FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4540, 622 aa 1>>>pF1KE4540 622 - 622 aa - 622 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7536+/-0.000399; mu= 22.7937+/- 0.025 mean_var=71.8534+/-14.339, 0's: 0 Z-trim(112.7): 28 B-trim: 30 in 1/52 Lambda= 0.151304 statistics sampled from 21701 (21722) to 21701 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16 Scan time: 10.850 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002582 (OMIM: 261680,614168) phosphoenolpyruvat ( 622) 4296 947.5 0 XP_011527141 (OMIM: 261680,614168) PREDICTED: phos ( 490) 3374 746.1 6.5e-215 NP_004554 (OMIM: 261650,614095) phosphoenolpyruvat ( 640) 3189 705.8 1.1e-202 NP_001294983 (OMIM: 261650,614095) phosphoenolpyru ( 506) 2748 609.5 9e-174 NP_001278485 (OMIM: 261650,614095) phosphoenolpyru ( 506) 2748 609.5 9e-174 XP_006720221 (OMIM: 261650,614095) PREDICTED: phos ( 497) 2496 554.5 3.2e-157 NP_001018083 (OMIM: 261650,614095) phosphoenolpyru ( 441) 2024 451.4 3.1e-126 >>NP_002582 (OMIM: 261680,614168) phosphoenolpyruvate ca (622 aa) initn: 4296 init1: 4296 opt: 4296 Z-score: 5065.7 bits: 947.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4296; 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74.3% identity (90.3% similar) in 506 aa overlap (117-622:1-506) 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 RIESKTVIVTQEQRDTVPIPKTGLSQLGRWMSEEDFEKAFNARFPGCMKGRTMYVIPFSM :: ::..: . ::::::.::::::.:::: NP_001 MSPADFQRAVDERFPGCMQGRTMYVLPFSM 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 GPLGSPLSKIGIELTDSPYVVASMRIMTRMGTPVLEALGDGEFVKCLHSVGCPLPLQKPL ::.:::::.::..:::: :::::::::::.:::::.:::::.::::::::: :: : NP_001 GPVGSPLSRIGVQLTDSAYVVASMRIMTRLGTPVLQALGDGDFVKCLHSVGQPLTGQGEP 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 VNNWPCNPELTLIAHLPDRREIISFGSGYGGNSLLGKKCFALRMASRLAKEEGWLAEHML :..:::::: :::.:.::.::::::::::::::::::::::::.:::::..::::::::: NP_001 VSQWPCNPEKTLIGHVPDQREIISFGSGYGGNSLLGKKCFALRIASRLARDEGWLAEHML 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 VLGITNPEGEKKYLAAAFPSACGKTNLAMMNPSLPGWKVECVGDDIAWMKFDAQGHLRAI .::::.: :.:.:.:::::::::::::::: :.::::::::::::::::.::..:.:::: NP_001 ILGITSPAGKKRYVAAAFPSACGKTNLAMMRPALPGWKVECVGDDIAWMRFDSEGRLRAI 160 170 180 190 200 210 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 NPENGFFGVAPGTSVKTNPNAIKTIQKNTIFTNVAETSDGGVYWEGIDEPLASGVTITSW ::::::::::::::. :::::. :::.:::::::::::::::::::::.:: :::.::: NP_001 NPENGFFGVAPGTSATTNPNAMATIQSNTIFTNVAETSDGGVYWEGIDQPLPPGVTVTSW 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 KNKEWSSEDGEPCAHPNSRFCTPASQCPIIDAAWESPEGVPIEGIIFGGRRPAGVPLVYE .: :. : :::::::::::.:: ::::.: :::.::::::..:::::::: ::::::: NP_001 LGKPWKPGDKEPCAHPNSRFCAPARQCPIMDPAWEAPEGVPIDAIIFGGRRPKGVPLVYE 280 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 ALSWQHGVFVGAAMRSEATAAAEHKGKIIMHDPFAMRPFFGYNFGKYLAHWLSMAQHPAA :..:.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::.:: ::::: . .: NP_001 AFNWRHGVFVGSAMRSESTAAAEHKGKIIMHDPFAMRPFFGYNFGHYLEHWLSMEGRKGA 340 350 360 370 380 390 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 KLPKIFHVNWFRKDKEGKFLWPGFGENSRVLEWMFNRIDGKASTKLTPIGYIPKEDALNL .::.::::::::.:. :.:::::::::.:::.:. :..:. :.. :::: .::: ::.: NP_001 QLPRIFHVNWFRRDEAGHFLWPGFGENARVLDWICRRLEGEDSARETPIGLVPKEGALDL 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 KGLGHINMMELFSISKEFWEKEVEDIEKYLEDQVNADLPCEIEREILALKQRISQM .:: :. .:::. :.:::.::.::..:: .::: ::: :. :. ::..:. .: NP_001 SGLRAIDTTQLFSLPKDFWEQEVRDIRSYLTEQVNQDLPKEVLAELEALERRVHKM 460 470 480 490 500 >>XP_006720221 (OMIM: 261650,614095) PREDICTED: phosphoe (497 aa) initn: 2496 init1: 2089 opt: 2496 Z-score: 2943.5 bits: 554.5 E(85289): 3.2e-157 Smith-Waterman score: 2496; 74.8% identity (90.4% similar) in 460 aa overlap (14-472:31-490) 10 20 30 40 pF1KE4 MPPQLQNGLNLSAKVVQGSLDSLPQAVREFLENNAELCQPDHI .:..:.: .:: ..:.:.:..:.::::. : XP_006 MAALYRPGLRLNWHGLSPLGWPSCRSIQTLRVLSGDLGQLPTGIRDFVEHSARLCQPEGI 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 HICDGSEEENGRLLGQMEEEGILRRLKKYDNCWLALTDPRDVARIESKTVIVTQEQRDTV :::::.: :: : .:..:..:.: ::.::::: :::.::::.:::::::: ::::: XP_006 HICDGTEAENTATLTLLEQQGLIRKLPKYNNCWLARTDPKDVARVESKTVIVTPSQRDTV 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 PIPKTGL-SQLGRWMSEEDFEKAFNARFPGCMKGRTMYVIPFSMGPLGSPLSKIGIELTD :.: : .::: ::: ::..: . ::::::.::::::.::::::.:::::.::..::: XP_006 PLPPGGARGQLGNWMSPADFQRAVDERFPGCMQGRTMYVLPFSMGPVGSPLSRIGVQLTD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 SPYVVASMRIMTRMGTPVLEALGDGEFVKCLHSVGCPLPLQKPLVNNWPCNPELTLIAHL : :::::::::::.:::::.:::::.::::::::: :: : :..:::::: :::.:. 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NP_001 SAYVVASMRIMTRLGTPVLQALGDGDFVKCLHSVGQPLTGQGEPVSQWPCNPEKTLIGHV 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 PDRREIISFGSGYGGNSLLGKKCFALRMASRLAKEEGWLAEHMLVLGITNPEGEKKYLAA ::.::::::::::::::::::::::::.:::::..:::::::::.::::.: :.:.:.:: NP_001 PDQREIISFGSGYGGNSLLGKKCFALRIASRLARDEGWLAEHMLILGITSPAGKKRYVAA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 AFPSACGKTNLAMMNPSLPGWKVECVGDDIAWMKFDAQGHLRAINPENGFFGVAPGTSVK :::::::::::::: :.::::::::::::::::.::..:.::::::::::::::::::. 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