FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3929, 500 aa 1>>>pF1KE3929 500 - 500 aa - 500 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7560+/-0.000951; mu= 15.5381+/- 0.057 mean_var=78.4473+/-15.740, 0's: 0 Z-trim(105.0): 98 B-trim: 45 in 1/49 Lambda= 0.144806 statistics sampled from 8098 (8209) to 8098 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 3.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 3285 696.3 2e-200 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 1304 282.6 1.3e-75 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 1276 276.7 6.9e-74 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 918 201.8 1.4e-51 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 847 187.0 4e-47 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 812 179.7 6.6e-45 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 750 166.7 5.7e-41 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 686 153.4 5.9e-37 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 672 150.5 5.3e-36 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 661 148.1 2.1e-35 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 659 147.8 3.4e-35 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 647 145.3 1.9e-34 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 647 145.3 2e-34 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 627 141.0 2.9e-33 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 621 139.8 6.9e-33 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 620 139.5 6.9e-33 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 616 138.8 1.6e-32 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 611 137.6 2.6e-32 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 594 134.2 4.3e-31 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 567 128.5 2e-29 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 553 125.5 1.2e-28 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 435 100.9 3.6e-21 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 357 84.6 2.8e-16 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 347 82.5 1.1e-15 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 307 74.2 4e-13 CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 302 73.2 1e-12 CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 293 71.3 3.8e-12 CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 285 69.7 1.4e-11 CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 285 69.7 1.5e-11 CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 285 69.7 1.6e-11 CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 285 69.7 1.6e-11 >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa) initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 3711.7 bits: 696.3 E(32554): 2e-200 Smith-Waterman score: 3285; 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CCDS62 AVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNT 470 480 490 500 510 520 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 1227 init1: 565 opt: 1276 Z-score: 1440.0 bits: 276.7 E(32554): 6.9e-74 Smith-Waterman score: 1276; 45.9% identity (72.9% similar) in 468 aa overlap (43-497:35-481) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV .:::: . ..:. .:.:::::: CCDS13 MTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS . : ::.::: . :::::::: :: .:..:::::::.::..:::: CCDS13 TH----------DSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALS 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT : ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : :...: . ..:.:. :.. : CCDS13 FSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL--KREAETLR-EREGEE-FDNTCCAE 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--------QLL :.:::..::::.::.::.:...:::.:.:.: : ..: . ::. :: :: CCDS13 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT .. : :::.::: :..:::: . .:.. : ::::::::.:.:. :.:: .... CCDS13 HV-EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS ...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: ::: CCDS13 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA .. .:::.. :: : :.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.: CCDS13 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 pF1KE3 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSI--MEM ::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.:..:..:::: :.. CCDS13 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNMKDAFARSIEMMDI 410 420 430 440 450 460 480 490 500 pF1KE3 LRLKGRERASTRSSGGDDFWF . :. : . ... :. CCDS13 VVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQH 470 480 490 500 510 520 >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa) initn: 914 init1: 428 opt: 918 Z-score: 1039.4 bits: 201.8 E(32554): 1.4e-51 Smith-Waterman score: 918; 37.7% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (43-457:27-435) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV ::::: : :: . :: .:.:::..: . CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCL 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS : :. .. : :::: .: :..:::. .::. :.. : :..:. . .: . CCDS16 A-----GGYDTIFS---LCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT : .:...: .: .:.::... .:.:: : . :. . .: . . : CCDS16 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRR--C-- 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 pF1KE3 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSA-ELSWLDLQ-------LLE .. .:..:::: :: ::. .:.:.....:: . : . . ::. :: . :: CCDS16 -QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLE 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQE .: .::.::: :..::.. .. .: . ::.:.:::::::..: . : :.. .: CCDS16 NVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL-GARM-ME 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTV : :: . ::.::..: :..::.:::.::..: ... . ..:.::::..:.::: .::.. CCDS16 LTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSAL 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 EYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALP : ::: :.: : :.: ..::: .::::::::: : :: ::. : . .: :....::: CCDS16 GYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALP 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 IAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLK : : . : : .. :.:.... : .:... CCDS16 IHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEA 410 420 430 440 450 460 490 500 pF1KE3 GRERASTRSSGGDDFWF CCDS16 PSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK 470 480 490 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 907 init1: 416 opt: 847 Z-score: 959.6 bits: 187.0 E(32554): 4e-47 Smith-Waterman score: 941; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (27-460:6-438) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF :: : : . . .:::: : :. ::. CCDS12 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG : .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.: CCDS12 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES .:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .: CCDS12 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 pF1KE3 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL . .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . :: CCDS12 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 SWLDL----QLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL . . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..: CCDS12 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLL :. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: :::: CCDS12 LLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 pF1KE3 LFLSVGISIFSTVEYFAEQSI-PDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVA ::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..:: CCDS12 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEA-AVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL . ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . :: CCDS12 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF CCDS12 PDSAGLADDSADALWVRAGR 450 460 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 1120 init1: 545 opt: 812 Z-score: 919.7 bits: 179.7 E(32554): 6.6e-45 Smith-Waterman score: 1158; 43.3% identity (68.7% similar) in 467 aa overlap (26-476:7-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF : :. : :. ..:::: . ..:..: : CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELV-----NLNVGGFKQSVDQSTLLRF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG :::::::: . . :. :::::: . .:.::.:::. . :::::..: :: CCDS16 PHTRLGKLLTCHSE-------EAI---LELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTG 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE3 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTED------- .:::::.::..:: :::.::::.:: ::::: .:: .::: .. :. . ..: CCDS16 KLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSF 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 -QESQHESE-QDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS . : :.: . :. .:.:.: .:.:. .:..... :. :..::. : . : CCDS16 EESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHS 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KE3 A-----ELSWLDLQLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPF : . .: .:: .: .::.:::::...:. . . .: .. ::::...:.:: CCDS16 MSEFQNEDGEVDDPVLEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPF 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 YITLLVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEV : :: :. . . ....::.:..::.:::.: .:.:::.:::.:::::: :. . :.:: CCDS16 YATLAVD--TKEEESEDIENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEV 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 GLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGK :::::::::::::::.. : .:.. ...::.: ::::: ::::::::: .: : .:: CCDS16 GLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGK 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 IVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQ--REALKKLTKNIATDSYI ..: ::. ::::.::::.:: ..:: : : :. : : ..: .: CCDS16 LIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYY--QKQKDIDVDQCSEDAPEK------CHELP 390 400 410 420 430 470 480 490 500 pF1KE3 SVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF :.::.::. . CCDS16 YFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 440 450 460 470 480 490 >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 1142 init1: 521 opt: 750 Z-score: 849.0 bits: 166.7 E(32554): 5.7e-41 Smith-Waterman score: 1097; 41.3% identity (69.8% similar) in 441 aa overlap (29-449:87-514) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALS :: ..: :: . ..::::: . :. :. CCDS64 EDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELA 60 70 80 90 100 110 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 CFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYR ::.::::.::. .. :. : :::: . .::::::. .:. : ..: CCDS64 GFPKTRLGRLATSTSRSRQ----------LSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYL 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQ .: : :.. :: ::.:. :::. ::: . :: :::: : .... . : . CCDS64 SGVLLVLDGLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQV 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 HESEQDFSQ----GPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAE .:.:. : . :: :..:::..::: ::.::. .:: : ::.::.. .:: ..: CCDS64 EEAEELFRDMRFYGP---QRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVE 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 pF1KE3 LSWL---------DLQ-LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAI ::. .:: .:..:...:: :..::. . : :: :.. :..::.:: CCDS64 EMQQHSGQGEGGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAI 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 pF1KE3 LPFYITLLVESLSG-----SQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMT ::.:. ::.: ..: .::. . .::....:.::.: .:.:::.:::::::..:.: CCDS64 LPLYLQLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFT 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 ITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDI . :::..:: ::::...:: ::.. : .:...:.:.::..: .::::..:..::::::. CCDS64 LRQCYQQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDM 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 RPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNI :.: :.. ::.:: ::.. ..::.:. ..:: : :: : .. .:: CCDS64 YPETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQR 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 pF1KE3 ATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF CCDS64 ARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN 530 540 >>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa) initn: 845 init1: 429 opt: 686 Z-score: 777.0 bits: 153.4 E(32554): 5.9e-37 Smith-Waterman score: 1061; 39.9% identity (64.9% similar) in 476 aa overlap (6-446:17-475) 10 20 30 40 pF1KE3 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLAL-----GDCFTVN ...: .:: . : . .: :: : .. . . :: CCDS13 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRS-----TETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVN 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFD ::: : :: .::. :: ::::.: : :. . .:::: . . :..:: CCDS13 VGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQ----------AAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 RSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSET : : .::.::::.:::...::...: :: .:::. : .. .::: ::..:. :.. CCDS13 RHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERR-LTQP 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LDFKKDTE---------DQESQHESE-QDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGV . .:.. :. :. . : .. . : .:..:: .:.:: : ...:. CCDS13 HAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSC 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 pF1KE3 ISIIFVVVSIINMALMS----------AELSWL----------DLQLLEILEYVCISWFT .:: :..:: : . : : .. . : .:. ::: ::.::. CCDS13 VSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFS 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 GEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQELENVGRIVQVL : :.: . . :. . :.::....::::.:::. :.: .:. ..:..:::. CCDS13 FEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVF 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 RLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDT ::.: .:.:::.:::::::::: :. . :.:::.:::.:.::.:.:: : : ::. :. CCDS13 RLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKE-EDV 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 TFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSAC :...: :::.:.:::::::::. : :..::..: :::.::::.::::.:: ..:: CCDS13 GFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHF 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 YFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSG : : ::::: CCDS13 YRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSIDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHP 470 480 490 500 510 520 >>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa) initn: 889 init1: 408 opt: 672 Z-score: 759.9 bits: 150.5 E(32554): 5.3e-36 Smith-Waterman score: 847; 36.5% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (38-464:38-447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 LLDSPLDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGD-CFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLG :: ..:::.: :: ...:. .: : :: CCDS14 WLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDRYPDTLLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVME . : :. ::. ..::::::. . ::.::..::::::: . CCDS14 S------------------SEKEFFYDAD--SGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFS : : .: .:. ..:. . .:: ..: :.:: .: : .::.:. :. : CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERL-----AEDEEA--EQAGDGP 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE3 QGPC-PTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALM------SAELSWLD : ..::.:: .:.: .:::: .: .. .:..::.: .. ::. : . CCDS14 ALPAGSSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSRE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 L-------QLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLL : . .. .:. ::::..::.. . .::::::.: ..::..::::.:: :: CCDS14 QPCGERFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 VESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLL : . ..:. .::..:..:..:..::: ::: ::.:. .: :.:.::. CCDS14 VP---------KNDDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLF 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 FLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFM :...: ::.:: ..::.. :.:::.: :.:.. ..:::.::::. :.: .::: . . CCDS14 SLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSI 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KE3 CILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKL---KEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL : :::.::.:::. .: . :: : . ..: . : : .:.:. .:.... CCDS14 CSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQ 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 pF1KE3 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF CCDS14 NGGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGR 460 470 480 490 500 510 >>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 605 init1: 411 opt: 661 Z-score: 749.2 bits: 148.1 E(32554): 2.1e-35 Smith-Waterman score: 719; 31.5% identity (61.3% similar) in 463 aa overlap (43-479:41-457) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 LDSGSLTSLGSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV .:..: :: . ..:. ::.: :: CCDS85 EASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLG------ 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG-RLHVMEQLCAL .: . .:. :::::::. .: .:.::..: ::. .. 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