FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1341, 166 aa 1>>>pF1KE1341 166 - 166 aa - 166 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4269+/-0.000865; mu= 11.4898+/- 0.052 mean_var=76.4810+/-15.356, 0's: 0 Z-trim(107.3): 66 B-trim: 2 in 1/51 Lambda= 0.146655 statistics sampled from 9447 (9515) to 9447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 1.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31901.1 MYL2 gene_id:4633|Hs108|chr12 ( 166) 1086 238.8 1.1e-63 CCDS10677.1 MYLPF gene_id:29895|Hs108|chr16 ( 169) 831 184.9 2e-47 CCDS34713.1 MYL10 gene_id:93408|Hs108|chr7 ( 226) 763 170.6 5.5e-43 CCDS43197.1 MYL5 gene_id:4636|Hs108|chr4 ( 173) 743 166.3 8.3e-42 CCDS5478.1 MYL7 gene_id:58498|Hs108|chr7 ( 175) 692 155.5 1.5e-38 CCDS11830.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 ( 171) 634 143.2 7.2e-35 CCDS77145.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 ( 177) 634 143.2 7.4e-35 CCDS11831.1 MYL12B gene_id:103910|Hs108|chr18 ( 172) 626 141.5 2.3e-34 CCDS13276.1 MYL9 gene_id:10398|Hs108|chr20 ( 172) 621 140.5 4.9e-34 CCDS1832.1 CALM2 gene_id:805|Hs108|chr2 ( 149) 318 76.3 8.6e-15 CCDS9892.1 CALM1 gene_id:801|Hs108|chr14 ( 149) 318 76.3 8.6e-15 CCDS33061.1 CALM3 gene_id:808|Hs108|chr19 ( 149) 318 76.3 8.6e-15 CCDS7069.1 CALML3 gene_id:810|Hs108|chr10 ( 149) 306 73.8 5e-14 >>CCDS31901.1 MYL2 gene_id:4633|Hs108|chr12 (166 aa) initn: 1086 init1: 1086 opt: 1086 Z-score: 1256.5 bits: 238.8 E(32554): 1.1e-63 Smith-Waterman score: 1086; 100.0% identity (100.0% similar) in 166 aa overlap (1-166:1-166) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRVN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRVN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 VKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKADYVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 VKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKADYVR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 EMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 EMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD 130 140 150 160 >>CCDS10677.1 MYLPF gene_id:29895|Hs108|chr16 (169 aa) initn: 797 init1: 797 opt: 831 Z-score: 964.8 bits: 184.9 E(32554): 2e-47 Smith-Waterman score: 831; 71.9% identity (92.8% similar) in 167 aa overlap (1-166:1-167) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRA-GGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRV ::::.::.:. :..:.:::::.::::::::::::..::::::.:::.::::::::.::. 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CCDS10 NVKNEELDAMMKEASGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEDVITGAFKVLDPEGKGTIKKKFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE1 REMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD .:.:::: .:::.::. .:.::::::: ::.::::. ..::::. :: CCDS10 EELLTTQCDRFSQEEIKNMWAAFPPDVGGNVDYKNICYVITHGDAKDQE 130 140 150 160 >>CCDS34713.1 MYL10 gene_id:93408|Hs108|chr7 (226 aa) initn: 804 init1: 761 opt: 763 Z-score: 885.3 bits: 170.6 E(32554): 5.5e-43 Smith-Waterman score: 814; 66.7% identity (77.3% similar) in 198 aa overlap (4-166:29-226) 10 20 30 pF1KE1 MAPKKAKKRA-GGANSNVFSMFEQTQIQEFKE--- ..:.::: : :.:::::::.:.::::::: CCDS34 MLLRLVSNSWPQVILPPRPPKVLGLQAPRRARKRAEGTASSNVFSMFDQSQIQEFKESLA 10 20 30 40 50 60 40 50 60 pF1KE1 -------------------------------AFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRVN :::::::::::::::.:::::::::::.: CCDS34 LSPRLERNGMISAHCNLCLTGSSNSPASASQAFTIMDQNRDGFIDKEDLRDTFAALGRIN 70 80 90 100 110 120 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 VKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKADYVR :::::.. :.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: :::: .::: .. 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CCDS43 SLGKTNVKDDELDAMLKEASGPINFTMFLNLFGEKLSGTDAEETILNAFKMLDPDGKGKI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE1 KADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD . .:....: .::.... ::::::: ::.:::::: : ..:::::::. CCDS43 NKEYIKRLLMSQADKMTAEEVDQMFQFASIDVAGNLDYKALSYVITHGEEKEE 130 140 150 160 170 >>CCDS5478.1 MYL7 gene_id:58498|Hs108|chr7 (175 aa) initn: 716 init1: 680 opt: 692 Z-score: 805.7 bits: 155.5 E(32554): 1.5e-38 Smith-Waterman score: 692; 62.7% identity (87.0% similar) in 161 aa overlap (6-166:14-174) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDT : :.: ..:::::::::.:::::::::. .::::::.: : :::.: CCDS54 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 FAALGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKG .. ::.:.: .::.: :..:. ::::::::::.:::::.:.::::.::.::..::: ::: CCDS54 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE1 VLKADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD :.. : ...: :::..:: ::.:::: : :..::.:::.: .:::::.::. CCDS54 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE 130 140 150 160 170 >>CCDS11830.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 (171 aa) initn: 627 init1: 388 opt: 634 Z-score: 739.5 bits: 143.2 E(32554): 7.2e-35 Smith-Waterman score: 634; 57.7% identity (84.7% similar) in 163 aa overlap (5-166:9-170) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAAL :.::: :.::::.::.:.:::::::::...::::::::::.::.: .:.: CCDS11 MSSKRTKTKTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKA :. : .: .: :..:::::::::.:::::::::.:.:::..: ::: :: :. :... CCDS11 GK-NPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHG-EEKD ::.::.:::...::. ::::... : : ::..: ....:. :: ..:: CCDS11 DYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD 120 130 140 150 160 170 >>CCDS77145.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 (177 aa) initn: 627 init1: 388 opt: 634 Z-score: 739.3 bits: 143.2 E(32554): 7.4e-35 Smith-Waterman score: 634; 57.7% identity (84.7% similar) in 163 aa overlap (5-166:15-176) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLR :.::: :.::::.::.:.:::::::::...::::::::::.::. CCDS77 MDLTTTMSSKRTKTKTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLH 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 DTFAALGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEG : .:.::. : .: .: :..:::::::::.:::::::::.:.:::..: ::: :: :. CCDS77 DMLASLGK-NPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KGVLKADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHG-EEKD :... ::.::.:::...::. ::::... : : ::..: ....:. :: ..:: CCDS77 TGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD 120 130 140 150 160 170 >>CCDS11831.1 MYL12B gene_id:103910|Hs108|chr18 (172 aa) initn: 617 init1: 379 opt: 626 Z-score: 730.3 bits: 141.5 E(32554): 2.3e-34 Smith-Waterman score: 626; 56.7% identity (83.5% similar) in 164 aa overlap (4-166:9-171) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAA : .::: :.::::.::.:.:::::::::...::::::::::.::.: .:. CCDS11 MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLAS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLK ::. : . .: :..:::::::::.:::::::::.:.:::..: ::: :: :. :... CCDS11 LGK-NPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHG-EEKD ::.::.:::...::. ::::... : : ::..: ....:. :: ..:: CCDS11 EDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD 120 130 140 150 160 170 >>CCDS13276.1 MYL9 gene_id:10398|Hs108|chr20 (172 aa) initn: 614 init1: 376 opt: 621 Z-score: 724.6 bits: 140.5 E(32554): 4.9e-34 Smith-Waterman score: 621; 56.7% identity (84.1% similar) in 164 aa overlap (4-166:9-171) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAA : .::: :.::::.::.:.:::::::::...::::::::::.::.: .:. CCDS13 MSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLAS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLK ::. : .: .. :..:::::::::.:::::::::.:.:::..: ::: :: :..: .. CCDS13 LGK-NPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHG-EEKD :..::.:::...::. ::::.:. : : ::..: ....:. :: ..:: CCDS13 EDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD 120 130 140 150 160 170 >>CCDS1832.1 CALM2 gene_id:805|Hs108|chr2 (149 aa) initn: 269 init1: 175 opt: 318 Z-score: 379.0 bits: 76.3 E(32554): 8.6e-15 Smith-Waterman score: 318; 38.0% identity (73.2% similar) in 142 aa overlap (23-160:7-147) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRVN . :: ::::::...:.. :: : ..: .. .::. : CCDS18 MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQ-N 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 VKNEEIDEMIKEAP----GPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKA . :...::.:. : :.: ::::...:.: .: :: : .::.::: .:.: ..: CCDS18 PTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE1 DYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD .:...:. .:... ::::.:. : :...:...:...: CCDS18 AELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK 110 120 130 140 166 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:51:16 2016 done: Sun Nov 6 22:51:16 2016 Total Scan time: 1.800 Total Display time: -0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]