Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5745
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5745, 793 aa
  1>>>pF1KB5745 793 - 793 aa - 793 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1085+/-0.00119; mu= 17.2892+/- 0.072
 mean_var=108.2290+/-21.331, 0's: 0 Z-trim(104.4): 108  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.123283
 statistics sampled from 7782 (7895) to 7782 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time:  3.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 793) 5293 953.2       0
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 802) 4420 798.0       0
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 700) 3146 571.3 1.9e-162
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 642) 3086 560.6 2.9e-159
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1898) 2053 377.3 1.3e-103
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1907) 2053 377.3 1.3e-103
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496) 2035 374.0  1e-102
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1912) 2035 374.1 1.2e-102
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1502) 2026 372.4 3.1e-102
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9           (1505) 2026 372.4 3.1e-102
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1506) 2024 372.0  4e-102
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1501) 2013 370.1 1.5e-101
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1505) 2013 370.1 1.5e-101
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910) 2013 370.2 1.8e-101
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1505) 1993 366.5 1.8e-100
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1948) 1980 364.3 1.1e-99
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1439) 1532 284.5 8.4e-76
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6           (1440) 1532 284.5 8.4e-76
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1452) 1512 280.9   1e-74
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1465) 1512 281.0   1e-74
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1446) 1510 280.6 1.3e-74
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1462) 1510 280.6 1.3e-74
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1441) 1497 278.3 6.3e-74
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1460) 1497 278.3 6.4e-74
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (1448) 1429 266.2 2.8e-70
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (2315) 1431 266.7 3.1e-70
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1           (1436) 1385 258.4 6.2e-68
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1           (1446) 1385 258.4 6.3e-68
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1         (1440) 1382 257.8 9.1e-68
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1         (1433) 1374 256.4 2.4e-67
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3           (1445) 1217 228.5 6.2e-59
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1145) 1069 202.1 4.4e-51
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1306) 1069 202.1 4.8e-51
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  817 157.4   2e-37
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  817 157.4   2e-37
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1997)  817 157.5 2.1e-37
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (2127)  817 157.5 2.2e-37
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (2215)  817 157.5 2.2e-37
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         ( 937)  747 144.7 6.5e-34
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         (1115)  747 144.8 7.4e-34
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11          (1337)  725 140.9 1.3e-32
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 595)  660 129.1 2.1e-29
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 597)  660 129.1 2.1e-29
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 624)  660 129.1 2.2e-29
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 399)  621 122.0 1.9e-27
CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7         ( 977)  626 123.2   2e-27
CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7          (1015)  626 123.2 2.1e-27
CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 465)  621 122.1 2.1e-27
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7          ( 780)  624 122.8 2.2e-27
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12         ( 377)  619 121.6 2.3e-27


>>CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20              (793 aa)
 initn: 5293 init1: 5293 opt: 5293  Z-score: 5093.0  bits: 953.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5293; 100.0% identity (100.0% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDSWFILVLLGSGLICVSANNATTVAPSVGITRLINSSTAEPVKEEAKTSNPTSSLTSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDSWFILVLLGSGLICVSANNATTVAPSVGITRLINSSTAEPVKEEAKTSNPTSSLTSLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VAPTFSPNITLGPTYLTTVNSSDSDNGTTRTASTNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAPTFSPNITLGPTYLTTVNSSDSDNGTTRTASTNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 WEGNSSTAATTPETFPPSDETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WEGNSSTAATTPETFPPSDETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 ACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 FIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 CNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 QYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 MRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 LLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPIT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 VHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQ
              730       740       750       760       770       780

              790   
pF1KB5 EYIDAFSDYANFK
       :::::::::::::
CCDS13 EYIDAFSDYANFK
              790   

>>CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20              (802 aa)
 initn: 4411 init1: 4411 opt: 4420  Z-score: 4253.8  bits: 798.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5265; 98.9% identity (98.9% similar) in 802 aa overlap (1-793:1-802)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDSWFILVLLGSGLICVSANNATTVAPSVGITRLINSSTAEPVKEEAKTSNPTSSLTSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDSWFILVLLGSGLICVSANNATTVAPSVGITRLINSSTAEPVKEEAKTSNPTSSLTSLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VAPTFSPNITLGPTYLTTVNSSDSDNGTTRTASTNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAPTFSPNITLGPTYLTTVNSSDSDNGTTRTASTNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEP
               70        80        90       100       110       120

              130                140       150       160       170 
pF1KB5 WEGNSSTAATTPETFPPS---------DETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKY
       ::::::::::::::::::         :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WEGNSSTAATTPETFPPSGNSDSKDRRDETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKY
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB5 KQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKL
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB5 FREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASF
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB5 INGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCW
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 TYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGM
              370       380       390       400       410       420

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB5 LKFLKKVKACNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKFLKKVKACNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQ
              430       440       450       460       470       480

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB5 RCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKL
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB5 TSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQK
              550       560       570       580       590       600

             600       610       620       630       640       650 
pF1KB5 DSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITV
              610       620       630       640       650       660

             660       670       680       690       700       710 
pF1KB5 ELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQ
              670       680       690       700       710       720

             720       730       740       750       760       770 
pF1KB5 QQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQ
              730       740       750       760       770       780

             780       790   
pF1KB5 YEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK
       ::::::::::::::::::::::
CCDS13 YEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK
              790       800  

>>CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10               (700 aa)
 initn: 3130 init1: 1423 opt: 3146  Z-score: 3030.0  bits: 571.3 E(32554): 1.9e-162
Smith-Waterman score: 3146; 68.0% identity (85.5% similar) in 682 aa overlap (123-793:22-700)

            100       110       120          130         140       
pF1KB5 STNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEPWEGNSSTA---ATTPETFPPSD--ETPIIAVM
                                     :: .::    ::  . ::.     :..: .
CCDS76          MEPLCPLLLVGFSLPLARALRGNETTADSNETTTTSGPPDPGASQPLLAWL
                        10        20        30        40        50 

       150       160       170       180       190       200       
pF1KB5 VALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNR
       . :  ::... .... :..::.: ..:   ... .. ::  :. : : : ::.::::  .
CCDS76 L-LPLLLLLLVLLLAAYFFRFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPK
               60        70        80        90       100       110

       210       220       230       240       250       260       
pF1KB5 KYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILP
       :: :.::..:::::  : ::: : ::::::.::.  ::.: : :.::::.::::: ::::
CCDS76 KYFPIPVEHLEEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENREKNRYPNILP
              120       130       140       150       160       170

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB5 YDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATI
        ::::: :. ..:.: :::::::.:.::.::::::::::::.:::::::::.:::..:::
CCDS76 NDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSATI
              180       190       200       210       220       230

       330       340       350       360       370        380      
pF1KB5 VMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQ-QVGDMTNRK
       ::.:::::::: :: :::::::::::::::: ::: .::::::.:::::: :. :    :
CCDS76 VMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGC--K
              240       250       260       270       280          

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB5 PQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKACNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVI
         ::..:.:::::::::::::::::::::::::. :: .:: :::::::::::::::.::
CCDS76 APRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVI
      290       300       310       320       330       340        

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB5 DAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLE
       :::. :::.:.::::. :::::: :: :::::::::.::::::::.::::::::.:.:::
CCDS76 DAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSSLE
      350       360       370       380       390       400        

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB5 THLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRV
        ::: ...     .. ::::::.:::...:....:::::::::::: ::.:::::.::::
CCDS76 KHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRV
      410       420       430       440       450       460        

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB5 IIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTEL
       :. .:::.: :::.:::::::::::: .::.:::: ::.:::::::::::: .::::::.
CCDS76 ILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSHTIVMLTEV
      470       480       490       500       510       520        

        630       640       650       660       670            680 
pF1KB5 EERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVT-----NTRENKSRQIR
       .:: :.:: ::::..: :..:.::.:.:..   :. ..::.:::       .:.. : .:
CCDS76 QEREQDKCYQYWPTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQEEQVRVVR
      530       540       550       560       570       580        

             690       700       710       720       730       740 
pF1KB5 QFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLE
       :::::::::.:::..:::::..::::::::::.::::::::::::::::::: :::..::
CCDS76 QFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILE
      590       600       610       620       630       640        

             750       760       770       780       790   
pF1KB5 RVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK
       ::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::..:: ::::::::
CCDS76 RVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
      650       660       670       680       690       700

>>CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10               (642 aa)
 initn: 3078 init1: 1423 opt: 3086  Z-score: 2972.8  bits: 560.6 E(32554): 2.9e-159
Smith-Waterman score: 3086; 71.0% identity (87.3% similar) in 632 aa overlap (168-793:13-642)

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB5 SDETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVP
                                     :.: ..:   ... .. ::  :. : : : 
CCDS76                   MSNRSSFSRLTWFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVM
                                 10        20        30        40  

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB5 LLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENK
       ::.::::  .:: :.::..:::::  : ::: : ::::::.::.  ::.: : :.::::.
CCDS76 LLSRSPSGPKKYFPIPVEHLEEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENR
             50        60        70        80        90       100  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB5 EKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWR
       ::::: :::: ::::: :. ..:.: :::::::.:.::.::::::::::::.::::::::
CCDS76 EKNRYPNILPNDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWR
            110       120       130       140       150       160  

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB5 MIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQ
       :.:::..:::::.:::::::: :: :::::::::::::::: ::: .::::::.::::::
CCDS76 MVWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQ
            170       180       190       200       210       220  

        380       390       400       410       420       430      
pF1KB5 -QVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKACNPQYAGAIVVHCSAG
        :. :    :  ::..:.:::::::::::::::::::::::::. :: .:: ::::::::
CCDS76 PQLPDGC--KAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAG
              230       240       250       260       270       280

        440       450       460       470       480       490      
pF1KB5 VGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYG
       :::::::.:::::. :::.:.::::. :::::: :: :::::::::.::::::::.::::
CCDS76 VGRTGTFIVIDAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYG
              290       300       310       320       330       340

        500       510       520       530       540       550      
pF1KB5 DTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVL
       ::::.:.::: ::: ...     .. ::::::.:::...:....:::::::::::: ::.
CCDS76 DTELDVSSLEKHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVI
              350       360       370       380       390       400

        560       570       580       590       600       610      
pF1KB5 QIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWK
       :::::.:::::. .:::.: :::.:::::::::::: .::.:::: ::.:::::::::::
CCDS76 QIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWK
              410       420       430       440       450       460

        620       630       640       650       660       670      
pF1KB5 SCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVT-----N
       : .::::::..:: :.:: ::::..: :..:.::.:.:..   :. ..::.:::      
CCDS76 SHTIVMLTEVQEREQDKCYQYWPTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQA
              470       480       490       500       510       520

             680       690       700       710       720       730 
pF1KB5 TRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTG
        .:.. : .::::::::::.:::..:::::..::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS76 RQEEQVRVVRQFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTG
              530       540       550       560       570       580

             740       750       760       770       780       790 
pF1KB5 TFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYAN
       :: :::..::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::..:: ::::::
CCDS76 TFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYAN
              590       600       610       620       630       640

         
pF1KB5 FK
       ::
CCDS76 FK
         

>>CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1                 (1898 aa)
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Smith-Waterman score: 2053; 49.0% identity (75.5% similar) in 645 aa overlap (153-790:1260-1897)

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>>CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1                 (1907 aa)
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CCDS48 YRAALEYLGSFDHYAT  
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>>CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9               (1496 aa)
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CCDS75 RSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSS
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CCDS75 EKRE----VRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGC
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CCDS75 FIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQTEDQYIFIHDALLEAVTCGNTEVPA
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CCDS64 GFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYATSPYSDPVVSMDLDPQ--PITDEEE--GLI
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pF1KB5 VALSSLLVIVFII-IVLYMLRFKK---YKQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLAR--
        ... .:..:::: ::. .: .:.    :.: : : .  . :..    .  . :.  :  
CCDS64 WVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSKPDRKRAESDSRKSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRL
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