FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6315, 437 aa 1>>>pF1KE6315 437 - 437 aa - 437 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5993+/-0.000961; mu= 4.4994+/- 0.058 mean_var=214.5243+/-43.813, 0's: 0 Z-trim(113.5): 11 B-trim: 109 in 1/51 Lambda= 0.087566 statistics sampled from 14095 (14106) to 14095 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16 Scan time: 2.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs108|chr4 ( 437) 2923 381.7 7.9e-106 CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 ( 349) 766 109.1 7.1e-24 CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 ( 348) 744 106.3 4.9e-23 CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 ( 377) 712 102.3 8.6e-22 CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 ( 438) 467 71.4 2e-12 >>CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs108|chr4 (437 aa) initn: 2923 init1: 2923 opt: 2923 Z-score: 2013.4 bits: 381.7 E(32554): 7.9e-106 Smith-Waterman score: 2923; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDGNDNVTLLFAPLLRDNYTLAPNASSLGPGTDLALAPASSAGPGPGLSLGPGPSFGFSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MDGNDNVTLLFAPLLRDNYTLAPNASSLGPGTDLALAPASSAGPGPGLSLGPGPSFGFSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 NLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 YVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 YVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 YMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 YMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYG 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 TVKAENIIMMETAQTSL ::::::::::::::::: CCDS34 TVKAENIIMMETAQTSL 430 >>CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 (349 aa) initn: 800 init1: 734 opt: 766 Z-score: 542.1 bits: 109.1 E(32554): 7.1e-24 Smith-Waterman score: 766; 36.2% identity (65.5% similar) in 351 aa overlap (78-426:3-343) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 LSLGPGPSFGFSPGPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNV : .. .:: :. : : . .:.: CCDS97 MEAHNASAPFNFTLPPN---FGKRPTDLALSV 10 20 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 FVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVA .. : . ::.::::.. ... ::. .: : .: . :.:..:: ::.:. .:.: .. CCDS97 ILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIE 30 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 AVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTP :.:.:.::: :::::::..:: . :::::::.:: ::. :: .::: :.::: . . CCDS97 ALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGD 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 IVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTM . . .: ....: .::: .:. .. : . :..: .. .:. :.. .... CCDS97 LKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAIN 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 LGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAI .: .. .. . . . .::. :. :: :..:: : :.::: .::: ::::::..: CCDS97 VGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTI 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 LKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYK :..::::. :: ...::::: .:: .:. ... :. : : . . : :. : . : CCDS97 LNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLLIAIFWCY--EKF--KTPKDK---TKMIYT 270 280 290 300 310 320 410 420 430 pF1KE6 KLKEEEMADTSYG--TVKAENIIMMETAQTSL :: . : : :.:. CCDS97 AATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA 330 340 >>CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 (348 aa) initn: 655 init1: 426 opt: 744 Z-score: 527.1 bits: 106.3 E(32554): 4.9e-23 Smith-Waterman score: 744; 38.7% identity (72.3% similar) in 292 aa overlap (98-385:23-311) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCI----TMLGLGCT .. .:. :.: ....: : .:...::. CCDS95 MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCN 10 20 30 40 50 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLS :....: .:..:: : .. :::::..:: .:.:..:: . . ::.::. ::::::. : CCDS95 VEIKKFLGHIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTAS 60 70 80 90 100 110 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCS :... :::::.::. :: :::::: .::::: ::. :... . ..: .. .: : CCDS95 NILAYWVDGDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI-VIPYDNIGTSLVS 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 TLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVI ..:...:.:. .:. . : :.:.. . . :.::. ..: .: : ...: CCDS95 LVVPVSIGMFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAI-LIVLIAVVGGILYQSAWIIAPK-LWII 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 AIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMF . ..:.:::. :. :: . :: ::: .::: ::.:::..:..:.: :. .. .. : CCDS95 GTIFPVAGYSLGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTF 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 PLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVK ::.:..:: : :.::. .: : CCDS95 PLIYSIFQLAFAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK 290 300 310 320 330 340 >>CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 (377 aa) initn: 689 init1: 447 opt: 712 Z-score: 504.7 bits: 102.3 E(32554): 8.6e-22 Smith-Waterman score: 712; 38.1% identity (70.9% similar) in 278 aa overlap (115-392:44-318) 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 FPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAAL . :..:::.:.. .. .:.::: : .. : CCDS36 NSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEIRKLWSHIRRPWGIAVGLL 20 30 40 50 60 70 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 CQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISS :::::.:. :.:::..:.: : :.:::. ::::::..::.... :::::.::: :: : CCDS36 CQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIFTFWVDGDMDLSISMTTCS 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 TLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADY :. :: .::::...:.:.: . .: .. .:: ::...::.. :.. . . CCDS36 TVAALGMMPLCIYLYTWSW-SLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIPVAFGVYVNYRWPKQSKI 140 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 IVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHL :.:.. : :.:. . .:..:. : .. .:....:: :...:. :: . : CCDS36 ILKIGAVVGGVLLLVVAV-AGVVLAKGSWNS-DITLLTISFIFPLIGHVTGFLLALFTHQ 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 PPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKM . ::. ::::.::.:.: ..:.:.: . . .: ::: :.::: .. ..: :. CCDS36 SWQRCRTISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPLAYGLFQLIDGFLIVAAYQT 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 pF1KE6 YGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVKAENIIMMETAQTSL : .. .: CCDS36 YKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEGAITPGPPGPMDCHRALEPV 320 330 340 350 360 370 >>CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 (438 aa) initn: 389 init1: 283 opt: 467 Z-score: 336.6 bits: 71.4 E(32554): 2e-12 Smith-Waterman score: 467; 31.3% identity (64.9% similar) in 265 aa overlap (120-383:158-419) 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 APHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGL .:: .... : . .::. ..:.:. :: : CCDS34 QKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPLPVILGAVTQFFL 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 LPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLAL .:. .:::. : :. : .:.. ::::. . :..::.:::..:.:.:: .:::::: CCDS34 MPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLAILMTCTSTLLAL 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 VLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVS ..::. .::: .. . .:.. .. :: :.:...:. :... . :... .. CCDS34 IMMPVNSYIYSRI-LGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRIPEKASFLERI- 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLP-PNC . : :. . :. .: .: . : ......: : ::..: . :: : : CCDS34 IRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFAKVCTLPLPVC 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 KRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSE : :: .:.: : : :...:.:: . . . :. :. .. : ...:.:: CCDS34 K-TVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLIILVYKAKKRC 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 pF1KE6 MLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVKAENIIMMETAQTSL CCDS34 IFFLQDKRKRNFLI 430 437 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:01:24 2016 done: Tue Nov 8 12:01:24 2016 Total Scan time: 2.280 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]