FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3936, 179 aa 1>>>pF1KE3936 179 - 179 aa - 179 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5513+/-0.00103; mu= 10.8985+/- 0.062 mean_var=79.2957+/-17.090, 0's: 0 Z-trim(104.7): 154 B-trim: 601 in 2/45 Lambda= 0.144029 statistics sampled from 7854 (8045) to 7854 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 1.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7131.1 ARL5B gene_id:221079|Hs108|chr10 ( 179) 1191 257.0 4.4e-69 CCDS2195.1 ARL5A gene_id:26225|Hs108|chr2 ( 179) 1010 219.4 9.1e-58 CCDS46425.1 ARL5A gene_id:26225|Hs108|chr2 ( 142) 816 179.1 1e-45 CCDS45664.1 ARL5C gene_id:390790|Hs108|chr17 ( 179) 796 175.0 2.2e-44 CCDS1565.1 ARF1 gene_id:375|Hs108|chr1 ( 181) 611 136.5 8.4e-33 CCDS8774.1 ARF3 gene_id:377|Hs108|chr12 ( 181) 598 133.8 5.4e-32 CCDS44958.1 ARL1 gene_id:400|Hs108|chr12 ( 181) 577 129.5 1.1e-30 CCDS2884.1 ARF4 gene_id:378|Hs108|chr3 ( 180) 564 126.8 7.3e-30 CCDS34745.1 ARF5 gene_id:381|Hs108|chr7 ( 180) 559 125.7 1.5e-29 CCDS9695.1 ARF6 gene_id:382|Hs108|chr14 ( 175) 552 124.3 4e-29 CCDS7538.1 ARL3 gene_id:403|Hs108|chr10 ( 182) 506 114.7 3.1e-26 CCDS8088.1 ARL2 gene_id:402|Hs108|chr11 ( 184) 489 111.2 3.6e-25 CCDS3987.1 TRIM23 gene_id:373|Hs108|chr5 ( 574) 484 110.5 1.9e-24 CCDS3192.1 ARL14 gene_id:80117|Hs108|chr3 ( 192) 475 108.3 2.8e-24 CCDS5359.1 ARL4A gene_id:10124|Hs108|chr7 ( 200) 453 103.7 6.9e-23 CCDS73510.1 ARL1 gene_id:400|Hs108|chr12 ( 135) 430 98.8 1.4e-21 CCDS2928.1 ARL6 gene_id:84100|Hs108|chr3 ( 186) 427 98.3 2.8e-21 CCDS43322.1 TRIM23 gene_id:373|Hs108|chr5 ( 569) 430 99.3 4.4e-21 CCDS2512.1 ARL4C gene_id:10123|Hs108|chr2 ( 192) 422 97.3 5.8e-21 CCDS63169.1 ARL4C gene_id:10123|Hs108|chr2 ( 201) 422 97.3 6e-21 CCDS11463.1 ARL4D gene_id:379|Hs108|chr17 ( 201) 410 94.8 3.4e-20 CCDS9419.1 ARL11 gene_id:115761|Hs108|chr13 ( 196) 404 93.5 7.9e-20 CCDS3986.1 TRIM23 gene_id:373|Hs108|chr5 ( 546) 404 93.8 1.8e-19 CCDS13533.1 ARFRP1 gene_id:10139|Hs108|chr20 ( 201) 391 90.8 5.3e-19 CCDS46630.1 ARFRP1 gene_id:10139|Hs108|chr20 ( 173) 345 81.2 3.5e-16 CCDS68172.1 ARFRP1 gene_id:10139|Hs108|chr20 ( 154) 329 77.9 3.2e-15 CCDS1421.1 ARL8A gene_id:127829|Hs108|chr1 ( 186) 309 73.8 6.7e-14 CCDS2566.1 ARL8B gene_id:55207|Hs108|chr3 ( 186) 295 70.9 5e-13 CCDS55770.1 ARL2 gene_id:402|Hs108|chr11 ( 157) 293 70.4 5.8e-13 CCDS2925.1 ARL13B gene_id:200894|Hs108|chr3 ( 428) 283 68.6 5.5e-12 >>CCDS7131.1 ARL5B gene_id:221079|Hs108|chr10 (179 aa) initn: 1191 init1: 1191 opt: 1191 Z-score: 1353.8 bits: 257.0 E(32554): 4.4e-69 Smith-Waterman score: 1191; 100.0% identity (100.0% similar) in 179 aa overlap (1-179:1-179) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGLIFAKLWSLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKNT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 MGLIFAKLWSLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKNT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 HFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 HFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAAV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 LIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR 130 140 150 160 170 >>CCDS2195.1 ARL5A gene_id:26225|Hs108|chr2 (179 aa) initn: 1010 init1: 1010 opt: 1010 Z-score: 1150.5 bits: 219.4 E(32554): 9.1e-58 Smith-Waterman score: 1010; 79.9% identity (95.0% similar) in 179 aa overlap (1-179:1-179) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGLIFAKLWSLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKNT ::..:...: :: .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::..:: CCDS21 MGILFTRIWRLFNHQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFSMNEVVHTSPTIGSNVEEIVINNT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 HFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAAV .::::::::::::::::::::.::::.:.:::: ::::...:.::::.::::::::::.. 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CCDS45 LIFANKQDVKDSMRMVEISHFLTLSTIKDHSWHIQGCCALTREGLPARLQWMESQAAAN 130 140 150 160 170 >>CCDS1565.1 ARF1 gene_id:375|Hs108|chr1 (181 aa) initn: 609 init1: 588 opt: 611 Z-score: 702.4 bits: 136.5 E(32554): 8.4e-33 Smith-Waterman score: 611; 50.3% identity (80.2% similar) in 177 aa overlap (1-176:1-177) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGLIFAKLWS-LFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKN :: :::.:.. :: ..: ....:::: ::::::::.. ..:.: : :::: ::: . :: CCDS15 MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 THFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAA : .::.:::...: : :..::. .:.:::: ::::. ..:::.::::...:: :. CCDS15 ISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR .:.::::::. . :.::::. : : :.. . :.::. :: .:.:: .::.:..... CCDS15 LLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQ 130 140 150 160 170 180 CCDS15 K >>CCDS8774.1 ARF3 gene_id:377|Hs108|chr12 (181 aa) initn: 598 init1: 583 opt: 598 Z-score: 687.8 bits: 133.8 E(32554): 5.4e-32 Smith-Waterman score: 598; 49.7% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (1-176:1-177) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGLIFAKLW-SLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKN :: ::..: ::. ..: ....:::: ::::::::.. ..:.: : :::: ::: . :: CCDS87 MGNIFGNLLKSLIGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 THFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAA : .::.:::...: : :..::. .:.:::: ::::. ..:::.::::...:: :. CCDS87 ISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR .:.::::::. . :.::::. : : :.. . :.::. :: .:.:: .::.:..... CCDS87 LLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLANQLKNK 130 140 150 160 170 180 CCDS87 K >>CCDS44958.1 ARL1 gene_id:400|Hs108|chr12 (181 aa) initn: 566 init1: 566 opt: 577 Z-score: 664.2 bits: 129.5 E(32554): 1.1e-30 Smith-Waterman score: 577; 48.9% identity (76.7% similar) in 180 aa overlap (1-179:1-180) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGLIFAKLWS-LFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKN :: .:....: :: ..: ...:.:::.::::::::.. ..::: : :::: ::: .. :: CCDS44 MGGFFSSIFSSLFGTREMRILILGLDGAGKTTILYRLQVGEVVTTIPTIGFNVETVTYKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 THFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAA .: .::.::: :.: : :::::. .: :::: ::.:..:.: :: :: .:.:::: CCDS44 LKFQVWDLGGQTSIRPYWRCYYSNTDAVIYVVDSCDRDRIGISKSELVAMLEEEELRKAI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR ...:::::::. ::..:... : : ..::. :.: . : : :: ...::.. . : CCDS44 LVVFANKQDMEQAMTSSEMANSLGLPALKDRKWQIFKTSATKGTGLDEAMEWLVETLKSR 130 140 150 160 170 180 CCDS44 Q >>CCDS2884.1 ARF4 gene_id:378|Hs108|chr3 (180 aa) initn: 576 init1: 545 opt: 564 Z-score: 649.7 bits: 126.8 E(32554): 7.3e-30 Smith-Waterman score: 564; 45.0% identity (77.2% similar) in 180 aa overlap (1-179:1-180) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGLIFAKLWS-LFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKN ::: ...:.: :: ... ....:::: ::::::::.. ..:.: : :::: ::: . :: CCDS28 MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 THFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAA : .::.:::. .: :. :..::. .:.:::: ::::. . .:: .:: ..:: :. CCDS28 ICFTVWDVGGQDRIRPLWKHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEVADELQKMLLVDELRDAV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR .:.::::::. . :. .:.. : :.:.... :..:. :: : :: .::.:...... : CCDS28 LLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR 130 140 150 160 170 180 >>CCDS34745.1 ARF5 gene_id:381|Hs108|chr7 (180 aa) initn: 536 init1: 521 opt: 559 Z-score: 644.0 bits: 125.7 E(32554): 1.5e-29 Smith-Waterman score: 559; 44.4% identity (75.6% similar) in 180 aa overlap (1-179:1-180) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGLIFAKLWS-LFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKN ::: . :.: .: ... ....:::: ::::::::.. ..:.: : :::: ::: . :: CCDS34 MGLTVSALFSRIFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 THFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAA : .::.:::...: : :..::. .:.:::: ::::. . .:: .:: ...:: :. CCDS34 ICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVQESADELQKMLQEDELRDAV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR .:.::::::: . : ..:.. : :. .... :..:. :: : :: .::.:.. ... : CCDS34 LLVFANKQDMPNAMPVSELTDKLGLQHLRSRTWYVQATCATQGTGLYDGLDWLSHELSKR 130 140 150 160 170 180 >>CCDS9695.1 ARF6 gene_id:382|Hs108|chr14 (175 aa) initn: 545 init1: 545 opt: 552 Z-score: 636.4 bits: 124.3 E(32554): 4e-29 Smith-Waterman score: 552; 44.3% identity (75.3% similar) in 174 aa overlap (1-174:1-171) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGLIFAKLWSLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKNT :: ...: .: :.: .....::: ::::::::.. ... : : ::.: ::: .. ::. CCDS96 MGKVLSK---IFGNKEMRILMLGLDAAGKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 HFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAAV .: .::.:::...: : ::..:. .:.::: ::.:. ...::.:.. ...: : . CCDS96 KFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAII 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 LIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR ::::::::. : ::.. : :. :.:. :..: :: .:.:: .:: :.:: CCDS96 LIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS 120 130 140 150 160 170 179 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 08:47:29 2016 done: Sun Nov 6 08:47:30 2016 Total Scan time: 1.680 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]