FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6311, 425 aa 1>>>pF1KE6311 425 - 425 aa - 425 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7405+/-0.000325; mu= 15.5682+/- 0.020 mean_var=77.0544+/-15.298, 0's: 0 Z-trim(116.2): 45 B-trim: 133 in 1/54 Lambda= 0.146108 statistics sampled from 27213 (27260) to 27213 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16 Scan time: 8.040 The best scores are: opt bits E(85289) NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Hom ( 425) 2875 615.4 8.8e-176 XP_005257833 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 ( 425) 2875 615.4 8.8e-176 NP_001138495 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 2 [ ( 378) 2528 542.2 8.4e-154 XP_016880775 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 ( 403) 2389 512.9 5.8e-145 XP_005246913 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_005246914 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_016860399 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_005246911 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_005246912 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_016860398 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 NP_078859 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 1 [Hom ( 424) 1488 323.0 9.1e-88 XP_005246910 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 444) 1488 323.0 9.4e-88 NP_001138985 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [ ( 414) 1466 318.3 2.2e-86 NP_055581 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [Hom ( 414) 1466 318.3 2.2e-86 NP_001138986 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform b [ ( 434) 1466 318.4 2.3e-86 NP_001180457 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 2 [ ( 417) 1399 304.2 4e-82 NP_001138987 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform c [ ( 346) 1231 268.8 1.5e-71 XP_011510141 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 344) 1146 250.9 3.8e-66 >>NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Homo sa (425 aa) initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 3276.8 bits: 615.4 E(85289): 8.8e-176 Smith-Waterman score: 2875; 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