSRARLELRFAAAA--AAAPEGGWELSVAQAGQGAGAD---PGP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 MFVLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARL ... . :: :. .:: .: : : .: : . .. . .:::: CCDS42 VLLRQLVPALGPPVRAELLGAA--WARNASWPRSLRLALALRP--------RAPAACARL 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 RCSLHASLLVVTLNPDQCHP-SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIA .::::.:::.: ::: .: :: : :: . . :. ..:...::..:::.:.:: CCDS42 A---EASLLLVTLDPRLCHPLARPRRDAEPVLGGGPGGACRARRLYVSFREVGWHRWVIA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 PKGFMANYCHGECPFSLTISLNSS----NYAFMQALMHAVDP---EIPQAVCIPTKLSPI :.::.::::.:.: . ...: ... :.: ..:::::. : ..: :.:..:::: CCDS42 PRGFLANYCQGQCALPVALSGSGGPPALNHAVLRALMHAAAPGAADLP--CCVPARLSPI 290 300 310 320 330 340 340 350 360 pF1KE3 SMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG :.:. ::.:::.::.::::::::::: CCDS42 SVLFFDNSDNVVLRQYEDMVVDECGCR 350 360 370 >>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa) initn: 485 init1: 462 opt: 522 Z-score: 671.5 bits: 133.0 E(32554): 4.4e-31 Smith-Waterman score: 567; 31.1% identity (61.7% similar) in 360 aa overlap (26-363:54-395) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF : .:...:: . :.:.. :: . .. CCDS13 LVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLY 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLR-FLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLS :. .. : ... . :.:..: : .... ... ..:. . ..:::: CCDS13 --RRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESL----EELPETSGKTTRRFFFNLS 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 pF1KE3 AIKEREQLTLAQLGL------D-LGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF .: .: .: :.: . : :: :: .. .. .. . .: . .. : ... CCDS13 SIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHH----RINIYEIIKPATANSKFPVT-RLL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 pF1KE3 VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEILVKEDRD---------SRVN : : :.: ... .::. :. . . : :. .:. :... :: CCDS13 DTRLV--NQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSL 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 FQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHP--SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINF : : . ...: :::. . . :: .:..: : . :. :.:: :...: CCDS13 HQDEHSWSQIR-----PLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHPLYVDF 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTK :.::. ::.:: :. : :::::::: :. :::.:.:..:.:...:. .::.: :.::. CCDS13 SDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKACCVPTE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 pF1KE3 LSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG :: ::::: :.:..:.:..:.::::. ::: CCDS13 LSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR 370 380 390 >>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa) initn: 494 init1: 445 opt: 460 Z-score: 591.3 bits: 118.2 E(32554): 1.3e-26 Smith-Waterman score: 551; 31.8% identity (61.1% similar) in 365 aa overlap (26-363:58-407) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF : ..::..:: . :.:.: .: .. .. CCDS97 PETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLY 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 --QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNL :. : : : : .. . :.:..: . . . :. :. ..: ::: CCDS97 RLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAF--RFL-FNL 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 pF1KE3 SAIKEREQLTLAQLGL-----DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF- :.: : : .. :.: : : ::. .. : . .. .. :..: . ::... CCDS97 SSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPD--WERGFH-RINIYEVMKP----PAEVVPGHLIT 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 pF1KE3 -VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEIL------VKEDRDSRVNFQ .: . ....... .::. :. . . :.:: .:. ... . :.. . CCDS97 RLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRS 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 pF1KE3 -PEDTC--ARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRAAIPVPKLSC-----KNL-CHRHQ :. . :.:: :::. . . : .:: : :: :: :.::. CCDS97 LPQGSGNWAQLR-----PLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHHSQRARKKNKNCRRHS 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 LFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAV :...: :.::. ::.:: :..: ::::.::: :. :::.:.:..:.:...:. ::.: CCDS97 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSSIPKAC 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 pF1KE3 CIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG :.::.:: ::::: :. :.:.:..:..:::. ::: CCDS97 CVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR 380 390 400 >>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa) initn: 442 init1: 284 opt: 444 Z-score: 569.2 bits: 114.4 E(32554): 2.2e-25 Smith-Waterman score: 498; 29.9% identity (57.5% similar) in 358 aa overlap (36-363:164-512) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 PDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREAAATTG . : : :. :: : . . . : .: CCDS45 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG 140 150 160 170 180 190 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 V--SRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLT . : ... . ... . .. : :..: . .: . :::: : : : .: CCDS45 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRH-HKEFKFNLSQIPEGEVVT 200 210 220 230 240 250 130 140 150 160 170 pF1KE3 LAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRS-VPWP--QGA :.. . : .:. : ::.. .: . . . .:.: . : : .: CCDS45 AAEFRIYKDCVMGSFKN-------QTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGW 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 pF1KE3 VHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKED------------RDSRVNFQPEDTCARLR ..:.. ... : .:..:.:: : ..... ::. . :: : .. CCDS45 LEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPF-MVAFFK 310 320 330 340 350 360 230 240 250 260 270 pF1KE3 CSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRA-AIPVPKLSC---------KNLCHRHQLFINFRDL : . . . . . ::.: . . : ..: :. :..:.:...:.:: CCDS45 VSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDL 370 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLS ::. :::::::. :::: ::: : :. .:..:.:..:.:.: ..:: .:. : ::::. CCDS45 GWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLN 430 440 450 460 470 480 340 350 360 pF1KE3 PISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG ::.:: :.:.::::..:..::: ::: CCDS45 AISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH 490 500 510 >>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa) initn: 456 init1: 273 opt: 423 Z-score: 543.2 bits: 109.4 E(32554): 6.1e-24 Smith-Waterman score: 465; 28.0% identity (57.1% similar) in 382 aa overlap (30-363:59-430) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQ---KFQPVPYILKKIFQ :..::: . : :. : . .:... ... CCDS13 ADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYN 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 pF1KE3 D---REAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQ------- .:... : . . : ....: : : :. :. . . . .. CCDS13 AMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFH 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 pF1KE3 -----KLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQT . . :.:: : : : .: :.. . : . . : ...... : . :. :. CCDS13 PRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDN--ETFRISVYQVLQEHL-GRE 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TPKPGKMFVLRSVP-WP--QGAVHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSR-VN . .:.: : : .: . :.. ... : :::.:.:: : . : :.. .: CCDS13 S----DLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSV---ETLDGQSIN 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 pF1KE3 FQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCH-------PSRKR---RAAIPVPK--LSCKNL . .: . . ..:. .. . : :..: :. : . : :. CCDS13 PKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANV 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 pF1KE3 -----------CHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAF :..:.:...::::::. :::::.:. : ::.::: : :. .:..:.:. CCDS13 AENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAI 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 pF1KE3 MQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG .:.:.: ..:: .:. : ::.:. ::.:: :...::::..:..::: ::: CCDS13 VQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH 380 390 400 410 420 430 >>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa) initn: 370 init1: 187 opt: 422 Z-score: 542.4 bits: 109.1 E(32554): 6.8e-24 Smith-Waterman score: 430; 33.6% identity (57.7% similar) in 286 aa overlap (107-363:126-401) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 GVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGLDLGPNSY : . :.:. : : .: :.. . : : CCDS43 EQRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVP-SI 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 YNLGPELELALF-LVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVHFNLLDV--AKD-WND . :. :....: .::: . . . .: : : . .::: :.: : CCDS43 HLLNRTLHVSMFQVVQEQ------SNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLL 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 NPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRAA . .:..:: : . . :: : :. .. : . .:::. . : : ::. CCDS43 KRHKDLGLRLYVET-EDGHS-VDPGLAGLLGQ-RAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAV 210 220 230 240 250 260 260 270 280 pF1KE3 IPV----PKLSC--------------------KNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGF :. :: : ...:.::.:...:.:::: :.:::.:. CCDS43 RPLRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGY 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 MANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDN : ::.::: : : .:..:.:..:.:.: . :. .:.: : ::::: :.:: :...: CCDS43 SAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNN 330 340 350 360 370 380 350 360 pF1KE3 VILRHYEDMVVDECGCG ::::....::: ::: CCDS43 VILRKHRNMVVKACGCH 390 400 >>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa) initn: 370 init1: 187 opt: 421 Z-score: 541.1 bits: 108.9 E(32554): 8.1e-24 Smith-Waterman score: 429; 33.6% identity (57.7% similar) in 286 aa overlap (107-363:126-401) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 GVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGLDLGPNSY : . :.:. : : .: :.. . : : CCDS44 ERRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVP-SI 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 YNLGPELELALF-LVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVHFNLLDV--AKD-WND . :. :....: .::: . . . .: : : . .::: :.: : CCDS44 HLLNRTLHVSMFQVVQEQ------SNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLL 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 NPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRAA . .:..:: : . . :: : :. .. : . .:::. . : : ::. CCDS44 KRHKDLGLRLYVET-EDGHS-VDPGLAGLLGQ-RAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAV 210 220 230 240 250 260 260 270 280 pF1KE3 IPV----PKLSC--------------------KNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGF :. :: : ...:.::.:...:.:::: :.:::.:. CCDS44 RPLRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGY 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 MANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDN : ::.::: : : .:..:.:..:.:.: . :. .:.: : ::::: :.:: :...: CCDS44 SAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNN 330 340 350 360 370 380 350 360 pF1KE3 VILRHYEDMVVDECGCG ::::....::: ::: CCDS44 VILRKHRNMVVKACGCH 390 400 >>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa) initn: 389 init1: 211 opt: 421 Z-score: 540.3 bits: 108.9 E(32554): 8.9e-24 Smith-Waterman score: 440; 29.7% identity (60.4% similar) in 283 aa overlap (107-363:178-453) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 GVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGL--DLGPN : . :.:. : . : .: :.. . : . : CCDS49 TNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNN 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 SYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVL---RSVPWPQGAVHFNLLDVAKDWN . : ...... . . . : . . .:.: .. : . :.. ... : CCDS49 RFEN--ETIKISIYQIIKEY-----TNRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWV 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 pF1KE3 DNPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQ-------PEDTCARLRCSLHASLLVV-------- ::..:.:: : . . :. :. :.. . ..:: ... CCDS49 INPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVRAANK 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ----TLNPDQCHPSRKRRAAIPVPKLSC-KNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMAN . : .. : . .: ... . : :. :..:.:...::::::. :::::.:. : CCDS49 RKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAF 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVIL :: ::: : :. .:..:.:..:.:.: . :. .:. : ::::. ::.:: :...:::: CCDS49 YCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVIL 390 400 410 420 430 440 360 pF1KE3 RHYEDMVVDECGCG ..:..::: ::: CCDS49 KKYRNMVVRSCGCH 450 >>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 (501 aa) initn: 423 init1: 227 opt: 410 Z-score: 525.5 bits: 106.3 E(32554): 6e-23 Smith-Waterman score: 410; 46.3% identity (70.7% similar) in 123 aa overlap (247-363:378-500) 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 QPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRAAIPV-----PKLSCKNLCHRHQLFI ::::: . . :. . : : :. : . CCDS13 TKKRDLFFNEIKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQGKRPSKNLKARCSRKALHV 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 NFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCI ::.:.:: ::::: . : .:.: : : : :. .:.: .:.::...::: : . :. CCDS13 NFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCV 410 420 430 440 450 460 340 350 360 pF1KE3 PTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG ::.:::::.:. :. .::. ..::::::. ::: CCDS13 PTRLSPISILFIDSANNVVYKQYEDMVVESCGCR 470 480 490 500 364 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:28:10 2016 done: Sun Nov 6 22:28:10 2016 Total Scan time: 2.710 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]