Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6685, 427 aa
1>>>pF1KB6685 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7408+/-0.00104; mu= 14.1813+/- 0.062
mean_var=60.5887+/-12.432, 0's: 0 Z-trim(101.9): 49 B-trim: 388 in 1/50
Lambda= 0.164770
statistics sampled from 6676 (6725) to 6676 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 2798 674.1 7.2e-194
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 1154 283.3 3.1e-76
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 1151 282.6 5.3e-76
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 1139 279.7 3.6e-75
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 1107 272.1 7.3e-73
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 1092 268.5 8.4e-72
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 1078 265.2 8.3e-71
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1064 261.9 8.6e-70
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 832 206.7 3.4e-53
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 807 200.8 1.5e-51
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 722 180.6 2.1e-45
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 632 159.2 7.7e-39
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 627 158.0 1.5e-38
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 597 150.9 2e-36
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 597 150.9 2e-36
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 597 150.9 2.1e-36
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 596 150.6 2.4e-36
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 592 149.7 5.4e-36
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 570 144.4 1.8e-34
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 567 143.7 2.8e-34
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 544 138.3 1.3e-32
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 544 138.3 1.3e-32
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 544 138.3 1.4e-32
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 542 137.8 1.8e-32
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 525 133.7 3.1e-31
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 522 133.0 5.2e-31
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 510 130.2 3.6e-30
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 511 130.4 3.8e-30
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 496 126.8 3.6e-29
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 496 126.8 3.6e-29
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 449 115.7 8e-26
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 428 110.7 2.8e-24
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 413 107.1 3.1e-23
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 413 107.1 3.2e-23
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 397 103.3 4.4e-22
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 389 101.4 1.5e-21
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 380 99.3 9e-21
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 347 91.4 1e-18
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 334 88.3 1.5e-17
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 332 87.9 2.1e-17
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 329 87.2 3.9e-17
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 311 82.9 4.9e-16
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 258 70.2 1.9e-12
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
initn: 2798 init1: 2798 opt: 2798 Z-score: 3594.0 bits: 674.1 E(32554): 7.2e-194
Smith-Waterman score: 2798; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 WNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 WNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGK
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VVDPTKP
:::::::
CCDS99 VVDPTKP
>>CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 (422 aa)
initn: 1023 init1: 701 opt: 1154 Z-score: 1482.0 bits: 283.3 E(32554): 3.1e-76
Smith-Waterman score: 1154; 44.0% identity (76.4% similar) in 423 aa overlap (6-424:5-419)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSL-KIAPANADFA
.: :: .:.:: : : . : :.. .. . . .: .:. .:.:. ..::
CCDS32 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAH-GDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
.:.: .:...:: ::::::.:::.. :.::::: ... . ::::::::::: :.:.:.
CCDS32 LRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
::. ::::: ::. :: .::..:::.. :: ..:.. .: : : .:: :.: :
CCDS32 GFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKD-FYVDEN
. :::.....: :..:: . :...:..:::.:::.::: :..:: .: .. :.:::
CCDS32 RQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDER
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEML
:...:::: : .: : .:.:. : :.::...:.:.: ....::. :::...: .: :. :
CCDS32 TSLQVPMMHQ-KEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MRWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLE
.:..:: . . :.::::.:::::.: :..:::..:.:.... ::.::.: : .
CCDS32 RKWGQLL----LPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIK--FFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVL
:: ::: .:..: ::::.::... . ...... : .::::::.... ..:::.:
CCDS32 ISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLL
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB6 FLGKVVDPTKP
::::::.:
CCDS32 FLGKVVNPVAG
420
>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
initn: 1081 init1: 777 opt: 1151 Z-score: 1478.0 bits: 282.6 E(32554): 5.3e-76
Smith-Waterman score: 1151; 47.8% identity (78.2% similar) in 385 aa overlap (44-426:55-434)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 LLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAFRFYYLIASETPGK
...:. .. :.:::::.: .. :::..
CCDS41 GVLFAVGLCAPIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQ
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 NIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRGFQHLLHTLNLPGH
::::::.:.:.. ::::::: : ...:::.:::::::. :: .:.:::::.:.:..:..
CCDS41 NIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSK
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 GLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQLINDHVKKETRGK
: ..:::::....:.. :.::... .:::..: :.: . . ::.::::.:.::
CCDS41 DLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGK
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 IVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPK-DFYVDENTTVRVPMMLQDQEH
.::... : . :::::.:.::: ::::: : . : : :..::.:::: : .:.
CCDS41 VVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQ-KEQ
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 HWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMRWNNLLRKRNFYK
. : : : ::.:::::::..::.::..::::..:..:. . : .:.. :.::
CCDS41 FAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKR----
270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 KLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDE
.:. .:.::::.:: :. :::..:. ..:.: ::.:::.:...:..::. :::.:::.:
CCDS41 WIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSE
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KB6 AGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHI-LRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
::::.:::. . : . .. . ::: ::..: . .:...:::::: .:::
CCDS41 EGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
380 390 400 410 420 430
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 984 init1: 625 opt: 1139 Z-score: 1463.1 bits: 279.7 E(32554): 3.6e-75
Smith-Waterman score: 1139; 45.0% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (6-424:4-406)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANA-DFA
.::: :: ::. . ..:: .: : .... . :. .::.. ::.
CCDS99 MQLFLLLCLV-LLSPQGASLHRHHPREM-----KKRVEDLHVGAT---VAPSSRRDFT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
: .: .:: .:...:::::.::: . ::::::: : .. :::::::.:: . ::...::
CCDS99 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
:::.::. :: : :.. .:.::: . . . :.. ..: : : ::: :..:..
CCDS99 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENT
. :::.: :.:.::::::...: .......::::.::: :: : . : .:::: .:
CCDS99 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLM
.:::::: .....: :: :: : : :. . :.:.::..::::..:::...:. :. . :
CCDS99 VVRVPMMSREDQYH-YLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEA
.: ....:: .:::.:::::: ::: :...:: ::....:.. ::::::........
CCDS99 KWLKMFKKR----QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLG
:. :::...:::.::.:::::. . : ::. : . : ::::::. : .. ..::::
CCDS99 SEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDN---NILFLG
350 360 370 380 390 400
420
pF1KB6 KVVDPTKP
:: :
CCDS99 KVNRP
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 890 init1: 775 opt: 1107 Z-score: 1421.6 bits: 272.1 E(32554): 7.3e-73
Smith-Waterman score: 1107; 44.8% identity (73.6% similar) in 424 aa overlap (7-426:5-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAF
: :: .:::: . . : . .. . : . .: .: ::.::::
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRG
.: .. ..: ::..:::::::.: :.::::: . . ..::.:: ::::: ::...:..
CCDS32 SLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQ
:::::.::: . :. .:.:.:....:..: .: .:. .: .. : :.: :.... .
CCDS32 FQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTT
::::.::. :::::.::...: ....:::::::.::: :: :: . : . ::....
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CCDS32 FMSKVTNPKQA
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CCDS14 SNAAHKAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFL
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420
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CCDS14 GKVVNPTEA
410
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CCDS99 TGVTLNLTSKPI---ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
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CCDS99 GTG--AQTLPMETPL-VVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
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CCDS61 STDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYT
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CCDS61 QLEQALSARTLRKWSHSLQKR----WIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNAD
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CCDS61 ITNKATDGILFLGKVENPTKS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]