FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6353, 388 aa 1>>>pF1KE6353 388 - 388 aa - 388 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5141+/-0.000694; mu= 17.0104+/- 0.042 mean_var=79.5250+/-15.940, 0's: 0 Z-trim(111.3): 18 B-trim: 4 in 1/50 Lambda= 0.143821 statistics sampled from 12227 (12240) to 12227 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16 Scan time: 2.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 ( 388) 2599 548.4 4.1e-156 CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 ( 429) 797 174.5 1.6e-43 CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 372) 684 151.0 1.6e-36 CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 323) 594 132.3 6.1e-31 CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 369) 569 127.1 2.5e-29 CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 320) 548 122.7 4.5e-28 >>CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 (388 aa) initn: 2599 init1: 2599 opt: 2599 Z-score: 2916.1 bits: 548.4 E(32554): 4.1e-156 Smith-Waterman score: 2599; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 PPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 FSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 FSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 LLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 GDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 GFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 GFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRF 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 GFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA :::::::::::::::::::::::::::: CCDS17 GFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA 370 380 >>CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 (429 aa) initn: 772 init1: 423 opt: 797 Z-score: 894.8 bits: 174.5 E(32554): 1.6e-43 Smith-Waterman score: 797; 37.2% identity (69.6% similar) in 349 aa overlap (39-383:79-425) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 GLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPE . :: .. . . : : . 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CCDS10 GVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKE 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 TLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAI--DSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSC .:... : ....:..:.:: .: .:. . :.. : : ..:. : . ::. : CCDS10 ALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRC 350 360 370 380 390 400 370 380 pF1KE6 TLQVEQYQPEMAQ-CLRCQEPPQA :.:...:. :. . : :: CCDS10 TIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP 410 420 >>CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (372 aa) initn: 1312 init1: 678 opt: 684 Z-score: 769.0 bits: 151.0 E(32554): 1.6e-36 Smith-Waterman score: 1244; 53.7% identity (78.1% similar) in 352 aa overlap (40-385:32-370) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 LETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEES---KPVEMPF---HHCHRDPLPPP :::. . . .:. :::: . : CCDS30 EAKEKQHLLDARPAIRSYTGSLWQEGAGWIPLPRPGLDLQAIELAAQSNHHCHAQKGPDS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSL :.. .:.::::.: :.:..:: :::::::::::::.::::::::.: .::. ::::: CCDS30 HCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVVGGYLAHSLAVMTDAAHLLTDFASMLISLFSL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 WLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLT :.:.::::.::.:::.:.: ::::.::.:.:.:::.:.::: ::. .::.:.::.::.: CCDS30 WMSSRPATKTMNFGWQRAEILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLIT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDL .. :: .:..:...:::.: ::::. . . ::.: ::::::.::.::. CCDS30 SGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTTNQQ----EENP---------SVRAAFIHVIGDF 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFE .::.:::.:. ..::::.:: .::: ::.::: .::.: ::::. .::::::..: : CCDS30 MQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 PVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFS ::: :::: ::.: : ::.::::.. : :.:.:: ...: .::: ::::: ..: : CCDS30 AVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDAQAVLKTASSRLQGKFHFH 290 300 310 320 330 340 370 380 pF1KE6 SCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA . :.:.:.:. .: .: :: : CCDS30 TVTIQIEDYSEDMKDCQACQGPSD 350 360 370 >>CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (323 aa) initn: 967 init1: 588 opt: 594 Z-score: 668.9 bits: 132.3 E(32554): 6.1e-31 Smith-Waterman score: 870; 43.2% identity (64.8% similar) in 352 aa overlap (40-385:32-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 LETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEES---KPVEMPF---HHCHRDPLPPP :::. . . .:. :::: . : CCDS27 EAKEKQHLLDARPAIRSYTGSLWQEGAGWIPLPRPGLDLQAIELAAQSNHHCHAQKGPDS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSL :.. .:.::::.: :.:..:: :::: CCDS27 HCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVV------------------------------- 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 WLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLT : ::::.::.:.:.:::.:.::: ::. .::.:.::.::.: CCDS27 ------------------EILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLIT 100 110 120 130 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDL .. :: .:..:...:::.: ::::. . . ::.: ::::::.::.::. CCDS27 SGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTTNQQ----EENP---------SVRAAFIHVIGDF 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFE .::.:::.:. ..::::.:: .::: ::.::: .::.: ::::. .::::::..: : CCDS27 MQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFT 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 PVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFS ::: :::: ::.: : ::.::::.. : :.:.:: ...: .::: ::::: ..: : CCDS27 AVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDAQAVLKTASSRLQGKFHFH 240 250 260 270 280 290 370 380 pF1KE6 SCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA . :.:.:.:. .: .: :: : CCDS27 TVTIQIEDYSEDMKDCQACQGPSD 300 310 320 >>CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (369 aa) initn: 986 init1: 538 opt: 569 Z-score: 640.1 bits: 127.1 E(32554): 2.5e-29 Smith-Waterman score: 993; 42.3% identity (70.0% similar) in 383 aa overlap (10-385:4-367) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMP-------FH :: : ::. :... .. :.:. . ..:. ... : : : .. CCDS63 MEFLERTYLVN--DKAAKMYAFTLESVELQ-QKPVNKDQCPRERPEELESGGMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 HCHRDPLPPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADV ::: : . : .:. .: .: :.::.:: .:::::..: :::..::::::: :. CCDS63 HCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAICFIFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 GSMMGSLFSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDY :.. ::::::::..: .. .::::::.: :::: :.. .:.:::.:.::: :::. :: CCDS63 TSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAEILGALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HIEGGAMLLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVR .:.. .:....: :: ::.... :::: :.: : :.::: CCDS63 QIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRCLGHNHKEVQA----------------NASVR 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 AAFVHVLGDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILM :::::.::::.::..:: ....:::::.:: :::: ::.::: .:.:: :.: .:: CCDS63 AAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEYKIADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLM 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 EGTPRNVGFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEAS ::.:..... :.. .:.: :: ..: ::.:.::.. . :::.: .. : ..: : . CCDS63 EGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLHIWSLTMNQVILSAHVATAASRDSQVVRREIA 280 290 300 310 320 330 360 370 380 pF1KE6 SRLYSRFGFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA . : . : . : :.:.:. . .:: :..: CCDS63 KALSKSFTMHSLTIQMESPVDQDPDCLFCEDPCD 340 350 360 >>CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (320 aa) initn: 986 init1: 538 opt: 548 Z-score: 617.4 bits: 122.7 E(32554): 4.5e-28 Smith-Waterman score: 972; 45.0% identity (72.1% similar) in 333 aa overlap (53-385:2-318) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 GAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPERLHARRQLYAACAV .::: : . : .:. .: .: :. CCDS55 MYHCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAI 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 CFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSLWLSTRPATRTMTFGWHRSE ::.:: .:::::..: :::..::::::: :. :.. ::::::::..: .. .::::::.: CCDS55 CFIFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDLTSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAE 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 TLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLTASIAVCANLLMAFVLHQAG :::: :.. .:.:::.:.::: :::. ::.:.. .:....: :: ::.... :::: CCDS55 ILGALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDYQIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRC 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 PPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDLLQSFGVLAASILIYFKPQY :.: : :.::::::::.::::.::..:: ....:::::.: CCDS55 LGHNHKEVQA----------------NASVRAAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEY 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 KAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFEPVRDTLLSVPGVRATHELH : :::: ::.::: .:.:: :.: .::::.:..... :.. .:.: :: ..: :: CCDS55 KIADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLMEGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLH 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 LWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRC .:.::.. . :::.: .. : ..: : .. : . : . : :.:.:. . .:: : CCDS55 IWSLTMNQVILSAHVATAASRDSQVVRREIAKALSKSFTMHSLTIQMESPVDQDPDCLFC 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 QEPPQA ..: CCDS55 EDPCD 320 388 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:23:49 2016 done: Tue Nov 8 12:23:50 2016 Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]